8 resultados para ALU
em Scielo Saúde Pública - SP
Resumo:
OBJETIVO: Este estudo avaliou a contribuição de seis polimorfismos genéticos presentes em genes do sistema renina-angiotensina-aldosterona (SRAA) e fatores de risco clínicos para o desenvolvimento da hipertensão arterial essencial em um município da região Amazônica. MÉTODOS: Oitenta e dois indivíduos hipertensos e setenta e oito indivíduos normotensos foram genotipados quanto à presença de polimorfismos REN-G1051A (renina), AGT-M235T (angiotensinogênio), ECA-Alu I/D (enzima conversora de angiotensina I), AGTR1-A1166C (receptor tipo 1 da angiotensina II) e CYP11B2-C344T (aldosterona sintetase) pela técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR), com análise de restrição quando necessário. A influência de polimorfismos genéticos e fatores de risco clínicos na variação da pressão arterial foi avaliada por meio de regressão linear stepwise. RESULTADOS: Relatamos a co-ocorrência de fatores de risco clínicos e polimorfismo do gene da enzima conversora de angiotensina (ECA) na população de um município da região amazônica. Nossos resultados mostram que a elevação da pressão arterial sistólica é favorecida pelo alelo D do polimorfismo de inserção/deleção do gene da ECA e pelo aumento da idade, enquanto consumo de bebida alcoólica e envelhecimento estão associados ao aumento da pressão arterial diastólica (PAD). CONCLUSÃO: Esses achados indicam que os moradores de Santa Isabel do Rio Negro que possuem o alelo D da ECA ou têm o hábito de beber apresentam valores mais elevados de PAS e PAD, respectivamente, com o passar dos anos.
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The freshwater snails Biomphalaria straminea, B. intermedia, B. kuhniana and B. peregrina, are morphologically similar; based on this similarity the first three species were therefore grouped in the complex B. straminea. The morphological identification of these species is based on characters such as vaginal wrinkling, relation between prepuce: penial sheath:deferens vas and number of muscle layers in the penis wall. In this study the polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism technique was used for molecular identification of these molluscs. This technique is based on the amplification of the internal transcribed spacer regions ITS1 e ITS2 of the ribosomal RNA gene and subsequent digestion of these fragments by restriction enzymes. Six enzymes were tested: Dde I, Mnl I, Hae III, Rsa I, Hpa II e Alu I. The restriction patterns obtained with DdeI presented the best profile for separation of the four species of Biomphalaria. The profiles obtained with all the enzymes were used to estimate the genetic distances among the species through analysis of common banding patterns.
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We evaluated the Plasmodium vivax polymorphism by studying the Pvmsp-3 gene's polymorphic region by PCR-RFLP in 55 samples from patients living in Tierralta, Colombia. Three different sizes of the Pvmsp-3 gene were found, type A (1,900 bp), type B (1,500 bp) and type C (1,100 bp); most of the samples were type A (96.4 %). The Pvmsp-3 gene exhibited high polymorphism. Seven restriction patterns were found when using Alu I, and nine were found with Hha I; 12 different alleles were obtained when these patterns were combined. The findings suggest that this gene could be used in Colombia as a molecular epidemiologic marker for genotyping P. vivax.
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An analysis of the dietary content of haematophagous insects can provide important information about the transmission networks of certain zoonoses. The present study evaluated the potential of polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis of the mitochondrial cytochrome B (cytb) gene to differentiate between vertebrate species that were identified as possible sources of sandfly meals. The complete cytb gene sequences of 11 vertebrate species available in the National Center for Biotechnology Information database were digested with Aci I, Alu I, Hae III and Rsa I restriction enzymes in silico using Restriction Mapper software. The cytb gene fragment (358 bp) was amplified from tissue samples of vertebrate species and the dietary contents of sandflies and digested with restriction enzymes. Vertebrate species presented a restriction fragment profile that differed from that of other species, with the exception of Canis familiaris and Cerdocyon thous. The 358 bp fragment was identified in 76 sandflies. Of these, 10 were evaluated using the restriction enzymes and the food sources were predicted for four: Homo sapiens (1), Bos taurus (1) and Equus caballus (2). Thus, the PCR-RFLP technique could be a potential method for identifying the food sources of arthropods. However, some points must be clarified regarding the applicability of the method, such as the extent of DNA degradation through intestinal digestion, the potential for multiple sources of blood meals and the need for greater knowledge regarding intraspecific variations in mtDNA.
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The natural occurrence of Pseudomonas syringae pv. tabaci causing leaf spot symptoms in papaya seedlings is reported. The pathogen was identified through biochemical, physiological, serological, and molecular assays and artificial inoculations in papaya plants. It was also shown that the strains were pathogenic to bean and tobacco plants. The restriction patterns obtained with Afa I, Alu I, Dde I, Hae III, Hpa II, Hinf I, Sau 3A I and Taq I of the PCR-RFLP of 16S-23S DNAr were identical to the P. s. pv. tabaci patterns. Primers corresponding to hrpL gene of P. syringae were also tested and the results grouped the papaya strains with P s. pv. tabaci. Bacterial strains were deposited at Coleção de Culturas IBSBF, Instituto Biológico, Campinas, Brazil, under access numbers 1687 and 1822.
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OBJETIVO: o objetivo do estudo foi verificar a prevalência do polimorfismo denominado PROGINS no gene do receptor de progesterona entre mulheres com endometriose em seus diferentes estádios. MÉTODOS: estudo caso-controle desenvolvido entre novembro de 2003 e maio de 2004. Foram analisados os genótipos de 104 mulheres, das quais 66 com endometriose comprovada por videolaparoscopia (26 mulheres nos estádios I-II e 40 nos estádios III-IV) e 38 saudáveis. A inserção Alu de 306 pares de base no intron G do gene do receptor de progesterona denominada PROGINS foi detectada por meio de reação em cadeia da polimerase e analisada em gel de agarose 2% corado com brometo de etídio. Para análise estatística foi utilizado o teste ANOVA paramétrico. RESULTADOS: as amostras pertencentes aos grupos endometriose estádios I-II (grupo EndoI) e estádios III-IV (grupo EndoII) tiveram significativo aumento na incidência do alelo polimórfico do receptor de progesterona em relação ao grupo controle: 27% no grupo EndoI, 38% no EndoII e apenas 18% no grupo controle (p < 0,001). A prevalência da inserção, quando comparamos mulheres com endometriose, independente do estádio, com as do grupo controle, foi estatisticamente superior no grupo das doentes (p = 0,0385). CONCLUSÃO: há associação estatisticamente significante entre o polimorfismo PROGINS e a endometriose pélvica.
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OBJETIVOS: analisar a correlação entre o polimorfismo PROGINS e o câncer de mama. MÉTODOS: estudo caso-controle desenvolvido entre abril e outubro de 2004 com o pareamento de 50 mulheres com diagnóstico histopatológico de carcinoma de mama e 49 mulheres saudáveis. A inserção Alu de 306 pares de base no intron G do gene do receptor da progesterona denominada PROGINS foi detectada por meio de reação em cadeia da polimerase e analisada em gel de agarose 2% corado com brometo de etídio. Os grupos controle e experimental foram comparados, por meio de programa estatístico Epi-Info 6.0, quanto aos genótipos e às freqüências alélicas, utilizando-se o teste do chi2. RESULTADOS: em relação ao PROGINS encontramos uma prevalência na população estudada de 62 (62,6%) indivíduos homozigotos selvagens, 35 (35,3%) de heterozigotos e dois (2,1%) casos com a presença da mutação. Não foi evidenciada diferença significante em relação ao polimorfismo PROGINS, quando comparados os casos e controles, seja com relação à homozigose (62 vs 65,3%), heterozigose (36 vs 34,6%) ou à presença de mutação (2,0 vs 2,1%), com p de 0,920 (OR=1,01), 0,891 (OR=1,06) e 0,988 (OR=1,10), respectivamente. CONCLUSÕES: os resultados mostraram que o polimorfismo PROGINS não conferiu risco substancial de câncer de mama em seus portadores.
Resumo:
Familial hypercholesterolemia (FH) is a common autosomal disorder that affects about one in 500 individuals in most Western populations and is caused by a defect in the low-density-lipoprotein receptor (LDLr) gene. In this report we determined the molecular basis of FH in 59 patients from 31 unrelated Brazilian families. All patients were screened for the Lebanese mutation, gross abnormalities of the LDLr gene, and the point mutation in the codon 3500 of the apolipoprotein B-100 gene. None of the 59 patients presented the apoB-3500 mutation, suggesting that familial defective ApoB-100 (FDB) is not a major cause of inherited hypercholesterolemia in Brazil. A novel 4-kb deletion in the LDLr gene, spanning from intron 12 to intron 14, was characterized in one family. Both 5' and 3' breakpoint regions were located within Alu repetitive sequences, which are probably involved in the crossing over that generated this rearrangement. The Lebanese mutation was detected in 9 of the 31 families, always associated with Arab ancestry. Two different LDLr gene haplotypes were demonstrated in association with the Lebanese mutation. Our results suggest the importance of the Lebanese mutation as a cause of FH in Brazil and by analogy the same feature may be expected in other countries with a large Arab population, such as North American and Western European countries.