Brazilian Flavivirus phylogeny based on NS5

In this work, a comprehensive phylogenetic study based on 600 base pair nucleotide and on putative 200 amino acid sequences of NS5 was carried out in order to establish genetic relationships among 15 strains of 10 Brazilian flaviviruses: Bussuquara, Cacipacore, dengue type 1, 2 and 4, Iguape, Ilheus, Rocio, Saint Louis encephalitis (SLE), and yellow fever. Phylogenetic trees were created by neighbor-joining and maximum parsimony methods. These trees showed Brazilian flaviviruses grouped into three main branches: yellow fever branch, dengue branch subdivided in types 1, 2 and 4 branches, and Japanese encephalitis virus (JEV) complex branch including SLE virus strains, Cacipacore, Iguape, Rocio, Ilheus and Bussuquara. Viruses transmitted by Aedes mosquitoes, such as dengue and urban yellow fever, that are also the only Flavivirus causing hemorrhagic fevers in Brazil, were grouped in the same cluster. Encephalitis associated viruses, transmitted by Culex mosquitoes such as JEV complex branch including SLE virus strains, Cacipacore, Iguape, Rocio, Ilheus and Bussuquara were also grouped in the same clade.

Phylogeny and evolution of the aspartyl protease family from clinically relevant Candida species

Aspartyl proteases are a class of enzymes that include the yeast aspartyl proteases and secreted aspartyl protease (Sap) superfamilies. Several Sap superfamily members have been demonstrated or suggested as virulence factors in opportunistic pathogens of the genus Candida. Candida albicans, Candida tropicalis, Candida dubliniensis and Candida parapsilosis harbour 10, four, eight and three SAP genes, respectively. In this work, genome mining and phylogenetic analyses revealed the presence of new members of the Sap superfamily in C. tropicalis (8), Candida guilliermondii (8), C. parapsilosis(11) and Candida lusitaniae (3). A total of 12 Sap families, containing proteins with at least 50% similarity, were discovered in opportunistic, pathogenic Candida spp. In several Sap families, at least two subfamilies or orthologous groups were identified, each defined by > 90% sequence similitude, functional similarity and synteny among its members. No new members of previously described Sap families were found in a Candida spp. clinical strain collection; however, the universality of SAPT gene distribution among C. tropicalis strains was demonstrated. In addition, several features of opportunistic pathogenic Candida species, such as gene duplications and inversions, similitude, synteny, putative transcription factor binding sites and genome traits of SAP gene superfamily were described in a molecular evolutionary context.

Phylogeny, ultrastructure, histopathology and prevalence of Myxobolus oliveirai sp. nov., a parasite of Brycon hilarii (Characidae) in the Pantanal wetland, Brazil

This paper presents the morphological, histological and ultrastructural characteristics of Myxobolus oliveirai sp. nov., a parasite of the gill filaments in Brycon hilarii from the Brazilian Pantanal. Out of 216 B. hilariispecimens examined (126 wild and 90 cultivated), 38.1% of wild specimens (n = 48) were infected. The parasites form elongated plasmodia primarily in the tip of gill filaments, reaching about 3 mm in length. A thorough comparison with all the Myxobolus species described from South American hosts, as well as nearly all the Myxobolus species described so far is provided. Partial sequencing of the 18S rDNA gene revealed a total of 1,527 bp. The Myxobolus species parasite of B. hilarii did not match any of the Myxozoa available in GenBank. In the phylogenetic analysis, M. oliveirai sp. nov. composed a monophyletic group with eight other species: five species of Myxobolus parasites of mugilid fishes, two parasites of pangasiid and one of centrarchid. Infection prevalence values of the parasite revealed no significant differences between wet and dry seasons or between males and females. The importance of the infection to the farming of the host species is emphasized.

Molecular phylogeny of the Myzorhynchella Section of Anopheles (Nyssorhynchus) (Diptera: Culicidae): genetic support for recently described and resurrected species

Phylogenetic relationships among species of the Myzorhynchella Section of Anopheles (Nyssorhynchus) were investigated using the nuclear ribosomal DNA second internal transcribed spacer (ITS2), the nuclear whitegene and mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI) regions. The recently described Anopheles pristinus and resurrected Anopheles guarani were also included in the study. Bayesian phylogenetic analyses found Anopheles parvus to be the most distantly related species within the Section, a finding that is consistent with morphology. An. pristinus and An. guarani were clearly resolved from Anopheles antunesi and Anopheles lutzii, respectively. An. lutzii collected in the same mountain range as the type locality were found within a strongly supported clade, whereas individuals from the southern state of Rio Grande do Sul, tentatively identified as An. lutzii based on adult female external morphology, were distinct from An. lutzii, An. antunesi and from each other, and may therefore represent two new sympatric species. A more detailed examination of An. lutzii sensu latoalong its known geographic range is recommended to resolve these anomalous relationships.

The phylogeny of Simulium (Chirostilbia) (Diptera: Simuliidae) and perspectives on the systematics of the genus in the Neotropical Region

Recently, knowledge of Neotropical Simuliidae has been accumulating quickly. However, information about supra-specific relationships is scarce and diagnoses of Simulium subgenera are unsatisfactory. To investigate the relationships among Simulium (Chirostilbia) species and test the subgenus monophyly, we performed a cladistic analysis. The ingroup included all species of this subgenus and the outgroup included representatives of the 17 species groups of Neotropical Simulium and three Holarctic species. The study was based on a data matrix with 31 terminal taxa and 45 morphological characteristics of adult, pupa and larva. The phylogenetic analysis under equal weights resulted in eight most-parsimonious trees (length = 178, consistency index = 34, retention index = 67). The monophyly of the S. (Chirostilbia) was not supported in our analysis. The Simulium subpallidum species group was closer to Simulium (Psilopelmia) and Simulium (Ectemnaspis) than to the Simulium pertinax species group. Additionally, we describe the three-dimensional shape of the terminalia of male and female of Simulium (Chirostilbia) for the first time and provide comments about the taxonomic problems involving some species of the subgenus: Simulium acarayense, Simulium papaveroi, S. pertinax, Simulium serranum, Simulium striginotum and S. subpallidum.

Desenvolvimento pré-imaginal de Eueides isabella dianasa (Hübner) (Lepidoptera, Nymphalidae, Heliconiinae) em folhas de Passiflora edulis L. (Passifloraceae)

Lagartas de Eueides isabella dianasa (Hübner, 1806) estão entre os insetos fitófagos que ocorrem em P. edulis. Para esse estudo, foram coletados ovos logo após a oviposição, sendo feitas observações diárias para o registro de eclosão, ecdises (confirmadas pelas cápsulas cefálicas), pupação e emergência de adultos. A viabilidade de ovos foi de 94,9%. O período embrionário observado (em dias ± erro padrão da média) foi de 4,25 ± 0,18. O período larval de 16,9 ± 0.34 dias apresentou cinco ínstares: 2,75 ± 0,2; 2,8 ± 0,2; 3,0 ± 0,1; 3,6 ± 0,2 e 4,6 ± 0,15. O período larval ativo foi de 15,83 ± 0,34 dias, seguido por um período prepupal e pupal de, respectivamente, de 7,42 ± 0,15 (período inativo dentro do desenvolvimento pós-embrionário de 8,4 ± 0,15). O desenvolvimento pós-embrionário foi de 24,25 ± 0,37. A duração do desenvolvimento pré-imaginal de 28,5 ± 0,4 pode ser considerada curta entre os lepidópteros. A duração relativa foi de 14,9% para o período embrionário e de 85,9% para o pós-embironário. O uso do tempo durante o período pós-embrionário foi de 11,3%; 11,7%; 12,4%; 14,8%; 18,9% e 30,6% respectivamente como L1, L2, L3, L4, L5 e pupa. O período larval representou 65,3% enquanto o período inativo (prepupa + pupa) 34,7%. A sobrevivência no final do desenvolvimento, considerando o período de ovo, foi de 27,5% e, considerando o período pós-embrionário, 30,0%, tendo sido mais evidente no quinto ínstar e no período pupal com 63,0% e 64,7%, respectivamente. Este é o primeiro registro de Eueides isabella dianasa no Estado de Alagoas, Brasil.

Phylogeny of wasps of the genus Mischocyttarus de Saussure (Hymenoptera, Vespidae, Polistinae)

A phylogenetic analysis is presented of subgenera and species-groups of Mischocyttarus de Saussure, the largest genus of social wasps. The analysis is based on 62 morphological and nest architecture characters, coded for 71 terminals representing much of the taxonomic diversity within the genus, plus three outgroup terminals representing other polistine tribes. The main conclusions about phylogenetic relationships within the genus are based on parsimony analysis under implied weights. Monophyly of Mischocyttarus is confirmed as well as that of most of the previously recognized subgenera: Mischocyttarus s. str., Clypeopolybia, Monogynoecus, Scytokeraia, Phi, Kappa, Megacanthopus and Omega sensu Richards (1978). Haplometrobius as conceived by Richards (1978) is not a monophyletic taxon, but some of its species-groups are monophyletic. The groups of M.artifex and M.cerberus are raised to subgenus level, and a new concept of Haplometrobius restricts it to the group of M.iheringi (the type species of this subgenus) in the sense of this work. The concept of subgenus Omega is widened to include the species-groups of M.surinamensis and M.prominulus. Besides the new subgeneric classification presented, limits and diagnoses of all species-groups of the subgenera Phi and Haplometrobius sensu Richards (1978) are discussed, and a new key for all subgenera and species-groups of Mischocyttarus is also presented.

Visitantes florais do maracujá-amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpa Deg. Passifloraceae) em áreas de cultivo com diferentes proximidades a fragmentos florestais na região Norte Fluminense, RJ

Este trabalho teve como objetivos estudar a biologia floral e identificar os principais polinizadores do maracujá-amarelo em áreas de cultivo com diferentes proximidades a fragmentos florestais no norte do estado do Rio de Janeiro. A floração do maracujá-amarelo teve duração de nove meses, no período de setembro a maio. As flores iniciavam a antese às 12:00 h e abriam-se ao longo do dia até às 16:30 h. O processo de curvatura dos estiletes ocorreu ao longo da antese e 72,4% das flores curvaram seus estiletes. A produção de néctar deu-se continuamente, atingindo 18μl/flor/hora e a concentração de solutos totais variou entre 38 e 42%. Xylocopa frontalis e Xylocopa ordinaria foram os principais polinizadores do maracujá-amarelo pela freqüência de visitas, comportamento intrafloral e porte corporal. Estas espécies de abelhas, além de Apis mellifera, estiveram presentes em todas as áreas de cultivo. A maior riqueza de visitantes polinizadores do maracujá-amarelo foi observada em áreas de cultivo próximas a fragmentos florestais, fato relacionado à presença de certos grupos de abelhas nativas, como Centridini e Euglossina (Apidae) que dependem de áreas florestais para nidificação e alimentação. A proximidade a fragmentos florestais também é importante para o fornecimento de recursos alimentares e de nidificação ao longo do ano para a manutenção de populações de Xylocopa.

Phylogeny and revision of the bee genus Rhinocorynura Schrottky (Hymenoptera, Apidae, Augochlorini), with comments on its female cephalic polymorphism

Phylogeny and revision of the bee genus Rhinocorynura Schrottky (Hymenoptera, Apidae, Augochlorini), with comments on its female cephalic polymorphism. A taxonomic revision and a phylogeny for the species of Rhinocorynura are provided. Six species are recognized: R. briseis, R. crotonis, R. inflaticeps and R. vernoniae stat. nov., the latter removed from synonymy with R. inflaticeps, in addition to two newly described species, R. brunnea sp. nov. and R. viridis sp. nov. Lectotypes for Halictus crotonis Ducke, 1906 and Halictus inflaticeps Ducke, 1906 are hereby designated. Another available name included in Rhinocorynura, Corynuropsis ashmeadi Schrottky, 1909, is removed from the genus and treated as species inquerenda in Augochlorini. Rhinocorynura is monophyletic in the phylogenetic analysis and the following relationships were found among its species: (R. crotonis (R. briseis ((R. brunnea sp. nov. + R. viridis sp. nov.) (R. inflaticeps + R. vernoniae)))). Biogeographic relationships within the genus and comparisons with related taxa are presented. Females of all species exhibit pronounced variation in body size, in two of them, R. inflaticeps and R. vernoniae, with structural modifications possibly linked to division of labor. Identification key and illustrations for the species are provided.

The type-species of Psilochlorops Duda (Diptera, Chloropidae) and its position in the phylogeny of the genus, with the description of a new species

The type-species of Psilochlorops Duda (Diptera, Chloropidae) and its position in the phylogeny of the genus, with the description of a new species. The genus Psilochlorops is known only for the Neotropical Region and had six described species to date. Psilochlorops niger sp. nov. is herein described and the male genitalia of P. clavitibia, the type-species of the genus, is described in detail. A new cladistic analysis of Psilochlorops is presented, including all known species of the genus.

Influência de fungos micorrízicos arbusculares, associada à adição de compostos fenólicos, no crescimento de mudas de maracujazeiro amarelo (Passiflora edulis f. flavicarpus)

Realizou-se um experimento em casa de vegetação, com o objetivo de avaliar a influência da inoculação com fungos micorrízicos arbusculares (FMAs), associada à adição de formononetina (nas concentrações de 0, 5 e 10 µ mol L-1), quercetina e morina (nas concentrações de 0, 5, 10 e 15 µ mol L-1), no crescimento e teor de nutrientes de mudas de maracujazeiro, avaliadas em duas fases: produção das mudas em substrato estéril e após o transplantio para substrato não-estéril. Utilizaram-se as espécies Glomus clarum (Gc) e Glomus fasciculatum (Gf) e uma população nativa de FMAs (IN) isolada de um plantio de maracujá no município de São João da Barra (RJ). Todos os FMAs avaliados (Gc, Gf e IN) proporcionaram aumentos significativos na produção de matéria seca e no teor de nutrientes na fase de produção de mudas e após o transplantio para substrato não-estéril. A aplicação dos compostos fenólicos teve efeito apenas na fase após o transplantio, destacando-se as plantas não inoculadas que mostraram efeito benéfico da aplicação dos flavonóis quercetina e morina e do isoflavonóide formononetina (apenas na concentração 5 µ mol L-1) na colonização radicular pelos FMAs, indicando que tais compostos estimularam a população nativa de FMAs presente no substrato. Nas plantas inoculadas, não se verificou efeito dos compostos na colonização radicular pelo fungo, mas observou-se efeito positivo em algumas das variáveis analisadas.

INFLUÊNCIA DE DIVERSOS SUBSTRATOS NO DESENVOLVIMENTO DE MUDAS DE MARACUJAZEIRO AZEDO (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa DEG)

Objetivando avaliar a influência de diversos substratos no desenvolvimento de mudas de maracujazeiro-azedo, conduziu-se um experimento em casa de vegetação da Emprapa Cerrados. Utilizou-se o delineamento experimental de blocos casualizados, em esquema fatorial 2 x 4 x 3 x 2, totalizando 48 tratamentos, 18 plantas úteis por parcela e 4 repetições. Os tratamentos constituíram-se das combinações de: dois substratos comerciais (PlantmaxR -- à base de vermiculita mais casca de Pinus sp e VermiculitaR); três fontes orgânicas (f.o.) (húmus, esterco de curral e NutriplantaR (produto à base de bactérias) e ausência de f.o., na proporção de 3:1 do substrato básico para a f.o.); duas formulações de adubo [OsmocoteR na fórmula 14-14-14 (produto de lenta liberação de nutrientes) e 4-14-8 (de liberação normal)], além da ausência de adubo; e Glomus etunicatum, ausência e presença. O substrato comercial PlantmaxR foi superior à VermiculitaR em todas as características analisadas. Dentre as f.o., o NutriplantaR junto com o esterco proporcionaram o melhor desempenho. O OsmocoteR promoveu o maior desenvolvimento das mudas, seguido pelo 4-14-8. A presença ou ausência de f.o. combinada com PlantmaxR praticamente não influenciou nas características analisadas. Não se deve utilizar o Glomus etunicatum associado a PlantmaxR, devido ao alto teor de fósforo presente neste substrato.

EXTRAÇÃO DE DNA GENÔMICO DE Passiflora spp. PARA ANÁLISES PCR-RAPD

A identificação e caracterização da diversidade genética de plantas por meio de técnicas moleculares envolvem a avaliação de vários indivíduos, necessitando-se, portanto, de métodos rápidos e precisos de extração do DNA. O co-isolamento de polissacarídeos, fenóis e compostos secundários é o principal problema encontrado no isolamento e purificação de DNA vegetal. Folhas das diversas espécies de Passiflora possuem níveis variados desses compostos que podem comprometer este procedimento. O presente estudo foi realizado com o objetivo de avaliar a qualidade e quantidade de DNA de folhas de variedades de Passiflora spp., utilizando-se de três métodos de extração. Os três métodos forneceram DNA em qualidade e quantidade suficientes para a realização da técnica PCR-RAPD.

Atratividade e preferência alimentar de adultos de Epicauta atomaria (Germ., 1821) (Col.: Meloidae) em maracujazeiros (Passiflora spp.), sob condições de laboratório

A atratividade e a preferência alimentar de adultos de Epicauta atomaria (Germ., 1821) por folhas de espécies de maracujazeiro Passiflora spp. foram avaliadas sob condições de laboratório. Em testes de atratividade realizados em placas de Petri e olfatômetro, os discos foliares e extratos foliares de P. setacea e P. edulis f. flavicarpa foram os mais preferidos por adultos de E. atomaria, enquanto P. giberti, P. nitida e P. alata foram os menos preferidas nos dois tipos de recipientes. Nos testes de consumo com e sem chance de escolha utilizando discos foliares, P. setacea foi a mais consumida, confirmando sua suscetibilidade; P. giberti e P. nitida foram pouco consumidas, apresentando não-preferência para alimentação como mecanismo de resistência; P. edulis f. flavicarpa e P. alata também revelaram não-preferência para alimentação, porém em níveis mais baixos.

Propagação por estaquia dos maracujazeiros doce (Passiflora alata Dryand.) e amarelo (P. edulis f. flavicarpa O. Deg.)

A estaquia é uma das técnicas de propagação vegetativa do maracujazeiro que permite a obtenção de pomares uniformes, bem como de porta-enxertos que confiram ganhos de produtividade e/ou resistência a pragas e doenças. Porém, as informações sobre o melhor tipo de estaca a ser usado não são conclusivas. Com o objetivo de avaliar o desempenho de vários tipos de estacas, como material para formação de mudas de maracujazeiros, foi conduzido um experimento no Setor de Fruticultura da Universidade Federal de Viçosa. Os fatores em estudo foram estacas apicais, medianas e basais do último surto de crescimento dos maracujazeiros doce (Passiflora alata Dryand.) e amarelo (P. edulis f. flavicarpa O. Deg.). Cinqüenta dias após o início do experimento, foram avaliados a percentagem de enraizamento, o número de raízes, o comprimento da maior raiz, a massa seca do sistema radicular, o comprimento e a área do sistema radicular, e a massa seca da parte aérea. Estacas das posições basal e mediana apresentaram maior potencial de enraizamento e maior crescimento do sistema radicular. Embora não tenham diferido quanto à percentagem de enraizamento e ao número de raízes, o maracujazeiro-doce apresentou sistema radicular mais vigoroso que o amarelo.