Minimizing inter-genotypic competition effects to predict genetic values and selection in forestry genetic tests

The effect of competition is an important source of variation in breeding experiments. This study aimed to compare the selection of plants of open-pollinated families of Eucalyptus with and without the use of competition covariables. Genetic values were determined for each family and tree and for the traits height, diameter at breast height and timber volume in a randomized block design, resulting in the variance components, genetic parameters, selection gains, effective size and selection coincidence, with and without the use of covariables. Intergenotypic competition is an important factor of environmental variation. The use of competition covariables generally reduces the estimates of variance components and influences genetic gains in the studied traits. Intergenotypic competition biases the selection of open-pollinated eucalypt progenies, and can result in an erroneous choice of superior genotypes; the inclusion of covariables in the model reduces this influence.

The intravenous glucose tolerance and postprandial glucose tests may present different responses in the evaluation of obese dogs

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

CHARACTERIZATION of RALSTONIA SOLANACEARUM STRAINS FROM BRAZIL USING MOLECULAR METHODS and PATHOGENICITY TESTS

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A duplicated nitrotienyl derivative with antimycobacterial activity: synthesis, X-ray crystallography, biological and mutagenic activity tests

A duplicated nitrotienyl derivative was obtained as a by-product from the synthesis of a proposed molecular hybrid of a nitrotienyl derivative and isoniazid with an expected dual antimycobacteria mechanism. The structure was shown to be the 5,5'-dinitro-2(2,3-diaza-4-(2'-tienyl)buta-1,3-dienyl)tiophene by X-ray crystallography. The minimal inhibitory concentration (MIC) determination of this compound proved to be promising against Mycobacterium pathogenic strains such as M. avium and M. kansasei, although it had a high level of mutagenicity, as observed in mutagenic activity tests. (c) 2006 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Mathematical tests about the existence and applications of PPS-wavelets in function approximation problems

Neural networks and wavelet transform have been recently seen as attractive tools for developing eficient solutions for many real world problems in function approximation. Function approximation is a very important task in environments where computation has to be based on extracting information from data samples in real world processes. So, mathematical model is a very important tool to guarantee the development of the neural network area. In this article we will introduce one series of mathematical demonstrations that guarantee the wavelets properties for the PPS functions. As application, we will show the use of PPS-wavelets in pattern recognition problems of handwritten digit through function approximation techniques.

Interpretation of Resistivity Piezocone Tests in a Contaminated Municipal Solid Waste Disposal Site

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Prediction of Soil Properties from the Concepts of Energy Transfer in Dynamic Penetration Tests

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Evaluation of geomembrane UV degradation using melt flow index and oxidative induction time tests

Many factors such as the sunlight, intensity of radiation, temperature, and moisture may influence the degradation process of geosynthetics. UV stabilizers are used especially in polyolefin geomembrane to prevent the degradation process. In these geomembranes the service lifetime is initially governed by the consumption of antioxidants. Tests like MFI and OIT are a alternative to detect the oxidative degradation in polyolefins. This article evaluates HDPE geomembrane degradation after UV exposure through the results of MFI and OIT tests. Two kinds of geomembranes were evaluated: a black and smooth (0.8, 1.0, 1.5, 2.5 mm) and a white and textured (1.0 mm). MFI test showed some levels of superficial degradation (crosslink) in HDPE geomembrane.

Síndrome de Silver-Russell: relato de caso

OBJETIVO: descrever o fenótipo da síndrome de Silver-Russell (SSR) e apresentar um caso diagnosticado com esta afecção genética, abordando aspectos genéticos, psicológicos e fonoaudiológicos. MÉTODOS: trata-se de relato de caso de uma criança do gênero feminino, sete anos e onze meses, portadora da síndrome de Silver-Russel. Foram realizadas avaliação genética médica e molecular, avaliação psicológica, avaliação fonoaudiológica e aplicação de testes complementares. RESULTADOS: a análise molecular da região 7p11 excluiu a dissomia uniparental para este caso. No exame físico foram constatados os principais sinais clínicos da SSR que incluiu retardo no crescimento de origem pré-natal, fácies típica, assimetrias ósseas e clinodactilia do 5º dedo. A avaliação cognitiva e fonoaudiológica mostraram deficiência mental, distúrbio de linguagem oral e comprometimento das funções orais. CONCLUSÃO: o estudo deste caso possibilitou a divulgação do fenótipo da SSR com suas manifestações físicas, cognitivas e fonoaudiológicas. Embora o teste molecular não tenha confirmado um dos possíveis mecanismos etiológicos da síndrome, a avaliação genética médica constatou a presença dos principais sinais clínicos que foram correlacionados à literatura. A avaliação psicológica e fonoaudiológica apontaram para comprometimento cognitivo e de comunicação, funções orais , sugerindo que importantes alterações fonoaudiológicas podem fazer parte do fenótipo desta síndrome, ainda pouco difundida para fonoaudiólogos.

Surgical risk tests related to cardiopulmonary postoperative complications: comparison between upper abdominal and thoracic surgery

PURPOSE: To investigate if tests used in the preoperative period of upper abdominal or thoracic surgeries are able to differentiate the patients that presented cardiopulmonary postoperative complications. METHODS: Seventy eight patients, 30 submitted to upper abdominal surgery and 48 to thoracic surgery were evaluated. Spirometry, respirometry, manovacuometry, six-minute walk test and stair-climbing test were performed. Complications from immediate postoperative to discharge from hospital were registered. RESULTS: The postoperative complications rate was 17% in upper abdominal surgery and 10% in thoracic surgery. In the univariate regression, the only variable that kept the correlation with postoperative complications in the upper abdominal surgery was maximal expiratory pressure. In thoracic surgery, the maximal voluntary ventilation, six-minute walk test and time in stair-climbing test presented correlation with postoperative complications. After multiple regression only stair-climbing test continued as an important risk predictor in thoracic surgery. CONCLUSION: The respiratory pressure could differentiate patients with complications in upper abdominal surgery, whereas in thoracic surgery, only spirometric values and exercise tests could differentiate them.

Care cost for pregnant and parturient women with diabetes and mild hyperglycemia

OBJETIVO: Comparar custos de hospitalização e de atenção ambulatorial em gestantes/parturientes diabéticas e com hiperglicemia leve. MÉTODOS: Estudo observacional, prospectivo, quantitativo descritivo realizado em centro de diabete perinatal em Botucatu, SP, entre 2007 e 2008. Foram estimados os custos por absorção diretos e indiretos disponíveis na instituição e os custos específicos para a doença (medicamentos e exames). As 30 gestantes diabéticas tratadas com dieta foram acompanhadas em ambulatório e 20 tratadas com dieta mais insulina foram hospitalizadas. RESULTADOS: O custo da doença diabete (para a assistência pré-natal e parto) foi de US$ 3,311.84 para as gestantes hospitalizadas e de US$ 1,366.04 para as acompanhadas em ambulatório. CONCLUSÕES: Os custos diretos e indiretos e o custo total da assistência pré-natal foram mais elevados nas gestantes diabéticas hospitalizadas enquanto os custos da assistência ao parto e hospitalização para parto e puerpério foram semelhantes. Os custos da assistência pré-natal como no parto/puerpério foram superiores aos valores pagos pelo Sistema Único de Saúde.

Identification of Staphylococcus saprophyticus isolated from patients with urinary tract infection using a simple set of biochemical tests correlating with 16S-23S interspace region molecular weight patterns

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Comparação entre dois testes de rastreamento do diabetes gestacional e o resultado perinatal

OBJETIVO: comparar dois testes de rastreamento para diabetes e seus resultados com o resultado da gestação. MÉTODOS: no total, 279 pacientes foram submetidas a dois testes de rastreamento do diabetes gestacional - associação glicemia de jejum e fatores de risco (GJ + FR) e o teste de tolerância à glicose simplificado (TTG50g). O rastreamento pela associação GJ + FR caracterizou-se pela dosagem da glicemia de jejum e anamnese para identificação dos fatores de risco na primeira consulta de pré-natal. O TTG50g foi realizado entre a 24ª e a 28ª semana de gestação e caracterizou-se pela dosagem das glicemias plasmáticas em jejum e uma hora após a sobrecarga oral com 50 g de glicose. Os resultados, positivo e negativo, foram relacionados ao resultado da gestação. Foram consideradas variáveis dependentes: via de parto, idade gestacional, peso e índice ponderal ao nascimento, índices de Apgar <7 no 1º e 5º minutos, necessidade de Unidade de Terapia Intensiva (UTI), tempo de permanência hospitalar e óbito neonatal. Empregou-se o teste t de Student, admitindo-se 5% como limite de significância para calcular a diferença de proporção de das médias. RESULTADOS: apenas dois resultados perinatais estudados foram diferenciados pelos testes. O TTG50g alterado esteve associado à maior proporção de cesárea (58,7 versus 34,3%) e a associação GJ + FR positiva, maior taxa de prematuridade (15,4 versus 5,4%). As demais variáveis não foram diferentes nas pacientes com testes de rastreamento positivo e negativo. CONCLUSÕES: Apesar da relação entre a prematuridade e associação GJ + FR positiva e aumento de cesárea e TTG50g alterado, seria falha crítica aceitá-los como definitivos. Entre outras explicações, múltiplos fatores intercorrentes e as características próprias dos testes de rastreamento devem ser consideradas.

Short- and long-term reproductive effects of prenatal and lactational growth restriction caused by maternal diabetes in male rats

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Comparison between 100-g glucose tolerance test and two other screening tests for gestational diabetes: combined fasting glucose with risk factors and 50-g glucose tolerance test

CONTEXTO E OBJETIVO: A falta de consenso sobre os protocolos de rastreamento e diagnóstico do diabetes gestacional, associada às dificuldades na realização do teste oral simplificado do diabete gestacional (o teste de tolerância a 100 g de glicose, considerado padrão-ouro) justificam a comparação com alternativas. O objetivo deste trabalho é comparar o teste padrão-ouro a dois testes de rastreamento: associação de glicemia de jejum e fatores de risco (GJ + FR) e o teste oral simplificado de tolerância a 50 g de glicose (TTG 50 g), com o teste de tolerância a 100 g de glicose (TTG 100 g). TIPO DE ESTUDO E LOCAL: Estudo de coorte longitudinal, prospectivo, realizado no Serviço de Ginecologia e Obstetrícia do Hospital Universitário da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. MÉTODOS: 341 gestantes foram submetidas aos três testes. Calcularam-se os índices de sensibilidade (S), especificidade (E), valores preditivos (VPP e VPN), razões de probabilidade (RPP e RPN) e resultados falsos (FP e FN), positivos e negativos da associação GJ + FR e do TTG 50 g em relação ao TTG 100 g. Compararam-se as médias das glicemias de uma hora pós-sobrecarga (1hPS) com 50 e 100 g. Na análise estatística, empregou-se o teste t de Student, com limite de significância de 5%. RESULTADOS: A associação GJ + FR encaminhou mais gestantes (53,9%) para a confirmação diagnóstica que o TTG 50 g (14,4%). Os dois testes foram equivalentes nos índices de S (86,4 e 76,9%), VPN (98,7 e 98,9%), RPN (0,3 e 0,27) e FN (15,4 e 23,1%). As médias das glicemias 1hPS foram semelhantes, 106,8 mg/dl para o TTG 50 g e 107,5 mg/dl para o TTG 100 g. CONCLUSÕES: Os resultados da eficiência diagnóstica associados à simplicidade, praticabilidade e custo referendaram a associação GJ + FR como o mais adequado para o rastreamento. A equivalência das glicemias de 1hPS permitiram a proposição de um novo protocolo de rastreamento e diagnóstico do diabete gestacional, com menores custo e desconforto.