High proportion of hepatitis C virus genotypes 1 and 3 in a large cohort of patients from Southern Brazil

Hepatitis C virus (HCV) isolates have been divided into six genotypes (1 to 6). The duration of hepatitis C standard treatment is 48 weeks for patients infected with HCV genotype 1 vs 24 weeks for those infected with genotypes 2 and 3. A total of 1544 HCV isolates from chronic patients living in the southern Brazilian states of Rio Grande do Sul (RS, n = 627) and Santa Catarina (SC, n = 917) were genotyped by restriction fragment length polymorphism (RFLP) of polymerase chain reaction (PCR) products. In RS, 338 (53.9%; 95% CI 50.0 - 57.8%), 34 (5.4%; 95% CI 3.8 - 7.4%) and, 255 (40.7%; 95% CI 36.9 - 44.6%) samples were from genotypes 1, 2, and 3, respectively. In SC, 468 (51%; 95% CI 47.8 - 54.2%), 26 (2.9%; 95% CI 1.9 - 4.1%) and, 423 (46.1%; 95% CI 42.9 - 49.3%) samples were from genotypes 1, 2, and 3, respectively. Genotyping results were confirmed by direct nucleotide sequencing of PCR products derived from 68 samples, without any discrepancy between PCR-RFLP and nucleotide sequencing methods. In conclusion, almost half of the hepatitis C patients from South of Brazil are infected by genotypes 2 and 3 and, these results have important consequential therapeutic implications as they can be treated for only 24 weeks, not 48.

Síntese de 1,3,5-triazinas substituídas e avaliação da toxicidade frente a Artemia Salina leach

The synthesis of ten symmetrically and unsymmetrically substituted 1,3,5-triazines by Phase Transfer Catalysis (PTC) method is described. Their toxicities were determined against Artemia salina Leach. The LD50 values have also been obtained for these compounds.

Spectrophotometric determination of arsenic in soil samples using 2-(5-bromo-2-pyridylazo)-5-di-ethylaminophenol (Br-PADAP)

In this paper, a new, simple and sensitive method for arsenic determination in soil is proposed. This is based on the reduction of silver (I) and iron (III) ions by arsine followed by a complexation reaction of iron (II) with the spectrophotometric reagent Br-PADAP 2-(5-bromo-2-pyridylazo)-5-di-ethylaminophenol. Arsenic determination with a Sandell's sensitivity of 3.1 10-4 cm-2, linear range from 0.1 µg ml-1 to 2.0 µg ml-1 (r560 = 0.9995), molar absorptivity of 2.45 10(5) l mol-1 cm-1 and a concentration detection limit of 1.4 ng ml-1 (3s) were obtained using a 10 ml sample volume. Selectivity was increased with the use of EDTA as a masking agent. The proposed method was applied for arsenic determination in the presence of several ions amounts in digested soil samples. The results revealed that antimony (III), mercury (II), germanium (IV), platinum (IV) interferes at all analyzed proportions. The interferences can be easily removed by the use of EDTA. Precision and accuracy obtained were satisfactory with a R.S.D. < 5 %. Recovery of arsenic in soil samples varied from 95.55 to 102.70 % with a mean of 99.63 %. These results demonstrated that the proposed method is applicable for arsenic analysis in different soil samples.

Active replication of hepatitis B virus (HBV) in HIV type 1 and in HIV type 2 infected patients

To evaluate the effect of concurrent infection by HIV on HBV infection or immunity, we have studied a group of 66 HIV1+ symptomatic Caucasian patients and another of 38 African HIV2+ asymptomatic individuals, concerning their HBV status: serological markers of infection and presence of HBV-DNA in serum, the last taken as sign of hepatitis B virus active replication, were monitored. HIV+ groups were compared with seronegative controls, adequately matched for age, sex and ethnological background. HBV DNA was found in 7.6% of HIV1+ Caucasian patients and 3.2% of seronegative controls; in African HIV2+ individuals 2.6% were also HBV DNA+, a percentage close to that found in HIV2 seronegative controls (2.9%). No correlation was found between HIV infection and HBV active replication. Immunodepression that follows HIV infection over time may be compatible with a degree of T cell function capable of avoiding reinfection with or reactivation of HBV, even in symptomatic stages of acquired immunodeficiency syndrome. Our findings are relevant to the choice of preventive strategies in populations at risk for HIV and HBV infection.

Hipometilação do LINE-1 está Associada ao Risco de Doença Cardíaca Coronariana na População Chinesa

Fundamentos: O n37;vel de metila31;ão global do ADN de leuc3;citos no sangue tem sido associado ao risco de doen31;a arterial coronariana (DAC), com resultados inconsistentes em diferentes popula31;ões. Faltam dados semelhantes da popula31;ão chinesa, onde diferentes fatores gen33;ticos, de estilo de vida e ambientais podem afetar a metila31;ão do ADN e sua rela31;ão com o risco de DCC. Objetivos: Analisar se a metila31;ão global está associada ao risco de doen31;a coronariana na popula31;ão chinesa. M33;todos: Foram inclu37;dos um total de 334 casos de DCC e 788 controles saudáveis. A metila31;ão global do ADN de leuc3;citos de sangue foi estimada por meio da análise das repeti31;ões do LINE-1 usando pirosequenciamento de bissulfito. Resultados: Em uma análise inicial restrita aos controles o n37;vel do LINE-1 diminui significativamente com a idade avan31;ada, colesterol total elevado, e diagn3;stico de diabetes. Na análise de caso-controle, a redu31;ão da metila31;ão do LINE-1 foi associada ao aumento do risco de DCC, tendo a análise por quartil revelado uma odds ratio (IC 95%) de 0,9 (0,6-1,4), 1,9 (1,3-2,9) e 2,3 (1,6 3.5) para o terceiro, segundo e primeiro (o mais baixo) quartil (P da tend34;ncia < 0,001), respectivamente, em compara31;ão com o quarto (o mais alto) quartil. A metila31;ão inferior (< mediana) do LINE-1 esteve associada a 2,2 vezes (IC 95% = 1,7-3,0) o aumento de risco de doen31;a coronariana. As estimativas de risco de DCC menores relacionadas com o LINE-1 tenderam a ser mais fortes entre os indiv37;duos com maior tercil de homociste37;na (P intera31;ão = 0,042) e naqueles com diagn3;stico de hipertensão arterial (P intera31;ão = 0,012). Conclusão: A hipometila31;ão do LINE-1 está associada ao risco de doen31;a coronariana na popula31;ão chinesa. Fatores de risco de DCC potenciais tais como a idade avan31;ada, colesterol total elevado, e diagn3;stico de diabetes podem ter impacto na metila31;ão global do ADN, exercendo, portanto, o seu efeito sobre o risco de doen31;a coronariana.

Human bocavirus 1 and 3 infection in children with acute gastroenteritis in Brazil

To determine the positivity rate of human bocavirus (HBoV) 1 and 3 among children who presented with acute gastroenteritis symptoms during the period of 1994-2004 in the Central-West Region of Brazil, 762 faecal samples were tested using polymerase chain reaction (PCR) for the detection of HBoV DNA. Primers for a segment of the non-structural viral protein 1 (NS1) gene of HBoV-1 and HBoV-3 were used. Twelve HBoV-positive samples were further characterised via genomic sequencing and phylogenetic analysis. Of the samples tested, 5.8% (n = 44) were positive for HBoV-1 or HBoV-3 and co-infection was observed in 14 (31.8%) of the 44 HBoV-positive samples. Nine of the 14 samples were also positive for Rotavirus A and five were positive for Aichi virus. The genomic sequencing of the NS1 partial sequence of 12 HBoV-samples showed that 11 samples were characterised as HBoV-1 and that one was characterised as HBoV-3. The phylogenetic analysis showed that the HBoV-1 samples had a high sequence homology to others previously identified in China, Sweden and Brazil. This is the first study conducted in the Central-West Region of Brazil to detect HBoV-1 and HBoV-3 in faecal samples from children with acute gastroenteritis. Further studies are required to define the role of HBoVs as aetiological agents of gastroenteritis.

Disponibilidade de zinco para milho pelos extratores Mehlich-1, Mehlich-3 e DPTA em solos de Minas Gerais, na presença e ausência de calagem

No Brasil, diversos extratores químicos são utilizados na determinação de Zn disponível para as plantas, destacando-se Mehlich-1 e DTPA. Este trabalho foi realizado com o objetivo de estudar a disponibilidade de Zn em solos de Minas Gerais em função de doses de Zn e de calcário e extratores químicos, utilizando-se milho como planta indicadora. Os extratores estudados foram: (a) Mehlich-1 com filtragem lenta após a extração (M-1f); (b) Mehlich-1 com retirada do sobrenadante após 16 h de repouco (M-1s); (c) Mehlich-3 (M-3); e (d) DTPA. As amostras receberam adubação básica com macro e micronutrientes (-Zn) e cinco doses de Zn na forma de ZnSO4 (0, 2, 4 6 e 8 mg dm-3 de Zn) na ausência ou presença de calagem. Quinze dias após a fertilização, subamostras foram coletadas para a determinação de Zn pelos extratores. Para Mehlich-1, o extrato foi obtido por meio de dois procedimentos: filtragem logo após extração (M-1f) e retirada de alíquota após 16 h (M-1s). O restante do solo foi acondicionado em vasos plásticos, para o cultivo do milho durante 50 dias. A capacidade de extração variou na seguinte ordem: M-1s > M-1f > M-3 > DTPA, para todos os solos, na ausência e na presença de calagem. O M-1s e o M-3 não apresentaram diferenças na capacidade de extração com a calagem, enquanto M-1f e DTPA foram sensíveis à calagem. Os teores de Zn obtidos com todos os extratores correlacionaram-se significativa e negativamente com o teor de argila e a capacidade de campo dos solos, tanto na ausência como na presença de calagem. Os teores obtidos com DTPA apresentaram maior correlação com características de solo na presença de calagem, indicando que esse extrator aumentou sua sensibilidade à capacidade-tampão em valores mais elevados de pH. Todos os extratores mostraram correlações com o conteúdo de Zn na planta; portanto, podem ser utilizados na avaliação da disponibilidade de Zn do solo.

Submissão às recomendações do BI-RADS™ por médicos e pacientes: análise preliminar de 3.000 exames realizados em uma clínica particular

O Breast Imaging Reporting and Data System (BI-RADS™) do American College of Radiology é um sistema que objetiva padronizar o laudo mamográfico, reduzir os fatores de confusão na descrição e interpretação das imagens e facilitar a emissão do resultado final do exame. OBJETIVO: Buscar identificar o grau de submissão das mulheres e médicos às recomendações do BI-RADS em Goiânia, GO. MATERIAIS E MÉTODOS: Foram avaliadas, prospectivamente, 3.000 mulheres submetidas à mamografia em um serviço radiológico particular em Goiânia (janeiro a dezembro de 2002). Os laudos foram emitidos de acordo com o BI-RADS. As mulheres classificadas nas categorias 0, 3, 4 e 5 foram acompanhadas por contato telefônico. RESULTADOS: Mulheres que se recusaram a seguir orientação: categorias 0 (11,5%), 3 (13,8%), 4 (28%) e 5 (0%). Não houve orientação médica para seguir recomendação: categorias 0 (18,2%), 3 (17%), 4 (20%). Mulheres que se submeteram à recomendação: categorias 0 (1,8%), 3 (5,7%), 4 (40%), 5 (100%). Perdidas no seguimento: categorias 0 (68,5%), 3 (39%) e 4 (12%). CONCLUSÃO: É baixa a submissão às recomendações do BI-RADS nas categorias 0 e 3, e moderada na categoria 4. Aproximadamente 30% das mulheres classificadas na categoria 0 não se submeteram à avaliação adicional por imagem, por recusa própria ou por falta de orientação médica.

Synthesis, antimicrobial and cytotoxic activities of 5-benzylidene-2-[(pyridine-4-ylmethylene)hydrazono]-thiazolidin-4-one and 2-[(pyridine-4-ylmethylene) hydrazono]-thiazolidin-4-one derivatives

A new series of 5-benzylidene-2-[(pyridine-4-ylmethylene)hydrazono]-thiazolidin-4-ones 4a-l have been synthesized. These compounds were designed by a molecular hybridization approach. 2-[(Pyridine-4-ylmethylene)hydrazono]-thiazolidin-4-ones 3a-d were also obtained and used as intermediates to give the target compounds. The in vitro antimicrobial and cytotoxic activities were evaluated for both series. The intermediate 3b showed considerable antibiotic activity against B. subtilis and C. albicans. In the cytotoxic activity compounds 3b (IC50= 4.25 ± 0.36 µg/mL) and 4l (IC50= 1.38 ± 0.04 µg/mL) were effective for inhibition of human erythromyeloblastoid leukemia (K-562) and human lung carcinoma (NCI-H292) cell lines, respectively.

Avaliação da variabilidade do Grapevine leafroll-associated virus 1 e 3 por análise de seqüências de nucleotídeos e polimorfismo conformacional de fita simples

As principais espécies de vírus envolvidas na etiologia do enrolamento da folha da videira (Vitis spp.) são Grapevine leafroll-associated virus 1 e 3 (GLRaV-1 e -3). Neste estudo da variabilidade desses vírus, foram amplificados dois fragmentos de DNA (396 bp do GLRaV-1 e 602 bp do GLRaV-3) por RT-PCR, a partir de RNA total extraído de nervuras e pecíolos de videiras infetadas, utilizando-se dois pares de oligonucleotídeos. Os DNAs amplificados foram clonados e reamplificados, a partir dos clones recombinantes, e comparados quanto às diferenças conformacionais das fitas simples desnaturadas (SSCP). Foram observados dois padrões distintos de perfis eletroforéticos para cada vírus, tendo sido seqüenciado pelo menos um clone viral correspondente a cada padrão. As duas seqüências de nucleotídeos obtidas para o GLRaV-1 apresentaram maior homologia (79,8% e 87,4%) com um isolado australiano e as duas seqüências relativas ao GLRaV-3 exibiram maior homologia (75,1% e 81,8%) com um isolado norte-americano. Os resultados demonstraram a ocorrência de seqüências variantes destes vírus nas videiras analisadas.

Soroprevalência de herpesvírus bovinos tipos 1 e/ou 5 no Estado do Rio Grande do Sul

Este estudo objetivou estimar a prevalência de anticorpos contra os herpesvírus bovinos tipos 1 e 5 (BoHV-1 e BoHV-5) no Estado do Rio Grande do Sul (RS), Brasil, frente a diferentes cepas de BoHV-1 e BoHV-5. As amostras de soro utilizadas foram extraídas de uma amostragem mais ampla, desenhada para estimar a prevalência de brucelose bovina no Estado. Todos os soros foram coletados de vacas com idade igual ou superior a 24 meses de idade, não vacinadas contra herpesvírus bovinos, de rebanhos de corte e leite. O cálculo amostral foi baseado em uma expectativa de prevalência média de infecção de 33%, considerando-se um erro padrão não superior a 1% e um intervalo de confiança de 95%. Com base nesse cálculo foram examinados 2.200 soros, provenientes de 390 propriedades e 158 municípios. Os soros foram analisados na busca de anticorpos contra BoHV-1 e BoHV-5 pela técnica de soroneutralização (SN), executada frente a quatro cepas de vírus distintas: EVI123/98 e Los Angeles (BoHV-1.1); EVI88/95 (BoHV-5a) e A663 (BoHV-5b). A prevalência média de anticorpos contra o BoHV-1 e BoHV-5 nos animais amostrados foi de 29,2% (642/2200); animais soropositivos foram identificados em 57,7% (225/390) dos rebanhos. As estimativas de prevalência variaram de acordo com a cepa e/ou vírus utilizado para o desafio nos testes de SN. A prevalência e a sensibilidade mais altas foram obtidas quando os resultados positivos à SN frente aos quatro vírus distintos foram somados. O uso de somente um vírus de desafio na SN levaria a redução de sensibilidade de 20,4% a 34,6% quando comparada com os resultados positivos combinados. Estes achados evidenciam que anticorpos contra BoHV-1 e BoHV-5 estão amplamente difundidos nos rebanhos do RS, embora a prevalência em distintas regiões geográficas seja bastante variada. Os resultados obtidos nas estimativas de prevalência foram fortemente afetados pelas diferentes amostras de vírus usadas nos testes de SN. Esse fato deve ser levado em consideração quando estudos sorológicos para BoHV-1 e BoHV-5 forem realizados. Como a SN não é capaz de discriminar as respostas de anticorpos para BoHV-1 e BoHV-5, a prevalência tipo-específica permanece desconhecida.

The epigenetic modifiers 5-aza-2'-deoxycytidine and trichostatin A influence adipocyte differentiation in human mesenchymal stem cells

Epigenetic mechanisms such as DNA methylation and histone modification are important in stem cell differentiation. Methylation is principally associated with transcriptional repression, and histone acetylation is correlated with an active chromatin state. We determined the effects of these epigenetic mechanisms on adipocyte differentiation in mesenchymal stem cells (MSCs) derived from bone marrow (BM-MSCs) and adipose tissue (ADSCs) using the chromatin-modifying agents trichostatin A (TSA), a histone deacetylase inhibitor, and 5-aza-2′-deoxycytidine (5azadC), a demethylating agent. Subconfluent MSC cultures were treated with 5, 50, or 500 nM TSA or with 1, 10, or 100 µM 5azadC for 2 days before the initiation of adipogenesis. The differentiation was quantified and expression of the adipocyte genes PPARG and FABP4 and of the anti-adipocyte gene GATA2 was evaluated. TSA decreased adipogenesis, except in BM-MSCs treated with 5 nM TSA. Only treatment with 500 nM TSA decreased cell proliferation. 5azadC treatment decreased proliferation and adipocyte differentiation in all conditions evaluated, resulting in the downregulation of PPARG and FABP4 and the upregulation of GATA2. The response to treatment was stronger in ADSCs than in BM-MSCs, suggesting that epigenetic memories may differ between cells of different origins. As epigenetic signatures affect differentiation, it should be possible to direct the use of MSCs in cell therapies to improve process efficiency by considering the various sources available.

Effects of 5-aza-2′deoxycytidine on RECK gene expression and tumor invasion in salivary adenoid cystic carcinoma

Reversion-inducing cysteine-rich protein with kazal motifs (RECK), a novel tumor suppressor gene that negatively regulates matrix metalloproteinases (MMPs), is expressed in various normal human tissues but downregulated in several types of human tumors. The molecular mechanism for this downregulation and its biological significance in salivary adenoid cystic carcinoma (SACC) are unclear. In the present study, we investigated the effects of a DNA methyltransferase (DNMT) inhibitor, 5-aza-2′deoxycytidine (5-aza-dC), on the methylation status of the RECK gene and tumor invasion in SACC cell lines. Methylation-specific PCR (MSP), Western blot analysis, and quantitative real-time PCR were used to investigate the methylation status of the RECK gene and expression of RECK mRNA and protein in SACC cell lines. The invasive ability of SACC cells was examined by the Transwell migration assay. Promoter methylation was only found in the ACC-M cell line. Treatment of ACC-M cells with 5-aza-dC partially reversed the hypermethylation status of the RECK gene and significantly enhanced the expression of mRNA and protein, and 5-aza-dC significantly suppressed ACC-M cell invasive ability. Our findings showed that 5-aza-dC inhibited cancer cell invasion through the reversal of RECKgene hypermethylation, which might be a promising chemotherapy approach in SACC treatment.

Utilização da microtécnica para a identificação sorológica intratípica de estirpes de poliovírus dos tipos 1 e 3

Foram estudadas de modo comparativo a macro e a microtécnica em provas de identificação sorológica intratípica de 28 estirpes de poliovírus dos tipos 1 e 3, segundo o método da "comparação dos índices de neutralização". Os resultados alcançados mostraram uma correlação elevada entre os índices de neutralização obtidos com ambas as técnicas empregadas - 0,931 e 0,971 após incubação de três e cinco dias, respectivamente - e correspondência total na identificação das estirpes examinadas. Conclui-se que a microtécnica pode ser utilizada em substituição da macrotécnica tradicional na identificação intratípica de poliovírus dos tipos 1 e 3, com, a vantagem da economia de meios e reagentes, e até mesmo com sensível redução de esforços humanos e tempo de execução das provas.

Nutritional status of pregnant women: prevalence and associated pregnancy outcomes

INTRODUCTION: Although obesity is well recognized as a current public health problem, its prevalence and impact among pregnant women have been less investigated in Brazil. The objective of the study was to evaluate the impact of pre-obesity and obesity among pregnant women, describing its prevalence and risk factors, and their association with adverse pregnancy outcomes. METHODS: A cohort of 5,564 pregnant women, aged 20 years or more, enrolled at aproximately 20 to 28 weeks of pregnancy, seen in prenatal public clinics of six state capitals in Brazil were followed up, between 1991 and 1995. Prepregnancy weight, age, educational level and parity were obtained from a standard questionnaire. Height was measured in duplicate and the interviewer assigned the skin color. Nutritional status was defined using body mass index (BMI), according to World Health Organization (WHO) criteria. Odds ratios and 95% confidence interval were calculated using logistic regression. RESULTS: Age-adjusted prevalences (and 95% CI) based on prepregnancy weight were: underweight 5.7% (5.1%-6.3%), overweight 19.2% (18.1%-20.3%), and obesity 5.5% (4.9%-6.2%). Obesity was more frequently observed in older black women, with a lower educational level and multiparous. Obese women had higher frequencies of gestational diabetes, macrosomia, hypertensive disorders, and lower risk of microsomia. CONCLUSIONS: Overweight nutritional status (obesity and pre-obesity) was seen in 25% of adult pregnant women and it was associated with increased risk for several adverse pregnancy outcomes, such as gestational diabetes and pre-eclampsia.