179 resultados para generalised linear mixed model


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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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O rio Corumbataí é um dos principais tributários da margem direita do rio Piracicaba que é um tributário do rio Tietê. O rio Corumbataí integra a bacia do rio Paraná e é regionalmente importante não só por possuir águas de boa qualidade, mas também por possuir elementos raros na paisagem local. Este estudo visou caracterizar as assembléias de peixes do rio Corumbataí e fornecer dados que contribuam para uma avaliação da sua qualidade ambiental. Na bacia do rio Corumbataí, foram amostrados 4 rios principais, cada um com 3 pontos de coleta. Vinte e quatro amostras foram coletadas durante os meses de março a julho e de setembro a dezembro de 2001. Dados bióticos foram avaliados por medidas de diversidade. Um modelo linear ANCOVA foi utilizado para testar a hipótese de variação espaço-temporal nas assembléias de peixes, com a riqueza de espécies como variável resposta, ordem do rio como fator e temperatura e logaritmo natural do número de indivíduos como covariáveis. Esta análise mostrou uma variação espaço-temporal que é corroborada por conceitos exaustivamente discutidos na literatura, tais como relação espécie-área e o conceito de rio contínuo. Dados provenientes do rio Ribeirão Claro mostraram um padrão diferente quando comparados com os outros rios. Esta diferença foi provavelmente devido à interferência humana e atesta o processo de fragmentação de hábitats aquáticos que podem ter levado a um isolamento das populações locais de peixes.

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Foram alocados aleatoriamente vinte trabalhadores expostos ocupacionalmente ao chumbo em uma indústria de acumuladores elétricos de médio porte, no interior do Estado de São Paulo, os quais apresentavam plumbemia e excreção urinária do ácido delta-aminolevulínico, nos últimos dois anos, sempre menores que 60 µg/dL e 10 mg/L, respectivamente. Os trabalhadores foram submetidos a eletroneurografia do nervo radial direito e a dosagem de plumbemia. Com estas medidas ajustou-se um modelo de regressão linear simples de primeira ordem, tendo como variável dependente a velocidade de condução e como variável independente a plumbemia. Analisando-se a regressão ajustada, infere-se que o valor preditivo negativo do limite de tolerância biológica brasileiro aplicado à plumbemia seja de apenas 0,63. O estudo sugere que o valor do referido limite de tolerância deva ser reduzido do atual valor de 60 µg/dL para 32 µg/dL, para ter um valor preditivo negativo de 0,99.

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A pressão arterial diastólica foi analisada enquanto indicador genérico de envelhecimento, e sua associação com o tempo de serviço foi estudada após o controle da idade como possível fator de confundimento. O estudo foi realizado entre operários de um curtume brasileiro em julho de 1993. Foi testada a associação entre pressão diastólica e tempo de serviço, ajustando um modelo de regressão linear de segunda ordem, em que a pressão diastólica era função da idade e do tempo de serviço do operário. Ao ajustar o modelo, pode-se prever que, no início do trabalho no curtume, em média, cada período de um ano está associado com um aumento de cerca de 1,5 mmHg na pressão diastólica. O ajuste obtido realça um componente diretamente associado ao trabalho como parte do coeficiente de aumento da pressão no grupo estudado. Esse componente é o dobro daquele diretamente associado com a idade.

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O estudo verificou a associação entre perda auditiva induzida por ruído (PAIR) e queixa de zumbido em trabalhadores expostos ao ruído ocupacional. Foram entrevistados e avaliados trabalhadores com histórico de exposição ao ruído ocupacional atendidos em dois ambulatórios de audiologia. Estudou-se a existência de associação entre PAIR e ocorrência de zumbido por intermédio do ajuste de modelo de regressão logística, tendo como variável dependente o zumbido e como variável independente a PAIR, classificada em seis graus, controlada pelas co-variáveis idade e tempo de exposição ao ruído. Os dados foram coletados entre abril e outubro de 2003, na Cidade de Bauru, Estado de São Paulo, Brasil, contemplando 284 trabalhadores. Estimou-se que a prevalência de zumbido aumenta de acordo com a evolução do dano auditivo, controlado para a idade e tempo de exposição ao ruído. Os achados justificam o investimento em programas de conservação auditiva particularmente voltados para o controle da emissão de ruídos na fonte e para a intervenção na evolução das perdas auditivas geradas pela exposição ao ruído visando à manutenção da saúde auditiva e à diminuição dos sintomas associados.

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A análise da interação genótipo x ambiente utilizda no melhoramento de plantas tem sofrido mudanças na última década, melhorando a sua eficiência quanto à seleção dos genótipos sob diferentes condições ambientais. O objetivo deste trabalho foi analisar a produtividade e estabilidade de 12 genótipos de arroz em oito ambientes, durante os anos 2005 e 2006, na Colômbia. O delineamento utilizado foi o de blocos ao acaso com quatro repetições. Os parâmetros de estabilidade fenotípica e o agrupamento dos ambientes foram estimados pelo estudo da interação genótipo x ambiente, segundo o método SREG (Regressão nos sítios ou locais) e seu gráfico biplot (GGE). As análises estatísticas indicaram diferenças significativas (com 5% de probabilidade de erro) entre genótipos e entre ambientes e significância (com 5% de probabilidade de erro) da interação genótipo x ambiente, sugerindo uma resposta diferente dos genótipos nos vários ambientes. No método SREG, os dois primeiros componentes principais da interação explicaram 75,29% da interação. Os genótipos 400094, 350361 e a variedade Fedearroz 50 foram considerados os de maior produtividade. Segundo o gráfico biplot GGE, os ambientes La Libertad e Escobal foram os mais favoráveis para o cultivo do arroz.

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O objetivo do trabalho foi avaliar diferentes doses de efluente de abatedouro avícola para proporcionar melhorias nas características produtivas, morfogênicas e estruturais do capim-piatã. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, adotando-se delineamento inteiramente casualizado, em que foram testadas cinco doses de efluentes: 324, 648, 972, 1.296 e 1620m³ ha-1 ou equivalente a 50, 100, 150, 200 e 250kg ha-1 de N. As variáveis mensuradas foram: produção de matéria seca (MS), taxa de aparecimento de folha (TApF), taxa de alongamento de folha (TAlF), filocrono, taxa de alongamento de pseudocolmo (TAlC), comprimento final de folha (CFF) e números de folhas verdes (NFV). A produção de MS seguiu um modelo linear de predição em função das doses efluente avícola, em que o tratamento com 250kg ha-1 de N foi 55% maior, quando comparado com o tratamento de 50kg ha-1 de N. Todas as características morfogênicas e estruturais avaliadas com exceção do filocrono apresentaram comportamento linear positivo. Dessa forma, o efluente de abatedouro avícola pode ser utilizado como uma alternativa para adubação do capim-piatã, pois este respondeu de maneira crescente até a dose máxima testada.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Estudaram-se o comportamento da curva de lactação em 31 cabras mestiças Saanen e o efeito de duas estratégias de suplementação de concentrado: 30% das exigências em energia líquida da 3ª semana até o final da lactação (ESC.1); 60% das exigências em energia líquida diária da 3ª à 13ª semana, e 15% da 14ª semana até o final da lactação (ESC.2), em sistemas de produção semi-confinamento e pastagem. Os seguintes modelos foram avaliados: Wood linear e não-linear, Morant linear e não-linear, D-set e Grossman. O modelo Wood não linear foi o que melhor descreveu o comportamento da curva de lactação. A resposta da estratégia de suplementação com concentrado variou em função do sistema de produção. A estratégia de suplementação com concentrado afetou mais intensamente o comportamento da curva de lactação no sistema de produção semi-confinamento. A estratégia ESC.2, de suplementação com concentrado, resultou em mais dias para atingir o pico de produção, no sistema semi-confinamento, e maior produção no pico em ambos sistemas.

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O objetivo deste trabalho foi apresentar a reparametrização de um modelo de desvios das médias dos grupos contemporâneos até um modelo animal não-restrito (equações dos modelos mistos de Lush - EMML). Aplicando restrições sobre as EMML, foi obtido o modelo animal segundo Henderson (equações dos modelos mistos de Henderson - EMMH). Para obter as EMMH, restrições do tipo X'A-1λ aH = 0 foram impostas e estas geraram a necessidade de pressuposições fortes, como ausência de seleção, para que as propriedades das EMMH pudessem ser provadas. Para diferentes situações examinadas, as restrições foram confirmadas. O somatório destas restrições pode ser erroneamente interpretado como propriedade das soluções de um modelo animal de que os animais-base tenham a soma dos seus valores genéticos igual a zero.

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This study aimed to: a) to compare the covariance components obtained by Restricted Maximum Likelihood (REML) and by bayesian inference (BI): b) to run genetic evaluations for weights of Canchim cattle measured at weaning (W240) and at eighteen months of age (W550), adjusted or not to 240 and 550 days of age, respectively, using the mixed model methodology with covariance components obtained by REML or by BI; and c) to compare selection decisions from genetic evaluations using observed or adjusted weights and by REML or BI. Covariance components, heritabilities and genetic correlation for W240 and W550 were estimated and the predicted breeding values were used to select 10% and 50% of the best bulls and cows, respectively. The covariance components obtained by REML were smaller than the a posteriori means obtained by Bl. Selected animals from both procedures were not the same, probably because the covariance components and genetic parameters were different. The inclusion of age of animal at weighing as a covariate in the statistical model fitted by BI did not change the selected bulls and cows.

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When an area to be irrigated has a high slope gradient in the manifold line direction, an option is to use a tapered pipeline to economize on pipe costs and to keep pressure head variations within desired limits. The objective of this paper is to develop a linear optimization model to design a microirrigation system with tapered, downhill manifold lines, minimizing the equivalent annual cost of the hydraulic network and the annual pumping cost, and maximizing the emission uniformity previously established to the subunit. The input data are irrigation system layout, cost of all hydraulic network components, and electricity price. The output data are equivalent annual cost, pipeline diameter in each line of the system, pressure head in each node, and total operating pressure head. To illustrate its capability, the model is applied in a citrus orchard in Sao, Paulo State, Brazil, considering slopes of 3, 6, and 9%. The model proved to be efficient in the design of the irrigation system in terms of the emission uniformity desired.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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The objective of this study was to investigate the influence of different levels of biofertilizers from cattle and swine manure on the structural, morphogenetic and productive characteristics of Brachiaria brizantha cv. Piata. The experiment was arranged in a completely randomized factorial design with split plots. The plots were defined by eight treatments: two biofertilizers (cattle and swine), four levels (0, 100, 200 and 300 kg N.ha(-1)) and subplots by four different cutting periods. The cutting for plant uniformity was performed at 45 days after sowing at 15 cm above the soil surface. The biofertilizeres were applied in a single level, after the cutting of plants, in rates of 0, 0.23 and 0.19, 0.45 and 0.38, 0.68 and 0.57 liters pot(-1) for the biofertilizers from cattle and swine manure, respectively. These rates were also equivalent to levels of 0, 100, 200 and 300 kg N.ha(-1). There was no significant difference between the types of biofertilizers as there was no interaction between them and the different levels, hence both biofertilizers could be applied without any loss of nutrient intake by the plants used in this experiment. There was a significant difference between the production of green and dry matter, the leaf appearance rate, phyllochron, leaf and pseudostem elongation rates, number of green leaves, final leaf length, number and weight of tillers, according to the increase of nitrogen rates, following linear prediction model. Effect of the cutting periods was also observed, once the plants harvested during the summer presented greater performance of structural and morphogenetic characteristics.

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Scrotal circumference data from 47,605 Nellore young bulls, measured at around 18 mo of age (SC18), were analyzed simultaneously with 27,924 heifer pregnancy (HP) and 80,831 stayability (STAY) records to estimate their additive genetic relationships. Additionally, the possibility that economically relevant traits measured directly in females could replace SC18 as a selection criterion was verified. Heifer pregnancy was defined as the observation that a heifer conceived and remained pregnant, which was assessed by rectal palpation at 60 d. Females were exposed to sires for the first time at about 14 mo of age (between 11 and 16 mo). Stayability was defined as whether or not a cow calved every year up to 5 yr of age, when the opportunity to breed was provided. A Bayesian linear-threshold-threshold analysis via Gibbs sampler was used to estimate the variance and covariance components of the multitrait model. Heritability estimates were 0.42 +/- 0.01, 0.53 +/- 0.03, and 0.10 +/- 0.01, for SC18, HP, and STAY, respectively. The genetic correlation estimates were 0.29 +/- 0.05, 0.19 +/- 0.05, and 0.64 +/- 0.07 between SC18 and HP, SC18 and STAY, and HP and STAY, respectively. The residual correlation estimate between HP and STAY was -0.08 +/- 0.03. The heritability values indicate the existence of considerable genetic variance for SC18 and HP traits. However, genetic correlations between SC18 and the female reproductive traits analyzed in the present study can only be considered moderate. The small residual correlation between HP and STAY suggests that environmental effects common to both traits are not major. The large heritability estimate for HP and the high genetic correlation between HP and STAY obtained in the present study confirm that EPD for HP can be used to select bulls for the production of precocious, fertile, and long-lived daughters. Moreover, SC18 could be incorporated in multitrait analysis to improve the prediction accuracy for HP genetic merit of young bulls.