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Resumo:
Referat anlässlich der Vorstellung des Audiopädagogischen Dienstes Solothurn
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Regional lymph node metastasis negatively affects prognosis in colon cancer patients. The molecular processes leading to regional lymph node metastasis are only partially understood and proteomic markers for metastasis are still scarce. Therefore, a tissue-based proteomic approach was undertaken for identifying proteins associated with regional lymph node metastasis. Two complementary tissue-based proteomic methods have been employed. MALDI imaging was used for identifying small proteins (≤25 kDa) in situ and label-free quantitative proteomics was used for identifying larger proteins. A tissue cohort comprising primary colon tumours without metastasis (UICC II, pN0, n = 21) and with lymph node metastasis (UICC III, pN2, n = 33) was analysed. Subsequent validation of identified proteins was done by immunohistochemical staining on an independent tissue cohort consisting of primary colon tumour specimens (n = 168). MALDI imaging yielded ten discriminating m/z species, and label-free quantitative proteomics 28 proteins. Two MALDI imaging-derived candidate proteins (FXYD3 and S100A11) and one from the label-free quantitative proteomics (GSTM3) were validated on the independent tissue cohort. All three markers correlated significantly with regional lymph node metastasis: FXYD3 (p = 0.0110), S100A11 (p = 0.0071), and GSTM3 (p = 0.0173). FXYD3 and S100A11 were more highly expressed in UICC II patient tumour tissues. GSTM3 was more highly expressed in UICC III patient tumour tissues. By our tissue-based proteomic approach, we could identify a large panel of proteins which are associated with regional lymph node metastasis and which have not been described so far. Here we show that novel markers for regional lymph metastasis can be identified by MALDI imaging or label-free quantitative proteomics and subsequently validated on an independent tissue cohort. Copyright © 2012 Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd.
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To characterize proteomic changes found in Barrett's adenocarcinoma and its premalignant stages, the proteomic profiles of histologically defined precursor and invasive carcinoma lesions were analyzed by MALDI imaging MS. For a primary proteomic screening, a discovery cohort of 38 fresh frozen Barrett's adenocarcinoma patient tissue samples was used. The goal was to find proteins that might be used as markers for monitoring cancer development as well as for predicting regional lymph node metastasis and disease outcome. Using mass spectrometry for protein identification and validating the results by immunohistochemistry on an independent validation set, we could identify two of 60 differentially expressed m/z species between Barrett's adenocarcinoma and the precursor lesion: COX7A2 and S100-A10. Furthermore, among 22 m/z species that are differentially expressed in Barrett's adenocarcinoma cases with and without regional lymph node metastasis, one was identified as TAGLN2. In the validation set, we found a correlation of the expression levels of COX7A2 and TAGLN2 with a poor prognosis while S100-A10 was confirmed by multivariate analysis as a novel independent prognostic factor in Barrett's adenocarcinoma. Our results underscore the high potential of MALDI imaging for revealing new biologically significant molecular details from cancer tissues which might have potential for clinical application. This article is part of a Special Issue entitled: Translational Proteomics.
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In clinical diagnostics, it is of outmost importance to correctly identify the source of a metastatic tumor, especially if no apparent primary tumor is present. Tissue-based proteomics might allow correct tumor classification. As a result, we performed MALDI imaging to generate proteomic signatures for different tumors. These signatures were used to classify common cancer types. At first, a cohort comprised of tissue samples from six adenocarcinoma entities located at different organ sites (esophagus, breast, colon, liver, stomach, thyroid gland, n = 171) was classified using two algorithms for a training and test set. For the test set, Support Vector Machine and Random Forest yielded overall accuracies of 82.74 and 81.18%, respectively. Then, colon cancer liver metastasis samples (n = 19) were introduced into the classification. The liver metastasis samples could be discriminated with high accuracy from primary tumors of colon cancer and hepatocellular carcinoma. Additionally, colon cancer liver metastasis samples could be successfully classified by using colon cancer primary tumor samples for the training of the classifier. These findings demonstrate that MALDI imaging-derived proteomic classifiers can discriminate between different tumor types at different organ sites and in the same site.
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Hintergrund: Die Nachfrage nach komplementärmedizinischer Behandlung, insbesondere im Bereich der Traditionellen Chinesischen Medizin (TCM), hat im In-und Ausland im Verlauf der letzten beiden Jahrzehnte stetig zugenommen. Um zukünftige Ärzte kompetenter auf die Patientenbedürfnisse vorzubereiten, wurde von Fachpersonen aus der Forschung, klinischen Praxis, Bildung und Politik eine stärkere Integration der Komplementärmedizin (CAM) in bestehende Ausbildungsprogramme interdisziplinär diskutiert. Mit der vorliegenden Umfragestudie wurde bei Medizinstudierenden im Präklinikum sowohl deren Einstellung gegenüber, Erfahrung mit und Kenntnisstand zu der TCM in Erfahrung gebracht als auch abgeklärt, inwiefern das Interesse an einer Erweiterung ihres Pflicht-Curriculums um TCM-Unterrichtseinheiten vorhanden ist. Material und Methoden: 180 Medizinstudierende des zweiten Studienjahrs an der Universität Bern wurden gebeten, sich an der Fragebogenstudie zu beteiligen (Rücklaufquote 73,3%). Ergebnisse: Für 3,8% der Antwortenden ist die TCM der Schulmedizin ebenbürtig. Die grosse Mehrheit (76,3%) sieht die TCM als eine zur westlichen Medizin komplementäre Behandlungsform. Für 9,2% stellt die TCM eine primär auf dem Placeboeffekt beruhende Behandlungsform dar, und für 10,7% gilt die TCM als veraltet. 46,6% der Antwortenden befürworten die Aufnahme von zusätzlichen TCM-Veranstaltungen in das Pflichtstudium. 17,4% haben sich in der Vergangenheit mit TCM mit überwiegend positiver Rückmeldung behandeln lassen. Die Offenheit für TCM-Behandlungen bei jenen ohne Selbsterfahrung ist gross (76,1%). Eigene TCM-Kenntnisse wurden von 76,5% als kaum vorhanden eingeschätzt. Schlussfolgerungen: Von den Medizinstudierenden im Vorklinikum wird der TCM trotz geringer Vorkenntnisse grosses Interesse entgegengebracht. Möglichkeiten zur stärkeren Einbindung der TCM in das bestehende Medizinstudium sind zu prüfen.
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Nachhaltigkeit, Klimawandel und Umweltschutz sind zu festen Bestandteilen der politischen und medialen Agenda geworden. Als Christian Pfister in den 1960er Jahren mit den Wechselwirkungen zwischen Mensch, Umwelt und Raum in Berührung kam, wurden diese Fragen noch kaum diskutiert. Mit seinen Forschungen zur Geschichte des Klimas, der Naturkatastrophen, der Energie und des Verkehrs bewies er ein feines Gespür für zukunftsweisende Themen. Als einer der ersten Historiker wagte er sich an eine Verknüpfung von klimatischen, wirtschaftlichen, sozialen und demographischen Prozessen, deren Bestandteile er später zu einer Wirtschafts-, Sozial- und Umweltgeschichte zusammenfügte. Seine Forschung ist der nachhaltigen Entwicklung verpflichtet: der ökologischen und sozialen Verträglichkeit sowie der wirtschaftlichen Effizienz. Dieses «magische Dreieck» dient Christian Pfister als Interpretationsrahmen, der seinen Blick auf die Vergangenheit beeinflusst und seinen Forschungen sowohl innerhalb als auch ausserhalb der Geschichtswissenschaft eine nachhaltige Wirkung verschafft hat.