Florística e estrutura de fragmento florestal em área de transição na Amazônia Matogrossense no município de Sinop

A fragmentação do ambiente é intensa na amazônia matogrossense e é esperado como consequência, além do desaparecimento da vegetação original, que a flora dos fragmentos seja transicional, com elementos de floresta amazônica e de cerrado e que já apresentem elevada presença de famílias e espécies pioneiras. Este trabalho objetivou avaliar a composição florística e obter parâmetros fitossociológicos de componentes arbóreos presentes em um fragmento urbano no município de Sinop, Mato Grosso com vistas a confirmar sua classificação como vegetação de transição e detectar indícios de perturbação pela fragmentação. A vegetação foi amostrada pela instalação de 25 parcelas permanentes de 20 x 20m, onde foram amostrados os indivíduos com CAP igual ou superior a 15 cm à altura de 1,30m do solo. A densidade total da área foi de 1555 ind./ha, distribuídos em 37 famílias botânicas, 81 gêneros e 113 espécies. A família mais representativa foi Leguminosae com 14 espécies. As espécies que mais contribuíram em abundância e apresentaram maior frequência foram: Cecropia sciadophylla, Cecropia sp., Bellucia grossularioides e Vismia guianensis. O índice de Shannon (H') foi de 3,55, considerado alto para uma floresta de transição. A equabilidade de Pielou foi de 0,75, sugerindo grande dominância de poucas espécies. As espécies que mais se destacaram em ordem decrescente de VI (%) foram Cecropia sp., Bellucia grossularioides, Qualea ingens, Cecropia sciadophylla, Vismia guianensis, Miconia prasina, Trattinickia burserifolia, Unonopsis guatterioides e Schefflera vinosa. O remanescente apresenta uma flora mista amazônica e de cerrado, confirmando ser ecótono e a abundância de pioneiras sugere distúrbios. Esta floresta protege espécies madeireiras e frutíferas com grande potencial para uso múltiplo, podendo ser um espaço educativo com vistas a conservação e manejo sustentável.

Modelo de escoamento superficial em bacia experimental da Reserva Florestal Adolpho Ducke

Neste estudo, a experimentação e a modelagem hidrológica de eventos de precipitação transformada em escoamento superficial em sistemas naturais de floresta são investigadas, contemplando os seguintes tratamentos: construção de algoritmo computacional iterativo de otimização para a identificação do hidrograma unitário médio (função de transferência chuva-descarga) da bacia e para o cálculo das precipitações efetivas adequadas à cada evento chuva-escoamento; aplicação da metodologia à bacia hidrográfica do igarapé Bolívia, situada no interior da Reserva Florestal Adolpho Ducke; análise e interpretação do algoritmo criado, enfocando a sua convergência e o significado dos resultados desse processo de otimização; e comparação com outros estudos em pequenas bacias da Amazônia Central. O período de medidas de chuva e de vazões estende-se de julho de 2004 a setembro de 2006, incluindo a fase de preparação da curva-chave do igarapé Bolívia e a formação de um conjunto amplo e diversificado de eventos de chuva e de escoamento no curso d'água.

Influência da certificação florestal no cumprimento da legislação ambiental e trabalhista na região amazônica

Nas últimas décadas tem surgido uma maior preocupação ambiental advinda das mudanças climáticas e dos desmatamentos contínuos das florestas tropicais. Para conciliar a exploração e a conservação das florestas surgiram alguns mecanismos, entre eles a certificação florestal. No Brasil, ela está presente há mais de uma década, através do FSC (Forest Stewardship Council), uma ONG (Organização Não-Governamental) que estabeleceu um padrão para a certificação do manejo florestal. Este padrão possui nove princípios e o primeiro deles trata da "Obediência às Leis e Princípios do FSC", exigindo o cumprimento e respeito de todas as leis aplicáveis ao país onde opera e obedecer a todos os seus Princípios e Critérios. Neste contexto, este trabalho teve por objetivo verificar a influência da certificação florestal no cumprimento da legislação nas unidades de manejo de florestas nativas. Buscaram-se os dados nos relatórios públicos das unidades de manejo certificadas até 2007. A avaliação foi realizada por meio da identificação e análise das principais não-conformidades, com relação ao primeiro princípio. Verificou-se que os principais problemas estavam relacionados à legislação ambiental e trabalhista. As não-conformidades da legislação trabalhista foram em sua maioria referentes aos problemas com trabalhadores terceirizados e a legislação ambiental referentes às áreas de preservação permanente e falta de autorizações de órgãos ambientais. Caso sejam tomadas ações para resolvê-las, pode-se concluir que a certificação florestal pode contribuir para o atendimento da legislação nas unidades de manejo de florestas nativas.

Sistema reprodutivo e polinização de Lepidagathis sessilifolia (Pohl) Kameyama ex Wassh. & J.R.I. Wood (Acanthaceae), em remanescente florestal da região sudoeste de Mato Grosso, Brasil

O gênero Lepidagathis apresenta distribuição pantropical com cerca de 100 espécies. No Brasil ocorrem 16 espécies, a maioria nas regiões Centro - Oeste e Sudeste. O estudo foi realizado em sub - bosque de remanescente florestal do município de Tangará da Serra - MT e teve como objetivo analisar a fenologia de floração, descrever a morfologia e biologia floral, verificar os visitantes florais e avaliar o sistema e o sucesso reprodutivo por meio de polinizações manuais. Lepidagathis sessilifolia apresenta inflorescências espiciformes, terminais, com cálice de cor rósea vistosa e corola de coloração branco-rósea. A floração ficou restrita aos meses de março a abril, durante a estação chuvosa. A senescência floral ocorreu após 24 ou 48 horas. A viabilidade dos grãos de pólen foi elevada (92,5%). O único polinizador observado visitando as flores de L. sessilifolia foi a abelha Partamona nhambiquara (Apidae - Meliponini). O sistema reprodutivo misto da espécie é caracterizado pela formação de frutos por meio de agamospermia, autopolinização e polinização cruzada. Esse sistema reprodutivo flexível é vantajoso, pois, garante a manutenção da espécie na área de estudo mesmo na ausência de polinizadores.

Efeito da pressão antrópica sobre igarapés na Reserva Florestal Adolpho Ducke, área de floresta na Amazônia Central

Foram investigadas variáveis físico-químicas e químicas de ambientes aquáticos, em área de floresta primária de terra firme, próxima à área urbana, no município de Manaus. Os cursos de águas superficiais investigados drenam tanto área de floresta primária como urbanizada e, na região, são chamados igarapés. Dois desses igarapés têm suas nascentes na área urbana, adentram a área de floresta e lá se juntam. Ainda dentro da mesma área o igarapé resultante encontra-se com um outro que drena apenas área de floresta primária. Neste estudo foram pesquisadas as variáveis ambientais: pH, condutividade elétrica da água, os cátions (Na+, K+, Ca2+, Mg2+ e Fe2+) e material em suspensão. Foi possível observar diferenças significativas nas médias da concentração de íons hidrogênio, na condutividade elétrica e na quantidade de material em suspensão, entre os igarapés estudados. No igarapé cuja nascente encontra-se dentro da reserva, os valores médios correspondentes ao pH, condutividade elétrica e material em suspensão foram, respectivamente, 4,47; 6,44 mS cm-1 e 1,25 mg L-1; e os valores mais elevados registrados nos impactados foram 6,84, 141,50 mS cm-1 e 9,50 mg L-1. Os resultados mostram que o igarapé que drena área de floresta mantém suas características naturais por estar protegido das atividades antrópicas, e os que provêm da área urbana encontram-se impactados.

Nutrição mineral da seringueira: I - Crescimento e recrutamento de macronutrientes no período de quatro anos pelo clone Fx 3864 na região de Rio Branco, AC

Com o objetivo de obter dados referentes ao crescimento e concentração e acúmulo de macronutrientes em função da idade da planta, foram coleta das amostras de folhas, galhos secos, ponta e base de galhos primários, e ponta, meio e base do tronco de plantas de seringueira clone Fx 3864 com 1,0 a 4,0 anos de idade em plantações situadas sobre Latossol Vermelho-Amarelo textura argilosa na área da BONAL S.A., localizada na região de Rio Branco, AC. Os resultados obtidos mostraram que: - O maior incremento no crescimento ocorreu a partir do terceiro ano. - As maiores concentrações de nutrientes, ocorreram nas folhas. - A extração de nutrientes pela seringueira, por hectare, no quarto ano, foi a seguinte: N - 24, 54 kg, P - 1,82 kg, Ca - 11,07 kg, Mg - 5,29 kg, S - 1,88 kg, - região do Amazonas. - A extração total de macronutrientes pelo sistema, em ordem decrescente: N K Ca Mg S P.

Biological aspects of the DM28C clone of Trypanosoma cruzi after metacylogenesis in chemically defined media

The biological characterization of the Trypanosoma cruzi clone Dm 28c in terms of its growth in LIT medium, cell-cycle, infectivity to mice and interaction with professional and non-professional phagocytic cells shows that it behaves as a bona fide T. cruzi representant. The biological properties of this myotropic clone do not change according to the origin of the trypomastigote forms (i. e., from triatomines, infected mice, cell-culture or from the chemically defined TAUP and TAU3AAG media). In addition Dm 28c metacyclic trypomastigotes from TAU3AAG medium display a high infectivity level to fibroblasts and muscle cells. Experiments on binding of cationized ferritin to trypomastigotes surface show the existence of cap-like structures of ferritin in regions near the kinetoplast. However the nature and role of these anionic sites remain to be determined. The results indicate that metacyclic trypomastigotes from Dm 28c clone obtained under chemically defined conditions reproduce the biological behaviour of T. cruzi, rendering this system very suitable for the study of cell-parasite interactions and for the isolation of trypanosome relevant macromolecules.

Cloning and Characterization of a Schistosoma mansoni cDNA Clone with a Specific Antigenic Expression during Development in a Vertebrate Host

Approximately 2.0 x 10 cDNA clones of an Schistosoma mansoni lgt11 cDNA library were screened in duplicate with serum from infected mice corresponding to distinct phases of infection. A cDNA clone (7/1) was isolated and recognized only by seven week serum. The clone was subcloned in pGEX-2T and Western-blot studies showed a specific antigenic expression confirming that only serum from the chronic phase is capable of recognizing this antigen. Dot-hybridization with RNA from different developmental phases of the parasite showed that the corresponding 7/1 RNA is expressed in all phases of parasite development in vertebrate hosts

Biological Parameters and Molecular Markers of Clone CL Brener - The Reference Organism of the Trypanosoma cruzi Genome Project

Clone CL Brener is the reference organism used in the Trypanosoma cruzi Genome Project. Some biological parameters of CL Brener were determined: (a) the doubling time of epimastigote forms cultured in liver infusion-tryptose (LIT) medium at 28oC is 58±13 hr; (b) differentiation of epimastigotes to metacyclic trypomastigotes is obtained by incubation in LIT-20% Grace´s medium; (c) trypomastigotes infect mammalian cultured cells and perform the complete intracellular cycle at 33 and 37oC; (d) blood forms are highly infective to mice; (e) blood forms are susceptible to nifurtimox and benznidazole. The molecular typing of CL Brener has been determined: (a) isoenzymatic profiles are characteristic of zymodeme ZB; (b) PCR amplification of a 24Sa ribosomal RNA sequence indicates it belongs to T. cruzi lineage 1; (c) schizodeme, randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) and DNA fingerprinting analyses were performed

The Trypanosoma cruzi Genome Project: Nuclear Karyotype and Gene Mapping of Clone CL Brener

By using improved pulsed field gel electrophoresis conditions, the molecular karyotype of the reference clone CL Brener selected for Trypanosoma cruzi genome project was established. A total of 20 uniform chromosomal bands ranging in size from 0.45 to 3.5 Megabase pairs (Mbp) were resolved in a single run. The weighted sum of the chromosomal bands was approximately 87 Mbp. Chromoblots were hybridized with 39 different homologous probes, 13 of which identified single chromosomes. Several markers showed linkage and four different linkage groups were identified, each comprising two markers. Densitometric analysis suggests that most of the chromosomal bands contain two or more chromosomes representing either homologous chromosomes and/or heterologous chromosomes with similar sizes

Towards the Physical Map of the Trypanosoma cruzi Nuclear Genome: Construction of YAC and BAC Libraries of the Reference Clone T. cruzi CL-Brener

Strategies to construct the physical map of the Trypanosoma cruzi nuclear genome have to capitalize on three main advantages of the parasite genome, namely (a) its small size, (b) the fact that all chromosomes can be defined, and many of them can be isolated by pulse field gel electrophoresis, and (c) the fact that simple Southern blots of electrophoretic karyotypes can be used to map sequence tagged sites and expressed sequence tags to chromosomal bands. A major drawback to cope with is the complexity of T. cruzi genetics, that hinders the construction of a comprehensive genetic map. As a first step towards physical mapping, we report the construction and partial characterization of a T. cruzi CL-Brener genomic library in yeast artificial chromosomes (YACs) that consists of 2,770 individual YACs with a mean insert size of 365 kb encompassing around 10 genomic equivalents. Two libraries in bacterial artificial chromosomes (BACs) have been constructed, BACI and BACII. Both libraries represent about three genome equivalents. A third BAC library (BAC III) is being constructed. YACs and BACs are invaluable tools for physical mapping. More generally, they have to be considered as a common resource for research in Chagas disease

Molecular Basis of Ribotype Variation in the Seventh Pandemic Clone and its O139 Variant of Vibrio cholerae

Ribotyping has been widely used to characterise the seventh pandemic clone including South American and O139 variants which appeared in 1991 and 1992 respectively. To reveal the molecular basis of ribotype variation we analysed the rrn operons and their flanking regions. All but one variation detected by BglI, the most discriminatory enzyme, was found to be due to changes within the rrn operons, resulting from recombination between operons. The recombinants are detected because of the presence of a BglI site in the 16S gene in three of the nine rrn operons and/or changes of intergenic spacer types of which four variants were identified. As the frequency of rrn recombination is high, ribotyping becomes a less useful tool for evolutionary studies and long term monitoring of the pathogenic clones of Vibrio cholerae as variation could undergo precise reversion by the same recombination event.

Comparative Analysis by Polymerase Chain Reaction Amplified Minicircles of Kinetoplast DNA of a Stable Strain of Trypanosoma cruzi from São Felipe, Bahia, its Clones and Subclones: Possibility of Predominance of a Principal Clone in this Area

Molecular characterization of one stable strain of Trypanosoma cruzi, the 21 SF, representative of the pattern of strains isolated from the endemic area of São Felipe, State of Bahia, Brazil, maintained for 15 years in laboratory by serial passages in mice and classified as biodeme Type II and zymodeme 2 has been investigated. The kinetoplast DNA (kDNA) of parental strain, 5 clones and 14 subclones were analyzed. Schizodeme was established by comparative study of the fragments obtained from digestion of the 330-bp fragments amplified by polymerase chain reaction (PCR) from the variable regions of the minicicles, and digested by restriction endonucleases Rsa I and Hinf I. Our results show a high percentual of similarity between the restriction fragment lenght polymorphism (RFLP) for the parental strain and its clones and among these individual clones and their subclones at a level of 80 to 100%.This homology indicates a predominance of the same "principal clone" in the 21SF strain and confirms the homogeneity previously observed at biological and isozymic analysis. These results suggest the possibility that the T. cruzi strains with similar biological and isoenzymic patterns, circulating in this endemic area, are representative of one dominant clone. The presence of "principal clones" could be responsible for a predominant tropism of the parasites for specific organs and tissues and this could contribute to the pattern of clinico-pathological manifestations of Chagas's disease in one geographical area.

Genome comparison of progressively drug resistant Plasmodium falciparum lines derived from drug sensitive clone

Chloroquine has been the mainstay of malaria chemotherapy for the past five decades, but resistance is now widespread. Pyrimethamine or proguanil form an important component of some alternate drug combinations being used for treatment of uncomplicated Plasmodium falciparum infections in areas of chloroquine resistance. Both pyrimethamine and proguanil are dihydrofolate reductase (DHFR) inhibitors, the proguanil acting primarily through its major metabolite cycloguanil. Resistance to these drugs arises due to specific point mutations in the dhfr gene. Cross resistance between cycloguanil and pyrimethamine is not absolute. It is, therefore, important to investigate mutation rates in P. falciparum for pyrimethamine and proguanil so that DHFR inhibitor with less mutation rate is favored in drug combinations. Hence, we have compared mutation rates in P. falciparum genome for pyrimethamine and cycloguanil. Using erythrocytic stages of P. falciparum cultures, progressively drug resistant lines were selected in vitro and comparing their RFLP profile with a repeat sequence. Our finding suggests that pyrimethamine has higher mutation rate compared to cycloguanil. It enhances the degree of genomic polymorphism leading to diversity of natural parasite population which in turn is predisposes the parasites for faster selection of resistance to some other antimalarial drugs.

Biological characterization of a beta-galactosidase expressing clone of Trypanosoma cruzi CL strain

Clone CL B5 of Trypanosoma cruzi is a beta-galactosidase expressing organism that was genetically transfected to be used for in vitro pharmacological screening. Biological parameters were determined, evaluating growth kinetics of epimastigotes, metacyclogenesis, infectivity to mammalian cell lines, parasitemia kinetics in mice and sensibility to nifurtimox and benznidazole. Differences in relation to other strains and CL parental strain were found, the most important being the incapability to produce death to mice in spite of the high inoculum used. However, it possesses the required features to be used for in vitro drug screening. Data obtained demonstrate that heterogeneity of T. cruzi appears even among clones of the same strain, and that these differences found do not prevent the use of clone CL B5 for the purpose that was engineered.