A bacterial artificial chromosome library for Biomphalaria glabrata, intermediate snail host of Schistosoma mansoni

To provide a novel resource for analysis of the genome of Biomphalaria glabrata, members of the international Biomphalaria glabrata Genome Initiative (biology.unm.edu/biomphalaria-genome.html), working with the Arizona Genomics Institute (AGI) and supported by the National Human Genome Research Institute (NHGRI), produced a high quality bacterial artificial chromosome (BAC) library. The BB02 strain B. glabrata, a field isolate (Belo Horizonte, Minas Gerais, Brasil) that is susceptible to several strains of Schistosoma mansoni, was selfed for two generations to reduce haplotype diversity in the offspring. High molecular weight DNA was isolated from ovotestes of 40 snails, partially digested with HindIII, and ligated into pAGIBAC1 vector. The resulting B. glabrata BAC library (BG_BBa) consists of 61824 clones (136.3 kb average insert size) and provides 9.05 × coverage of the 931 Mb genome. Probing with single/low copy number genes from B. glabrata and fingerprinting of selected BAC clones indicated that the BAC library sufficiently represents the gene complement. BAC end sequence data (514 reads, 299860 nt) indicated that the genome of B. glabrata contains ~ 63% AT, and disclosed several novel genes, transposable elements, and groups of high frequency sequence elements. This BG_BBa BAC library, available from AGI at cost to the research community, gains in relevance because BB02 strain B. glabrata is targeted whole genome sequencing by NHGRI.

Towards the Physical Map of the Trypanosoma cruzi Nuclear Genome: Construction of YAC and BAC Libraries of the Reference Clone T. cruzi CL-Brener

Strategies to construct the physical map of the Trypanosoma cruzi nuclear genome have to capitalize on three main advantages of the parasite genome, namely (a) its small size, (b) the fact that all chromosomes can be defined, and many of them can be isolated by pulse field gel electrophoresis, and (c) the fact that simple Southern blots of electrophoretic karyotypes can be used to map sequence tagged sites and expressed sequence tags to chromosomal bands. A major drawback to cope with is the complexity of T. cruzi genetics, that hinders the construction of a comprehensive genetic map. As a first step towards physical mapping, we report the construction and partial characterization of a T. cruzi CL-Brener genomic library in yeast artificial chromosomes (YACs) that consists of 2,770 individual YACs with a mean insert size of 365 kb encompassing around 10 genomic equivalents. Two libraries in bacterial artificial chromosomes (BACs) have been constructed, BACI and BACII. Both libraries represent about three genome equivalents. A third BAC library (BAC III) is being constructed. YACs and BACs are invaluable tools for physical mapping. More generally, they have to be considered as a common resource for research in Chagas disease

Desfolha artificial simulando danos de pragas na cultura do girassol (Helianthus annuus L., Asteraceae)

O girassol está sujeito às perdas de área foliar por diferentes fatores, dentre eles os insetos desfolhadores, contra aos quais geralmente são dirigidas aplicações de inseticidas na cultura. A desfolha artificial em plantas de importância econômica é uma metodologia útil na simulação de ataques dessas pragas em lavouras na determinação dos níveis de dano econômico. O objetivo deste estudo foi avaliar componentes de produção das plantas de girassol submetidas a níveis crescentes de desfolha de 0, 10, 25, 50, 75 e 100%, realizada em três distintos estádios fenológicos da cultura, a saber: V6 (seis folhas com no mínimo 4,0 cm de comprimento), R1 (quando a inflorescência circundada pela bráctea imatura torna-se visível) e R5.5 (50% das flores do disco estão fertilizadas ou em antese), perfazendo um total de 18 tratamentos, os quais foram dispostos em blocos ao acaso, com quatro repetições. Para todos os componentes de produção avaliados (diâmetro do capítulo, biomassa total de sementes da planta e biomassa de 100 aquênios) houve efeito significativo da interação dos tratamentos, evidenciando que o efeito da desfolha será dependente do estágio fenológico da planta. O estádio R5.5 foi mais sensível à desfolha, ocasionando perdas em todos os componentes de produção avaliados.

Dose inseminante utilizada na fertilização artificial de ovócito de piracanjuba (Brycon orbignyanus)

A piracanjuba (Brycon orbignyanus Valenciennes, 1849) é uma espécie de peixe migratória, ameaçada de extinção. O objetivo do presente estudo foi determinar a dose inseminante na fertilização artificial de ovócitos de piracanjuba. Para isso, utilizou-se delineamento em blocos casualizados, com quatro tratamentos e três repetições. Três casais de piracanjuba, selecionados dos tanques de reprodutores da Estação Ambiental de Itutinga (EAI - CEMIG), no período de piracema 2006/2007, receberam aplicação de hormônio extrato bruto de hipófise de carpa (EBHC) para obtenção dos gametas. Adotaram-se quatro tratamentos diferentes para a fertilização de 0,1 grama de ovócitos: 10µL, 20µL, 30µL e 40µL de sêmen. As amostras foram ativadas com 5 mL de água do próprio tanque e, em seguida, levadas para incubadoras, dotadas de renovação constante de água, à temperatura de 28ºC. Após 8 e 16 horas, analisaram-se as taxas de fertilização (ovos viáveis) e de eclosão dos ovos, respectivamente. Os resultados obtidos foram comparados pelo teste de Tukey a 5%. As relações sêmen-ovócitos testadas não alteraram as taxas de fertilização e eclosão (P>0,05). O número de espermatozoides-ovócitos, variando de 10,4 x10(5) a 41,6 x10(5), foi eficiente para obtenção de boas taxas de fertilidade.

Applications of artificial intelligence to condition-based maintenance

In this paper we discuss interesting developments of expert systems for machine diagnosis and condition-based maintenance. We review some elements of condition-based maintenance and its applications, expert systems for machine diagnosis, and an example of machine diagnosis. In the last section we note some problems to be resolved so that expert systems for machine diagnosis may gain wider acceptance in the future.

Aspectos ecológicos da leishmaniose tegumentar americana: 2. ecótopo artificial como abrigo de Psychodopygus intermedius e observações sobre alimentação e reprodução sob influência de fatores físicos naturais

As observações levadas a cabo em um galinheiro experimental mostraram que Psychodopygus intermedius tem a capacidade de nele abrigar-se. Para se chegar a este resultado, a metodologia utilizada consistiu na coleta total diurna e exame do estado de alimentação e digestão sangüínea dos Ps. intermedius como parâmetro da sua maior ou menor permanência no ecótopo estudado. Além disso, observou-se paralelamente, os tempos para o repasto sangüíneo, digestão completa, oviposição, sobrevivência e cópula sob a influência direta dos fatores físicos naturais. A importância epidemiológica dos resultados reside em novas elucidações experimentais sobre a viabilidade da transmissão da leshmaniose tegumentar ocorrer em ambiente domiciliar.

Opinião de médicos brasileiros sobre fecundação artificial do ponto de vista ético

Foi realizado levantamento da opinião dos médicos que compareceram ao "XIV Congresso Brasileiro de Reprodução Humana", sob o ponto de vista ético, a respeito da fecundação artificial. Foram analisados os resultados, chegando-se a selecionar alguns itens comportamentais como preliminarmente aceitos. Propõe-se a realização de estudos mais profundos que objetivam abordar os vários aspectos aceitos ou não pela sociedade.

Duration of larval and pupal development stages of Aedes albopictus in natural and artificial containers

Aedes albopictus were reared in different containers: a tree hole, a bamboo stump and an auto tire. The total times from egg hatching to adult emergence were of 19.6,27.3 and 37.5 days, respectively, according to the container. The first, second and third-instar larvae presented growth periods with highly similar durations. The fourth-instar larvae was longer than the others stages. The pupation time was longer than the fourth-instar larvae growth period. The temperature of the breeding sites studied, which was of 18° C to 22° C on average, was also taken into consideration. The mortality of the immature stages was analysed and compared as between the experimental groups; it was lower in the natural containers than in the discarded tire. The average wing length of adult females emerging from tree hole was significantly larger (p < 0.05) than that of those emerging from the tire.

Encontro de Aedes scapularis (Diptera: Culicidae) em criadouro artificial em localidade da região Sul do Brasil

Duas larvas de Aedes scapularis foram encontradas em um criadouro artificial, no Município de Sertaneja, Norte do Estado do Paraná, Brasil, durante atividade de rotina para o controle de vetores da dengue.

Epidemiology of bacterial meningitis among children in Brazil, 1997-1998

OBJECTIVE: To document the incidence and the descriptive epidemiology of bacterial meningitis among individuals under age 20 in a geographically defined region in Brazil during the two-year period immediately preceding the introduction of Haemophilus influenzae type b (Hib) vaccines into the national immunization program of Brazil. METHODS: Population-based epidemiological study of all cases of bacterial meningitis reported among residents of Campinas, Brazil, under age 20 (n=316,570) during the period of 1997-98, using comprehensive surveillance records compiled by the Campinas Health Department from cases reported among hospital inpatients, outpatients, emergency room visits, death certificates, and autopsy reports. RESULTS: The incidence of bacterial meningitis (n=274) was 334.9, 115 and 43.5 cases/10(5) person-years (pys) for residents of Campinas under age 1, 5 and 20, respectively. All cases were hospitalized, with an average length of stay of 12 days. Documented prior antibiotic use was 4.0%. The case-fatality rate of bacterial meningitis in individuals under age 20 was 9% (24/274) with 75% of deaths occurring in children under the age of five. The incidence of Hib meningitis (n=26) was 62.8 and 17 cases/10(5) pys in children age <1 and <5, respectively. CONCLUSIONS: The incidence of Hib meningitis in children under the age of 5 in Campinas during 1997-98 was similar to that reported in the US, Western Europe, and Israel prior to widespread Hib vaccine use in those regions. This study provides a baseline for later studies to evaluate changes in the etiology and incidence of bacterial meningitis in children after introduction of routine Hib vaccination in Brazil.

Rede neural artificial para detecção de sobremortalidade atribuível à cólera no Ceará

OBJETIVO: Avaliar as redes neurais recorrentes enquanto técnica preditiva para séries temporais em saúde. MÉTODOS: O estudo foi realizado durante uma epidemia de cólera ocorrida no Estado do Ceará, em 1993 e 1994, a partir da sobremortalidade tendo como causa básica as infecções intestinais mal definidas (CID-9). O número mensal de óbitos por essa causa, referente ao período de 1979 a 1995 no Estado do Ceará, foram obtidos do Sistema de Informação de Mortalidade (SIM) do Ministério da Saúde. Estruturou-se uma rede com dois neurônios na camada de entrada, 12 na camada oculta, um neurônio na camada de saída e um na camada de memória. Todas as funções de ativação eram a função logística. O treinamento foi realizado pelo método de backpropagation, com taxa de aprendizado de 0,01 e momentum de 0,9, com dados de janeiro de 1979 a junho de 1991. O critério para fim do treinamento foi atingir 22.000 epochs. Compararam-se os resultados com os de um modelo de regressão binomial negativa. RESULTADOS: A predição da rede neural a médio prazo foi adequada, em dezembro de 1993 e novembro e dezembro de 1994. O número de óbitos registrados foi superior ao limite do intervalo de confiança. Já o modelo regressivo detectou sobremortalidade a partir de março de 1992. CONCLUSÕES: A rede neural se mostrou capaz de predição, principalmente no início do período, como também ao detectar uma alteração concomitante e posterior à ocorrência da epidemia de cólera. No entanto, foi menos precisa do que o modelo de regressão binomial, que se mostrou mais sensível para detectar aberrações concomitantes à circulação da cólera.

Bacterial agents isolated from cerebrospinal fluid of patients with Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS) and neurological complications

Cerebrospinal fluid (CSF) samples from 2083 patients with acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) and neurological complications were bacteriologically examined during a period of 7 years (1984-1990). The percentage of patients who had at least one bacterial agent cultured from the CSF was 6.2%. Mycobacterium tuberculosis was the most frequently isolated agent (4.3%), followed by Mycobacterium avium complex or MAC (0.7%), Pseudomonas spp (0.5%), Enterobacter spp (0.4%), and Staphylococcus aureus (0.3%). Among 130 culture positive patients, 89 (68.5%) had M. tuberculosis and 15 (11.6%) had MAC. The frequency of bacterial isolations increased from 1988 (5.2%) to 1990 (7.2%), partly due to the increase in MAC isolations. Bacterial agents were more frequently isolated from patients in the age group 21-30 years and from women (p<0.05).

Dot-enzyme-linked immunosorbent assay (Dot-ELISA) for detection of pneumococcal polysaccharide antigens in pleural fluid effusion samples.: Comparison with bacterial culture, counterimmunoelectrophoresis and latex agglutination

A dot-enzyme-linked immunosorbent assay (Dot-ELISA) for pneumococcal antigen detection was standardized in view of the need for a rapid and accurate immunodiagnosis of acute pneumococcal pneumonia. A total of 442 pleural fluid effusion samples (PFES) from children with clinical and laboratory diagnoses of acute bacterial pneumonia, plus 38 control PFES from tuberculosis patients and 20 negative control serum samples from healthy children were evaluated by Dot-ELISA. The samples were previously treated with 0.1 M EDTA pH 7.5 at 90°C for 10 min and dotted on nitrocellulose membrane. Pneumococcal omniserum diluted at 1:200 was employed in this assay for antigen detection. When compared with standard bacterial culture, counterimmunoelectrophoresis and latex agglutination techniques, the Dot-ELISA results showed relative indices of 0.940 to sensitivity, 0.830 to specificity and 0.760 to agreement. Pneumococcal omniserum proved to be an optimal polyvalent antiserum for the detection of pneumococcal antigen by Dot-ELISA. Dot-ELISA proved to be a practical alternative technique for the diagnosis of pneumococcal pneumonia.

Bacterial antigen detection in cerebrospinal fluid by the latex agglutination test

Eighty purulent cerebrospinal fluid (CSF) samples from patients with clinical evidence of meningitis were studied using the Directigen latex agglutination (LA) kit to determine the presence of bacterial antigen in CSF. The results showed a better diagnostic performance of the LA test than bacterioscopy by Gram stain, culture and counterimmunoelectrophoresis (CIE), as far as Neisseria meningitidis groups B and C, and Haemophilus influenzae type b are concerned, and a better performance than bacterioscopy and culture considering Streptococcus pneumoniae. Comparison of the results with those of culture showed that the LA test had the highest sensitivity for the Neisseria meningitidis group C. Comparing the results with those of CIE, the highest levels of sensitivity were detected for N. meningitidis groups B and C. Regarding specificity, fair values were obtained for all organisms tested. The degree of K agreement when the LA test was compared with CIE exhibited better K indices of agreement for N. meningitidis groups B and C.