Comparison of methods for the identification of coagulase-negative staphylococci

Coagulase-negative staphylococci (CNS) species identification is still difficult for most clinical laboratories. The scheme proposed by Kloos and Schleifer and modified by Bannerman is the reference method used for the identification of staphylococcal species and subspecies; however, this method is relatively laborious for routine use since it requires the utilization of a large number of biochemical tests. The objective of the present study was to compare four methods, i.e., the reference method, the API Staph system (bioMérieux) and two methods modified from the reference method in our laboratory (simplified method and disk method), in the identification of 100 CNS strains. Compared to the reference method, the simplified method and disk method correctly identified 100 and 99% of the CNS species, respectively, while this rate was 84% for the API Staph system. Inaccurate identification by the API Staph method was observed for Staphylococcus epidermidis (2.2%), S. hominis (25%), S. haemolyticus (37.5%), and S. warneri (47.1%). The simplified method using the simple identification scheme proposed in the present study was found to be efficient for all strains tested, with 100% sensitivity and specificity and proved to be available alternative for the identification of staphylococci, offering, higher reliability and lower cost than the currently available commercial systems. This method would be very useful in clinical microbiology laboratory, especially in places with limited resources.

Estomatite protética em pacientes com Diabetes mellitus: prevalência de Candida spp. e eficiência dos tratamentos com nistatina e desinfecção de próteses por micro-ondas

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Pesquisa de genes de resistência do M. tuberculosis a isoniazida e rifampicina por sequenciamento e pela tecnologia de DNA-STRIP

Tuberculose (TB), causada por Mycobacterium tuberculosis, é uma das doenças infecciosas que mais causam mortes. Estima-se que mais de dois bilhões de pessoas estejam infectadas no mundo. O tratamento da TB consite em associação de fármacos, isoniazida, rifampicina, pirazinamida e etambutol, nos primeiros 2 meses e 4 meses de isoniazida e de rifampicina. Internacionalmente, são consideradas cepas multi resistentes (MDR), as que apresentam resistência simultânea a isoniazida e a rifampicina. A rápida detecção de resistência é essencial para o controle e tratamento da TB, reduzindo, assim, o custo do tratamento e a transmissão da doença. Neste projeto, os isolados já identificados fenotipicamente como resistentes a isoniazida e/ou rifampicina, foram submetidos ao sequenciamento de Sanger para pesquisa de 3 genes relacionados a resistência a isoniazida (katG, inhA e ahpC) e 1 gene de resistência a rifampicina (rpoB). Foi realizada uma comparação destes genes mutados para a resistência utilizando o novo teste desenvolvido pela Biomérieux, denominado GenoType® MTBDRplus, que se baseia na tecnologia DNA-STRIP. Através deste novo teste, foi observada mutação em 22 isolados clínicos de M. tuberculosis para genes de resistência a isoniazida e/ou rifampicina, sendo 4 provenientes do MS e 18 de SP. Já pelo sequenciamento genético foi observada mutação em 24 isolados para genes de resistência a isoniazida e/ou rifampicina, sendo 6 provenientes do MS e 18 de SP. Portanto, através do sequenciamento de Sanger, foi possível detectar um número maior de isolados mutados e mais mutações quando comparado ao teste GenoType® MTBDRplus. Isso acontece porque na técnica de sequenciamento, um fragmento do gene como um todo é analisado e no caso do teste GenoType® MTBDRplus, é verificada apenas a ausência ou presença das mutações mais frequentes descritas na literatura, além de não ser analisado o gene ahpC. A grande ...