Identification et analyse des éléments caractérisant la participation de la population locale et les paramètres à considérer pour l'élaboration d'un plan d'aménagement et de gestion de terroir: Cas du Fokontany Ambohibary Sokafana - Corridor Anjozorobe Angavo

La gestion durable des ressources naturelles est actuellement perçue comme une condition essentielle pour le développement durable, et surtout pour les pays en développement comme Madagascar. Face à la dégradation continue des ressources naturelles et surtout forestières, diverses stratégies sont adoptées par l’état malgache, dont l’extension des aires protégées qui veut allier la protection intégrale de certaines parties des ressources, et la satisfaction des besoins des populations riveraines. Le Code des Aires Protégées constitue un outil destiné à la gestion de ces aires de conservation. Toutefois, l’élaboration du plan d’aménagement ne prend pas souvent en compte des paramètres tels que l’augmentation de la population et les besoins qui s’en suivent, ou bien la participation de ces populations au processus d’élaboration et de mise en oeuvre du plan. Le défi est d’arriver à intégrer ces deux logiques de protection et de satisfaction des besoins de la population locale en réalisant des plans d’aménagement et de gestion concertés. Le cas du fokontany Ambohibary Sokafana dans le Corridor Anjozorobe Angavo est étudié pour identifier les paramètres à considérer si on veut atteindre cet objectif : paramètres écologiques et socio-économiques influençant la gestion des ressources forestières, critères permettant de définir la participation des acteurs dans cette gestion. Une revue des ouvrages spécifiques traitant du sujet ainsi que des observations et rencontres avec les divers acteurs sur terrain ont été menées afin de pouvoir identifier ces divers paramètres. Les analyses ont permis d’avancer deux scénarii qui traduisent l’intégration de la protection des forêts et la satisfaction des besoins en bois et en produits vivriers des populations riveraines, en tenant compte des motivations de ces dernières à participer au processus d’appropriation du plan d’aménagement et de gestion.

A transposable element insertion in APOB causes cholesterol deficiency in Holstein cattle

Cholesterol deficiency, a new autosomal recessive inherited genetic defect in Holstein cattle, has been recently reported to have an influence on the rearing success of calves. The affected animals show unresponsive diarrhea accompanied by hypocholesterolemia and usually die within the first weeks or months of life. Here, we show that whole genome sequencing combined with the knowledge about the pedigree and inbreeding status of a livestock population facilitates the identification of the causative mutation. We resequenced the entire genomes of an affected calf and a healthy partially inbred male carrying one copy of the critical 2.24-Mb chromosome 11 segment in its ancestral state and one copy of the same segment with the cholesterol deficiency mutation. We detected a single structural variant, homozygous in the affected case and heterozygous in the non-affected carrier male. The genetic makeup of this key animal provides extremely strong support for the causality of this mutation. The mutation represents a 1.3kb insertion of a transposable LTR element (ERV2-1) in the coding sequence of the APOB gene, which leads to truncated transcripts and aberrant splicing. This finding was further supported by RNA sequencing of the liver transcriptome of an affected calf. The encoded apolipoprotein B is an essential apolipoprotein on chylomicrons and low-density lipoproteins, and therefore, the mutation represents a loss of function mutation similar to autosomal recessive inherited familial hypobetalipoproteinemia-1 (FHBL1) in humans. Our findings provide a direct gene test to improve selection against this deleterious mutation in Holstein cattle.