Population genetic evidence that basidiospores play an important role in the disease cycle of rice-infecting populations of Rhizoctonia solani AG-1 IA in Iran

The fungus Rhizoctonia solani AG-1 IA causes sheath blight, one of the most important rice diseases worldwide. The first objective of this study was to analyse the genetic structure of R. solani AG-1 IA populations from three locations in the Iranian Caspian Sea rice agroecosystem. Three population samples of R. solani AG-1 IA isolates were obtained in 2006 from infected rice fields separated by 126-263km. Each field was sampled twice during the season: at the early booting stage and 45days later at the early mature grain stage. The genetic structure of these three populations was analysed using nine microsatellite loci. While the population genetic structure from Tonekabon and Amol indicated high gene flow, they were both differentiated from Rasht. The high gene flow between Tonekabon and Amol was probably due mainly to human-mediated movement of infested seeds. The second objective was to determine the importance of recombination. All three populations exhibited a mixed reproductive mode, including both sexual and asexual reproduction. No inbreeding was detected, suggesting that the pathogen is random mating. The third objective was to determine if genetic structure within a field changes over the course of a growing season. A decrease in the proportion of admixed genotypes from the early to the late season was detected. There was also a significant (P=0·002) increase in the proportion of loci under Hardy-Weinberg equilibrium. These two lines of evidence support the hypothesis that basidiospores can be a source of secondary inoculum. © 2012 BSPP.

Investigation of the genetic diversity of domestic Capra hircus breeds reared within an early goat domestication area in Iran

Background: Iran is an area of particular interest for investigating goat diversity. Archaeological remains indicate early goat domestication (about 10 000 years ago) in the Iranian Zagros Mountains as well as in the high Euphrates valley and southeastern Anatolia. In addition, mitochondrial DNA data of domestic goats and wild ancestors (C. aegagrusor bezoar) suggest a pre-domestication management of wild populations in southern Zagros and central Iranian Plateau. In this study genetic diversity was assessed in seven Iranian native goat breeds, namely Markhoz, Najdi, Taleshi, Khalkhali, Naini, native Abadeh and Turki-Ghashghaei. A total of 317 animals were characterized using 14 microsatellite loci. Two Pakistani goat populations, Pahari and Teddy, were genotyped for comparison.Results: Iranian goats possess a remarkable genetic diversity (average expected heterozygosity of 0.671 across loci, 10.7 alleles per locus) mainly accounted for by the within-breed component (G(ST) = 5.9%). Positive and highly significant F-IS values in the Naini, Turki-Ghashghaei, Abadeh and Markhoz breeds indicate some level of inbreeding in these populations. Multivariate analyses cluster Iranian goats into northern, central and western groups, with the western breeds relatively distinct from the others. Pakistani breeds show some relationship with Iranian populations, even if their position is not consistent across analyses. Gene flow was higher within regions (west, north, central) compared to between regions but particularly low between the western and the other two regions, probably due to the isolating topography of the Zagros mountain range. The Turki-Ghashghaei, Najdi and Abadeh breeds are reared in geographic areas where mtDNA provided evidence of early domestication. These breeds are highly variable, located on basal short branches in the neighbor-joining tree, close to the origin of the principal component analysis plot and, although highly admixed, they are quite distinct from those reared on the western side of the Zagros mountain range.Conclusions: These observations call for further investigation of the nuclear DNA diversity of these breeds within a much wider geographic context to confirm or re-discuss the current hypothesis (based on maternal lineage data) of an almost exclusive contribution of the eastern Anatolian bezoar to the domestic goat gene pool.

Predição do consumo de pasto de capim-elefante (Pennisetum purpureum, Schumack) por vacas mestiças Holandês x Zebu em lactação

Foram desenvolvidas equações de predição de consumo de pasto de capim-elefante (Pennisetum purpureum, Schumack) por vacas mestiças Holandês x Zebu em lactação, utilizando-se procedimentos de stepwise em regressões múltiplas, aplicados a um banco de dados de experimentos conduzidos ao longo de três anos na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) Gado de Leite (Coronel Pacheco, MG). As variáveis independentes disponíveis foram relacionadas a características inerentes às vacas (dias em lactação; teores de proteína, gordura e extrato seco total e produções destes componentes no leite; produção de leite in natura ou corrigida para 4% de gordura; ordem de lactação; peso vivo atual; peso vivo ao parto e grau de sangue Holandês x Zebu); ao manejo (dias de pastejo; disponibilidade de forragem e período de descanso da pastagem); ao ambiente (estação do ano e precipitação pluviométrica) e à alimentação (digestibilidade in vitro e parâmetros da composição química do pasto de capim-elefante e da cana-de-açúcar - Saccharum officinarum (L.) corrigida com 1% de uréia; consumos de suplemento volumoso (cana corrigida com uréia) e concentrado; concentrações fecais de proteína bruta e de fibras em detergente neutro e ácido). Efeitos linear e quadrático e transformações logarítmicas foram adicionalmente incluídos no banco de dados. Foram obtidas equações de predição de consumo de pasto de capim-elefante (expresso em kg/vaca/dia ou % do peso vivo) com coeficientes de determinação de 65,2 a 67,0%. As principais variáveis independentes incluídas nas equações foram o consumo do suplemento volumoso usado na estação seca do ano (cana corrigida com uréia); a digestibilidade in vitro do pasto de capim-elefante; a precipitação pluviométrica; a produção de leite corrigida para 4% de gordura; o peso vivo atual ou, em alternativa a este, o valor da pesagem realizada após o parto da vaca; além do consumo de suplemento concentrado, que evidenciou um efeito de substituição àquele do pasto de capim-elefante.

Desempenho de pontas de pulverização na deposição de gotas de pulverização na cultura do amendoim

The objective of this study was to evaluate the effect of nozzles on spray droplet deposition in the peanut crop cultivar 'Runner IAC 886'. The study was conducted in the field, and the applications of treatments performed in the vegetative stage (V1) and reproductive (R2). It was used the Brilliant Blue FDC - 1 as tracer in water solution, at 500 ppm. The treatments consisted of seven spray nozzle XR 110015 VS (150 L ha(-1)), XR 11002 VS (200 L ha(-1)), TX-VK 6 (150L ha(-1)), TX-VK 8 (200 L ha-1), AI 110015 VS (150 L ha(-1)), AI11002 VS (200 L ha(-1)) e TJ60 11002 VS (150 e 200 L ha(-1)). It was used a randomized blocks design, with four replications. After application, plants were immediately collected, and washed in 100 mL of distilled water for posterior tracer quantification in spectrophotometer. The data had been adjusted a regression curve for Gompertz model. The results had evidenced that at low volumes of application the nozzle AI 110015 VS and TJ60 11002 VS, were the ones with best distribution uniformity of spray on plants of peanut cultivar 'Runner IAC 886' in the vegetative stage (V1) and reproductive (R2) respectively, and the largest deposits and higher percentage of failures in applications have been found in younger plants by comparing the growth stages of application, regardless of the spray nozzle and volume.

Interferência do hipoclorito de sódio na absorção de macro e micronutrientes nas culturas da soja e do feijão

The objective of this work was to evaluate the effect of the sodium hypochlorite application in different levels in the fresh and dry biomass and in the uptake of macronutrients and micronutrients in plants of soybean and bean. The experiments were carried at the greenhouse of the "Departamento de Recursos Naturais/Ciência do Solo, FCA/UNESP, Botucatu/SP", in columns of rigid PVC with capacity to 1.0 liter of soil. The experimental design used in each experiment was entirely randomized, with 4 replications. The treatments in each experiment were constituted of 5 doses of sodium hypochlorite (0.0, 0.5, 1.0, 2.0 and 4.0 L ha(-1)). The following parameters were evaluated: fresh and dry biomass, macro and micronutrients contents in the plants leaves. The levels of sodium hypochlorite did not reflect significantly on the fresh and dry biomass of soybean and bean. The soybean dry biomass presented significant difference among the level of sodium hypochlorite. Average contents of macro and micronutrients obtained in bean leaves were not affected by the levels of sodium hypochlorite. The sulphur contents in soybean leaves presented significant difference. The sodium hypochlorite did not affect negatively the macro and micronutrients contents in leaves of soybean and bean.

Interação de doses de calcário e zinco nas características morfológicas e nos componentes de produção da mamoneira

O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência de doses de calcário e zinco e, a interação destes sobre o desenvolvimento da cultura da mamona. A hipótese deste trabalho é que o aumento de doses de calcário diminui a disponibilidade de zinco no solo para a planta. O experimento foi desenvolvido em estufa para cultivo protegido, sem controle de temperatura, em vasos com 17 dm³ de Latossolo Vermelho distrófico, textura média. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, com quatro repetições. Os tratamentos foram arranjados num esquema fatorial 3 x 5, sendo os fatores: três saturações por bases (40, 60 e 80%) e cinco doses adicionadas de Zn (0,5; 1,0; 2,0; 4,0 e 8,0 mg dm-3 de solo). Apenas uma planta por vaso foi conduzida até 174 dias após emergência (maturidade fisiológica do racemo primário), quando foi avaliada a produção. Maiores doses de calcário resultaram em maior número de grãos por planta e MS dos grãos por planta. Houve interação V% e Zn na altura da planta, massa seca da raiz, comprimento da parte masculina e total do racemo. No entanto, nenhum destes incrementos refletiu em diferença significativa na massa de 100 grãos da mamoneira.

Avaliação do polimorfismo no gene da metilenotetrahidrofolato redutase e concentração de folato e vitamina B12 em pacientes portadores do HIV-1 em tratamento com anti-retrovirais

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Presença do papilomavirus humano em lesões malignas de mucosa oral

O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência do papilomavírus humano 6/11 e 16/18 em pacientes, com lesões orais clínicamente diagnosticadas como leucoplasias, atendidas na Faculdade de Odontologia de Araraquara, UNESP, Brasil. Após a inclusão em parafina, os cortes corados com H&E, foram selecionadas 30 biópsias e separadas em 3 grupos: lesões sem displasia (n=10), lesões com diferentes graus de displasia (n=10) e carcinoma espinocelular invasivo(n=10). As lesões que apresentaram displasia epitelial foram classificadas de acordo com os critérios histopatológicos propostos por Van Der Waal. As lesões foram investigadas para a presença de HPV por hibridização in situ com sondas biotiniladas de amplo espectro, 6/11 e 16/18. HPV 16/18 foi detectado em 20% (n=2) das biópsias com displasia severa. A presença de HPV 16/18 em lesões malignas sugere sua importância como fator de risco na carcinogênese oral.

Search for heavy lepton partners of neutrinos in proton-proton collisions in the context of the type III seesaw mechanism

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Search for new physics with jets and missing transverse momentum in pp collisions at root s=7 TeV

A search for new physics is presented based on an event signature of at least three jets accompanied by large missing transverse momentum, using a data sample corresponding to an integrated luminosity of 36 pb(-1) collected in proton-proton collisions at root s = 7 TeV with the CMS detector at the LHC. No excess of events is observed above the expected standard model backgrounds, which are all estimated from the data. Exclusion limits are presented for the constrained minimal supersymmetric extension of the standard model. Cross section limits are also presented using simplified models with new particles decaying to an undetected particle and one or two jets.

Dependence on pseudorapidity and on centrality of charged hadron production in PbPb collisions at root s(NN)=2.76 TeV

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Locais de implante de microchips de identificação eletrônica de leitões: seleção e validação por análise de imagem

Nas últimas décadas, a produção de suínos, pressionada por uma crescente demanda por alimentos, tem-se caracterizado pela maior concentração de animais em grandes unidades de produção, dificultando o registro dos dados individuais. Os sistemas automáticos de identificação eletrônica podem auxiliar a detecção de doenças, a avaliação de respostas fisiológicas, o controle de ingestão de alimentos, a atividade física e ainda o impacto ambiental causado pelo sistema de produção, promovendo melhor controle da propriedade. Transponders injetáveis, brincos eletrônicos e o monitoramento por meio da análise de imagem estão sendo utilizados no processo de identificação. O objetivo desta pesquisa foi avaliar os diferentes locais de implante subcutâneo de microchips em leitões, verificando-se possíveis infecções e/ou rejeições, migrações dos microchips em relação ao local de implante e sua validação em relação à análise de imagem.

Efeito das condições ambientais no nível de ruído emitido por leitões

Objetivou-se, com este trabalho, avaliar a influência das variáveis ambientais nos níveis de ruídos emitidos por suínos e quantificar as faixas em dB comparativamente às condições de conforto térmico estabelecidas pela literatura. O experimento foi conduzido em câmara climática, onde foram alojados cinco leitões em fase de creche, submetidos à variação na temperatura ambiente de 20°C a 38°C e umidade relativa de 50% a 80%. Decibelímetros foram instalados para o registro dos níveis de ruídos e sensores dataloggers para os dados de temperatura e umidade relativa. O nível de atividade foi utilizado para quantificar a movimentação dos animais por intermédio de análise de imagens. Análises de correlação e regressão foram aplicadas nos dados para análise estatística. As variáveis ambientais influenciam na emissão de ruídos pelos leitões quando expostos a diferentes condições térmicas. Os níveis de ruídos foram estabelecidos em faixas de acordo com a condição térmica a que animais foram submetidos. Para a condição de conforto (20 a 23°C), níveis de ruídos na faixa de 70 a 75dB; condição de alerta (23 a 30°C), níveis de ruídos na faixa de 60 a 70dB e para condição de estresse térmico (acima de 30°C), na faixa de 55 a 60dB.

Anatomia e uso da madeira de duas variedades de Sclerolobium paniculatum Vog. do sul do Maranhão, Brasil

O presente estudo traz informações sobre a utilização da madeira de duas variedades de Sclerolobium paniculatum (var. subvelutinum e rubiginosum) em propriedades rurais do sul do Maranhão, a análise anatômica do lenho e a correlação destas características com o uso da madeira. Foram realizadas entrevistas com 17 agricultores residentes na zona rural dessa região, com a finalidade de se conhecer a utilização destas variedades nas propriedades rurais. As variedades subvelutinum Benth. e rubiginosum (Mart. ex Tul. ) Benth. são conhecidas na região como cachamorra-preta e cachamorra-branca, respectivamente, sendo a primeira mais utilizada na confecção de cercados. Para o estudo anatômico do lenho, foram coletados discos à altura do peito de três indivíduos de cada variedade e, destes, obtidas amostras do cerne, na região de transição com o alburno. As amostras foram processadas de acordo com a metodologia usual para anatomia de madeira. Houve diferença estatística significativa (p<0,05) para seis parâmetros anatômicos entre as duas variedades. A utilização diferencial das variedades pode ser decorrente, principalmente, das características das fibras e dos elementos de vasos. Sugere-se que sejam realizados estudos que abordem variações climáticas e características do solo para melhor entendimento das diferenças anatômicas quantitativas encontradas no lenho das variedades.

Electrophoretic and chromatographic profile for S-like hemoglobin

Hemoglobin variants originate mainly by simple amino acid substitutions, the result of nucleotide sequence changes. Recently, the number of known abnormal hemoglobins has increased due to improvement in analysis methodologies; however, many laboratories are not prepared to correctly identify mutants. Hb S is a very well-characterized hemoglobin variant that varies in prevalence in different regions of Brazil. However, there is a type of Hb that presents electrophoretic migration in alkaline pH similar to Hb S, named S-like Hb, which can be incorrectly diagnosed; therefore, its frequency is underestimated. We obtained reference ranges for Hb S by HPLC, and we examined the electrophoretic and chromatographic profiles of S-like Hb. Hb Hasharon, Hb D-Los Angeles, Hb Korle-Bu, Hb Lepore, Hb D-Iran, Hb G-like, Hb Queens, Hb Montgomery, and Hb Q-India were found. Cases of association between two beta chain mutants were also found. Electrophoresis in alkaline and acid pH was utilized to initially screen these Hb variants, and globin chain electrophoresis at both high and low pH was performed to identify the globin chain mutant. Chromatographic analysis permitted the identification of the hemoglobin variant and also facilitated the quantification of these variants. Therefore, an association of classical laboratory diagnostic methodologies is fundamental for the correct identification of suspect Hb variants. The S and S-like hemoglobin profiles determined in this study will help in the diagnosis of these variants in health care services.