Re-mapping the molecular features of the human immunodeficiency virus type 1 and human T-cell lymphotropic virus type 1 Brazilian sequences using a bioinformatics unit established in Salvador, Bahia, Brazil, to give support to the viral epidemiology studies

The analysis of genetic data for human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) is essential to improve treatment and public health strategies as well as to select strains for vaccine programs. However, the analysis of large quantities of genetic data requires collaborative efforts in bioinformatics, computer biology, molecular biology, evolution, and medical science. The objective of this study was to review and improve the molecular epidemiology of HIV-1 and HTLV-1 viruses isolated in Brazil using bioinformatic tools available in the Laboratório Avançado de Sáude Pública (Lasp) bioinformatics unit. The analysis of HIV-1 isolates confirmed a heterogeneous distribution of the viral genotypes circulating in the country. The Brazilian HIV-1 epidemic is characterized by the presence of multiple subtypes (B, F1, C) and B/F1 recombinant virus while, on the other hand, most of the HTLV-1 sequences were classified as Transcontinental subgroup of the Cosmopolitan subtype. Despite the high variation among HIV-1 subtypes, protein glycosylation and phosphorylation domains were conserved in the pol, gag, and env genes of the Brazilian HIV-1 strains suggesting constraints in the HIV-1 evolution process. As expected, the functional protein sites were highly conservative in the HTLV-1 env gene sequences. Furthermore, the presence of these functional sites in HIV-1 and HTLV-1 strains could help in the development of vaccines that pre-empt the viral escape process.

Detection of diarrheagenic Escherichia coli from children with and without diarrhea in Salvador, Bahia, Brazil

We identified different diarrheagenic (DEC) Escherichia coli pathotypes isolated from 1,207 children with and without acute endemic diarrhea in Salvador, Bahia, Brazil collected as part of a case-control study. Since the identification of DEC cannot be based on only biochemical and culture criteria, we used a multiplex polymerase chain reaction developed by combining five specific primer pairs for Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC), Shiga toxin-producing E. coli/ Enterohaemorrhagic E. coli (STEC/EHEC), Enterotoxigenic E. coli (ETEC) and Enteroaggregative E. coli (EAEC) to detect these pathotypes simultaneously in a single-step reaction. In order to distinguish typical and atypical EPEC strains, these were tested for the presence of EAF plasmid. The prevalence of diarrheagenic E. coli in this sample of a global case-control study was 25.4% (259 patients) and 18.7% (35 patients) in the diarrhea group (1,020 patients) and the control group (187 patients), respectively. The most frequently isolated pathotype was EAEC (10.7%), followed by atypical EPEC (9.4%), ETEC (3.7%), and STEC (0.6%). Typical EPEC was detected only in one sample. The prevalence of the pathotypes studied in children with diarrhea was not significantly different from that in children without diarrhea.

Current situation of Chagas disease in Central America

Chagas disease in Central America is known since 1913 when the first human case was reported in El Salvador. The other Central American countries reported their first cases between 1933 and 1967. On October 1997 was launched the Central American Initiative for Chagas Disease Control (IPCA). The objectives of this sub-regional Initiative are: (1) the elimination of Rhodnius prolixus in Central America; (2) the reduction of the domiciliary infestation of Triatoma dimidiata; and (3) the elimination of the transfusion transmission of Trypanosoma cruzi. Significant advancements being close to the elimination of R. prolixus in Central America and the control of the transfusion transmission has been a transcendent achievement for the sub-region. The main challenges that the IPCA will have in the close future are: developing effective strategies for control and surveillance of T. dimidiata; and surveillance of other emerging triatominae species like R. pallescens, T. nitida, and T. ryckmani.

Prevalence and genotypes of hepatitis C virus among injecting drug users from Salvador-BA, Brazil

Hepatitis C virus (HCV) is the major infectious disease agent among injecting drug users (IDUs), with seroprevalence ranging from 50-90%. In this paper, serological and virological parameters were investigated among 194 IDUs, 94 ex-IDUs and 95 non-IDUs that were sampled by the "snowball" technique in three localities renowned for both intense drug use and trafficking activities in Salvador, Brazil. The majority of the participants were male, but sex and mean age differed significantly between IDUs/ex-IDUs and non-IDUs (p < 0.05). Anti-HCV screening revealed that 35.6%, 29.8% and 5.3% of samples from IDUs, ex-IDUs and non-IDUs, respectively, were seropositive. HCV-RNA detection confirmed that the prevalence of infection was 29.4%, 21.3% and 5.3% for IDUs, ex-IDUs and non-IDUs, respectively. Genotyping analysis among IDUs/ex-IDUs determined that 76.9% were infected with genotype 1, 18.5% with genotype 3 and 4.6% with a mixed genotype; this result differed significantly from non-IDUs, where genotype 3 was the most frequent (60%), followed by genotype 1 (20%) and a mixed genotype (20%). We report a significantly higher prevalence of HCV infection in IDUs/ex-IDUs compared to the control group (p < 0.001). Although the sample size of our study was small, the differences in HCV genotype distribution reported herein for IDUs/ex-IDUs and non-IDUs warrant further investigation.

Elimination of Rhodnius prolixus in El Salvador, Central America

Epidemiological studies performed in El Salvador between 1955-1972 demonstrated a high frequency of two triatomine vectors (Triatoma dimidiata and Rhodnius prolixus). However, the frequency of R. prolixus decreased by 1976 and this species has not been found since 1995. The main factors influencing the elimination of R. prolixus in El Salvador are discussed in this paper.

Epidemiological aspects of influenza A related to climatic conditions during and after a pandemic period in the city of Salvador, northeastern Brazil

During the influenza pandemic of 2009, the A(H1N1)pdm09, A/H3N2 seasonal and influenza B viruses were observed to be co-circulating with other respiratory viruses. To observe the epidemiological pattern of the influenza virus between May 2009-August 2011, 467 nasopharyngeal aspirates were collected from children less than five years of age in the city of Salvador. In addition, data on weather conditions were obtained. Indirect immunofluorescence, real-time transcription reverse polymerase chain reaction (RT-PCR), and sequencing assays were performed for influenza virus detection. Of all 467 samples, 34 (7%) specimens were positive for influenza A and of these, viral characterisation identified Flu A/H3N2 in 25/34 (74%) and A(H1N1)pdm09 in 9/34 (26%). Influenza B accounted for a small proportion (0.8%) and the other respiratory viruses for 27.2% (127/467). No deaths were registered and no pattern of seasonality or expected climatic conditions could be established. These observations are important for predicting the evolution of epidemics and in implementing future anti-pandemic measures.

Acute Chagas disease in El Salvador 2000-2012 - Need for surveillance and control

Several parasitological studies carried out in El Salvador between 2000-2012 showed a higher frequency of acute cases of Chagas disease than that in other Central American countries. There is an urgent need for improved Chagas disease surveillance and vector control programs in the provinces where acute Chagas disease occurs and throughout El Salvador as a whole.

Tabagismo: conhecimentos, atitudes, hábitos e grau de dependência de jovens fumantes em Salvador

O estudo objetivou avaliar o grau de dependência ao cigarro e caracterizar dados sócio-demográficos, conhecimentos, hábitos e atitudes de jovens fumantes. Responderam um questionário 102 estudantes de Salvador, sendo 11 tabagistas. A idade média dos fumantes foi 18,2 anos e de experimentação do cigarro 13,4 anos. Houve predomínio de homens, jovens no 1.º ano colegial, de cor parda e entes próximos fumantes. A maioria recebeu orientação familiar e escolar sobre os prejuízos do fumo, mas poucos sabiam dos benefícios de parar de fumar. Quase metade fumava há mais de três anos e iniciou o hábito por curiosidade. Mais da metade fumava um cigarro por dia, com baixo teor de nicotina, comprava o cigarro em lojas, desejava parar de fumar, já fez tentativas, mas nunca parou. O grau de dependência foi baixo para a maioria dos jovens. O estudo oferece pistas para enfermeiras atuarem junto aos jovens no controle do tabagismo.

Necessidades de mulheres no puerpério imediato em uma maternidade pública de Salvador, Bahia, Brasil

Objetivando identificar as necessidades de puérperas que demandam cuidados de enfermagem e compreender como elas percebem os cuidados de enfermagem durante sua permanência no Alojamento Conjunto, realizamos uma pesquisa descritiva com dados qualitativos, orientados pela perspectiva de gênero. Entrevistamos 25 mulheres que se encontravam internadas em unidade de Alojamento Conjunto de uma maternidade pública de Salvador-Bahia. A análise de conteúdo na modalidade temática conduziu-nos à apreensão de duas categorias: a necessidade de acolhimento e necessidade de cuidados físicos. O resultado deste estudo aponta para a necessidade de modificações na prática e no modo de cuidar da enfermagem, não somente nos procedimentos técnicos, mas também na incorporação de valores e iniciativas humanizadoras do cuidado.

A implantação do projeto de atendimento Móvel de Urgência em Salvador/BA: panorama e desafios

O estudo objetivou relatar a experiência na implantação e estruturação do projeto do Serviço Móvel de Urgência (SAMU-192), em Salvador, cujas bases legais foram portarias do Ministério da Saúde e a Norma Operacional de Assistência à Saúde 02/2002. O serviço tem como finalidade prestar assistência gratuita ao indivíduo, em um primeiro nível de atenção, com agravos de natureza clínica, cirúrgica, traumática e psiquiátrica que acarretam sofrimento, seqüelas ou morte e ocorrem fora do ambiente hospitalar. O objetivo específico foi garantir o atendimento às situações de urgência e emergência por meio do SAMU-192, regulado, hierarquizado e integrado ao Sistema Único de Saúde, assegurando recursos públicos inclusive integrados à rede complementar de assistência. Despesas para sua instalação foram pactuadas no município e em comissões intergestoras federal e estadual. Os desafios do serviço incluem educação comunitária, capacitação profissional, avaliação de recursos humanos e materiais, na dinâmica e qualidade da atenção.

Comunidade de Euglossini (Hymenoptera, Apidae) das dunas litorâneas do Abaeté, Salvador, Bahia, Brasil

Community of Euglossini (Hymenoptera, Apidae) from the coastal sand dunes of Abaeté, Salvador, Bahia, Brazil. The Euglossini community structure was analyzed by attracting males with the scents eucalyptol, eugenol, vanillin, benzyl benzoate and methyl salicylate, and by netting bees on flowers. The samplings took place three times a month along one year from 6:00 a.m. to 6:00 p.m. The scent baits attracted 670 individuals belonging to seven species of three genus. The predominant species were Euglossa cordata (Linnaeus, 1758) (76.6%) and Eulaema nigrita Lepeletier, 1841 (21.8%). Euglossini males visited the scents along the whole year, being more abundant in May and in August. The most efficient fragrance was eucalyptol, attracting 624 individuals of five species. The males abundance fluctuated along the day, being the highest frequency observed between 8:00 a.m. to 10:00 a.m. Forty eigth Euglossini females of four species were netted visiting flowers of 14 plant species belonging to 13 families. Solanaceae and Caesalpiniaceae were the most visited. The species catched on flowers were Euglossa cordata, Eulaema nigrita, Euplusia mussitans (Fabricius, 1787) and Eulaema meriana flavescens Friese 1899. Euglossa cordata was the predominant species on flowers (64.6%), being collected during almost the whole year. Euplusia mussitans was the only species netted on flowers which males were not sampled on the scents.

Direito à memória das comunidades tradicionais: organização de acervo nos terreiros de candomblé de Salvador, Bahia

Este artigo conta a experiência da instituição Koinonia Presença Ecumênica e Serviço na realização de Oficinas de Direito à Memória, com ênfase na organização de acervos com comunidades tradicionais de terreiros de candomblé de diferentes nações, localizados em Salvador, Bahia.

Efeitos da poluição atmosférica (litorânea e industrial) em isoladores da rede elétrica da região metropolitana de Salvador

The performances of eight kinds of insulators from electrical distribution lines in Salvador-BA, Brazil, were evaluated considering the chemical and physical local environmental pollution. The parameters that were chosen as characteristic for the insulators' properties were leakage current and partial electrical discharge. A data storage processing system and a communication link to the lab were built for data acquisition. The results show that the main contribution to the poor performance of the insulators is settleable magnetite particulate matter on the insulator in addition to the long term wetness time, t4.

Prevenção da transmissão vertical do HIV: atitude dos obstetras em Salvador, Brasil

OBJETIVO: avaliar as atitudes e conhecimento dos obstetras das maternidades públicas da cidade de Salvador (MPS) sobre as recomendações do Ministério da Saúde para a profilaxia da transmissão vertical do vírus humano da imunodeficiência (HIV) e terapia antiretroviral em gestantes. Avaliou-se também a influência das condições de trabalho, disponibilidade da testagem rápida e da terapia antiretroviral em relação à aplicação destas recomendações. MÉTODOS: realizou-se um estudo de corte transversal entre agosto e novembro de 2005, envolvendo 129/152 (85%) dos obstetras de todas as MPS. Utilizou-se como instrumento um questionário anônimo, estruturado e auto-explicativo, com questões sobre as características da população, condições de trabalho e disponibilidade de insumos, conhecimento e atitudes relacionadas ao aconselhamento e testagem para o HIV e condutas com as pacientes (uso da zidovudina (AZT), reconhecimento de fatores de risco, escolha e manejo da via de parto e cuidados no puerpério). RESULTADOS: dos obstetras, 69% referiram conhecer integralmente as recomendações do Ministério da Saúde; 90,7% concordaram com a solicitação compulsória da testagem rápida para o HIV; 63,6% escolheram a cesariana para via de parto; 38% contra-indicaram o parto por via vaginal; 37,5% recomendaram isolamento das pacientes soropositivas e 58,1% indicaram laqueadura tubária. A maioria (90%) dos sujeitos referiram a existência de fatores prejudiciais à aplicabilidade das recomendações, sendo que os mais apontados foram a realização inadequada e a indisponibilidade das informações do pré-natal na admissão. Embora a testagem rápida estivesse disponível, apenas um terço dos entrevistados afirmou que o resultado estava sempre disponível em tempo hábil. CONCLUSÕES: algumas atitudes relacionadas à assistência à gestante com HIV foram discordantes das recomendações do Ministério da Saúde. Na opinião dos entrevistados a inadequação do pré-natal e a indisponibilidade do resultado da testagem rápida influenciam negativamente na aplicação das recomendações para profilaxia da transmissão vertical do HIV.

Diagnóstico de raiva no Rio Grande do Sul, Brasil, de 1985 a 2007

São apresentados os resultados de 23 anos de diagnósticos de raiva realizados no Instituto de Pesquisas Veterinárias Desidério Finamor, no Estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Entre os anos de 1985 e 2007, um total de 23.460 amostras foram diagnosticadas no laboratório, compreendendo cerca de 95% do número total de amostras submetidas ao diagnóstico laboratorial de raiva no Estado. A metodologia utilizada seguiu técnicas padrões como a imunofluorescência direta (IFD) e inoculação em camundongos (IC). Não ocorreram casos de raiva humana no período. O vírus rábico (VR) foi detectado em 739 (3,1%) amostras, sendo 656 (88,7%) de origem bovina. O vírus foi também identificado em 23 caninos (3,1%), 21 eqüinos (2,9%), 29 quirópteros (4,0%), 4 felinos (0,5%), 3 ovinos (0,4%), 2 suínos (0,27%) e em um animal selvagem de espécie indeterminada (0,13%). O último caso de raiva em cães associado com variantes do vírus endêmicas nessa espécie foi diagnosticado em 1988. Dois episódios de contaminação incidental registrados em um felino em 2001 e em um canino em 2007, associados com variantes do vírus prevalentes em morcegos. Em relação à raiva bovina, os dados aqui apresentados revelam uma marcante diminuição no número de casos de raiva nessa espécie, em comparação com registros prévios. Por outro lado, um aumento no número de casos de raiva em morcegos hematófagos e não hematófagos vem sendo observado; no entanto, não é possível associar este aumento com modificações nas relações vírus/hospedeiro, pois o número de morcegos submetidos para diagnóstico tem igualmente aumentado. Isto provavelmente reflete o aumento do conhecimento sobre o papel de morcegos no ciclo de transmissão, e não necessariamente alterações no vírus e/ou nos hospedeiros.