71 resultados para Similarity Coefficient
em Repositório Institucional UNESP - Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho"
Resumo:
Objetivou-se neste trabalho a obtenção de padrões de infestação de plantas daninhas na cultura de cana-de-açúcar com histórico de colheita mecanizada sem queima prévia da palha. Foram realizadas amostragens em 28 talhões na região de Ribeirão Preto, SP; em cada talhão foram demarcadas unidades de avaliação e coleta, na proporção de duas por hectare, que consistiram de áreas (quatro linhas de 4 metros de comprimento) mantidas sem controle de plantas daninhas e onde foram realizadas as amostragens de plantas emergidas. As amostragens foram realizadas aos 120 dias após o corte, com quadrados vazados (0,5 x 0,5 m) lançados aleatoriamente duas vezes em cada uma das unidades de avaliação e coleta. Com os dados obtidos, calculou-se a importância relativa e o índice de agregação das espécies ou grupo de espécies. Esses índices foram usados no processamento da análise de agrupamento hierárquica, utilizando como medida de semelhança a distância euclidiana e como estratégia de agrupamento o método UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using arithmetic Averages). Foi possível distinguir quatro grupos em função da importância relativa e cinco grupos de talhões em função do índice de agregação; dentro de alguns grupos houve formação de subgrupos.
Resumo:
O conhecimento da composição específica do banco de sementes de plantas daninhas e a sua correlação com a flora estabelecida são importantes para nortear o manejo a ser adotado e a escolha dos herbicidas. A colheita mecanizada de cana-de-açúcar acarretou mudanças significativas na composição da flora infestante, quando proporcionou a manutenção de uma camada de palha, reduziu a movimentação do solo e dispensou a prática da queimada. Foram realizados levantamentos do banco de sementes e da flora de plantas daninhas que se estabeleceu em 28 talhões colhidos mecanicamente, sem queima prévia da palha. Com base nos dados de banco de sementes, efetuaram-se estudos fitossociológicos e de correlação entre a composição do banco de sementes e a flora emergida. As principais espécies presentes no banco de sementes foram as pertencentes à classe das dicotiledôneas anuais, com destaque para Amaranthus spp. e diversas espécies de Euphorbiaceae e Convolvulaceae. As sementes de gramíneas tradicionais da cultura tiveram pouca participação. O banco de sementes apresentou correlação não-significativa com a flora emergente, independentemente da época de colheita do talhão, da metodologia de quantificação do banco de sementes e das espécies de plantas daninhas.
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Apesar da importância na dinâmica dos ecossistemas aquáticos, as macrófitas podem formar densas e extensas colonizações em corpos hídricos cujos equilíbrios ecológicos foram rompidos. Nessas condições, essas plantas promovem uma série de problemas que as tornam alvos de controle. Para elaboração de planos adequados de manejo dessa vegetação, é fundamental o conhecimento das dinâmicas relativas das populações que a compõem. O objetivo deste trabalho foi realizar levantamentos mensais da composição específica da comunidade de macrófitas que coloniza o reservatório de Santana, localizado no município de Piraí/RJ, monitorando 97 pontos georreferenciados, abrangendo toda a lâmina d'água. Foram identificadas 41 espécies, inseridas em 21 famílias botânicas. As famílias Poaceae, Pontederiaceae e Cyperacae foram as que apresentaram os maiores números de espécies ao longo do ano. Salvinia herzogii e Egeria densa apresentaram as maiores notas anuais de colonização do reservatório. As populações de Eichhornia azurea, Brachiaria arrecta e Paspalum repens completaram o grupo das espécies numericamente mais relevantes. As plantas de hábito flutuante tenderam a apresentar populações com padrão de distribuição geográfica casualizado, enquanto as espécies fixadas no sedimento e as submersas apresentaram populações com padrão agregado. Não houve expressivas variações mensais dos valores dos índices de diversidade (H') e de equitabilidade (E') das comunidades de macrófitas aquáticas ao longo do ano. O dendrograma construído com o coeficiente de Odum mostrou uma seqüência lógica dos meses, evidenciando uma definida sucessão de populações divididas em dois grupos de similaridade separados pelo mês de junho. Nessa época, o nível de água do reservatório foi reduzido e o sedimento ficou exposto, favorecendo as espécies de hábito emergente.
Resumo:
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
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A protective digestive microflora helps prevent and reduce broiler infection and colonization by enteropathogens. In the current experiment, broilers fed diets supplemented with probiotics and essential oil (EO) blends were infected with a standard mixed Eimeria spp. to determine effects of performance enhancers on ileal and cecal microbial communities (MCs). Eight treatment groups included four controls (uninfected-unmedicated [UU], unmedicated-infected, the antibiotic BMD plus the ionophore Coban as positive control, and the ionophore as negative control), and four treatments (probiotics BC-30 and Calsporin; and EO, Crina Poultry Plus, and Crina PoultryAF). Day-old broilers were raised to 14 days in floor pens on used litter and then were moved to Petersime batteries and inoculated at 15 days with mixed Eimeria spp. Ileal and cecal samples were collected at 14 days and 7 days postinfection. Digesta DNA was subjected to pyrosequencing for sequencing of individual cecal bacteria and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) for determination of changes in ileal and cecal MC according to percentage similarity coefficient (%SC). Pyrosequencing is very sensitive detecting shifts in individual bacterial sequences, whereas DGGE is able to detect gross shifts in entire MC. These combined techniques offer versatility toward identifying feed additive and mild Eimeria infection modulation of broiler MC. Pyrosequencing detected 147 bacterial species sequences. Additionally, pyrosequencing revealed the presence of relatively low levels of the potential human enteropathogens Campylobacter sp. and four Shigella spp. as well as the potential poultry pathogen Clostridiun perfringens. Pre- and postinfection changes in ileal (56%SC) and cecal (78.5%SC) DGGE profiles resulted from the coccidia infection and with increased broiler age. Probiotics and EO changed MC from those seen in UU ilea and ceca. Results potentially reflect the performance enhancement above expectations in comparison to broilers not given the probiotics or the specific EO blends as feed supplements.
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Flavobacterium columnare is a cosmopolite bacteria and it is one of the main problem in Brazilian aquaculture, causing high mortalities index and economic damage. The main factors that contribute to columnaris disease are inadequate water quality, excess handling, high density of fish and temperature variations. For a successful epidemiological study and disease control, it is essential to differentiate the F. columnare from other yellow pigmentation bacteria. The present study used molecular techniques to characterize, by RAPD-PCR, two strains of F. columnare isolated from Oreochromis niloticus and Brycon orbignyanus. Data were analyzed as binary (0 and 1) and a genetic similarity matrix was generated by Jaccard's coefficient. Cluster analysis was performed by the neighbor joining method. The RAPD-PCR technique confirmed to be a usefull tool to obtain genetic profiles from F. columnare isolates based on the oligonucleotides used and to verify genetic similarity.
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The present work evaluated larvae cannibalism of matrinxa, Brycon cephalus, originated from eggs exposed to triiodothyronine, in the period of 36 to 72 hours after hatching. Observed parameters were: weight and length of larvae, stomach content, presence of cannibalism and type of attacks. This study was carried out at Centro de Pesquisa e Gestao de Recursos Pesqueiros Continentais (CEPTA/IBAMA), Pirassununga-SP, in November 2004. Three females were hormonally induced to spawn and pooled oocytes were fertilized and separated into four batches that constituted the treatments: L-1 (control - water); L-2 (0.01 ppm T-3); L-3 (0.05 ppm T-3) and L-4 (0.1 ppm T-3). Eggs were exposed during 15 minutes to water or to solutions containing the different concentrations of T3. Eggs were distributed in 12 conic incubators (60 L), with three replicates per treatment. There was stocked 500 mL of eggs per incubator and hatched larvae were counted. Samples of 30 larvae per treatment were colleted during occurrence of cannibalism (36, 48, 60 and 72 hours post hatching). Predator larvae (with rests of larvae in the stomach) were 50% of the total number of larvae and they presented weight 50% higher compared to that of non predator larvae (without rests of larvae in the stomach) and 9% higher regarding length. Coefficient of variation of weight and length did not differ among treatments, showing similarity in relation to the size. The stomach content revealed that cannibalism occurred in around 50-60 % of larvae, regardless the exposure to the triiodothyronine, and attacks were characterized as head-tail and tail-head attacks.
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Foram coletadas 143 amostras de mãos de humanos e camas hospitalares, através de swabs no caldo BHI, em um hospital escola da cidade de Ribeirão Preto/SP. As amostras coletadas foram incubadas a 37ºC por 24 horas e após este período as culturas foram semeadas em placas de Petri contendo agar Staphylococcus Médium 110. As colônias típicas do gênero Staphylococcus foram colhidas e estocados a 4ºC até o momento de elaboração das provas de catalase, manitol, hemólise, DNAse e coagulase. As cepas isoladas foram analisadas através da técnica de RAPD-PCR para verificar o grau de similaridade. A sensibilidade das cepas isoladas foi testada frente a 10 diferentes antibióticos. Das 92 cepas de Staphylococcus sp isoladas, 67 (72,8%) foram identificados como Staphylococcus coagulase-negativas e 25 (27,2%) como Staphylococcus coagulase-positivas. A análise de similaridade mostrou uma grande heterogeneidade entre as cepas, entretanto foram isoladas algumas cepas com 100% de similaridade. Resistência a oxacilina foi encontrada em 39 (42%) cepas. Duas cepas de estafilococos coagulase-negativos mostraram-se resistentes a vancomicina. Onze cepas (12%) de estafilococos foram consideradas multirresistentes. Medidas de desinfecção das mãos de pessoal e dos leitos hospitalares e a racionalização do uso indiscriminado de antibióticos podem contribuir para a queda da transmissão de patógenos e diminuição da pressão de seleção, e conseqüentemente diminuindo a freqüência e letalidade das infecções nosocomiais.
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Este estudo visou avaliar a variabilidade e distância genética dentro de uma população-base de melhoramento genético de Eucalyptus grandis. A avaliação da variabilidade genética tem como objetivos principais analisar a base genética da população-base e montar um banco de dados marcadores moleculares da população em análise. Essa população é formada por 327 indivíduos, principalmente das procedências de Coff's Harbour, Atherton e Rio Claro. Devido à heterozigosidade natural dessa população, ela pode ser dividida em diversas subpopulações, de acordo com a latitude e longitude de origem; e dentro de subpopulações, em função do grau de melhoramento genético já realizado do material analisado no Brasil. Isso permitiu avaliar quanto da variabilidade detectada dentro da população-base foi devido a esses fatores: procedência e grau de melhoramento. A aplicação da técnica RAPD permitiu avaliar 70 locos polimórficos, que foram analisados utilizando-se o coeficiente de Jaccard, o que resultou em matrizes de similaridade genética entre os indivíduos. Os dados de similaridade genética posteriormente foram submetidos à análise estatística. Osdados indicaram que a população-base apresenta ampla base genética, com média de similaridade genética de 0,328. O subgrupo denominado Região 3, composto por material selvagem da macrorregião de Atherton, juntamente com material de APS da macrorregião de Coff's Harbour, foi um dos que mais contribuíram para a ampla base genética da população-base. Foi possível detectar diferença estatística entre as populações selvagens das procedências de Atherton e Coff's Harbour, assim como entre essas procedências e a de Rio Claro.
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Genomic DNAs isolated from strains of Xylella fastidiosa that caused citrus variegated chlorosis, coffee leaf scorch, Pierce's Disease of grapevine, and plum leaf scorch were analyzed by arbitrarily primed polymerase chain reaction. Purified DNA was amplified under nonstringent conditions with single primers 21 nucleotides (nt) long. Thirty-nine amplification products were observed that were useful to distinguish among the strains and to derive a similarity matrix and construct a phenogram showing possible relationships among the strains. Strains isolated from diseased coffee and citrus in Brazil were closely related to each other (coefficient of similarity of 0.872), but only distantly related to a strain isolated from diseased grapevine in the USA (coefficient of similarity of 0.650). Strains of Xylella fastidiosa isolated from diseased plums in the USA and Brazil clustered with strains from different hosts isolated from their respective countries of origin. Thus, there may be two quite dissimilar clusters of strains of Xylella fastidiosa, one in North America and the other in South America. Each cluster contains strains that can cause disease in plum. The methods described provide a convenient and rapid method to distinguish between strains of Xylella fastidiosa that cause diseases of coffee and citrus in the same region of Brazil. This has not been possible previously. This will potentially enable the two strains to be distinguished in alternate hosts or in insect vectors.
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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An interferometric technique was used to determine the temperature coefficient of the optical path length (dS/dT) as a function of the temperature in several optical glasses. The temperature range was between 25degreesC and 180degreesC. The studied samples included undoped and doped oxide glasses, such as low silica calcium aluminosilicate, phosphates, borates and also chalcogenides. The oxide glasses had dS/dT between 10 X 10(-6) K-1 and 20x10(-6) K-1, while for the chalcogenides, these were around 70 x 10(-6)K(-1). The results showed that dS/dTs increased with the temperature in all samples. For samples doped with Nd the dS/dT values were found to be independent of concentration. on the other hand, for the phosphate glass doped with Cr, dS/dT increased about 5% when compared with the Nd doped one. In conclusion, the used interferometric method, which is a considerably simpler and a lower cost technique, and is a useful tool to measure dS/dT in semi-transparent glasses as a function of the composition and temperature. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.
Resumo:
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
Resumo:
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)