INSEL: an in silico method for optimizing and exploring biorecognition assays

A practical in silico method for optimizing and exploring biointeraction-based events is developed.

Prediction of crude protein digestibility of animal by-product meals for dogs by the protein solubility in pepsin method

Animal by-product meals have large variability in crude protein (CP) content and digestibility. In vivo digestibility procedures are precise but laborious, and in vitro methods could be an alternative to evaluate and classify these ingredients. The present study reports prediction equations to estimate the CP digestibility of meat and bone meal (MBM) and poultry by-product meal (PM) using the protein solubility in pepsin method (PSP). Total tract CP digestibility of eight MBM and eight PM samples was determined in dogs by the substitution method. A basal diet was formulated for dog maintenance, and sixteen diets were produced by mixing 70 % of the basal diet and 30 % of each tested meal. Six dogs per diet were used to determine ingredient digestibility. In addition, PSP of the MBM and PM samples was determined using three pepsin concentrations: 0·02, 0·002 and 0·0002 %. The CP content of MBM and PM ranged from 39 to 46 % and 57 to 69 %, respectively, and their mean CP digestibility by dogs was 76 (2·4) and 85 (2·6) %, respectively. The pepsin concentration with higher Pearson correlation coefficients with the in vivo results were 0·0002 % for MBM (r 0·380; P = 0·008) and 0·02 % for PM (r 0·482; P = 0·005). The relationship between the in vivo and in vitro results was better explained by the following equations: CP digestibility of MBM = 61·7 + 0·2644 × PSP at 0·0002 % (P = 0·008; R (2) 0·126); and CP digestibility of PM = 54·1 + 0·3833 × PSP at 0·02 % (P = 0·005; R (2) 0·216). Although significant, the coefficients of determination were low, indicating that the models were weak and need to be used with caution.

Comparação do sistema de monitoramento computadorizado de digestão in vitro com os métodos in vivo e in situ: 2. Uso do resíduo da matéria seca de forragens

RESUMO - O objetivo deste trabalho foi comparar o sistema de monitoramento computadorizado da produção de gás in vitro com os métodos in vivo e in situ. Nas comparações, foram utilizadas silagens de milho com alto/baixo teores de matéria seca, com/sem inoculante. A digestibilidade das silagens com alto teor de matéria seca (MS), com/sem inoculação, não apresentou diferenças entre os métodos analisados. Quando avaliadas separadamente do efeito do inóculo, essas silagens diferiram nos métodos in vitro/gás e in situ, mas não no in vivo. Entretanto, quando analisadas somente sob efeito do inoculante, apenas no método in situ houve diferença. Não foram encontradas diferenças na digestibilidade da fibra em detergente neutro (FDN) das silagens com alta ou baixa MS, inoculadas ou não, bem como em relação ao pH ao final da digestão. em conclusão, o desaparecimento da MS e FDN quantificada pelo resíduo no sistema in vitro/gás foi semelhante aos demais métodos avaliados.

Bone apposition and surface treatment in dental implants: histomorphometric pilot evaluation in rabbits

The surface of dental implants is an important factor for osseointegration process and different methods of surface treatment have been described. Objective: To investigate the bone apposition in implant surface treated with sandblasting and acid-etching. Material and methods: Ten rabbits were selected and received one implant treated with method I in the left tibia and one implant treated with method II in the right tibia. Then, twenty implants were divided in two groups, according to methods of sandblasting and acid-etching (method I and method II). After 7, 14, 30, 45 and 60 days, tibias were retrieved and submitted to histotechnical procedures. The percentages of bone–implant contact (BIC) and bone area between threads (BABT) were determined throughout histomorphometric analysis and bone apposition was detected in implants of both groups. Results: In BABT measurements, an increase was observed after 45 and 60 days in the method II, compared to method I and no differences were found after 7, 14 and 30 days. In BIC measurements, an increase was detected with method II at 45 days when compared to method I. No differences between groups in BIC values were observed after 7, 14, 30 and 60 days. Conclusion: Our data demonstrated that implants treated with the method II presented increase in the contact between bone and implant after 45 days compared to method I. Moreover, with concern to bone area between threads, it was observed an increased in the method II after 45 and 60 days. However, both groups can be successfully used as a therapeutic strategy to rehabilitation of edentulous patients. Then, further experiments are needed to evaluate, in depth, the putative differential role of each surface treatment.

Degradabilidade da Matéria Seca e Fibra em Detergente Neutro da Cana-de-açúcar (Saccharum spp) com Diferentes Fontes de Proteína

Foram utilizados cinco bovinos fistulados no rúmen para se determinar a degradação da cana-de-açúcar em dietas com diferentes fontes de proteína degradável, por meio do método de incubação de sacos de náilon. Os tratamentos estudados foram: cana e uréia; cana e farelo de soja; cana, farelo de soja e uréia; cana e glúten de milho; cana, glúten de milho e uréia. Após um período de adaptação de 14 dias, iniciou-se a incubação dos sacos de náilon, nos tempos de 3, 6, 12, 24, 48, 72, 96 e 120 horas. Após o período de incubação, foram determinados o pH e a concentração de amônia no fluido ruminal, em amostras retiradas 0, 3, 6, 9, 12, 15, 18 e 21 horas após a alimentação. O delineamento estatístico utilizado foi o de blocos casualizados, com tratamentos como parcelas e tempos como subparcelas. A concentração de amônia foi mais elevada nos tratamentos com maior quantidade de proteína degradável, porém não houve efeito significativo para os tratamentos. Para os valores de pH, houve significância, apresentando valores mais elevados para os tratamentos com maior quantidade de proteína degradável. Não se observou efeito significativo das diferentes fontes de nitrogênio sobre a degradação da matéria seca e da fibra em detergente neutro da cana-de-açúcar, sendo que a degradabilidade dessas duas frações variou apenas com o tempo de incubação. Os resultados do experimento não comprovaram o princípio de que a maior quantidade de proteína degradável no rúmen possa induzir maior degradação da FDN da dieta.

Produção Fecal e Fluxo Duodenal de Matéria Seca e Matéria Orgânica Estimados por Meio de Indicadores

O objetivo deste trabalho foi comparar os indicadores internos, fibra em detergente neutro e fibra em detergente ácido indigestíveis, obtidos após 144h de incubação in vitro e in situ (FDNiv; FDNis; FDAiv; FDAis) com o indicador externo, o óxido crômico (Cr2O3), para estimativas da produção fecal, do fluxo duodenal de matéria seca e matéria orgânica em novilhos mestiços (HxZ) confinados. Foram utilizadas dietas à base de silagens de milho, de raspa e de casca de mandioca, e também de cana-de-açúcar ensilada com polpa cítrica peletizada. Os novilhos foram castrados e canulados no rúmen e no duodeno. O período experimental teve 11 dias de adaptação às dietas e 8 dias de coleta. O delineamento experimental foi o quadrado latino (4x4), com quatro tratamentos, num arranjo em parcela subdividida, sendo as dietas estudadas nas parcelas, e os indicadores nas subparcelas. Os resultados obtidos em percentagem do peso vivo para a estimativa da produção fecal, utilizando-se os diferentes indicadores, mostraram que a FDAiv (0,88 %), a FDAis (0,85 %) e o Cr2O3 (0,99 %), embora com diferenças significativas, podem ser utilizados pelos resultados biologicamente consistentes. Para estimar o fluxo duodenal de matéria seca e matéria orgânica, foram utilizados os valores de produção fecal obtidos com a FDAiv. Os indicadores internos não apresentaram diferenças entre si para o fluxo duodenal de matéria seca, com média de 3,29 kg/dia, porém o óxido crômico superestimou o fluxo (4,95 kg/dia). Para o fluxo duodenal de matéria orgânica não houve diferença entre os indicadores com média de 2,73 kg/dia.

Testes multiambientais na seleção de genótipos de arroz utilizando o modelo de regressão nos sítios ou locais

A análise da interação genótipo x ambiente utilizda no melhoramento de plantas tem sofrido mudanças na última década, melhorando a sua eficiência quanto à seleção dos genótipos sob diferentes condições ambientais. O objetivo deste trabalho foi analisar a produtividade e estabilidade de 12 genótipos de arroz em oito ambientes, durante os anos 2005 e 2006, na Colômbia. O delineamento utilizado foi o de blocos ao acaso com quatro repetições. Os parâmetros de estabilidade fenotípica e o agrupamento dos ambientes foram estimados pelo estudo da interação genótipo x ambiente, segundo o método SREG (Regressão nos sítios ou locais) e seu gráfico biplot (GGE). As análises estatísticas indicaram diferenças significativas (com 5% de probabilidade de erro) entre genótipos e entre ambientes e significância (com 5% de probabilidade de erro) da interação genótipo x ambiente, sugerindo uma resposta diferente dos genótipos nos vários ambientes. No método SREG, os dois primeiros componentes principais da interação explicaram 75,29% da interação. Os genótipos 400094, 350361 e a variedade Fedearroz 50 foram considerados os de maior produtividade. Segundo o gráfico biplot GGE, os ambientes La Libertad e Escobal foram os mais favoráveis para o cultivo do arroz.

A Method for Determination of Ammonia in Air using Oxalic Acid-Impregnated Cellulose Filters and Fluorimetric Detection

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Degradabilidade ruminal da matéria seca de grãos de milho e de sorgo com alto ou baixo conteúdo de tanino processados

This work evaluated the effects of high moisture silage, extrusion and corn and sorghum drying with and without tannin, on the chemical composition and ruminal digestion of dry matter. The experimental design was completely randomized in 3x3 factorial scheme (kinds of grains: processing), for the chemical composition and degradability and three blocks (animals) through in situ method. It was verified significant difference between kinds of grains and processing in relation to the chemical composition, except for crude protein and mineral matter. The contents of etherextract in the three types of grains, were reduced significantly with the high moisture silage, extrusion and drying in relation to the humid material. For the contents of phenols, total and condensed tannin there was effect of hybrid, processing and interaction, and the most elevated contents were found in sorghum with tannin. Although grain composition has been similar, the interaction in ruminal ambient associated to the tannin, promoted differences in the dry matter degradability. It was concluded that sorghum without tannin may be ensiled or extruded, while the sorghum with tannin, must be extruded to improve the degradability and availability of nutrients.

Estudo de métodos para classificação e localização precisa de padrões usando um sistema de luz estruturada

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Caracterização hidrogeológica e simulação numérica de fluxo em uma região situada no distrito industrial de Paulínia (SP)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estudo radiográfico da relação entre os principais métodos de avaliação da idade óssea e dentária com a idade cronológica quando aplicados à leucodermas e xantodermas brasileiros

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise de modelos troposféricos no posicionamento baseado em redes usando o conceito de VRS

In the past few years several GPS (Global Position System) positioning techniques have been develope and/or improved with the goal of obtaining high accuracy and productivity in real time. The reference station network concept besides to enabling quality and reliability in positioning for scientific and civil GPS community, allows studies concerning tropospheric refraction modeling in the network region. Moreover, among the network corrections transmission methods available to users, there is the VRS (Virtual Reference Station) concept. In this method, the data of a virtual station are generated near the rover receiver (user). This provides a short baseline and the user has the possibility of using a single frequency receiver to accomplish the relative positioning. In this paper, the methodology applied to generate VRS data, using different tropospheric models is described. Thus, comparative tests were conducted in the four seasons with the NWP/INPE (Numerical Weather Prediction/National Institute for Space Research) and Hopfield tropospheric models. In order to analyse the VRS data quality, it was used the Precise Point Positioning (PPP) method, where satisfactory results were found. Mean differences between PNT/INPE and Hopfield models of 9.75% and 24.2% for the hydrostatic and wet days, respectively were obtained.

Métodos eletrocardiográficos em equinos American Miniature Horse

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Degradabilidade ruminal da matéria seca de grãos de milho e de sorgo com alto ou baixo conteúdo de tanino processados

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)