Polymerase chain reaction with two molecular targets in mucosal leishmaniasis' diagnosis: a validation study

We validated the polymerase chain reaction (PCR) with a composite reference standard in 61 patients clinically suspected of having mucosal leishmaniasis, 36 of which were cases and 25 were non-cases according to this reference standard. Patient classification and test application were carried out independently by two blind observers. One pair of primers was used to amplify a fragment of 120 bp in the conserved region of kDNA and another pair was used to amplify the internal transcript spacers (ITS) rDNA. PCR showed 68.6% (95% CI 59.2-72.6) sensitivity and 92% (95% CI 78.9-97.7) specificity; positive likelihood ratio: 8.6 (95% CI 2.8-31.3) and negative likelihood ratio: 0.3 (95% CI 0.3-0.5), when kDNA molecular target was amplified. The test performed better on sensitivity using this target compared to the ITS rDNA molecular target which showed 40% (95% CI 31.5-42.3) sensitivity and 96% (95% CI 84.1-99.3) specificity; positive likelihood ratio: 10 (95% CI 2.0-58.8) and negative likelihood ratio: 0.6 (95% CI 0.6-0.8). The inter-observer agreement was excellent for both tests. Based upon results obtained and due to low performance of conventional methods for diagnosing mucosal leishmaniasis, we consider PCR with kDNA as molecular target is a useful diagnostic test and the ITS rDNA molecular target is useful when the aim is to identify species.

Stool sample storage conditions for the preservation of Giardia intestinalis DNA

Stool is chemically complex and the extraction of DNA from stool samples is extremely difficult. Haemoglobin breakdown products, such as bilirubin, bile acids and mineral ions, that are present in the stool samples, can inhibit DNA amplification and cause molecular assays to produce false-negative results. Therefore, stool storage conditions are highly important for the diagnosis of intestinal parasites and other microorganisms through molecular approaches. In the current study, stool samples that were positive for Giardia intestinalis were collected from five different patients. Each sample was stored using one out of six different storage conditions [room temperature (RT), +4ºC, -20ºC, 70% alcohol, 10% formaldehyde or 2.5% potassium dichromate] for DNA extraction procedures at one, two, three and four weeks. A modified QIAamp Stool Mini Kit procedure was used to isolate the DNA from stored samples. After DNA isolation, polymerase chain reaction (PCR) amplification was performed using primers that target the β-giardin gene. A G. intestinalis-specific 384 bp band was obtained from all of the cyst-containing stool samples that were stored at RT, +4ºC and -20ºC and in 70% alcohol and 2.5% potassium dichromate; however, this band was not produced by samples that had been stored in 10% formaldehyde. Moreover, for the stool samples containing trophozoites, the same G. intestinalis-specific band was only obtained from the samples that were stored in 2.5% potassium dichromate for up to one month. As a result, it appears evident that the most suitable storage condition for stool samples to permit the isolation of G. intestinalis DNA is in 2.5% potassium dichromate; under these conditions, stool samples may be stored for one month.

Liderança no contexto da enfermagem

A liderança é uma das ferramentas imprescindível no processo de trabalho do enfermeiro. Este estudo teve como objetivos fazer um levantamento bibliográfico sobre liderança no contexto da enfermagem e caracterizar tal produção científica encontrada, com base nas variáveis: ano, local de publicação e categorização dos temas. Tratou-se de uma revisão de literatura realizada on-line na base de dados LILACS, considerando periódicos, dissertações e teses disponíveis em língua portuguesa e espanhola, nos últimos vinte anos. Dos 31 trabalhos selecionados, 17 (54,8%) em revista de enfermagem internacional, 10 artigos (32,2%) foram publicados em periódicos de enfermagem nacional, 3 dissertações de mestrado (9,8%) e 1 tese de livre-docência (3,2%), com maior predomínio de divulgação entre 1997 e 1998 (22,6%). Ao categorizar as referências teve-se: 14 trabalhos (45,2%) sobre estilo de liderança exercido pelos enfermeiros, 15 (48,4%) reflexões sobre liderança e 2 publicações (6,4%) discorrendo a respeito de liderança e comunicação.

Interaction between Telenomus remus and Trichogramma pretiosum in the management of Spodoptera spp.

Interaction betweeen Telenomus remus and Trichogramma pretiosum in the management of Spodoptera spp. The use of egg parasitoids is a promising strategy for Integrated Pest Management (IPM), but different species of parasitoids have greater or lesser control efficiency, depending on the pest species. Recently, not only Anticarsia gemmatalis and Pseudoplusia includens but also Spodoptera cosmioides and S. eridania have been among the key Lepidoptera larvae attacking soybeans. This study evaluated the combination of Telenomus remus and Trichogramma pretiosum for parasitism of eggs of the Spodoptera complex, for better control efficiency and broader spectrum of action among the key pests of soybeans. The experiment was carried out under controlled environmental conditions (25 ± 2ºC; 70 ± 10% RH; and 14 h photophase) in a completely randomized experimental design with seven treatments and 10 replicates with S. frugiperda, S. cosmioides and S. eridania eggs. Each replicate consisted of one egg mass of each Spodoptera species, with approximately 100 eggs offered to the parasitoids. The treatments were: 1) 10 females of T. pretiosum; 2) nine females of T. pretiosum and one female of T. remus; 3) eight females of T. pretiosum and two females of T. remus; 4) seven females of T. pretiosum and three females of T. remus; 5) six females of T. pretiosum and four females of T. remus; 6) five females of T. pretiosum and five females of T. remus, and 7) 10 females of T. remus. The parameter evaluated was the percentage of parasitized eggs. Results showed that treatments combining both parasitoid species with only 1 T. remus for each 9 T. pretiosum (10%) and only 2 T. remus for each 8 T. pretiosum (20%) were enough to significantly increase the parasitism observed on eggs of S. cosmioides and S. frugiperda, respectively. This association of T. pretiosum and T. remus in different proportions is very promising for biological control in IPM programs because it provides wide spectrum of control.

Energy substrate used by workers of leaf-cutting ants during nest excavation

Energy substrate used by workers of leaf-cutting ants during nest excavation. In this study we aimed to ascertain whether leaf-cutting ant workers lose body reserves (fat or sugars) as a function of nest excavation. For each treatment, we isolated 10 workers of Atta sexdens into two experimental groups, Control (C- without excavation) and Soil (S- with excavation), which were kept for different time intervals (0, 24, 48 or 72 hours), totaling 700 tested workers. We then determined the concentration of soluble carbohydrates and total lipid content in them. The total carbohydrates were determined colorimetrically, based on the reaction between carbohydrates and sulfuric acid-phenol. For determination of lipids, the insects were immersed in organic solvent until they reached a constant weight. Our results showed that carbohydrates are consumed during nest excavation activities. In the experimental groups S24, S48 and S72, there was an average reduction of 5.82 (20.42%), 14.31 (44.96%) and 13.27 (43.96%) µ.mg-1 in soluble sugar when compared with the experimental groups that did not excavate. Furthermore, the lipids were not used during this activity. With respect to dry mass of the workers, their values were C0 = 8%, C24 = 10.4%, C48 = 9.2%, C72 = 10%, S24 = 9.2%, S48 = 8.7% and S72 = 8.5%. Our results show experimentally that the source of energy for nest excavation is carbohydrates, whereas lipids are conserved for other activities.

Propágulos de fungos micorrízicos arbusculares em solos deficientes em fósforo sob diferentes usos, da região semi-arida no nordeste do Brasil

A conversão de áreas de caatinga em agricultura e pecuária de subsistência é uma das características marcantes da região semi-árida do Nordeste do Brasil. O presente estudo investigou o efeito dessa conversão sobre os propágulos de fungos micorrízicos arbusculares (FMA) em 10 locais diferentes, distribuídos nos Estados da Paraíba e de Pernambuco. Cada local consistiu de uma área de vegetação nativa (caatinga) contígua com uma área cultivada, na mesma posição de encosta. Amostras de solo foram coletadas a intervalos de 20-30 m, nas profundidades de 0-7,5 e 7,5-15 cm (10 locais x 2 usos do solo x 2 profundidades com 4 pontos amostrais) ao longo de uma transecção que cruzava as áreas contíguas. As raízes (< 2 mm) catadas das amostras de solo (n = 160) foram coloridas com azul de tripan para quantificar o grau de colonização por FMA, verificando-se também o tipo de estruturas fúngicas presentes. Esporos de FMA extraídos do solo por peneiramento úmido foram incubados em solução de cloreto de iodonitrotetrazólio (INT) e contados, considerando-se viáveis os corados pelo INT. O solo foi analisado quanto ao teor de P-resina e CO total (COT). Para análise dos resultados, as 10 áreas com vegetação nativa foram separadas em dois subgrupos: caatinga preservada (CaatP, n = 6) e caatinga raleada (CaatR, n = 4), por apresentarem diferentes graus de degradação. Pelo mesmo motivo, as áreas cultivadas também foram separadas em dois subgrupos: cultivada preservada (CultP, n = 4) e cultivada degradada (CultD, n = 6). Dessa forma, foram estabelecidos quatro níveis de intensidade de uso do solo ou degradação, conforme o histórico de uso, a observação visual da degradação da vegetação ou do solo e a erosão do solo avaliada pela técnica do 137Cs. O efeito da intensidade de uso do solo nos propágulos de FMA somente foi observado na camada de 0-7,5 cm, exceto para esporos não-viáveis. A densidade de esporos viáveis variou de 1,4 a 6,8 esporos/50 g de solo e a de não-viáveis, de 91,4 a 226 esporos/50 g de solo. A categoria CaatR foi a que apresentou resultados mais consistentes em relação ao estímulo do desmatamento seletivo (raleamento) sobre os propágulos, com maior número de esporos viáveis, maior intensidade de colonização e diminuição da proporção de amostras com vesículas, em relação às demais categorias. Os teores de P-resina nas amostras de solo foram, em geral, muito baixos (< 6 mg kg-1), tendo-se observado que a colonização radicular em amostras com teores inferiores a 1,5 mg kg-1 foi menos intensa naquelas com P-resina acima desse valor. Observou-se também que a colonização das raízes foi favorecida pelos teores mais altos de COT, o mesmo acontecendo com o número de esporos viáveis.

Comunidades microbianas, atividade enzimática e fungos micorrízicos em solo rizosférico de "Landfarming" de resíduos petroquímicos

As raízes das plantas podem estimular a microbiota do solo, a qual pode contribuir para o aumento da eficiência do processo de remediação. Assim, avaliar a magnitude dos efeitos das raízes sobre a microbiota do solo é de grande interesse e de relevância prática e ecológica. Neste trabalho, avaliaram-se a densidade microbiana, a atividade enzimática, a estrutura da comunidade bacteriana e a presença de fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) na rizosfera de plantas de ocorrência espontânea em solo de sistema de "landfarming" de resíduos petroquímicos. Avaliaram-se também solos rizosféricos de cinco plantas e solo-controle sem planta por meio de contagens de microrganismos em placas, eletroforese em gel com gradiente desnaturante (DGGE) de fragmentos do gene rRNA 16S, seqüenciamento genético, atividades enzimáticas, percentagem de colonização radicular e contagem e identificação de esporos de FMAs. As plantas estimularam a densidade microbiana total e da população de degradadores de antraceno, com contagens médias de 1,5 x 10(6) e 2,2 x 10(6) UFC g-1 no solo seco, respectivamente, enquanto, no solo sem planta, essas contagens foram de 5,7 x 10(5) e 2,9 x 10(5) UFC g-1 no solo seco para os respectivos grupos microbianos. As espécies de maior efeito foram Bidens pilosa e Eclipta alba. Entretanto, esses efeitos estimulantes não foram verificados para a atividade enzimática do solo. A colonização micorrízica das raízes (em torno de 40 %) e a densidade de esporos nos solos rizosféricos foram elevadas (entre 900 e 4.800 esporos por 50 cm³ de solo), sendo maior na Brachiaria decumbens. Foram identificadas quatro espécies de FMAs: Acaulospora morrowiae, Glomus intraradices, Paraglomus occultum e Archaeospora trappei. Com exceção de G. intraradices, essas espécies não foram observadas em áreas contaminadas por hidrocarbonetos de petróleo. A análise por DGGE revelou que os solos rizosféricos apresentaram comunidades bacteriana diferente do solo sem plantas. As bactérias degradadoras de antraceno isoladas apresentaram relação filogenética com os gêneros Streptomyces, Nocardioides, Arthrobacter, Pseudoxanthomonas e com gêneros não identificados das famílias Cellulomonadaceae, Xanthomonadaceae e Rhodobacteraceae, sendo quatro destes isolados pertencentes aos actinomicetos. Apenas Nocardioides e o gênero relacionado com a família Cellulomonadaceae foram relatados em áreas brasileiras contaminadas com hidrocarbonetos de petróleo. Conclui-se que as plantas estimulam o aumento da densidade de células bacterianas e alteram a comunidade microbiana do solo de "landfarming" de resíduo petroquímico.

Application of alkaline waste from pulp industry to acid soil with pine

In Brazil extensive areas are covered with pine forests, planted for pulp and paper production. This industry generates solid alkaline waste, such as dregs. The application of this dregs to forest soils is an alternative for soil acidity correction and plant nutrient supply, as well as a solution for its proper disposal. The purpose of this study was to compare the residual effect of surface application of dregs and dolomitic lime on (a) changes in the physical and chemical properties of an acidic soil and (b) pine tree development. The experiment was carried out in 2004 in Bocaina do Sul, Santa Catarina, consisting of the application of increasing dreg and lime rates to a Pinus taeda L. production area, on a Humic Cambisol, in a randomized block design with four replications and 10 x 10 m plots. The treatments consisted of levels of soil acidity amendments corresponding to the recommendations by the SMP method to reach pH 5.5 in the 0-20 cm layer, as follows: no soil amendment; dregs at 5.08 (1/4 SMP), 10.15 (1/2 SMP) and 20.3 Mg ha-1 (1 SMP); and lime at 8.35 (1/2 SMP) and 16.7 Mg ha-1 (1 SMP). Soil layers were sampled in 2010 for analyses of soil chemical and physical properties. The diameter at breast height of the 6.5 year old pine trees was also evaluated. Surface application of dregs improved soil chemical fertility by reducing acidity and increasing base saturation, similar to liming, especially in surface layers. Dregs, comparable to lime, reduced the degree of clay flocculation, but did not affect the soil physical quality. There was no effect of the amendments on increase in pine tree diameter. Thus, the alternative to raise the pH in forest soils to 5.5 with dregs is promising for the forestry sector with a view to dispose of the waste and increase soil fertility.

VARIABILIDADE ESPACIAL DA PRODUTIVIDADE DE SORGO E DE ATRIBUTOS DO SOLO NA REGIÃO DO ECÓTONO CERRADO-PANTANAL, MS

O Sorghum bicolor (L.) Moech é uma importante forrageira de alta produção, que cresce no cenário brasileiro ainda de forma lenta em substituição ao cultivo de milho safrinha. A cultura do sorgo seria alternativa no período da seca na produção de silagem para o período das águas; contudo, o crescimento e desenvolvimento das plantas pode ser influenciado por alterações nos atributos do solo, como textura, porosidade e estrutura do solo. O objetivo deste trabalho foi analisar e caracterizar a dependência e variabilidade espacial entre atributos do solo e a cultura do sorgo forrageiro, em um Planossolo Hidromórfico no ecótono Cerrado-Pantanal. Para tanto, estimaram-se a produtividade de matérias verde e seca de forragem (MVF e MSF) de sorgo forrageiro e os atributos do solo, como macroporosidade (Ma), microporosidade (Mi), porosidade total (Pt), diâmetro médio geométrico, diâmetro médio ponderado, índice de estabilidade de agregados (IEA) e teor de carbono orgânico total do solo (COT), em duas profundidades: 1 (0,00-0,10 m) e 2 (0,10-0,20 m). Em relação à malha geoestatística, foram realizadas 50 coletas de atributos de planta e solo em 40 ha. Isso possibilitou detectar a elevada variabilidade espacial dos atributos de planta (MVF e MSF) e também os atributos do solo que mais variaram espacialmente. Com relação às variáveis que apresentaram dependência espacial, o coeficiente de determinação (r2) decresceu na seguinte ordem: IEA1, silte2, Ma1, Pt1, areia2, silte1, MSF, argila1, MVF e IEA2. Com isso, verificou-se que IEA1 apresentou o melhor ajuste semivariográfico (r2 = 0,926), com alcance de 677,0 m, e o avaliador da dependência espacial (50,6 %) moderado. O silte1, porém, evidenciou o menor alcance (111,0 m) e, assim, recomenda-se que em estudos posteriores o alcance mínimo a ser adotado, para esse tipo de avaliação, não deve ser inferior a esse valor em Planossolo Hidromórfico sob preparo convencional. A correlação linear foi significativa e elevada para MVF e MSF, ao passo que entre atributos de planta versus solo houve correlações positiva e negativa. No âmbito da cokrigagem, a argila1 foi o melhor indicador para estimar a variabilidade espacial da produtividade de massa seca de forragem de sorgo de correlação significativa e negativa (r = -0,292*).

CAPACIDADE COMBINATÓRIA PARA FRUTIFICAÇÃO EM CULTIVARES DE NOGUEIRA MACADÂMIA

Um experimento de cruzamentos dialélicos 5 x 5 foi conduzido na Estação Experimental de Tietê, SP, com o objetivo de avaliar a capacidade combinatória de nogueira macadâmia (Macadamia integrifolia Maiden & Betche), cultivares IAC Campinas A, IAC 2-23 A, IAC 4-12 B, IAC 4-20 e IAC 5-10. A avaliação de frutos fixados aos 14 dias após polinização manual revelou que todas as cultivares apresentaram auto-incompatibilidade. Houve diferenças significativas quanto a capacidades geral (CGC) e específica de combinação (CEC) e efeito recíproco (ER) entre elas. A cultivar IAC Campinas A reduziu a frutificação inicial em todos os cruzamentos em que participou como progenitor feminino. Os melhores resultados de frutificação inicial foram apresentados pelos cruzamentos entre as cultivares: IAC 4-20 x IAC Campinas A, IAC 4-12 B x IAC 2-23 A, IAC 4-20 x IAC 4-12 B, IAC 5-10 x IAC 2-23 A, IAC 5-10 x IAC 4-20, IAC 4-20 x IAC 2-23 A e IAC 5-10 x IAC 4-12 B.

Produção de mudas de acácia colonizadas com micorrizas e rizóbio em diferentes recipientes

Realizou-se um experimento em casa de vegetação, com o objetivo de avaliar diferentes métodos na produção de mudas de Acacia mangium Willd, colonizadas com fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) e rizóbio. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado num esquema fatorial 4x2 (controle, FMAs, rizóbio e FMAs + rizóbio x blocos prensados e tubetes de plástico), com seis repetições. Os blocos prensados foram confeccionados com substratos orgânicos (bagaço de cana + torta de filtro de usina açucareira) e vermiculita, colocados em fôrma metálica de 60x40x20 cm e prensados a 10 kgf cm-2, a fim de proporcionar agregação do material. A inoculação do rizóbio foi realizada com estirpe selecionada para a espécie (Br 3609, Br 6009). A inoculação de FMAs foi feita no momento da confecção dos blocos. Mudas de Acacia mangium que receberam inóculo de FMAs + rizóbio e produzidas em blocos prensados apresentaram maior produção de matéria seca e conteúdo de N na parte aérea. O conteúdo de P na parte aérea é significativamente maior somente nas mudas infectadas com os FMAs, independentemente do tipo de recipiente.

Simplificação da equação de viabilidade para predizer a longevidade de sementes de milho e soja

A equação de Ellis & Roberts utiliza a temperatura, a umidade e a qualidade inicial da semente para predizer sua longevidade, porém exige experimentos complexos e demorados. O objetivo deste trabalho foi simplificar a equação de viabilidade para predizer a longevidade da semente de milho e soja em condições de armazenamento aberto. A equação simplificada é explicada pelo modelo Vp = Vi - (tgbeta).p, em que Vp é a viabilidade em probit no período p, Vi é a germinação inicial do lote e tgb é a taxa de deterioração da semente para cada espécie. Sementes de milho BRS201 e BRS206 e soja cultivar IAC-8 e MG/BR 46 (Conquista) foram embaladas em sacos de papel e armazenadas por 0, 30, 60, 90, 120, 150, 180, 240, 300 e 360 dias, em galpões abertos, em Sete Lagoas, MG, e Brasília, DF. Os dados foram transformados em 'probit' e a declividade da reta (tgbeta) foi calculada entre 0 e 30 dias. O coeficiente (tgbeta) variou de 1,4767.10-3 a 2,687.10-3 em milho e de 2,868.10-3 a 3,617.10-3 em soja, dependendo das condições climáticas do armazém. A germinação da semente de soja declinou mais rapidamente que a de milho. O modelo prediz com precisão a longevidade das sementes de milho e soja em armazém aberto.

Spatiotemporal dynamics of soil rotifers in a South-Bohemian beech forest

The objective of this work was to determine seasonal variation and vertical distribution of the soil rotifer assemblage in a climax beech forest in South Bohemia. During 2005, soil rotifer was investigated to the species level. Soil samples of 10 cm² and 10 cm in depth were divided into five layers, which were processed separately. Thirty one rotifer species were identified during the investigation. Dominant species significantly changed throughout the seasons. The most abundant species were Encentrum arvicola and Wierzejskiella vagneri among the monogononts, and Adineta steineri, Ceratotrocha cornigera, Habrotrocha filum, Habrotrocha ligula, Macrotrachela plicata, Mniobia tentans, Mniobia incrassata and Mniobia granulosa among the bdelloids. Mean Shannon diversity index varied from 1.99 to 2.63. Total rotifer abundance varied from 212±63 to 513±127 10³ individuals m-2 along the year, with the highest numbers found in May, and the lowest in July. The great part of the community was concentrated in the upper (fresh litter) and second (partially decomposed litter) layers and significantly decreased in the soil vertical profile on all sampling dates. The highest rotifer density of 43 individuals g-1 was found in the upper layer in May.

Towards an ecological index for tropical soil quality based on soil macrofauna

The objective of this work was to construct a simple index based on the presence/absence of different groups of soil macrofauna to determine the ecological quality of soils. The index was tested with data from 20 sites in South and Central Tabasco, Mexico, and a positive relation between the model and the field observations was detected. The index showed that diverse agroforestry systems had the highest soil quality index (1.00), and monocrops without trees, such as pineapple, showed the lowest soil quality index (0.08). Further research is required to improve this model for natural systems that have very low earthworm biomass (<10 g m-2) and a high number of earthworm species (5-7), as it is in the tropical rain forest, whose soil quality index was medium (0.5). The application of this index will require an illustrated guide for its users. Further studies are required in order to test the use of this index by farmers.

Tolerância de genótipos de cereais de inverno ao alumínio em cultivo hidropônico e em campo

O objetivo deste trabalho foi determinar a capacidade de crescimento radicular de 75 genótipos de cereais de inverno em cultivo hidropônico, em diferentes concentrações de alumínio, avaliar a relação entre o grau de tolerância/sensibilidade, em solução hidropônica, e a resistência/suscetibilidade ao crestamento em campo. Os cereais cevada, triticale, centeio, trigo e Aegilops tauschii foram avaliados em hidroponia, com concentrações de Al3+ que variaram entre 0,5 (cevada), 2 e 6 (triticale), 6 e 10 (centeio) e 2 mg L-1 (trigo e Ae. tauschii). Os delineamentos experimentais foram inteiramente casualizados. Em campo, foram avaliados os mesmos genótipos, exceto Ae. tauschii, em solo com pH 4,4 e 4,85, corrigido a 1/2 e 1/4 do índice SMP. Utilizou-se uma escala de notas com variação de escores de 0,5 (altamente resistente) a 5 (altamente suscetível). Foi observada elevada relação entre a tolerância ao alumínio em hidroponia e a resistência ao crestamento em campo. A seleção de cereais em meio hidropônico pode ser considerada eficiente como ferramenta de apoio aos programas de melhoramento genético para essa característica.