Genome-Wide Survey of SNP Variation Uncovers the Genetic Structure of Cattle Breeds

The imprints of domestication and breed development on the genomes of livestock likely differ from those of companion animals. A deep draft sequence assembly of shotgun reads from a single Hereford female and comparative sequences sampled from six additional breeds were used to develop probes to interrogate 37,470 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 497 cattle from 19 geographically and biologically diverse breeds. These data show that cattle have undergone a rapid recent decrease in effective population size from a very large ancestral population, possibly due to bottlenecks associated with domestication, selection, and breed formation. Domestication and artificial selection appear to have left detectable signatures of selection within the cattle genome, yet the current levels of diversity within breeds are at least as great as exists within humans.

Efeito de linhagens e substratos no crescimento miceliano e na produtividade em cultivo axênico de shiitake (Lentinula edodes (Berk.) Pegler)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estimativa de parâmetros estruturais de áreas de produção de eucalipto através de imagens de satélite na região de Botucatu /SP

Pós-graduação em Agronomia (Energia na Agricultura) - FCA

Cattle-Derived Microsatellite Markers to Study the Water Buffalo Genome

Microsatellites are well-known DNA markers used in a variety of studies such as genome mapping, genetic diversity analysis, genetic conservation and phylogenetic studies. Although microsatellites are important markers, their development and characterization demands extensive time and high cost. Thus, before new markers are developed for a particular species, it is worthwhile to test the available markers from related species. In the present study, we evaluate cattle-derived microsatellite markers for genetic studies of water buffalo. Eighty-five percents of a total of 120 microsatellite markers were optimized using buffalo DNA (Bubalus bubalis). The results showed in this paper were also deposited in the National Center for Biological Information database (NCBI) (ProbeDB and UniSTS) for use in population genetic studies of buffalo by the scientific community. The use of heterologous primers significantly reduces the cost of developing specific markers for buffalo, providing a useful short cut for the genetic population analysis and gene mapping studies.

A presença de alunos autistas em salas regulares, a aprendizagem de ciências e a alfabetização científica: percepções de professores a partir de uma pesquisa fenomenológica

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

A divulgação científica na mídia impressa: as ciências biológicas em foco

Este artigo tem como objetivo discutir algumas características da divulgação científica que toma as ciências biológicas como tema central. Optou-se pela análise de livros que, no contexto brasileiro, alcançaram sucesso público e que são, freqüentemente, mencionados por alunos universitários, tanto em sala de aula quanto em seus escritos. O enfoque dado à pesquisa é de cunho antropológico, enfatizando-se que, na pós-modernidade, fluem paralelamente duas culturas, rotuladas por Giddens (2002) de a cultura da segurança e a cultura de risco.

Avaliação da decomposição de plantas aquáticas no solo através da liberação de CO2

O objetivo deste trabalho foi avaliar a decomposição de três espécies de plantas aquáticas imersas, incorporadas ao solo, provenientes do controle mecânico, em reservatórios de usinas hidrelétricas. O estudo foi realizado em casa de vegetação, localizada no Núcleo de Pesquisas Avançadas em Matologia (NUPAM) da FCA/Unesp-Botucatu. A avaliação foi conduzida em vasos contendo 14 kg de solo, com três incorporações de 50 e 100 t MF de plantas ha-1, sob duas condições de solo: seco e úmido. Com a simulação de descarte da biomassa coletada e incorporada ao solo, pôde-se conhecer, através da liberação de CO2, a degradação de três espécies de macrófitas aquáticas submersas. Para quantificação do CO2 liberado, em cada vaso foi acondicionado um frasco com solução de NaOH, sendo, logo após, lacrados e incubados por 24 horas; em seguida, foram titulados com HCl. Para ajuste e interpolação dos dados, estes foram analisados seguindo modelo de Mitscherlich, com algumas modificações. As liberações acumuladas em solo úmido foram de 1.294 e 1.582 kg CO2 ha-1, sendo 6,2 e 5,6 vezes superiores ao ocorrido em solo seco, para 50 e 100 t MF ha-1, respectivamente, observando-se que cerca de 55% da liberação de CO2 ocorreu nos primeiros 30 dias. Pode-se concluir que o solo seco é a melhor condição para descarte e incorporação da biomassa, porém deverá existir um sistema de irrigação para que o processo de degradação da biomassa incorporada seja acelerado.

Digital monitoring of mycelium growth kinetics and vigor of shiitake (Lentinula edodes (Berk.) Pegler) on agar medium

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Evaluation of simulated external root resorptions with digital radiography and digital subtraction radiography

Introduction: Root resorption can cause damage in orthodontic patients. Digital subtraction radiography (DSR) is a useful resource for the detection of mineral losses. The purpose of this study was to compare the efficacy of digital radiography (DR) and DSR in detecting simulated external root resorption. Examiner agreement between the 2 techniques was also evaluated. Methods: Root resorptions of various sizes were simulated on the apical and lingual aspects of 49 teeth from 9 dry human mandibles. The teeth were radiographed in standardized conditions. The radiographs were registered with Regeemy Image Registration and Mosaicking (version 0.2.43-RCB, DPI-INPE, Sao Jose dos Campos, São Paulo, Brazil) and subtracted with Image Tool (University of Texas Health Science Center at San Antonio). The subtracted images and the digital radiographs were evaluated by 3 oral radiologists. Results: No statistically significant differences were found for the methods in the detection of apical root resorptions, independently from lesion size, and of lingual resorptions of 1.2 mm or greater. DSR was significantly better than DR for detection of lingual resorptions up to 1 mm. Resorptions less than 0.5 mm were not precisely detected by either method. DSR provided better intraexaminer and interexaminer agreement than did DR. Conclusions: Both methods are precise for detection of apical root resorptions as small as 0.5 mm and lingual resorptions of 1 mm or more. However, DSR frequently performed better than did DR. (Am J Orthod Dentofacial Orthop 2011;139:324-33)

On an acute case of Chagas disease in a region under vector control in the state of São Paulo, Brazil

Desde a década de 1970 não se notificavam casos autóctones de doença de Chagas aguda em São Paulo. em março de 2006 a Vigilância Epidemiológica registrou óbito por doença de Chagas aguda, em Itaporanga, de paciente de seis anos de idade. Exame histopatológico post mortem realizado no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu confirmou o diagnóstico. Consultamos prontuários de hospitais e entrevistamos profissionais de saúde envolvidos além de familiares do paciente. Descrevemos medidas adotadas in loco para identificar a via de transmissão, reservatórios e vetores. Discutimos as possíveis fontes de infecção. Na região não foram identificados outros casos humanos, vetores ou reservatórios vertebrados infectados por Trypanosoma cruzi. Salientamos a importância de manter a vigilância, mesmo em áreas onde a transmissão de doença de Chagas está interrompida e naquelas ainda infestadas por triatomíneos. Deve-se admitir a hipótese diagnóstica de doença de Chagas quando observados: edema palpebral (uni ou bilateral), insuficiência cardíaca, miocardite, pericardite, anasarca, quadros similares aos de síndrome nefrótica ou glomerulonefrite sem causas outras aparentes, em pacientes com dados epidemiológicos positivos. Encontro, mesmo em raras ocasiões, de triatomíneos na região ou ainda contato com alimento contaminável com formas infectantes de T. cruzi.

Insecticide selectivity to two species of Trichogramma in three different hosts, as determined by IOBC/WPRS methodology

BACKGROUND: The use of Trichogramma species is a potential key strategy in integrated pest management. However, its effectiveness depends on the use of chemicals that do not interfere with parasitism and parasite population growth. Here, a study was made of the effects of synthetic insecticides on Trichogramma pretiosum and Trichogramma exiguum in different hosts (Ephestia kuehniella, Plutella xylostella and Spodoptera frugiperda) and the influence of International Organisation for Biological Control (IOBC/WPRS) methodology in selectivity studies using different Trichogramma species. The insecticides used were commercial formulations (triflumuron at a concentration of 0.2 mL L-1 water, etofenprox at a concentration of 0.47 mL L-1 water and endosulfan at a concentration of 7.5 mL L-1 water); the control treatment consisted of distilled water. Eggs attached to cardboard cards were offered to parasitoids inside glass cages. Parasitised eggs, parasitism and adult emergence rates and parasitism reduction were evaluated.RESULTS: Endosulfan and etofenprox, classified as class-4 toxic products, were extremely toxic to the parasitoids. Triflumuron, classified as a non-toxic product, was selective to the parasitoids in eggs of all hosts.CONCLUSIONS: The methodology recommended by IOBC/WPRS influenced results regarding the use of different species of parasitoids, and the use of a single parasitoid species in their experiment is questionable. (C) 2011 Society of Chemical Industry

Biodegradable Nanoparticles Containing Benzopsoralens: An Attractive Strategy for Modifying Vascular Function in Pathological Skin Disorders

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Application of UTHSCSA-Image ToolTM to estimate concrete texture

The texture of concrete blocks is very important and is often the decisive factor when choosing a product, particularly if the building specifications does not dispense with the high resistance of the blocks, but has the purpose of reducing costs with finishing, therefore preferring exposed blocks with a closer texture. Furthermore, a closer texture, especially for exteriors,may be the vital factor of the building's pathology.However, there is so far no standard to quantify the texture of a structural block. This article proposes to apply the freely available UTHSCSA-Image ToolTM program developed by the University of Texas Health Science Center at San Antonio to evaluate the texture of masonry blocks. One aspect that should never be overlooked when studying masonry blocks is compressive strength. Therefore, this work also gets the compressive strength of the blocks with and without the addition of lime. The addition of small quantities of lime proved beneficial for both texture and compressive strength. However, increasing the amount of lime proved to be feasible only to improve texture. © 2012 Taylor & Francis Group.

Influência de fragmentos florestais nativos sobre os parâmetros químicos, físicos e microbiológicos de solos cultivados com cana-de-açúcar

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Um estudo da monitoria de licenciandos em um centro de ciências para a melhoria da formação inicial de professores de física

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)