The performance of four molecular methods for the laboratory diagnosis of congenital toxoplasmosis in amniotic fluid samples

Introduction Toxoplasmosis may be life-threatening in fetuses and in immune-deficient patients. Conventional laboratory diagnosis of toxoplasmosis is based on the presence of IgM and IgG anti-Toxoplasma gondii antibodies; however, molecular techniques have emerged as alternative tools due to their increased sensitivity. The aim of this study was to compare the performance of 4 PCR-based methods for the laboratory diagnosis of toxoplasmosis. One hundred pregnant women who seroconverted during pregnancy were included in the study. The definition of cases was based on a 12-month follow-up of the infants. Methods Amniotic fluid samples were submitted to DNA extraction and amplification by the following 4 Toxoplasma techniques performed with parasite B1 gene primers: conventional PCR, nested-PCR, multiplex-nested-PCR, and real-time PCR. Seven parameters were analyzed, sensitivity (Se), specificity (Sp), positive predictive value (PPV), negative predictive value (NPV), positive likelihood ratio (PLR), negative likelihood ratio (NLR) and efficiency (Ef). Results Fifty-nine of the 100 infants had toxoplasmosis; 42 (71.2%) had IgM antibodies at birth but were asymptomatic, and the remaining 17 cases had non-detectable IgM antibodies but high IgG antibody titers that were associated with retinochoroiditis in 8 (13.5%) cases, abnormal cranial ultrasound in 5 (8.5%) cases, and signs/symptoms suggestive of infection in 4 (6.8%) cases. The conventional PCR assay detected 50 cases (9 false-negatives), nested-PCR detected 58 cases (1 false-negative and 4 false-positives), multiplex-nested-PCR detected 57 cases (2 false-negatives), and real-time-PCR detected 58 cases (1 false-negative). Conclusions The real-time PCR assay was the best-performing technique based on the parameters of Se (98.3%), Sp (100%), PPV (100%), NPV (97.6%), PLR (∞), NLR (0.017), and Ef (99%).

Association between histological findings, aminotransferase levels and viral genotype in chronic hepatitis C infection

Introduction: The genomic heterogeneity of hepatitis C virus (HCV) influences liver disorders. This study aimed to determine the prevalence of HCV genotypes and to investigate the influence of these genotypes on disease progression. Methods: Blood samples and liver biopsies were collected from HCV-seropositive patients for serological analysis, biochemical marker measurements, HCV genotyping and histopathological evaluation. Results: Hepatitis C virus-ribonucleic acid (HCV-RNA) was detected in 107 patients (90.6% with genotype 1 and 9.4% with genotype 3). Patients infected with genotype 1 exhibited higher mean necroinflammatory activity and fibrosis. Conclusions: HCV genotype 1 was the most prevalent and was associated with greater liver dysfunction.

Vitamin A, vitamin E, iron and zinc status in a cohort of HIV-infected mothers and their uninfected infants

Introduction We hypothesized that nutritional deficiency would be common in a cohort of postpartum, human immunodeficiency virus (HIV)-infected women and their infants. Methods Weight and height, as well as blood concentrations of retinol, α-tocopherol, ferritin, hemoglobin, and zinc, were measured in mothers after delivery and in their infants at birth and at 6-12 weeks and six months of age. Retinol and α-tocopherol levels were quantified by high performance liquid chromatography, and zinc levels were measured by atomic absorption spectrophotometry. The maternal body mass index during pregnancy was adjusted for gestational age (adjBMI). Results Among the 97 women 19.6% were underweight. Laboratory abnormalities were most frequently observed for the hemoglobin (46.4%), zinc (41.1%), retinol (12.5%) and ferritin (6.5%) levels. Five percent of the women had mean corpuscular hemoglobin concentrations < 31g/dL. The most common deficiency in the infants was α-tocopherol (81%) at birth; however, only 18.5% of infants had deficient levels at six months of age. Large percentages of infants had zinc (36.8%) and retinol (29.5%) deficiencies at birth; however, these percentages decreased to 17.5% and 18.5%, respectively, by six months of age. No associations between infant micronutrient deficiencies and either the maternal adjBMI category or maternal micronutrient deficiencies were found. Conclusions Micronutrient deficiencies were common in HIV-infected women and their infants. Micronutrient deficiencies were less prevalent in the infants at six months of age. Neither underweight women nor their infants at birth were at increased risk for micronutrient deficiencies.

Measuring male infertility: epidemiological aspects

Evidence suggests that human semen quality may have been deteriorating in recent years. Most of the evidence is retrospective, based on analysis of data sets collected for other purposes. Measures of male infertility are needed if we want to monitor the biological capacity for males to reproduce over time or between different populations. We also need these measures in analytical epidemiology if we want to identify risk indicators, risk factors, or even causes of an impaired male fecundity-that is, the male component in the biological ability to reproduce. The most direct evaluation of fecundity is to measure the time it takes to conceive. Since the time of conception may be missed in the case of an early abortion, time to get pregnant is often measured as the time it takes to obtain a conception that survives until a clinically recognized pregnancy or even a pregnancy that ends with a live born child occurs. A prolonged time required to produce pregnancy may therefore be due to a failure to conceive or a failure to maintain a pregnancy until clinical recognition. Studies that focus on quantitative changes in fecundity (that does not cause sterility) should in principle be possible in a pregnancy sample. The most important limitation in fertility studies is that the design requires equal persistency in trying to become pregnant and rather similar fertility desires and family planning methods in the groups to be compared. This design is probably achievable in exposure studies that make comparisons with reasonable comparable groups concerning social conditions and use of contraceptive methods.

Propagação in vivo e invitro de Cissus sicyoides, uma planta medicinal

O estudo da propagação de espécies utilizadas na medicina popular tem sido intensificado nos últimos anos devido ao crescente investimento em pesquisas para a descoberta de novos fármacos e da utilização da fitoterapia como um meio alternativo. O objetivo do trabalho foi a propagação in vivo e in vitro (estabelecimento e multiplicação) de Cissus sicyoides. Plantas mantidas em casa de vegetação forneceram estacas com 10 e 20 cm de comprimento, as quais foram tratadas com 0, 80 ou 160 mg/l de AIB, com ou sem sacarose + ácido bórico, por duas horas. Para o estabelecimento in vitro, após desinfestação, segmentos nodais com 10 mm de comprimento foram inoculados em meio de cultura sólido (MS), com diferentes concentrações de cinetina, BAP e ANA. Para a multiplicação in vitro, segmentos nodais com 10 mm foram inoculados em meio MS, suplementado com diferentes concentrações de BAP e ANA, e ANA e cinetina. Na propagação in vivo as estacas com 10 cm de comprimento apresentaram maior eficiência no enraizamento quando tratadas com 160 mg/l de AIB. In vitro os explantes foram melhor estabelecidos e multiplicados em meio de cultura suplementado com cinetina e ANA, que proporcionaram maior indução de gemas, crescimento em altura e ausência de calos na base das plântulas.

Screening of plants found in Amazonas State for lethality towards brine shrimp

226 methanol and water extracts representing 74 mainly native plant species found in Amazonas State, Brazil, were tested at a standard concentration of 500 μg/mL for lethality towards larvae of the brine shrimp species Artemia franciscana. Several cytotoxic plant species were identified in this work: Aspidosperma marcgravianum, A. nitidum, Croton cajucara, Citrus limetta, Geissospermum argenteum, Minquartia guianensis, Piper aduncum, P. amapense, P. capitarianum, P. tuberculatum and Protium aracouchini. The results were analyzed within the context of the available traditional knowledge and uses for these plants.

Screening of plants found in the State of Amazonas, Brazil for activity against Aedes aegypti larvae

Ethanol, methanol and water extracts representing mostly native plant species found in the Amazon region were prepared, respectively, by maceration, continuous liquid-solid extraction and infusion, followed by evaporation and freeze-drying. The freeze-dried extracts were tested for lethality toward Aedes aegypti larvae at test concentrations of 500 mg / mL. In general, methanol extracts exhibited the greatest larvicidal activity. The following 7 methanol extracts of (the parts of) the indicated plant species were the most active, resulting in 100% mortality in A. aegypti larvae: Tapura amazonica Poepp. (root), Piper aduncum L. (leaf and root), P. tuberculatum Jacq. (leaf, fruit and branch). and Simaba polyphylla (Cavalcante) W.W. Thomas (branch).

Bioactive dihydroxyfuranonaphthoquinones from the bark of Tabebuia incana A.H. Gentry (Bignoniaceae) and HPLC analysis of commercial pau d'arco and certified T.incana bark infusions

Tabebuia incana A.H. Gentry (Bignoniaceae) is a tree from the Brazilian Amazon having medicinal uses and is one several Tabebuia spp. known as pau d'arco or palo de arco in this region. Fractionation of the bark ethanolic extract afforded a mixture of 5 and 8-hydroxy-2-(1-hydroxyethyl)naphtho[2,3-b]furan-4,9-diones (1 and 2, respectively) identified on the basis of nuclear magnetic resonance (NMR), infrared (IR) and mass (MS) spectra, whose in vitro antimalarial and antitumor activity have been shown previously. This is the first study on T. incana bark, and 2 are described in this species for the first time. Also, high performance liquid chromatography (HPLC) analysis of T. incana bark tea revealed the presence of the 1 + 2 mixture peak corresponding to a concentration in the range 10-6-10-5 M. The chromatograms of teas prepared from commercial pau d' arco and T. incana bark were also studied and the presence of the 1 + 2 peak has potential for quality control of commercial plant materials.

Associação da medroxiprogesterona ao protocolo Ovsynch para inseminação artificial em tempo fixo de búfalas cíclicas (Bubalus bubalis) criadas na Amazônia Oriental

O presente estudo visou avaliar os efeitos da associação da medroxiprogesterona (análogo sintético da progesterona) ao protocolo Ovsynch sobre o crescimento folicular, a ovulação e a taxa de concepção de búfalas criadas na Amazônia Oriental (Tracuateua-PA). Vinte e sete fêmeas adultas (G1 n=14 e G2 n=13), cíclicas, sem bezerro ao pé e com ECC 3,5 foram submetidas a Ovsynch. Os animais do G2 receberam 60 mg de medroxiprogesterona entre D0 e D7 (D0=início do tratamento). A ultra-sonografia ovariana foi realizada nos D 0, 7, 9 e 10. O contingente de folículos pequenos diferiu no D7 (G1: 4,57±0,60 versus G2: 6,54±0,67; P=0,05). Tempo e tratamento influenciaram o diâmetro folicular no D7. O crescimento do folículo dominante entre D7 e D9 foi maior nos animais tratados (G1: 2,05±0,49 mm/dia versus 3,48±0,41 mm/dia; P<0,05). Mais animais do G1 ovularam precocemente (35,71% versus 30,77%), porém isso não afetou as taxas de concepção (G1: 50,00% e G2: 30,77%; P>0,05). Os achados sugerem que a medroxiprogesterona (1) aumenta recrutamento folicular e retarda o crescimento dos folículos com diâmetro maior que 5,0 mm entre D0 e D7; (2) sua retirada incrementa em 1,7 vezes o crescimento folicular do D7 ao D9; (3) pode contribuir para a ovulação de folículos maiores e, em tese, para maior formação de tecido luteínico; (4) não promove ovulação precoce após o Ovsynch; (5) não eleva as taxas de concepção após sincronização de fêmeas cíclicas e com bom escore corporal, devendo ser avaliada para uso em fêmeas acíclicas ou com ECC mais baixo.

Quantificação de cianeto total nas etapas de processamento das farinhas de mandioca dos grupos seca e d'água

O objetivo deste trabalho foi quantificar a concentração de cianeto total durante as etapas de produção da farinha de mandioca dos grupos seca e d'água. Em relação à farinha seca, a concentração de cianeto total na raiz de mandioca diminuiu de 160±11,8 mg HCN/kg para 149±12,3 mg HCN/kg após a trituração, 68±2,5 mg HCN/kg após a prensagem e chegando a 5±0,2 mg HCN/kg no produto final, após o processo de torração. Na produção da farinha d'água, a raiz de mandioca apresentava teor de cianeto total de 321±21,6 mg HCN/kg e durante o processo de fermentação da raiz, o teor de cianeto total nas primeiras 24 horas de fermentação era de 297±2,7 mg HCN/kg chegando a 64±2,3 mg HCN/kg após 96 horas em repouso no tanque. Após trituração e prensagem da massa fermentada, os valores diminuíram para 50±0,6 e 36±0,4 mg HCN/kg, respectivamente, obtendo-se no produto final a concentração de 9±0,1 mg HCN/kg, sendo evidenciado a eficiência do processo de destoxificação em ambos os processamentos.

Composição química e valor nutricional para grandes herbívoros das folhas e frutos de aninga (Montrichardia linifera, Araceae)

Montrichardia linifera (Araceae), conhecida popularmente como 'aninga', faz parte dos ecossistemas de várzea da Amazônia e da dieta natural de animais como peixe-boi, tartarugas, peixes, búfalo e gado. Com o objetivo de contribuir para o conhecimento químico e valor nutricional da mesma, folhas e frutos de M. linifera foram coletados às margens dos rios Guamá e Maratauíra, no Estado do Pará, Brasil. Em folhas e frutos foram realizadas análises de umidade, resíduo mineral fixo (cinzas), lipídios, proteínas, fibra bruta, concentração de carboidratos e valor calórico. A composição mineral (Ca, Mg, Cu, Fe, Zn e Mn) foi obtida por espectrometria de absorção atômica de chama. Observou-se que tanto as folhas quanto os frutos da aninga, apesar de calóricos (289,75 kcal e 355,12 kcal, respectivamente), possuem baixo valor protéico (0,44% e 0,24 %, respectivamente). As concentrações de manganês obtidas (folha = 3279,46 mg kg-1e fruto = 18151,53 mg kg-1) foram consideradas tóxicas, extrapolando o limite máximo tolerável para ruminantes (1000 mg kg-1). A M. linifera, tem capacidade de absorver e bioacumular grandes quantidades de Ca, Mg e Mn presentes no solo, o que torna inadequada a sua utilização exclusiva na alimentação de quelônios, bovinos e bubalinos, havendo necessidade de mais estudos para sua aplicação como parte da ração.

Influência da fermentação na qualidade da farinha de mandioca do grupo d'água

A etapa de fermentação na produção da farinha de mandioca do grupo d'água é responsável pelo desenvolvimento de características químicas e sensoriais peculiares no produto. O objetivo deste estudo foi verificar a influência da etapa de fermentação das raízes de mandioca nos principais parâmetros físico-químicos da farinha, seguido de avaliação sensorial da preferência do consumidor. As análises realizadas foram determinação do teor de umidade, cinzas, proteínas, amido e acidez total titulável. O teste sensorial utilizado foi o de ordenação-preferência dos produtos. De acordo com os resultados obtidos, a etapa de fermentação, responsável pelo aumento da acidez total titulável da farinha de mandioca do grupo d'água, foi o único parâmetro que excedeu o valor limite permitido pela legislação brasileira vigente. Com base no resultado da análise sensorial, houve maior preferência dos consumidores pela farinha de mandioca com maior teor de acidez total (3,44 cmol NaOH kg-1), que corresponde à raiz fermentada por 96 horas.

Occurrence of Aelurostrongylus abstrusus (Railliet, 1898) larvae (Nematoda: Metastrongylidae) infecting Achatina (Lissachatina) fulica Bowdich, 1822 (Mollusca: Gastropoda) in the Amazon region

Achatina fulica or "giant African snail" is an exotic species, considered to be one of the world's hundred most invasive species, causing serious environmental damages. In the present study we report, for the first time, the occurrence of Aelurostrongylus abstrusus infecting A.fulica in the Amazon region. This nematode is described parasitizing mainly the pulmonary system of felines, which causes "aelurostrongilose", also known as feline cardio-pulmonary strongyloidosis. New morphometric data of third stage larvae are presented herein. The present study demonstrated that 40% of all the snails were infected by A. abstrusus. Achatina fulica specimens were collected from three different areas in Manaus namely: rural; east and west areas. The east area presents the highest prevalence of 80%. The large number of A.fulica found in inhabited areas increases the chances of emergent zoonoses, which highlights the need of further studies so as to better control this disease.

Avaliação da distribuição de cobre associado a compostos de diferentes massas moleculares na polpa de açaí

Neste estudo, cromatografia de exclusão por tamanho (SEC) com detecção por UV e detecção off-line por espectrometria de absorção atômica em forno de grafite (GF AAS) foi usada para investigar a associação de cobre a espécies de alta massa molecular (HMW) e baixa massa molecular (LMW) presentes na polpa de açaí (Euterpe oleracea Mart.). A concentração total de cobre obtida nos digeridos da polpa de açaí foi 10,5 µg g-1. Cobre foi encontrado associado às frações de HMW e LMW, correspondentes às massas moleculares de 28,7, 2,6 e 0,43 kDa.

Mineralogia e geoquímica de perfis de solo com Terra Preta Arqueológica de Bom Jesus do Tocantins, sudeste da Amazônia

A comparação de dados morfológicos, mineralógicos e químicos de solo com horizontes antrópicos - Terra Preta Arqueológica (TPA) com Argissolos adjacentes permitiu identificar os principais processos responsáveis pela formação da TPA em um sítio arqueológico no Município de Bom Jesus do Tocantins, sudeste do Estado do Pará. A similaridade entre os dados dos horizontes subsuperficiais do solo com TPA e solos adjacentes indica que o horizonte antrópico do solo TPA foi provavelmente desenvolvido a partir de um horizonte similar aos Argissolos adjacentes com posterior transformação pedogenética através da introdução de materiais orgânicos e inorgânicos por antigas colonizações humanas, resultando no espessamento do horizonte superficial e em concentrações maiores de CaO e P2O5 (teores totais), Zn (teor traço), P e Zn disponível (teores disponíveis), além de Ca e Mg trocáveis (teores trocáveis) em relação aos Argissolos adjacentes. Além disso, essa intervenção antrópica antiga também provocou modificações no horizonte subsuperficial do Argissolo com TPA, como concentrações altas de P2O5 e principalmente P disponível. O Soil Taxonomy e o Sistema Brasileiro de Classificação de Solos (SiBCS) são adequados para a identificação de solo com horizonte antrópico (p.exe. TPA), uma vez que priorizam nas ordens do solo os principais processos pedogenéticos atuantes na formação do solo, relacionados aos horizontes subsuperficiais, além das transformações pedogenéticas posteriores no horizonte superficial. Contudo, este trabalho recomenda o acréscimo de alguns atributos diagnósticos como quantidade de artefatos cerâmicos e líticos, P2O5, P e Zn disponíveis, C orgânico, Ca2++ Mg2+ (teores trocáveis), CTC e índice de saturação por bases no horizonte superficial para o agrupamento e distinção dos diversos tipos de solos antrópicos antigos da Amazônia.