Influence of different levels of aluminum on the development of citrus rootstock swingle citrumelo (Citrus paradisi mcf. x Poncirus trifoliata raf.) in nutrient solution

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Metodologia para germinação de sementes de Leonurus sibiricus L

O objetivo do trabalho foi investigar a influência de diferentes temperaturas, o comportamento fotoblástico e a absorção de água de sementes de Leonurus sibiricus L. Essa espécie medicinal é originária da Índia, distribuída pela Ásia, África e América, utilizada no tratamento de reumatismo, problemas dermatológicos e respiratórios. Para tanto, as sementes foram submetidas a temperaturas entre 5 a 40ºC, com intervalos de 5ºC, e alternadas de 20/30, 20/25 e 25/30ºC, com 5 repetições de 50 sementes cada, em condições de luz e escuro. No estudo da absorção de água as sementes foram colocadas para germinar na temperatura de 20ºC e na presença da luz e pesadas para avaliar o ganho de água durante todo o processo germinativo, até a protrusão da radícula. Pelos resultados verificou-se que os maiores porcentuais de germinação e índice de velocidade de germinação ocorreram na temperatura constante de 20ºC, e nas temperaturas alternadas 20/25, 25/30, 25/30ºC sob luz. Houve germinação na temperatura mínima de 10ºC e na máxima 40ºC. No ensaio de absorção de água verificou-se que as sementes iniciam a protrusão da radícula com 65 horas de exposição e seguem padrão trifásico na curva de absorção. O modelo estatístico ajustado para a espécie foi y = 1,869 (1 - 0,414 exp ( -0,201t) + exp [-2,397 + 0,037 (t - 65)], com R²= 0,9998.

Determinação da demanda química de oxigênio em águas por espectrofotometria simultânea dos íons crômio(III) e dicromato

Propõe-se metodologia analítica para a determinação da demanda química de oxigênio(DQO) em águas e efluentes pouco poluídos, pela espectrofotometria simultânea dos íons crômio(III) e dicromato, após a clássica oxidação sulfocrômica das amostras, à quente e catalisada por íons Ag+. Demonstra-se que a inter-relação entre as concentrações de DQO, de crômio(III) formado e de dicromato residual permite simplificar a resolução numérica do sistema - de multicomponente, envolvendo as concentrações desses dois íons, e medidas de absorbância em pelo menos dois comprimentos de onda para monocomponente, envolvendo diretamente a concentração em DQO, e medida de absorbância num único comprimento de onda.

New primers for the amplification and sequencing of nuclear loci in a taxonomically wide set of reptiles and amphibians

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Molecular models of NS3 protease variants of the Hepatitis C virus

Background: Hepatitis C virus (HCV) currently infects approximately three percent of the world population. In view of the lack of vaccines against HCV, there is an urgent need for an efficient treatment of the disease by an effective antiviral drug. Rational drug design has not been the primary way for discovering major therapeutics. Nevertheless, there are reports of success in the development of inhibitor using a structure-based approach. One of the possible targets for drug development against HCV is the NS3 protease variants. Based on the three-dimensional structure of these variants we expect to identify new NS3 protease inhibitors. In order to speed up the modeling process all NS3 protease variant models were generated in a Beowulf cluster. The potential of the structural bioinformatics for development of new antiviral drugs is discussed.Results: the atomic coordinates of crystallographic structure 1CU1 and 1DY9 were used as starting model for modeling of the NS3 protease variant structures. The NS3 protease variant structures are composed of six subdomains, which occur in sequence along the polypeptide chain. The protease domain exhibits the dual beta-barrel fold that is common among members of the chymotrypsin serine protease family. The helicase domain contains two structurally related beta-alpha-beta subdomains and a third subdomain of seven helices and three short beta strands. The latter domain is usually referred to as the helicase alpha-helical subdomain. The rmsd value of bond lengths and bond angles, the average G-factor and Verify 3D values are presented for NS3 protease variant structures.Conclusions: This project increases the certainty that homology modeling is an useful tool in structural biology and that it can be very valuable in annotating genome sequence information and contributing to structural and functional genomics from virus. The structural models will be used to guide future efforts in the structure-based drug design of a new generation of NS3 protease variants inhibitors. All models in the database are publicly accessible via our interactive website, providing us with large amount of structural models for use in protein-ligand docking analysis.

Quasispecies of hepatitis C virus genotype 1 and treatment outcome with Peginterferon and Ribavirin

The majority of patients with chronic hepatitis C fail to respond to antiviral therapy. The genetic basis of this resistance is unknown. The quasispecies nature of HCV may have an important implication concerning viral persistence and response to therapy. The HCV nonstructural 5A (NS5A) protein has been controversially implicated in the inherent resistance of HCV to interferon (IFN) antiviral therapy. To evaluate whether the NS5A quasispecies pre-treatment composition of HCV 1a/1b is related to responsiveness to combined pegylated interferon (PEG-IFN) and Ribavirin therapy, detailed analyses of the complete NS5A were performed. Fifteen full-length NS5A clones were sequenced from 11 pretreatment samples of patients infected with genotype 1 HCV (3 virological sustained responders, 4 non-responders, and 4 end-of-treatment responders). Our study could not show a significant correlation between the mean number of mutations in HCV NS5A before treatment and treatment outcome, and the phylogenetic construction of complete NS5A sequences obtained from all patients failed to show any clustering associated with a specific response pattern. No single amino acid position was associated with different responses to therapy in any of the NS5A regions analyzed, and mutations were clustered downstream the ISDR, primarily in the V3 region. We observed that the CRS and NLS regions of the NS5A protein were conflicting for some variables analyzed, although no significant differences were found. If these two regions can have antagonistic functions, it seems viable that they present different mutation profiles when compared with treatment response. The patient sample that presented the lowest genetic distance values also presented the smallest number of variants, and the most heterogeneous pattern was seen in the end-of-treatment patients. These results suggest that a detailed molecular analysis of the NS5A region on a larger sample size may be necessary for understanding its role in the therapy outcome of HCV 1a/1b infection. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.

Genetic diversity of NS5A protein from hepatitis C virus genotype 3a and its relationship to therapy response

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

A Weak Maximum Principle for Optimal Control Problems with Nonsmooth Mixed Constraints

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estudo espectro eletroquímico de sistemas estruturados argila-corante

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Studies on stem cuttings of kiwi (Actinidia chinensis PL. CV Bruno)

O presente trabalho teve como objetivo, estudar o efeito de auxinas sintéticas e do boro, sobre o enraizamento de estacas caulinares de kiwi (Actinidia chinensisPlanch. cv Bruno). As estacas continham dois nós com aproximadamente 10 cm de comprimento, contendo 2 folhas cortadas ao meio. As bases das estacas receberam os seguintes tratamentos: control (H2O); NAA 300 mg.L-1; IBA 300 mg.L-1; NAA 300 mg.L-1 + B; IBA 300 mg.L-1 + B; NAA 0,5%-pó e IBA 0,5%-pó. Após os tratamentos as estacas foram plantadas em bandejas de enraizamento contendo vermiculita pura e colocadas em câmara de nebulização por 120 dias até a coleta das mesmas. Para a avaliação do efeito das auxinas e boro, foram realizadas as seguintes observações: 1. porcentagem de estacas enraizadas; 2. análise de açúcares redutores e açúcares totais (em g/100 g de matéria seca); 3. análise de triptofano (em µg/100 mg de matéria seca). Além disso, foram verificados o efeito dos tratamentos em quatro épocas, que corresponderam às estações do ano (primavera, verão, outono e inverno). Através dos resultados obtidos no processo de enraizamento de estacas caulinares de kiwi (Actinidia chinensis Planch. cv Bruno), conclui-se ser o verão a melhor época de coleta dos ramos para a produção das estacas sem a necessidade do tratamento com auxinas.

Effect of plant growth regulators in the rooting of Pinus cuttings

O trabalho avaliou o enraizamento de estacas de Pinus caribaea var. hondurensis Morelet sob a ação de diferentes níveis de reguladores vegetais. As estacas foram feitas de brotações de 4 a 6cm de comprimento de mudas de P. caribaea var. hondurensis Morelet com corte bisel na base sendo as acículas basais eliminadas. A base das estacas foram submetidas aos tratamentos por 2 segundos com os seguintes tratamentos: 1- NAA 2000mg L-1; 2- NAA 4000mg L-1; 3- NAA 6000mg L-1; 4- NAA 2000mg L-1 + PBZ 100mg L-1; 5- NAA 4000mg L-1 + PBZ; 6- NAA 6000mg L-1 + PBZ; 7- IBA 2000mg L-1; 8- IBA 4000mg L-1; 9- IBA 6000mg L-1; 10-IBA 2000mg L-1 + PBZ; 11- IBA 4000mg L-1 + PBZ; 12- IBA 6000mg L-1 + PBZ e testemunha. Após os tratamentos as estacas foram plantadas em tubetes contendo 50% de palha de arroz carbonizada e 50% de vermiculita. As avaliações realizadas aos 60 dias após o plantio mostraram que estacas de P. caribaea tratadas com IBA levaram a maior porcentagem de estacas enraizadas que aquelas tratadas com NAA, sendo o mais efetivo, IBA a 4000mg L-1 em conjunto com 100mg L-1 de paclobutrazol.

Síntese do anodo cerâmico La1-xSr xCr0,5Mn0,5O3 pela técnica dos precursores poliméricos

Compostos da família La1-xSr xCr0,5Mn0,5O3 são apontados como potenciais anodos cerâmicos de células a combustível de óxidos sólidos. A utilização de anodos cerâmicos tem como objetivo eliminar os problemas de depósito de carbono na superfície do níquel e a baixa resistência a ciclos de redução/oxidação observados no compósito cerâmica-metal à base de zircônia estabilizada e níquel, que é o material anódico mais usado nestas células. Neste estudo são apresentados os resultados da síntese pela técnica dos precursores poliméricos e da caracterização de compostos com x = 0,5, estequiométrico e com 5% de deficiência catiônica no sítio A da estrutura perovskita La1-xSr xCr0,5Mn0,5O3 e (La1-xSr x)0,95Cr0,5Mn0,5O3, respectivamente. Os resultados evidenciam que o composto estudado possui altos valores de condutividade elétrica e baixa reatividade com eletrólitos à base de zircônia.

Microdureza de resinas em função da cor e luz halógena

O objetivo desse trabalho foi avaliar a influência da intensidade da luz e cor de uma resina composta no grau de dureza Knoop. Corpos-de-prova foram confeccionados utilizando-se matrizes de poliéster envoltas por um anel de cobre, contendo uma cavidade padronizada de 6 mm de diâmetro por 2 mm de espessura. Estas cavidades foram preenchidas com resina composta selecionada, Fill Magic - Vigodent, com as cores A3, B3, C3, D3 e I, fotopolimerizadas através de um fotopolimerizador Elipar, calibrado para produzir 3 intensidades de luz diferentes: 450 mW/cm², 800 mW/cm² e uma intensidade de luz crescente de 100 a 800 mW/cm². Foram confeccionados 90 corpos-de-prova em que o tempo de exposição da resina à luz halógena foi de 40 s. As amostras foram armazenadas em tubos de ensaio com água destilada a 37 ± 1ºC. Após este período, foram realizados os testes de dureza Knoop na região de superfície e fundo. Os resultados mostraram que houve diferença estatística em relação a intensidade de luz, entretanto em relação a cor, não houve diferença estatística. Os autores concluíram que a cor do compósito não influencia a dureza Knoop e que a intensidade progressiva promoveu os melhores resultados de dureza Knoop.