Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

THE REDUCTIVE PERTURBATION METHOD AND THE KORTEWEG-DE VRIES HIERARCHY

By using the reductive perturbation method of Taniuti with the introduction of an infinite sequence of slow time variables tau(1), tau(3), tau(5), ..., we study the propagation of long surface-waves in a shallow inviscid fluid. The Korteweg-de Vries (KdV) equation appears as the lowest order amplitude equation in slow variables. In this context, we show that, if the lowest order wave amplitude zeta(0) satisfies the KdV equation in the time tau(3), it must satisfy the (2n+1)th order equation of the KdV hierarchy in the time tau(2n+1), With n = 2, 3, 4,.... AS a consequence of this fact, we show with an explicit example that the secularities of the evolution equations for the higher-order terms (zeta(1), zeta(2),...) of the amplitude can be eliminated when zeta(0) is a solitonic solution to the KdV equation. By reversing this argument, we can say that the requirement of a secular-free perturbation theory implies that the amplitude zeta(0) satisfies the (2n+1)th order equation of the KdV hierarchy in the time tau(2n+1) This essentially means that the equations of the KdV hierarchy do play a role in perturbation theory. Thereafter, by considering a solitary-wave solution, we show, again with an explicit, example that the elimination of secularities through the use of the higher order KdV hierarchy equations corresponds, in the laboratory coordinates, to a renormalization of the solitary-wave velocity. Then, we conclude that this procedure of eliminating secularities is closely related to the renormalization technique developed by Kodama and Taniuti.

Determination of mercury in agroindustrial samples by flow-injection cold vapor atomic absorption spectrometry using ion exchange and reductive elution

A flow-injection system with a Chelite-S® cationic resin packed minicolumn is proposed for the determination of trace levels of mercury in agroindustrial samples by cold vapor atomic absorption spectrometry. Improved sensitivity and selectivity are attained since mercuric ions are on-line concentrated whereas other potential interferents are discarded. With on-line reductive elution procedure, concentrated hydrochloric acid could be replaced by 10% w/v SnCl2, in 6 M HCl as eluent. The reversed-intermittent stream either carries the atomic mercury, to the flow cell in the forward direction or removes the residue from reactor/gas liquid separator to a discarding flask in the opposite direction. Concentration and volume of reagent, acidity, flow rates, commutation times and potential interfering species were investigated. For 120 s preconcentration time, the proposed system handles about 25 samples h-1 (50.0 500 ng l-1), consuming about 10 ml sample and 5 mg SnCl2 per determination. The detection limit is 0.8 ng l-1 and the relative standard deviation (RSD) (n = 12) of a 76.7 ng l-1 sample is about 5%. Results are in agreement with certified value of standard materials at 95% confidence level and good recoveries (97-128%) of spiked samples were found. (C) 2000 Elsevier Science B.V.

New reductive addition of hard nucleophiles to 6,7-bis(methylsulfanyl)-1,4-dihydro-1,4-methanonaphthalene-5,8-dione

A new reaction mode of 6,7-bis(methylsulfanyl)-1,4-dihydro-1,4-methanonaphthalene-5,8-dione 1 with the hard nucleophiles sodium benzene- or methane-sulfinate and cyanide, in DMSO, at room temperature, leads to the unexpected hydroquinonoid products 3a-c. All the data are in agreement with a mechanistic pathway involving the initial attack of the hard nucleophile onto the hard carbonyl group, followed by a symbiotic re-attack of the oxygen on the incoming group. In the case of soft nucleophiles, reaction on the olefinic carbon of the enedione system is preferential.

Comparação de procedimentos de quantificação de nitrato em tecido vegetal

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Podzolization as a deferralitization process: dynamics and chemistry of ground and surface waters in an Acrisol-Podzol sequence of the upper Amazon Basin

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Electrochemical Reduction as a Powerful Tool to Highlight the Possible Formation of By-Products More Toxic Than Sudan III Dye

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Electrochemical evaluation of lipophilic antioxidants from Iryanthera juruensis fruits (Myristicaceae)

Testes em placas de CCDC reveladas com solução de beta-caroteno mostraram a presença de duas substâncias com propriedades antioxidantes no extrato hexânico. Elas foram isoladas e identificadas como 3-metil-sargacromenol (1) and sargacromenol (2). O extrato hexânico forneceu ainda o ácido 3-metil-sargaquinóico (3) e o ácido sargaquinóico (4). O comportamento eletroquímico destas substâncias foi investigado em CH2Cl2/Bu4NBF4 sobre eletrodo de carbono vítreo. A oxidação do grupo fenólico nos tocotrienóis 1 and 2 é responsável por um pico anódico em potenciais de +0.23V e +0.32V, os quais são correlacionados com sua atividade antioxidante. O mecanismo de oxidação é comparado com o comportamento eletroquímico do antioxidante alfa-tocopherol.

Determinação eletroanalítica de corante reativo presente como contaminante em proteínas purificadas por cromatografia de afinidade

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Análise voltamétrica do corante têxtil do tipo antraquinona empregando eletrodos de carbono impresso

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Síntese e emprego do ciclometalado [Pd(dmba)(N3)(PPh3)] em processos catalíticos envolvendo a n-carbonilação redutiva de nitroarenos a carbamatos e na síntese de derivados da uréia

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Síntese e emprego do [Pd(dmba)(NCO)(PPh3)] em processos catalíticos envolvendo a preparação de derivados da uréia e de alcoxicarbonil complexos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação dos produtos da degradação oxidativa da Hb S nos genótipos SS, SF (S/beta0 talassemia) e AS, em comparação com hemoglobinas normais

A doença falciforme é um termo genérico usado para determinar um grupo de alterações genéticas caracterizadas pelo predomínio de hemoglobina (Hb) S. Os principais genótipos que compõem o grupo de doença falciforme são os seguintes: SS, SF [S/beta0 talassemia e S/persistência hereditária de Hb fetal (PHHF)], SFA (S/beta+ talassemia), SC, SD e SH (S/alfa talassemia). O presente trabalho analisa os resultados das avaliações de produtos provenientes da oxidação da Hb S, identificados pela concentração da metemoglobina e de eritrócitos com corpos de Heinz em dois genótipos da doença falciforme (SS e S/beta0 talassemia) e no traço falcêmico (AS), em comparação com o genótipo normal (AA). A análise dos produtos da degradação oxidativa da hemoglobina, evidenciados pelo aumento dos valores das médias referentes à concentração de metemoglobina e do número de eritrócitos com corpos de Heinz, está diretamente relacionada com o aumento da concentração da Hb S. Assim, a degradação oxidativa da hemoglobina decresce entre os genótipos estudados da seguinte forma: SS>SF>AS>AA. É importante destacar que as análises indicaram que a simples presença de Hb S no eritrócito, como é o caso do genótipo AS, é capaz de causar elevação da concentração de metemoglobina em 52,62% das amostras analisadas e de induzir a precipitação de corpos de Heinz em 73,68% dos casos estudados. Explicações referentes aos processos oxidativos e redutores das hemoglobinas estudadas são apresentados no texto. Destaca-se, entre os resultados apresentados, a identificação por meio de eletroforese em agarose alcalina da fração de globina alfa-livre em todas as amostras do genótipo SF provenientes de pessoas com Hb S/beta0 talassemia. É proposto um esquema para explicar a origem da globina alfa-livre, especialmente para o genótipo S/beta0 talassemia, e a importância da sua identificação no diagnóstico laboratorial de Hb S/beta0 talassemia.

Adsorptive potentiometric stripping analysis of nucleic acids at mercury electrodes

The application of adsorptive stripping potentiometry to the reductive detection of nucleic acids at mercury electrodes is reported. Compared to analogous voltammetric stripping modes, constant current potentiometric stripping analysis (PSA) effectively addresses the hydrogen discharge background problem, and hence greatly improves the characteristics of the superimposed cytosine/adenine (CA) reduction peak. Compared to earlier schemes for trace measurements of nucleic acids at mercury or carbon electrodes that rely on anodic signals arising from the guanine residue, convenient quantitation can now be carried out in connection with the cytosine and adenine residues. Variables influencing the adsorptive PSA response are explored and optimized. With five minute accumulation, the detection limits for tRNA, ssDNA and dsDNA are 30 mu g l(-1), 60 mu g l(-1) and 2 mg l(-1), respectively. Such different values reflect the strong dependence of the PSA CA signal upon the nucleic-acid structure. This allows the quantitation of ssDNA or tRNA in the presence of dsDNA, and offers new possibilities for electrochemical studies of DNA structure and interactions.