An Integrative Genomic and Transcriptomic Analysis Reveals Potential Targets Associated with Cell Proliferation in Uterine Leiomyomas

Background: Uterine Leiomyomas (ULs) are the most common benign tumours affecting women of reproductive age. ULs represent a major problem in public health, as they are the main indication for hysterectomy. Approximately 40-50% of ULs have non-random cytogenetic abnormalities, and half of ULs may have copy number alterations (CNAs). Gene expression microarrays studies have demonstrated that cell proliferation genes act in response to growth factors and steroids. However, only a few genes mapping to CNAs regions were found to be associated with ULs. Methodology: We applied an integrative analysis using genomic and transcriptomic data to identify the pathways and molecular markers associated with ULs. Fifty-one fresh frozen specimens were evaluated by array CGH (JISTIC) and gene expression microarrays (SAM). The CONEXIC algorithm was applied to integrate the data. Principal Findings: The integrated analysis identified the top 30 significant genes (P<0.01), which comprised genes associated with cancer, whereas the protein-protein interaction analysis indicated a strong association between FANCA and BRCA1. Functional in silico analysis revealed target molecules for drugs involved in cell proliferation, including FGFR1 and IGFBP5. Transcriptional and protein analyses showed that FGFR1 (P = 0.006 and P<0.01, respectively) and IGFBP5 (P = 0.0002 and P = 0.006, respectively) were up-regulated in the tumours when compared with the adjacent normal myometrium. Conclusions: The integrative genomic and transcriptomic approach indicated that FGFR1 and IGFBP5 amplification, as well as the consequent up-regulation of the protein products, plays an important role in the aetiology of ULs and thus provides data for potential drug therapies development to target genes associated with cellular proliferation in ULs. © 2013 Cirilo et al.

Multiobjective short-term planning of electric power distribution systems using NSGA-II

This paper presents a mixed integer nonlinear programming multiobjective model for short-term planning of distribution networks that considers in an integrated manner the following planning activities: allocation of capacitor banks; voltage regulators; the cable replacement of branches and feeders. The objective functions considered in the proposed model are: to minimize operational and investment costs and minimize the voltage deviations in the the network buses, subject to a set of technical and operational constraints. A multiobjective genetic algorithm based on a Non-Dominated Sorting Genetic Algorithm (NSGA-II) is proposed to solve this model. The proposed mathematical model and solution methodology is validated testing a medium voltage distribution system with 135 buses. © 2013 Brazilian Society for Automatics - SBA.

Modelo de programação matemática para controle do crescimento da vegetação sob redes de distribuição de energia elétrica

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Alocação otimizada de bancos de capacitores em sistemas de distribuição de energia elétrica através de metaheurísticas multiobjetivo

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Metaheurística particle swarm utilizada para alocação ótima de bancos de capacitores em sistemas de distribuição radial

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Planejamento da expansão de sistemas de transmissão considerando a retirada de linhas de transmissão

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Times assíncronos inicializadores para o planejamento da expansão da transmissão de energia elétrica baseados no modelo híbrido linear

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Otimização do problema de carregamento de container usando uma metaheurística eficiente

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Alocação otimizada de dispositivos de proteção em sistema de distribuição de energia elétrica

Pós-graduação em Engenharia Elétrica - FEIS

Algoritmo genético na otimização do custo de colheita e transporte da cana-de-açúcar

Pós-graduação em Biometria - IBB

Planejamento econômico de gráficos de controle X para monitoramento de processos autocorrelacionados

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Metodologia para análise e interpretação de alarmes em tempo real de sistemas de distribuição de energia elétrica

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Análise dos zeros da FTMA e ajuste de parâmetros de controladores suplementares de amortecimento acoplado ao dispositivo FACTS UPFC

Pós-graduação em Engenharia Elétrica - FEIS

Planejamento de médio e longo prazo de sistemas de distribuição de energia elétrica com geradores distribuídos (GDs) considerando custos de confiabilidade, operação e expansão

Pós-graduação em Engenharia Elétrica - FEIS

Otimização multiobjetivo no controle da dengue

Pós-graduação em Biometria - IBB