The STATFLUX code: a statistical method for calculation of flow and set of parameters, based on the Multiple-Compartment Biokinetical Model

The code STATFLUX, implementing a new and simple statistical procedure for the calculation of transfer coefficients in radionuclide transport to animals and plants, is proposed. The method is based on the general multiple-compartment model, which uses a system of linear equations involving geometrical volume considerations. Flow parameters were estimated by employing two different least-squares procedures: Derivative and Gauss-Marquardt methods, with the available experimental data of radionuclide concentrations as the input functions of time. The solution of the inverse problem, which relates a given set of flow parameter with the time evolution of concentration functions, is achieved via a Monte Carlo Simulation procedure.Program summaryTitle of program: STATFLUXCatalogue identifier: ADYS_v1_0Program summary URL: http://cpc.cs.qub.ac.uk/summaries/ADYS_v1_0Program obtainable from: CPC Program Library, Queen's University of Belfast, N. IrelandLicensing provisions: noneComputer for which the program is designed and others on which it has been tested: Micro-computer with Intel Pentium III, 3.0 GHzInstallation: Laboratory of Linear Accelerator, Department of Experimental Physics, University of São Paulo, BrazilOperating system: Windows 2000 and Windows XPProgramming language used: Fortran-77 as implemented in Microsoft Fortran 4.0. NOTE: Microsoft Fortran includes non-standard features which are used in this program. Standard Fortran compilers such as, g77, f77, ifort and NAG95, are not able to compile the code and therefore it has not been possible for the CPC Program Library to test the program.Memory, required to execute with typical data: 8 Mbytes of RAM memory and 100 MB of Hard disk memoryNo. of bits in a word: 16No. of lines in distributed program, including test data, etc.: 6912No. of bytes in distributed Program, including test data, etc.: 229 541Distribution format: tar.gzNature of the physical problem: the investigation of transport mechanisms for radioactive substances, through environmental pathways, is very important for radiological protection of populations. One such pathway, associated with the food chain, is the grass-animal-man sequence. The distribution of trace elements in humans and laboratory animals has been intensively studied over the past 60 years [R.C. Pendlenton, C.W. Mays, R.D. Lloyd, A.L. Brooks, Differential accumulation of iodine-131 from local fallout in people and milk, Health Phys. 9 (1963) 1253-1262]. In addition, investigations on the incidence of cancer in humans, and a possible causal relationship to radioactive fallout, have been undertaken [E.S. Weiss, M.L. Rallison, W.T. London, W.T. Carlyle Thompson, Thyroid nodularity in southwestern Utah school children exposed to fallout radiation, Amer. J. Public Health 61 (1971) 241-249; M.L. Rallison, B.M. Dobyns, F.R. Keating, J.E. Rall, F.H. Tyler, Thyroid diseases in children, Amer. J. Med. 56 (1974) 457-463; J.L. Lyon, M.R. Klauber, J.W. Gardner, K.S. Udall, Childhood leukemia associated with fallout from nuclear testing, N. Engl. J. Med. 300 (1979) 397-402]. From the pathways of entry of radionuclides in the human (or animal) body, ingestion is the most important because it is closely related to life-long alimentary (or dietary) habits. Those radionuclides which are able to enter the living cells by either metabolic or other processes give rise to localized doses which can be very high. The evaluation of these internally localized doses is of paramount importance for the assessment of radiobiological risks and radiological protection. The time behavior of trace concentration in organs is the principal input for prediction of internal doses after acute or chronic exposure. The General Multiple-Compartment Model (GMCM) is the powerful and more accepted method for biokinetical studies, which allows the calculation of concentration of trace elements in organs as a function of time, when the flow parameters of the model are known. However, few biokinetics data exist in the literature, and the determination of flow and transfer parameters by statistical fitting for each system is an open problem.Restriction on the complexity of the problem: This version of the code works with the constant volume approximation, which is valid for many situations where the biological half-live of a trace is lower than the volume rise time. Another restriction is related to the central flux model. The model considered in the code assumes that exist one central compartment (e.g., blood), that connect the flow with all compartments, and the flow between other compartments is not included.Typical running time: Depends on the choice for calculations. Using the Derivative Method the time is very short (a few minutes) for any number of compartments considered. When the Gauss-Marquardt iterative method is used the calculation time can be approximately 5-6 hours when similar to 15 compartments are considered. (C) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Efeitos ambientais e genéticos sobre escores visuais e ganho de peso à desmama de animais formadores da raça Brangus

Estudaram-se os efeitos da idade da vaca ao parto e da idade do animal à desmama, bem como os efeitos genéticos aditivo direto e materno e da heterozigose individual, sobre os escores visuais de conformação, precocidade e musculatura e ganho de peso do nascimento à desmama, de animais formadores da raça Brangus. Foram analisados 53.683, 45.136, 52.937 e 56.471 dados de conformação, precocidade e musculatura à desmama e ganho de peso do nascimento à desmama, respectivamente, de animais nascidos entre 1986 e 2002, provenientes do arquivo zootécnico da empresa Gensys Consultores Associados S/C Ltda. Os efeitos de ambiente e genéticos sobre as características em estudo foram analisados pelo método de quadrados mínimos usando modelos matemáticos que incluíram grupo de contemporâneos como variável classificatória e a idade da vaca ao parto, a idade do animal à desmama e os efeitos aditivo direto e materno e da heterozigose individual como co-variáveis. Todos os efeitos incluídos nos modelos afetaram significativamente as características avaliadas, com exceção do efeito da idade da vaca ao parto sobre o ganho de peso do nascimento à desmama e do efeito aditivo materno sobre todas as características estudadas. Os efeitos ambientais e genéticos revelaram-se importantes fontes de variação para as características estudadas e devem, pois, ser considerados na distinção e comparação dos animais para seleção.

Endogamia em um rebanho da raça Guzerá

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Effect of crude protein levels and organic selenium supplementation in the diets fed during the breeding season on reproductive parameters of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens)

There is little information on the nutrition of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens) reared in captivity, and their nutritional requirements still need to be determined. This study aimed at determining dietary crude protein requirements and testing four organic selenium supplementation levels in the diet of red-winged tinamous during the breeding season. Birds were housed in a conventional broiler house divided in 16 boxes with one male and three females each. Iso-energy (2800kcal ME/kg) pelleted feeds, based on corn and soybean meal, were supplied in tube feeders. In the first experiment, treatments consisted of four different diets containing different crude protein (CP) contents (15, 18, 21, or 24%) and in the second experiment, the four diets contained equal protein level (22.5%) and four different organic selenium levels (0, 0.2, 0.4, or 0.8ppm). Data were analyzed by the least square method. The best egg weight and eggshell thickness were obtained with 22.5% dietary CP. Organic selenium did not influence the studied reproductive traits of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens) males or females.

Degradação in situ da matéria seca e da fração fibrosa do capim marandu obtido por diferentes métodos de amostragem, no período seco do ano

Este trabalho foi realizado na Faculdade de Ciências Agrárias Veterinárias - Unesp - Jaboticabal e foi conduzido, com o objetivo de avaliar a influência do método de amostragem do pasto sobre a degradabilidade in situ da matéria seca e da fração fibrosa de capim Marandu, colhido no período seco dos anos de 2003 e 2005. O experimento foi instalado em delineamento de blocos casualizados com parcela subdividida, com três repetições, representadas pelos piquetes amostrados. Nas parcelas, foram avaliados cinco métodos de amostragens de forragem (método do quadrado metálico; método de avaliação através de extrusa de bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio de extrusa de bovino Cruzado (Red Angus x Nelore); método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino Cruzado (Red Angus x Nelore) e as subparcelas foram constituídas pelos anos de amostragem, 2003 e 2005. Foram determinadas as frações da cinética ruminal: solúvel A; insolúvel potencialmente degradável B; taxa de degradação Kd; degradação potencial (DP) e fração não degradável C da MS e degradação potencial (DP), fração não degradável C e taxa de degradação Kd da FDN e da FDA. de acordo com os resultados obtidos, observou-se que o método do quadrado metálico subestimou as características da degradação do capim. Os métodos do pastejo simulado se assemelharam muito ao das extrusas, no entanto, a prática do simulador é que assegurou a amostragem eficiente, conforme foi constatado pelos dados obtidos no ano de 2003 e 2005.

Estudo preliminar da influência do perímetro escrotal sobre a libido em touros jovens da raça Nelore

O perímetro escrotal (PE) de 202 touros jovens da raça Nelore, sem experiência sexual prévia, classificados pela Associação Brasileira de Criadores de Zebu como superiores ou elite, foi medido aos 7, 12, 18 e 28 meses de idade, aproximadamente. Após a última medição, eles foram submetidos ao teste de libido e procedeu-se à colheita de sêmen por eletroejaculação, seguida de avaliação andrológica. As medidas do PE aos 7, 12, 18 e 28 meses foram de 18,30; 22,29; 27,54 e 33,26cm, respectivamente. Os coeficientes de correlação simples entre estas medidas variaram de 0,35 a 0,53. O coeficiente de correlação entre PE aos 28 meses e peso corporal na mesma idade foi de 0,43. A correlação entre a nota da libido e o perímetro escrotal medido aos l8 meses foi de 0,15 e entre aquela e o perímetro escrotal aos 28 meses foi de 0,13. Observou-se elevado crescimento do perímetro escrotal entre o 7º e 18º meses de idade. Utilizou-se o método de quadrados mínimos para analisar a libido, incluindo ano de nascimento como efeito fixo e como covariáveis os efeitos lineares da idade e peso no momento da avaliação e medidas de perímetro escrotal aos 7, l2, l8 e 28 meses. Cada covariável foi retida de forma seqüencial obtendo-se vários modelos de análises e as somas de quadrados foram decompostas de forma seqüencial e parcial. O ano de nascimento, a idade e o perímetro escrotal aos 18 meses de idade afetaram significativamente a libido. Os coeficientes de correlação entre a libido e concentração espermática, motilidade, peso e idade do animal no momento da avaliação foram de 0,34, 0,l6, 0,38 e 0,35, respectivamente.

Efeito da endogamia sobre características de crescimento de bovinos da raça Gir no Brasil

Esta pesquisa foi conduzida com o objetivo de avaliar o efeito da endogamia e suas possíveis influências sobre o crescimento de bovinos de corte. Foram utilizadas 27.406 observações de peso à desmama, padronizado aos 205 dias (PD), e 14.317 informações de peso ao ano, padronizado aos 365 dias (PA), de animais da raça Gir, no período de 1970 a 1995. As análises foram feitas pelo método dos quadrados mínimos, incluindo-se o efeito aleatório de grupo contemporâneo e os efeitos fixos de geração (discreto), idade da vaca ao parto e taxa de endogamia do bezerro e da vaca como variáveis contínuas, considerando-se os efeitos linear e quadrático. Apenas 11,65% das vacas, 19,84% dos touros e 9,23% dos bezerros da raça Gir estudados apresentaram algum grau de endogamia e as estimativas das médias de endogamia foram de pequena magnitude, constatando-se valores de 1,04; 0,96; e 1,66% para vacas, touros e bezerros, respectivamente. O efeito da endogamia do animal foi significativo e quadrático para as duas características estudadas. Os resultados mostraram depressão endogâmica para ambas as características (PD e PA). Recomenda-se evitar os acasalamentos, intencionalmente, endogâmicos e monitorar os acasalamentos com base no parentesco entre os indivíduos, visando manter baixas as taxas de endogamia.

Análise de séries temporais de coordenadas estimadas com GPS: uma proposta metodológica para detecção, remoção e recuperação de efeitos sazonais

GPS active networks are more and more used in geodetic surveying and scientific experiments, as water vapor monitoring in the atmosphere and lithosphere plate movement. Among the methods of GPS positioning, Precise Point Positioning (PPP) has provided very good results. A characteristic of PPP is related to the modeling and/or estimation of the errors involved in this method. The accuracy obtained for the coordinates can reach few millimeters. Seasonal effects can affect such accuracy if they are not consistent treated during the data processing. Coordinates time series analyses have been realized using Fourier or Harmonics spectral analyses, wavelets, least squares estimation among others. An approach is presented in this paper aiming to investigate the seasonal effects included in the stations coordinates time series. Experiments were carried out using data from stations Manaus (NAUS) and Fortaleza (BRFT) which belong to the Brazilian Continuous GPS Network (RBMC). The coordinates of these stations were estimated daily using PPP and were analyzed through wavelets for identification of the periods of the seasonal effects (annual and semi-annual) in each time series. These effects were removed by means of a filtering process applied in the series via the least squares adjustment (LSQ) of a periodic function. The results showed that the combination of these two mathematical tools, wavelets and LSQ, is an interesting and efficient technique for removal of seasonal effects in time series.

Evaluation of TNF-alpha, IL-4, and IL-10 and parasite density in spleen and liver of L. (L.) chagasi naturally infected dogs

Dogs are the main domestic reservoirs of L. (L.) chagasi. Once in the vertebrate host, the parasite can cause visceral leishmaniasis, which can also be transmitted to humans. Cytokines are key elements of the host immune response against Leishmania spp. To investigate whether tumor necrosis factor (TNF)-alpha, interleukin (IL)-4 and IL-10 are associated with pattern infection in dogs, these cytokines were quantified in the spleen and liver of dogs naturally infected with L. (L.) chagasi, with or without clinical manifestations, and their levels were correlated with the parasite load verified in these organs. A total of 40 adult dogs naturally infected with L. (L.) chagasi were assessed, together with 12 uninfected control dogs. Samples from spleen and liver were used to determine the cytokine levels by capture ELISA and for quantifying parasite load by real-time PCR. Statistical analysis was performed using the minimum Chi square method and group means were compared using the Tukey test. TNF-alpha, IL-4 and IL-10 levels in infected dogs were higher than in control groups; the liver was the main cytokine-producing organ during infection. The level of splenic TNF-alpha showed correlation with parasite load and may represent an important marker for infection process evolution, with the participation of IL-10. These results may contribute to a clearer understanding of the immune response in dogs infected with L. (L.) chagasi, which may lead to the development of prophylactic or preventive measures for these animals.

Biology and shell relationship in Clibanarius vittatus (Bosc, 1802) (Crustacea, Diogenidae) from Sao Vicente, SP, Brasil.

This study aimed to characterize the populational structure of Clibanarius vittatus (Bosc, 1802), as well as to determine the morphometric relations between the animal's size and the variables: length of their chelar propodus and the size of the shell opening. C. vittatus is a relatively abundant pagurid on the west Atlantic coast, it occurs in the intertidal region from 38 degrees N to 28 degrees S. The animals in this study were randomly sampled every month on the Paranapu (a) over tilde Beach (46 degrees 23' S e 23 degrees 59' W), S (a) over tilde $ o Vicente (SP), Brazil. The biometrics data were adjusted to the power equation (y = ax(b)), by means of the minimum square method. A total of 427 individuals were collected. The size of the cephalothoraxic shield ranged from 2.5 to 12.7 mm, evidencing a representative sample of the population. The of most commonly genus of Gastropoda shells occupied by the hermits was Thais (97,26%). In relation to the morphometric analyses performed, it was observed a positive correlation between the animal size and the variables length of the chelar propodus and the size of the shells.

Levantamento fitossociológico das comunidades de plantas infestantes em áreas de produção de arroz irrigado cultivado sob diferentes sistemas de manejo

O presente trabalho de pesquisa teve como objetivo identificar a composição florística de comunidades de plantas daninhas presentes em áreas agrícolas de várzea, manejadas em diferentes sistemas. O trabalho foi desenvolvido em áreas de produção de arroz irrigado das cooperativas: Cooperativas Mista Rural Vale do Javaés e Cooperativa Agroindustrial Rio Formoso, em Formoso do Araguaia-TO. Foram separadas três áreas de 1 ha, sendo: 1 - área sem rotação de culturas (arroz/pousio) há mais de cinco anos; 2 - área com rotação de culturas (arroz/soja) há mais de cinco anos; 3 - área com rotação de culturas (arroz/melancia) há mais de dois anos. Para caracterização e estudo fitossociológico da comunidade infestante foi utilizado, como unidade amostral, um quadro (1,0 x 1,0 m), lançado aleatoriamente dentro da área de estudo (método do quadrado inventário), por meio de um caminhamento em ziguezague. Na área sem rotação, foram identificadas 8 famílias e 16 espécies, destacando-se a família Poaceae com maior número espécies; Fimbristylis miliacea (Cyperaceae) foi a espécie com o maior índice de importância relativa (84,46%). Na área com rotação arroz/soja, foram identificadas 8 famílias e 12 espécies, destacando-se as famílias Poaceae e Cyperaceae com maior número espécies; Cyperus esculentus (Cyperaceae) foi a espécie com o maior índice de importância relativa (91,4%). Na área com rotação arroz/melancia foram identificadas seis famílias e oito espécies, destacando-se as famílias Euphorbiaceae e Lamiaceae com maior número espécies; Physalis angulata (Solanaceae) foi a espécie com o maior índice de importância relativa (153,1%), seguida por Eclipta alba (Compositae) e Hyptis lophanta (Lamiaceae), com 40,45 e 37,6%, respectivamente.

Association of GH and IGF-1 polymorphisms with growth traits in a synthetic beef cattle breed

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos e análise de componentes principais para características de crescimento na raça Canchim

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação do peso à desmama e do ganho médio de peso de bezerros cruzados, no estado do Mato Grosso do Sul

O objetivo deste trabalho foi comparar o desempenho de bezerros mestiços de diferentes grupos genéticos até a desmama. Informações de 3631 bezerros F1 filhos de vacas Nelore com touros Aberdeen Angus, Brangus, Brangus (pelagem vermelha), Canchim, Gelbvieh, Nelore e Simental foram usadas (Grupo 1). Foram usadas também informações de 1896 bezerros de fêmeas Nelore com touros das raças supracitadas e de fêmeas F1 retrocruzadas com touros Gelbvieh e Nelore (Grupo 2). Os pesos à desmama foram ajustados aos 230 dias (PD230) e aos 240 dias (PD240), para os grupos 1 e 2, respectivamente, e o ganho médio diário até a desmama (GMD), para ambos os grupos, foi determinado. O modelo matemático usado nas análises pelo método de quadrados mínimos incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo (GC), grupo genético do bezerro (GG) e idade do bezerro e idade da vaca. GC e GG influenciaram as características estudadas em ambos os grupos. A idade do bezerro não influiu significativamente no PD230 e GMD no Grupo 1, mas no Grupo 2 foi significativa para PD240 e GMD. A idade da vaca ao parto influenciou as características estudadas tanto no Grupo 1 como no Grupo 2. Os animais cruzados foram superiores aos puros Nelore em ambos os grupos. Foi obtido, a partir do Grupo 2, um terceiro conjunto de dados, Grupo 3, contendo os produtos do retrocruzamento de fêmeas F1, Nelore-Gelbvieh, com touros Gelbvieh e Nelore, contendo 722 informações de PD240 e GMD. Nesse arquivo foram estimados os efeitos aditivos direto e materno e heterótico individual. Apenas o efeito heterótico individual foi significativo.

In situ degradability of hand harvested or extrusa samples of Tanzania grass (Panicum maximum, Jacq.)

In order to compare the in situ degradability of tanzania grass samples obtained as by extrusa or hand plucked, three ruminal fistulated cows were used in a completely randomized block design with split-plot scheme. Five grams of extrusa or hand harvested grasses were placed in nylon bags rumen incubated during 3, 6, 12, 24, 48, 96 and 120 hours. The degradability of DM, CP, NDF and ADF were, in this sequence, 62.59, 80.88, 50.73 and 46.65%, for hand-harvested grass; and 79.53, 90.97, 71.21 and 65.68%, for extrusa. In situ degradability data of hand harvested samples were not reliable.