Chromosome Evolution in African Cichlid Fish: Contributions from the Physical Mapping of Repeated DNAs

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Evolutionary dynamics of rRNA gene clusters in cichlid fish

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Isolamento e caracterização de microssatélites em Búfalo de rio (Bubulus bubalis) a partir da construção de bibliotecas genômicas parciais com hibridização seletiva

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Organização cromossômica de elementos repetitivos de DNA em representantes da sufamília Scarabaeinae (Coleoptera: Scarabaeidae)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Citogenética comparativa de peixes da família Cichlidae

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Mapeamento cromossômico comparativo em peixes ciclícos utilizando sequências repetitivas de DNA

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análises moleculares na subfamília hypoptopomatinae (Siluriformes, Loricariidae): isolamento, caracterização e mapeamento cromossômico de sequências repetitivas

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Chromosomal organization and evolutionary history of Mariner transposable elements in Scarabaeinae coleopterans

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Chromosome mapping of repetitive sequences in Anostomidae species: Implications for genomic and sex chromosome evolution

Background: Members of the Anostomidae family provide an interesting model system for the study of the influence of repetitive elements on genome composition, mainly because they possess numerous heterochromatic segments and a peculiar system of female heterogamety that is restricted to a few species of the Leporinus genus. The aim of this study was to isolate and identify important new repetitive DNA elements in Anostomidae through restriction enzyme digestion, followed by cloning, characterisation and chromosome mapping of this fragment. To identify repetitive elements in other Leporinus species and expand on studies of repetitive elements in Anostomidae, hybridisation experiments were also performed using previously described probes of LeSpeI repetitive elements. Results: The 628-base pair (bp) LeSpeII fragment was hybridised to metaphase cells of L. elongatus individuals as well as those of L. macrocephalus, L. obtusidens, L. striatus, L. lacustris, L. friderici, Schizodon borellii and S. isognathus. In L. elongatus, both male and female cells contained small clusters of LeSpeII repetitive elements dispersed on all of the chromosomes, with enrichment near most of the terminal portions of the chromosomes. In the female sex chromosomes of L. elongatus (Z2,Z2/W1W 2), however, this repeated element was absent. In the remaining species, a dispersed pattern of hybridisation was observed on all chromosomes irrespective of whether or not they were sex chromosomes. The repetitive element LeSpeI produced positive hybridisations signals only in L. elongatus, L. macrocephalus and L. obtusidens, i.e., species with differentiated sex chromosomes. In the remaining species, the LeSpeI element did not produce hybridisation signals. Conclusions: Results are discussed in terms of the effects of repetitive sequences on the differentiation of the Anostomidae genome, especially with respect to sex chromosome evolution. LeSpeII showed hybridisation patterns typical of Long Interspersed Elements (LINEs). The differential distribution of this element may be linked to sex chromosome differentiation in L. elongatus species. The relationship between sex chromosome specificity and the LeSpeI element is confirmed in the species L. elongatus, L. macrocephalus and L. obtusidens. © 2012 da Silva et al.; licensee BioMed Central Ltd.

Coptotermes gestroi (Isoptera: Rhinotermitidae) in Brazil: possible origins inferred by mitochondrial cytochrome oxidase II gene sequences

The Asian subterranean termite, Coptotermes gestroi, originally from northeast India through Burma, Thailand, Malaysia, and the Indonesian archipelago, is a major termite pest introduced in several countries around the world, including Brazil. We sequenced the mitochondrial COII gene from individuals representing 23 populations. Phylogenetic analysis of COII gene sequences from this and other studies resulted in two main groups: (1) populations of Cleveland (USA) and four populations of Malaysia and (2) populations of Brazil, four populations of Malaysia, and one population from each of Thailand, Puerto Rico, and Key West (USA). Three new localities are reported here, considerably enlarging the distribution of C. gestroi in Brazil: Campo Grande (state of Mato Grosso do Sul), Itajai (state of Santa Catarina), and Porto Alegre (state of Rio Grande do Sul).

Plant or fungal sequences? An alternative optimized PCR protocol to avoid ITS (nrDNA) misamplification

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Stress responses in juvenile pacu (Piaractus mesopotamicus) submitted to repeated air exposure.

Pacu juveniles (5.2 [plus or minus] 1.5 g) were submitted to two one-minute air exposures in a 24h interval, and sampled before the exposure (control) and 5, 15, 30 and 60 min., 24 and 48h afterwards for whole-body cortisol, sodium, potassium and calcium ion concentrations. For the first air exposure, there was a trend of increased cortisol concentration after 15 min., whereas in the second air exposure, the cortisol concentration increased significantly within 5 min. after stress was induced. Sodium ion concentration increased significantly 24h after both air exposures. Potassium concentration presented fluctuations over the experimental period. Calcium ion concentration increased progressively from 5 to 30 min., in both air exposures. The repeated air exposures exacerbated the cortisol response, but they did not affect the recovery ability of pacu over the experimental period. Additionally, the whole-body cortisol measurement might be a reliable indicator of stress, when sampled fish are smaller and blood volumes are very low, making samples inadequate for analysis.

Cutaneous Basophilia in the Resistance of Goats to Amblyomma cajennense Nymphs after Repeated Infestations

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Guinea Pigs Develop Cutaneous Basophilia after Repeated Infestations by Nymphs of the Tick Amblyomma triste

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Crop sequences in no-tillage system: effects on soil fertility and soybean, maize and rice yield

Os resíduos vegetais das culturas, ao se decomporem, alteram os atributos químicos do solo e, como consequência, influenciam a produtividade das culturas em sucessão. O objetivo deste trabalho foi avaliar os atributos químicos do solo e a produtividade das culturas de soja, milho e arroz, cultivadas no verão, em sucessão a culturas de inverno em semeadura direta. O experimento foi realizado em Jaboticabal-SP (48 ° 18 ' 58 '' W e 21 ° 15 ' 22 '' S), em um Latossolo Vermelho eutrófico. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso, no esquema em faixas, com três repetições. Os tratamentos foram constituídos pela combinação de quatro sequências de culturas de verão (monoculturas de milho e soja e rotações soja/milho e arroz/feijão/algodão) com sete culturas de inverno (milho, girassol, nabo forrageiro, milheto, guandu, sorgo e crotalária). Os cultivos iniciaram-se em 2002. Após o manejo das culturas de inverno e antes da semeadura das culturas de verão do ano agrícola 2006/2007, foram coletadas amostras de solo nas camadas de 0-2,5; 2,5-5,0; 5-10; 10-20; e 20-30 cm. Nas amostras de solo, foram determinados: teores de matéria orgânica, pH, teores de P (resina), K, Ca e Mg trocáveis e acidez potencial (H + Al). As sequências de verão rotação soja/milho e milho em monocultura proporcionaram no solo menores teores de matéria orgânica na camada de 0-10 cm e de P do solo na camada de 0-20 cm. Na sequência de verão arroz/feijão/algodão, maiores teores de K foram proporcionados pelas culturas de inverno crotalária e nabo forrageiro, na camada de 0-10 cm, e milheto, na de 0-2,5 cm. Crotalária, milheto, nabo forrageiro e sorgo, cultivados no inverno, proporcionaram maiores teores de matéria orgânica no solo na camada de 0-30 cm. Maiores teores de P no solo foram proporcionados pela crotalária, na camada de 0-2,5 cm, e pelo nabo forrageiro, na de 0-5 cm. Maiores produtividades de soja, como monocultura de verão, foram obtidas após nabo forrageiro e crotalária e, quando em rotação com milho no verão, após nabo forrageiro, crotalária e milheto. Maiores produtividades de milho foram obtidas após nabo forrageiro, milheto e guandu, e menor produtividade de arroz foi obtida após sorgo.