Comparison of different nonlinear functions to describe Nelore cattle growth

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estimação de parâmetros genéticos para produção de leite de cabras da raça Alpina

Foram utilizados 9.374 registros semanais de produção de leite de 302 primeiras lactações de cabras da raça Alpina. A produção de leite no dia do controle foi analisada por meio de um modelo animal, unicarater, de regressão aleatória, em que as funções de covariâncias para os componentes genéticos aditivos e de ambiente permanente foram modeladas por meio das funções de Wilmink, Ali e Schaeffer e por polinômios ortogonais, em uma escala de Legendre de ordens cúbica e quíntica. Assumiu-se, ainda, variância residual homogênea durante toda a lactação e heterogênea com três e quatro classes de variância residual. Os modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike (AIC), pelo critério de informação Bayesiano de Schwar (BIC), pela função de verossimilhança (Ln L), pela visualização das estimativas de variâncias genéticas, de ambiente permanente, fenotípicas e residuais e pelas herdabilidades. O polinômio de Legendre de ordem quíntica, com quatro e três classes de variâncias residuais, e a função de Ali e Schaeffer, com quatro classes de variâncias residuais, foram indicados como os mais adequados pelo AIC, BIC e Ln L. Estes modelos diferiram na partição da variância fenotípica para as variâncias de ambiente permanente, genética e residual apenas no início e no final da lactação. Contudo, a função de Ali e Schaeffer resultou em estimativas negativas de correlação genética entre os controles mais distantes. O polinômio de Legendre de ordem quíntica, assumindo variância residual heterogênea, mostrou-se mais adequado para ajustar a produção de leite no dia do controle de cabras da raça Alpina.

Random regression analyses using B-splines functions to model growth from birth to adult age in Canchim cattle

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Phylogeny, Ecology, and Heart Position in Snakes

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estimation of (co)variance components and genetic parameters for weights of red-winged tinamou using random regression models

Com este trabalho objetivou-se determinar parâmetros genéticos para peso corporal de perdizes em cativeiro. Foram utilizados modelos de regressão aleatória na análise dos dados considerando os efeitos genéticos aditivos diretos (AD) e de ambiente permanente de animal (AP) como aleatórios. As variâncias residuais foram modeladas utilizando-se funções de variância de ordem 5. A curva média da população foi ajustada por polinômios ortogonais de Legendre de ordem 6. Os efeitos genéticos aditivos diretos e de ambiente permanente de animal foram modelados utilizando-se polinômios de Legendre de segunda a nona ordem. Os melhores resultados foram obtidos pelos modelos de ordem 6 de ajuste para os efeitos genéticos aditivos diretos e de ordem 3 para os de ambiente permanente pelo Critério de Informação de Akaike e ordem 3 para ambos os efeitos pelos Critério de Informação Bayesiano de Schwartz e Teste de Razão de Verossimilhança. As herdabilidades estimadas variaram de 0,02 a 0,57. O primeiro autovalor respondeu por 94 e 90% da variação decorrente de efeitos aditivos diretos e de ambiente permanente, respectivamente. A seleção de perdizes para peso corporal é mais efetiva a partir de 112 dias de idade.

Non-stationary frequency analysis of extreme daily rainfall in São Paulo, Brazil

This work is an assessment of frequency of extreme values (EVs) of daily rainfall in the city of São Paulo. Brazil, over the period 1933-2005, based on the peaks-over-threshold (POT) and Generalized Pareto Distribution (GPD) approach. Usually. a GPD model is fitted to a sample of POT Values Selected With a constant threshold. However. in this work we use time-dependent thresholds, composed of relatively large p quantities (for example p of 0.97) of daily rainfall amounts computed from all available data. Samples of POT values were extracted with several Values of p. Four different GPD models (GPD-1, GPD-2, GPD-3. and GDP-4) were fitted to each one of these samples by the maximum likelihood (ML) method. The shape parameter was assumed constant for the four models, but time-varying covariates were incorporated into scale parameter of GPD-2. GPD-3, and GPD-4, describing annual cycle in GPD-2. linear trend in GPD-3, and both annual cycle and linear trend in GPD-4. The GPD-1 with constant scale and shape parameters is the simplest model. For identification of the best model among the four models WC used rescaled Akaike Information Criterion (AIC) with second-order bias correction. This criterion isolates GPD-3 as the best model, i.e. the one with positive linear trend in the scale parameter. The slope of this trend is significant compared to the null hypothesis of no trend, for about 98% confidence level. The non-parametric Mann-Kendall test also showed presence of positive trend in the annual frequency of excess over high thresholds. with p-value being virtually zero. Therefore. there is strong evidence that high quantiles of daily rainfall in the city of São Paulo have been increasing in magnitude and frequency over time. For example. 0.99 quantiles of daily rainfall amount have increased by about 40 mm between 1933 and 2005. Copyright (C) 2008 Royal Meteorological Society

Growth curves for ostriches (Struthio camelus) in a Brazilian population

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Water availability determines the richness and density of fig trees within Brazilian semideciduous forest landscapes

The success of fig trees in tropical ecosystems is evidenced by the great diversity (+750 species) and wide geographic distribution of the genus. We assessed the contribution of environmental variables on the species richness and density of fig trees in fragments of seasonal semideciduous forest (SSF) in Brazil. We assessed 20 forest fragments in three regions in Sao Paulo State, Brazil. Fig tree richness and density was estimated in rectangular plots, comprising 31.4 ha sampled. Both richness and fig tree density were linearly modeled as function of variables representing (1) fragment metrics, (2) forest structure, and (3) landscape metrics expressing water drainage in the fragments. Model selection was performed by comparing the AIC values (Akaike Information Criterion) and the relative weight of each model (wAIC). Both species richness and fig tree density were better explained by the water availability in the fragment (meter of streams/ha): wAICrichness = 0.45, wAICdensity = 0.96. The remaining variables related to anthropic perturbation and forest structure were of little weight in the models. The rainfall seasonality in SSF seems to select for both establishment strategies and morphological adaptations in the hemiepiphytic fig tree species. In the studied SSF, hemiepiphytes established at lower heights in their host trees than reported for fig trees in evergreen rainforests. Some hemiepiphytic fig species evolved superficial roots extending up to 100 m from their trunks, resulting in hectare-scale root zones that allow them to efficiently forage water and soil nutrients. The community of fig trees was robust to variation in forest structure and conservation level of SSF fragments, making this group of plants an important element for the functioning of seasonal tropical forests. © 2013 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Modelos não lineares, alometria e dinâmica de macromoléculas para analisar o crescimento do Acará Bandeira (Pterophyllum scalare)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Algumas distribuições de probalidade para idosos grupados e censurados

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Comparação de ajustes do modelo de Gompertz a dados de crescimento

Pós-graduação em Biometria - IBB

Ajustes de modelos não lineares de efeitos fixos, com ponderação e misto

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A aplicação da distribuição exponencial geométrica estendida para modelagem de dados pluviométricos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Confirmatory factor analysis of different versions of the Body Shape Questionnaire applied to Brazilian university students

This study aimed at evaluating the validity, reliability, and factorial invariance of the complete (34-item) and shortened (8-item and 16-item) versions of the Body Shape Questionnaire (BSQ) when applied to Brazilian university students. A total of 739 female students with a mean age of 20.44 (standard deviation = 2.45) years participated. Confirmatory factor analysis was conducted to verify the degree to which the one-factor structure satisfies the proposal for the BSQ's expected structure. Two items of the 34-item version were excluded because they had factor weights (lambda)< 40. All models had adequate convergent validity (average variance extracted =.43-.58; composite reliability=.85-.97) and internal consistency (alpha =.85-.97). The 8-item B version was considered the best shortened BSQ version (Akaike information criterion = 84.07, Bayes information criterion = 157.75, Browne-Cudeck criterion= 84.46), with strong invariance for independent samples (Delta chi(2)lambda(7)= 5.06, Delta chi(2)Cov(8)= 5.11, Delta chi(2)Res(16) = 19.30). (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

A note on model uncertainty in linear regression

We consider model selection uncertainty in linear regression. We study theoretically and by simulation the approach of Buckland and co-workers, who proposed estimating a parameter common to all models under study by taking a weighted average over the models, using weights obtained from information criteria or the bootstrap. This approach is compared with the usual approach in which the 'best' model is used, and with Bayesian model averaging. The weighted predictor behaves similarly to model averaging, with generally more realistic mean-squared errors than the usual model-selection-based estimator.