Optimal clone identifier for genomic shotgun libraries: OC Identifier tool

In DNA microarray experiments, the gene fragments that are spotted on the slides are usually obtained by the synthesis of specific oligonucleotides that are able to amplify genes through PCR. Shotgun library sequences are an alternative to synthesis of primers for the study of each gene in the genome. The possibility of putting thousands of gene sequences into a single slide allows the use of shotgun clones in order to proceed with microarray analysis without a completely sequenced genome. We developed an OC Identifier tool (optimal clone identifier for genomic shotgun libraries) for the identification of unique genes in shotgun libraries based on a partially sequenced genome; this allows simultaneous use of clones in projects such as transcriptome and phylogeny studies, using comparative genomic hybridization and genome assembly. The OC Identifier tool allows comparative genome analysis, biological databases, query language in relational databases, and provides bioinformatics tools to identify clones that contain unique genes as alternatives to primer synthesis. The OC Identifier allows analysis of clones during the sequencing phase, making it possible to select genes of interest for construction of a DNA microarray. ©FUNPEC-RP.

Ligas inteligentes com efeito memória de forma aplicáveis em um grande intervalo de temperaturas e particularmente superior a 200 oC.

Ligas que compreendem quantidades de metais expressas como porcentagens em peso, incluídas dentro dos seguintes intervalos: 8-20% de Al; 1-20% de Ag; 0-2% (de preferência 0,5-1%) de um metal minoritário (de preferência Co); e o resto até 1005 de Cu. As suas transformações martensíticas têm lugar a temperaturas superiores e aproximadamente 200°C, e próximas aos 400°C em alguns casos, sendo habituais as próximas aos 300°C. Possuem maior resistência à corrosão que as ligas convencionais. São úteis em novos campos de aplicação industrial como, por exemplo, no controle de temperatura em óleos de alto ponto de ebulição e em situações de grande desprendimento de calor por reações exotérmicas ou por grande roçamento.

Estudo comparativo de imunomarcações (OC, VEGF, TRAP) em humanos, nas cirurgia de levantamento do assoalho de seio maxilar utilizando osso autógeno e heterógeno

Pós-graduação em Odontologia - FOA

Ant communities (Hymenoptera: Formicidae) in an urban ecosystem near the Atlantic Rainforest

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Germinação de sementes de melão-de-são-caetano sob variação de água, luz e temperatura

The purpose of this study was to evaluate germination of Momordica charantia L. seeds under different conditions of: water availability (0.0, -0.2, -0.4, -0.6, -0.8 and -1.0 MPa), temperature (10, 15, 20, 25, 30 and 35 degrees C) and quality of incident light (filter dark, red, green, yellow, red off, blue, orange and without filter). For each variable evaluated, experiments were carried out in a completely randomized design with four replicates kept under controlled conditions (germination chamber). There were higher percentages of germination under conditions of mild water restriction (-0.2 MPa) and temperatures around 25 degrees C, regardless of the quality of light. Temperatures below 20 degrees C and above 30 degrees C reduced germination, although lower temperatures had strongly effects on germination. Water availability lower than -0.2 MPa strongly reduced germination, which was inhibited in the treatments of -0.8 and 1.0 MPa.

Infection of commercial laying hens with Salmonella Gallinarum: clinical, anatomopathological and haematological studies

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Segurança das condições de aplicação de herbicidas com aerobarco em plantas daninhas aquáticas no lago da Hidrelétrica de Jupiá

Os objetivos deste trabalho foram quantificar as exposições dérmicas (EDs) e respiratórias (ERs) proporcionadas ao piloto e ao seu ajudante nas aplicações de herbicidas para o controle de plantas daninhas aquáticas com aerobarco; classificar essas condições de trabalho em seguras ou inseguras; e calcular a necessidade de controle das exposições (NCE) e o tempo de trabalho seguro (TTS). O aerobarco utilizado tinha casco de alumínio (4,85 x 2,42 m) e acionamento por hélice acoplada a motor a gasolina de 350 HP. O equipamento de pulverização era composto por bomba de diafragma com fluxo máximo de 49,69 L min-1, pressão máxima de 25 kg cm-2, acionada por motor a gasolina de 4 HP, e tanque de calda de 189 L. A barra de pulverização de alumínio era composta de duas seções laterais de 3 m, posicionadas na linha entre o encosto do banco do piloto e o início da estrutura protetora da hélice. Cada seção da barra tinha seis bicos com pontas de jato plano com indução de ar AI 100 03, espaçados de 0,5 m, e uma ponta OC 20 fixada em cada extremidade. O conjunto de pontas pulverizava faixas de 6 m de largura e aplicava o volume de calda de 200 L ha-1. O sistema tinha gerenciador de fluxo, controlado por central eletrônica acoplada a DGPS (com precisão submétrica), para corrigir automaticamente a vazão em função de alterações na velocidade real da embarcação. As EDs e ERs aos herbicidas foram calculadas com os dados substitutos das exposições às caldas, avaliadas com os traçadores cobre e manganês adicionados às caldas. As exposições foram extrapoladas para uma jornada de trabalho de seis horas. A segurança das condições de trabalho foi determinada com o cálculo da margem de segurança (MS), utilizando-se a fórmula MS = (NOEL x 70)/(QAE x 10), em que QAE = quantidade absorvível da exposição. As condições de trabalho foram classificadas em seguras, se MS>1, ou inseguras, se MS<1. As exposições proporcionadas pelas condições de trabalho foram de 10,65 mL de calda por dia para o piloto e de 16,80 mL por dia para o ajudante, que fica sentado em uma cadeira a 2,0 m à frente do piloto e da barra de pulverização. Classificaram-se como seguras as aplicações dos herbicidas glyphosate (Rodeo, 6 L ha-1), 2,4D (DMA 806 BR, 8 L ha-1) e fluridone (Sonar AQ, 0,4 L ha-1), para o piloto e o seu ajudante. Classificou-se como insegura a aplicação do herbicida diquat (Reward, 4,0 L ha-1) para as duas condições de trabalho, cujas necessidades de controle das exposições calculadas foram de 65% para o piloto e de 78% para o ajudante do piloto.

Sources of human non-typhoid salmonellosis: a review

Salmonellosis is a worldwide disease caused by bacteria of the genus Salmonella. Currently, there are over 2,500 identified serovars of Salmonella. A reduced number of these serovars, about eighty, are implicated in most animals and human diseases. Most cases of salmonellosis in humans are associated with the consumption of contaminated food products such as beef, pork, poultry meat, eggs, vegetables, juices and other kind of foods. It may also be associated with the contact between humans and infected pet animals. Therefore, the chain of human salmonellosis is very complex and in most cases the origin of the infection is difficult to establish. The use of antimicrobial agents to treat and to prevent bacterial infections in humans and animals, as well as as growth promoters in animal production, has favoured the selection and transference of resistance genes between different bacteria, including Salmonella serovars. Many studies have confirmed the role of foods of animal origin as a source of multi drugresistant Salmonella serovars. For this reason, continuous surveillance of these pathogens along the food chain together with the responsible use of antimicrobial agents is necessary.

Serosurvey of selected avian pathogens in brazilian commercial Rheas (Rhea americana) and Ostriches (Struthio camelus)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Organic acids and/or compound with defined microorganisms to control Salmonella enterica serovar Enteritidis experimental infection in chickens

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação da atividade dos inibidores de tripsina após digestão enzimática em grãos de soja tratados termicamente

Este trabalho avalia a reativação dos inibidores de tripsina, após proteólise in vitro, de grãos de soja tratados termicamente. Para a inativação térmica dos inibidores, os grãos foram embebidos em água destilada (1:5 p/v) durante 12 horas e aquecidos em placas sob refluxo por 30 minutos. A reativação dos inibidores foi avaliada em comparação com a atividade das amostras cruas e aquecidas. A digestibilidade in vitro das proteínas variou de 47% ('OC-13') a 59% (Paraná), apresentando uma melhora, em média, de 32,6% com o aquecimento. A atividade dos inibidores de tripsina para os grãos crus variou de 122 a 206 UTI/mg de amostra, e os valores correlacionaram-se negativamente com a porcentagem de digestibilidade (r = -0,9177). Os inibidores tiveram suas atividades totalmente inativadas com o aquecimento dos grãos, os quais apresentaram porcentagem de recuperação, em média, de 40%. Com o aquecimento, a inativação dos inibidores provavelmente ocorre por complexação com os componentes do grão, o que leva à recuperação da atividade com o processo de digestão enzimática.

Blood serum components and serum protein test of Hybro-PG broilers of different ages

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Modelos para estimar as exigências de energia metabolizável para poedeiras

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Superação da dormência de sementes de capim colonião

O objetivo da pesquisa foi o de identificar tratamentos capazes de superar a dormência e elevar a taxa de germinação das sementes de Panicum maximum Jacq., passíveis de utilização visando semeadura a campo. Para tanto, sementes foram submetidas a tratamentos de imersão em H2SO4 (98%, 36N) por 5 minutos, de umedecimento do substrato de germinação com KNO3 (0,2%) e a tratamentos térmicos de 40, 55, 70 e 85OC por períodos de exposição de 5, 10 e 15h, em estufa com circulação forçada de ar. As sementes tratadas foram avaliadas por meio do teste de germinação, finalizado pelo teste de tetrazólio nas sementes não germinadas, bimestralmente, ao longo de 6 meses de armazenamento. Foi constatado que os tratamentos químicos (KNO3 e H2SO4) e térmicos (40, 55, 70 e 85 oC por 5, 10 e 15 h) são eficientes na superação da dormência que, não necessariamente, é revertida em elevação da taxa de germinação. A utilização da temperatura de 40oC reduz a taxa de dormência promovendo elevação na taxa de germinação das sementes.

Liberação de CO2, biomassa microbiana e fósforo disponível em solo adicionado de matéria seca de poaia-branca

O presente experimento, inteiramente casualizado, foi desenvolvido em condições de laboratório no Departamento de Defesa Fitossanitária, FCA/UNESP - Botucatu, entre julho e setembro de 1992. Amostras de Areia Quartzosa equivalentes à 40 g de terra seca à 105 oC ± 2 com ou sem adição de 1,9 g de matéria seca de plantas de poaia-branca (Richardia brasiliensis), 0,19 g de nitrogênio (NH4)2SO4 e 0,88 g de apatita de Araxá, foram incubadas no escuro a 25 o C ± 2 , com umidade mantida a 60% da capacidade de retenção de água. Durante a incubação, determinou-se o CO2 liberado, utilizando-se o método de retenção em NAOH seguida de titulometria com HCl; a biomassa microbiana, método de fumigação-incubação; o pH e a quantidade de fósforo extraído por resina. A maior liberação de CO2 ocorreu durante os dez primeiros dias de incubação, com 77% do total de carbono liberado nos tratamentos com adição de poaia, e 37% nos tratamentos sem adição da mesma. A liberação de CO2 foi 57 vezes maior nos tratamentos com poaia em relação ao controle. A poaia também provocou aumentos na biomassa microbiana (média de 8 vezes a biomassa do tratamento controle), e a adição de nitrogênio e/ou fosfato de rocha junto à poaia antecipou os picos de formação de biomassa de 20 para 10 dias de incubação. Os níveis de fósforo disponível foram maiores no tratamento com adição de fosfato de rocha apenas. A poaia também alcalinizou o sistema, não permitindo desta forma, observar-se relação significativa entre pH e teor de fósforo disponível.