Genetic associations in the detection of QTLs for wheat spike-related traits

The objective of this work was to assess the genetic diversity and population structure of wheat genotypes, to detect significant and stable genetic associations, as well as to evaluate the efficiency of statistical models to identify chromosome regions responsible for the expression of spike-related traits. Eight important spike characteristics were measured during five growing seasons in Serbia. A set of 30 microsatellite markers positioned near important agronomic loci was used to evaluate genetic diversity, resulting in a total of 349 alleles. The marker-trait associations were analyzed using the general linear and mixed linear models. The results obtained for number of allelic variants per locus (11.5), average polymorphic information content value (0.68), and average gene diversity (0.722) showed that the exceptional level of polymorphism in the genotypes is the main requirement for association studies. The population structure estimated by model-based clustering distributed the genotypes into six subpopulations according to log probability of data. Significant and stable associations were detected on chromosomes 1B, 2A, 2B, 2D, and 6D, which explained from 4.7 to 40.7% of total phenotypic variations. The general linear model identified a significantly larger number of marker-trait associations (192) than the mixed linear model (76). The mixed linear model identified nine markers associated to six traits.

Ação antagônica de rizobactérias contra Phytophthora parasitica e p. citrophthora e seu efeito no desenvolvimento de plântulas de citros

O antagonismo de Pseudomonas putida biovar A (C1-1B), P. putida biovar B (Santa Bárbara), P. fluorescens (C2-8C e RA2), Bacillus subtilis (OG e RC2) e Flavobacterium sp. (CIS/NA) contra Phytophthora parasitica e P. citrophthora , agentes da podridão radicular dos citros, foi avaliado através da inibição do crescimento micelial (cultura pareada) e redução na percentagem de infecção da doença em mudas de citros (tratamento de sementes com rizobactérias). Na seleção preliminar, 33 isolados bacterianos foram testados. Sementes de citros pré-germinadas foram tratadas por imersão nas suspensões das bactérias (10(9) ufc/ml), e plantadas em tubetes contendo solo natural infestado com o fitopatógeno (50 ml de suspensão/ kg de solo). A avaliação da percentagem de infecção foi efetuada após 15 dias. In vitro, os isolados bacterianos RC2, OG, CIS/NA e C1-1B foram os mais ativos inibidores do crescimento micelial de Phytophthora. Em condições de casa de vegetação, todos os isolados proporcionaram redução na percentagem de infecção da doença em todos os ensaios realizados. Promoção de crescimento de plantas foi verificada pela inoculação de plântulas com as linhagens OG, RC2, CiS/Na e C1-1B.

Características agronômicas de seis genótipos de maracujazeiro-azedo cultivados no Distrito Federal

Este trabalho teve como objetivo avaliar as características agronômicas de seis genótipos de maracujazeiro-azedo cultivados no Distrito Federal. O experimento foi desenvolvido na área experimental da Fazenda Água Limpa da Universidade de Brasília, no DF. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados, com quatro repetições, seis tratamentos e sete plantas por parcela. Foram avaliados os genótipos: Rubi Gigante, EC-3-0, EC-L-7, RC-3, Redondão e Gigante Amarelo. Os parâmetros analisados, durante seis meses (17 colheitas), foram: produtividade total estimada, quantidade de frutos e coloração da casca. O genótipo Rubi Gigante teve a maior produtividade (16,69 t/ha-1), enquanto o RC-3 a menor (2,92 t/ha-1). Foram observados resultados semelhantes quanto às variáveis: produtividade total e quantidade de frutos de tamanho: primeira, 1B e 1A em relação aos seis genótipos. Não houve diferença significativa a 5%, pelo teste de Tukey, para: % de frutos de coloração amarela, rosa e roxa; massa fresca de frutos amarelos e rosas; quantidade de frutos rosas e roxos, e também quantidade de frutos de tamanho 2A e 3A em relação a todos os genótipos avaliados. Os genótipos Rubi Gigante, Redondão, EC-3-0 e EC-L-7 podem ser recomendados para o cultivo no DF e região geoeconômica, se confirmarem a superioridade quando avaliados por um maior período e em diferentes condições ambientais.

Produtividade e qualidade de frutos de progênies de maracujazeiro-azedo cultivados no Distrito Federal

Este trabalho teve como objetivo avaliar a produtividade e a qualidade de frutos de progênies de maracujazeiro-azedo cultivados no Distrito Federal. Foi conduzido na Fazenda Água Limpa-UnB, utilizando-se de delineamento de blocos casualizados, com 14 tratamentos (progênies), 04 repetições, sendo a parcela útil de oito plantas. As progênies avaliadas foram: Vermelhão Ingaí, EC-RAM, AR01, AR02, mar20#36, mar20#46, AP1, FP01, FB200, RC3, GA2-A1*AG, mar20#03, mar20#23 e mar20#09. As características analisadas em 75 colheitas foram: produtividade (kg/ha), massa média de frutos (g), número de frutos por hectare, coloração da casca e classificação quanto ao tamanho. Houve maior rendimento em Vermelhão Ingaí, EC-RAM e AR01. O Vermelhão Ingaí produziu a maior quantidade de frutos por hectare, estatisticamente superior aos demais. O EC-RAM obteve o maior número de frutos rosa e roxo. Todas as progênies apresentaram maior produção de frutos de cor amarela. O peso médio total variou de 83 g em mar20#36 e 128 g em EC-RAM. A maior produtividade de frutos para fins industriais foi verificado em Vermelhão Ingaí com frutos de primeira e mar20#46 com frutos 1B. Já para consumo in natura foi observado em AR02 com frutos 1A e 2 A e em AR01 com frutos 3 A.

Nível de evidência e grau de recomendação dos artigos sobre a acurácia diagnóstica da ultrassonografia na síndrome do túnel do carpo

OBJETIVO: Este trabalho teve como objetivo avaliar a qualidade dos artigos relacionados com a acurácia diagnóstica da ultrassonografia na síndrome do túnel do carpo idiopática e relacionada com o trabalho. MATERIAIS E MÉTODOS: Realizou-se busca em bases de dados eletrônicas, selecionando-se relatórios de revisões sistemáticas, ensaios clínicos randomizados e estudos observacionais. Após quatro etapas de análise, desde a triagem inicial até a avaliação pelo instrumento elaborado pelo Critical Appraisal Skills Programme, os artigos foram classificados em níveis de evidência, com seus respectivos graus de recomendação. RESULTADOS: Dos 68 artigos inicialmente encontrados, apenas 4 preencheram os critérios de qualidade propostos neste estudo. A mensuração da área transversal do nervo mediano foi o critério mais importante para o diagnóstico de síndrome do túnel do carpo (ponto de corte entre 9 e 10 mm²: sensibilidade = 82-86,3%; especificidade = 48-87%). Os quatro artigos obtiveram nível de evidência "1b" e grau de recomendação "A". CONCLUSÃO: A avaliação ultrassonográfica em pacientes com suspeita clínica de síndrome do túnel do carpo pode ser realizada como teste de primeira linha, com boa relação custo-benefício, reduzindo a necessidade de exames eletrodiagnósticos.

Evaluation of preoperative computed tomography angiography in association with conventional angiography versus computed tomography angiography only, in the endovascular treatment of aortic diseases

Objective To evaluate the association of conventional angiography (AG) with computed tomography angiography (CTA) as compared with CTA only, preoperatively, in the treatment of aortic diseases. Materials and Methods Retrospective study involving patients submitted to endovascular treatment of aortic diseases, in the period from January 2009 to July 2010, with use of preoperative CTA + conventional AG or CTA only. The patients were divided into two groups, namely: G1 – thoracic aortic diseases; and G2 – abdominal aortic diseases. G1 was subdivided into 1A (preoperative AG + CTA) and 1B (preoperative CTA). G2 was subdivided into 2C (CTA + AG) and 2D (CTA only). Results The authors evaluated 156 patients. In subgroups 1A and 1B, the rate of technical success was, respectively, 100% and 94.7% (p = 1.0); and the rate of therapeutic success was, respectively, 81% and 58% (p = 0.13). A higher number of complications were observed in subgroup 1B (p = 0.057). The accuracy in the calculation of the prosthesis was higher in subgroup 1A (p = 0.065). In their turn, the rate of technical success in subgroups 2C and 2D was, respectively, 92.3% and 98.6% (p = 0.17). The rate of therapeutic success was 73% and 98.6% (p = 0.79). Conclusion Preoperative conventional AG should be reserved for cases where CTA cannot provide all the information in the planning of a therapeutic intervention.

Esfoliação e hidratação da caulinita após intercalação com uréia

Well-ordered Georgia kaolinite (Kga-1b) obtained from the source Clay Repository of the Clay Minerals Society (USA) was intercalated with urea using grinding procedures. To achieve complete intercalation 20% of urea (in weight) was used, producing Al2Si2O5(OH)4 (N2H4CO)0,86 with an interplanar basal spacing of 1,08nm. After washing with water under ultrasound stirring at 363K, urea was completely removed and kaolinite was partially exfoliated. After drying under air, the material was converted to hydrated kaolinite with the composition Al2Si2O5(OH)4 (H2O)0,64 and an interplanar basal spacing of 0,84nm. In this compound, water molecules positioned between the layers of the silicate can be removed after calcination at 573K, regenerating structurally disordered kaolinite.

NMR investigation and theoretical calculations of the effect of solvent on the conformational analysis of 4',7-di-hydroxy-8-prenylflavan

The NMR conformational study of 4',7-di-hydroxy-8-prenylflavan 1 was carried out in acetone-d6, DMSO-d6 and CDCl3 which enabled the proposition of three conformations, namely 1a, 1b and 1c, differing in the position of the prenyl group. Geometry optimizations performed using AM1 method showed that 1a (deltaHf = -86.2 kcal/mol) is as stable as 1b (deltaHf = -85.1 kcal/mol) and 1c (deltaHf = -85.4 kcal/mol). When the solvent was included, the calculations showed that the solute-solvent interactions could be explained either in the light of the electronic intermolecular delocalization or the electrostatic character between solute and solvent. Theoretical calculations (HF/6-31G*, deltaFT/BLYP/6-31G*, and deltaFT/B3LYP/6-31G*) showed that the combination of these types of interactions present in each solute-solvent system, dependent on the chemical properties of the solvent, lead to different spatial arrangements of the prenyl group, which in turn determined the conformation of 1.

Phytochemical investigation of Wissadula periplocifolia (L.) C. Presl and evaluation of its antibacterial activity

A phytochemical study on the aerial parts of Wissadula periplocifolia using chromatographic techniques has led to the isolation of sitosterol (1a), stigmasterol (1b), sitosterol 3-O-β-D-glucopyranoside (2a), stigmasterol 3-O-β-D-glucopyranoside (2b), phaeophytin A (3), 13²-hydroxy-(13²-S)-phaeophytin A (4), phaeophytin B (5), 17³-ethoxyphaeophorbide (6), 3,4-seco-urs-4(23),20(30)-dien-3-oic acid (7), 3-oxo-21β-H-hop-22(29)-ene (8), dammaradienone (9a), and taraxastenone (9b). The isolated compounds were characterised by spectroscopic analysis. A preliminary assay to evaluate the antibacterial activity of W. periplocifolia extracts and fractions showed that the dichloromethane, ethyl acetate, and n-butanol fractions were active against Enterococcus faecalis.

PERFIL DOS BOLSISTAS DE PRODUTIVIDADE EM PESQUISA NAS SUBÁREAS DA QUÍMICA DO CNPq

The profile analysis of CNPq Research Productivity Fellows (PQ) in the four subfields of chemistry and in their respective specialties highlighted particularities with regard to the indicators related to the judging criteria established by the Chemistry Advisory Committee. The curricula of all 727 PQ fellows with active grants in 15/03/2013 were analyzed spanning the past10 years (2003-2013). Out of all PQ-1 fellows, researchers in the subfield of Organic Chemistry had the highest median number of articles published per year. The subfield of Analytical Chemistry qualifies a higher number of postgraduate level students in comparison to other Chemistry subfields. Furthermore, this subfield had the highest average Hirsch index among PQ-1A and PQ-1B fellows. On the other hand, Inorganic Chemistry had the highest average number of patent applications per researcher, while Physical Chemistry had the specialties with the highest citation rates per paper and the highest average impact factors per journal. In all subfields, women made up a low proportion, especially at the highest levels of PQ fellowships. Although quantitative differences in scientific output were observed among the subfields, qualitative evaluation of science output was not carried out.

Anacardic acid derivatives from Brazilian propolis and their antibacterial activity

Propolis is a sticky, gummy, resinous substance collected by honeybees (Apis mellifera L.) from various plant sources, which has excellent medicinal properties. This paper describes the isolation and identification of triterpenoids and anacardic acid derivatives from Brazilian propolis and their antibacterial activity. Their structures were elucidated by ¹H and 13C NMR, including uni- and bidimensional techniques; in addition, comparisons were made with data from academic literature. These compounds were identified as: cardanols (1a + 1b), cardols (2a + 2b), monoene anacardic acid (3), a-amirine (4), b-amirine (5), cycloartenol (6), 24-methylene-cycloartenol (7) and lupeol (8). The determination of the position of the double bond after a reaction with Dimethyl disulfide (DMDS) is described for the phenol derivatives. The ethanolic extract was tested in vitro for antimicrobial activity by using the disc diffusion method and it showed significant results against Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa and Shigella spp.

Avaliação da reinfecção peritoneal após peritonite fecal em ratos

OBJETIVO: Há poucos estudos sobre os efeitos de uma nova infecção após peritonite séptica. Com o objetivo de compreender melhor esta situação, realizou-se o presente experimento tendo como parâmetro o papel do tempo neste fenômeno. MÉTODO: Foram utilizadas 36 ratas Wistar adultas, submetidas a peritonite fecal com injeção intraperitoneal de uma solução de fezes de ratos. Os animais foram divididos em quatro grupos (n = 9): Grupo 1A - controle: injeção intraperitoneal de solução de fezes com uma quantidade sabidamente letal (10 ml/kg); Grupo 1B - reinfecção: injeção intraperitoneal de solução de fezes com uma quantidade sabidamente não letal (2 ml/kg) e, após 30 dias, injeção de solução de fezes (10 ml/kg); Grupo 2A - controle da reinfecção tardia: injeção intraperitoneal de fezes a 10 ml/kg; Grupo 2B - reinfecção tardia: injeção intraperitoneal de fezes a 2ml/kg e, após quatro meses, injeção de 10ml/kg. RESULTADOS: Todos os nove animais do Grupo 1A morreram no período de sete dias após a injeção da solução de fezes. Já no Grupo 1B, pré-infectado, apenas um animal morreu, 24 horas após a injeção da solução de fezes a 10 ml/kg (p < 0,001). Em relação ao Grupo 2, oito dos nove animais de cada subgrupo morreram no período de sete dias. CONCLUSÕES: Uma sepse peritoneal menor por fezes eleva a resistência orgânica a nova contaminação fecal mais intensa que ocorra após um período curto. Contudo, essa defesa não persiste por tempo mais prolongado.

Avaliação de diferentes métodos de conservação esplênica para tratar lesão cortante do baço em cão

OBJETIVO: A morbimortalidade do tratamento conservador do baço após trauma desse órgão depende da extensão da lesão e da experiência da equipe cirúrgica com trauma esplênico. O objetivo deste trabalho é avaliar experimentalmente a recuperação esplênica após lesão cortante tratada conservadoramente. MÉTODO: Foram utilizados 20 cães machos, mestiços, com peso variando entre 7kg e 12kg. Sob anestesia com pentabarbitúrico sódico endovenoso, provocou-se uma lesão cortante longitudinal no baço, em uma extensão de 5 cm e profundidade de 3 cm. Em seguida, os animais foram distribuídos aleatoriamente, de acordo com a conduta com a ferida esplênica, em três grupos: Grupo 1 (n=10) - sem reparo cirúrgico; Grupo 2 (n=5) - sutura esplênica contínua com fio de categute cromado 5-0; Grupo 3 (n=5) - introdução de um segmento de omento maior na ferida esplênica e sutura contínua do baço com o omento, utilizando fio categute cromado 5-0. Os cães foram acompanhados durante cinco (Grupo 1A) ou 28 (Grupo 1B, 2 e 3) dias. RESULTADOS: Todos os animais sobreviveram ao pós-operatório e não foram percebidas adversidades decorrentes da operação durante esse período. Não foi encontrada diferença no aspecto macroscópico dos baços retirados de todos os grupos. À microscopia, percebeu-se fragmento de omento dentro da cicatriz esplênica nos animais do Grupo 3. CONCLUSÕES: A lesão cortante de baço canino pode ser tratada pelos métodos conservadores. Caso se opte pelo tratamento cirúrgico, a sutura com e sem auxílio do omento são eficazes.

Morfologia e resistência cicatriciais da parede abdominal após laparotomias longitudinal e transversal em coelhos

OBJETIVO: Foram estudadas comparativamente as laparotomias longitudinais paramediana e transversal avaliando-se a resistência cicatricial da parede abdominal e seu aspecto histológico, com peritônio suturado ou não. MÉTODO: 30 coelhos foram distribuídos em dois grupos: Grupo 1 (n = 10) - laparotomia longitudinal, Subgrupo 1A (n = 5) sutura das bainhas anterior e posterior do músculo reto abdominal, bem como do peritônio, Subgrupo 1B (n = 5) sutura da bainha anterior do músculo reto abdominal. Grupo 2 (n = 20) - laparotomia transversa, Subgrupo 2A (n = 5) sutura das bainhas anterior e posterior do músculo reto abdominal, bem como do peritônio, Subgrupo 2B (n = 5) sutura apenas da bainha anterior do músculo reto abdominal, Subgrupo 2C (n = 5) sutura, em plano único, do músculo reto abdominal e de sua bainha anterior, Subgrupo 2D (n = 5) síntese, da bainha posterior do músculo reto abdominal junto com o peritônio e, em seguida, sutura do músculo reto abdominal, complementada por sutura da bainha anterior desse músculo. Após 17 dias, foram retirados dois segmentos peritonio-aponeurotico-musculares da cicatriz para avaliação da resistência e de seus aspectos histológicos. RESULTADOS: O valor da resistência para cada um dos grupos avaliados mostrou 1A > 1B, 1A > 2A e 1B > 2B, e 2B > 2C > 2D > 2A (p = 0,014). Deiscência, infecção e aderências foram mais freqüentes no Grupo 2. A histologia mostrou degeneração e necrose muscular, com sua substituição por tecido conjuntivo fibroso maduro cicatricial. CONCLUSÃO: Esses dados indicam que o corte muscular transversal provoca maior enfraquecimento muscular e que o peritônio deixado aberto não altera a resistência cicatricial.

Pré-condicionamento isquêmico em diferentes tempos e seu efeito na translocação bacteriana induzida por isquemia e reperfusão intestinal em ratos

OBJETIVO: avaliar os efeitos de diferentes tempos de pré-condicionamento isquêmico(PCI) intestinal sobre a translocação bacteriana (TB). MÉTODOS: Trinta ratos Wistar pesando 280±27g foram alocados em cinco grupos. No grupo IR (n=6), foi realizada laparotomia e a artéria mesentérica superior foi ocluída por microclampe atraumático por 30 minutos. Nos quatro grupos com pré-condicionamento (n=6 cada), antes dos 30 minutos de isquemia-reperfusão (I/R) os ratos foram submetidos a PCI de dois, cinco, dez e 15 minutos e, em seguida, ao mesmo tempo de reperfusão. Vinte e quatro horas após, para avaliar se os tempos de pré-condicionamento influenciam o aparecimento de translocação bacteriana, amostras de linfonodos mesentéricos, fígado e baço foram coletadas em condições estéreis, para quantificação de unidades formadoras de colônias bacterianas por grama de tecido (UFC/g). Sangue foi coletado para dosagem de citocinas. RESULTADOS: No grupo I/R, o total de UFC/g em linfonodos mesentéricos, baço, fígado, bem como, a dosagem sérica de TNF-a, IL-1b e IL-6 foram significativamente maiores do que nos demais grupos (p<0,05). Pré-condicionamento de 15 minutos atenuou significativamente a BT e as citocinas séricas, comparando com os outros tempos de pré-condicionamento (p<0,05). CONCLUSÃO: Nossos dados sugerem o pré-condicionamento como fator-chave para reduzir translocação bacteriana em I/R intestinal. Numa escala de dois a 15 minutos, o melhor tempo de pré-condicionamento isquêmico para a atenuação da translocação bacteriana foi 15 minutos.