Metagenomic assembly and draft genome sequence of an Uncharacterized prevotella sp. from Nelore rumen

Prevotella is one of the most abundant genera in bovine rumen, although no genome has yet been assembled by a metagenomics approach applied to Brazilian Nelore. We report the draft genome sequence of Prevotella sp., comprising 2,971,040 bp, obtained using the Illumina sequencing platform. This genome includes 127 contigs and presents a low 48% GC.

Determination of potassium and sodium in an ash sample by gamma-ray spectroscopy

Neutron activation analysis and gamma-ray spectroscopy were used to determine the quantity of potassium and sodium in an ash sample of Tabebuia sp bombarded with thermal neutrons. These techniques, widely applied in nuclear physics, can be used in the context of wood science as an alternative for the usual physical chemistry methods applied in this area. The quantity of K and Na in an 8.60 +/- 0.10 mg of ash was determined as being 1.3 +/- 0.3 mg and 11.0 +/- 1.8 mu g, respectively. The ratio of Tabebuia sp converted into ash was also determined as 0.758 +/- 0.004%.

Antimicrobial resistance and species composition of Enterococcus spp. isolated from waters and sands of marine recreational beaches in Southeastern Brazil

Density, species composition and antimicrobial resistance in bacteria of the Enterococcus genus were evaluated in seawater and sands from 2 marine recreational beaches with different levels of pollution. The 2 beaches showed predominance of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium, in the water and the sand. Dry sand presented higher densities of Enterococcus sp. and higher frequency of resistant strains than wet sand and seawater. The beach with a higher degree of pollution presented higher percentages of resistant strains (66.7% and 61.5%, in sand and in water, respectively) and resistance to a larger number of antimicrobials compared with the less polluted beach, Ilha Porchat (35.7% and 31.25% of resistant strains in sand and water, respectively). in water samples, the highest frequencies of resistance were obtained against streptomycin (38.5%) and erythromycin (25%), whilst in sand, the highest frequencies were observed in relation to erythromycin and tetracycline (38.1% and 14.3%, respectively). These results show that water and sands from beaches with high indexes of faecal contamination of human origin may be potential sources of contamination by pathogens and contribute to the dissemination of bacterial resistance. (C) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Protozoan parasites of Xiphophorus spp. (Poeciliidae) and their relation with water characteristics

Investigou-se a relação entre as características da água e a infestação de protozoários parasitos, Icthyophthirius multifiliis e Trichodina sp., em peixe espada, Xiphophorus helleri e em plati, Xiphophorus maculatus, coletados em uma piscicultura de peixes ornamentais no Estado de São Paulo, Brasil. Os peixes foram coletados mensalmente, durante um ano, dos viveiros e das caixas de estocagem. A prevalência da infestação nos peixes das caixas e dos viveiros foram, respectivamente, 34,2% e 22,5% para I. multifiliis e 13% e 54% para Trichodina sp. A elevada condutividade elétrica e o pH da água reduziram a infestação por I. multifiliis. A baixa concentração de oxigênio resultou em aumento na infestação por Trichodina sp. O uso do sal, para aumentar a condutividade elétrica da água, consistiu em um método de controle de I. multifiliis. A redução do oxigênio dissolvido e a adição de fertilizante orgânico favoreceram a reprodução de Trichodina sp.

Occurrence of Cryptosporidium (Apicomplexa, Cryptosporidiidae) in Crotalus durissus terrificus (Serpentes, Viperidae) in Brazil

The objective of the present study was to investigate the prevalence of Cryptosporidium (Apicomplexa, Cryptosporidiidae) in the snake Crotalus durissus terrificus (Serpentes, Viperidae). Fifty animals were evaluated for the presence of oocysts of Cryptosporidium sp. at the time of arrival and 30 and 60 days later. Intestinal washings with saline solution (1% body weight), fecal samples, and organ scrapings were collected during the study. Oocysts were concentrated by an ether-phosphate-buffered saline sedimentation technique and then separated by a density gradient centrifugation technique. Smears were made with the sediment and submitted to modified acid-fast and auramine-rhodamine staining. Cryptosporidium-positive smears were used as controls for the experimental findings. The overall prevalence of Cryptosporidium sp. oocysts was 14%. Among the positive snakes, oocysts were detected only in the intestinal washing in two specimens, only in the feces in four specimens, and in both materials at least once in one specimen. The positive snakes were predominantly from Santa Maria da Serra city State of São Paulo (57.1%). We also observed that all of the examinations that presented positive results were obtained at least 27 days after the capture of the animals.

Geostatistical characterization of the spatial distribution of Xylella fastidiosa sharpshooter vectors on citrus

A distribuição espacial das espécies de cigarrinhas (Dilobopterus costalimai Young, Acrogonia sp. e Oncometopia facialis Signoret), vetoras da Xylella fastidiosa, agente causal da Clorose Variegada dos Citros, foi estudada com o uso da geoestatística. As avaliações foram feitas em um pomar comercial de laranja 'Pêra' (Citrus sinensis [L.] Osb.), objetivando estabelecer meios para melhor controle dos vetores e da doença. O monitoramento da ocorrência das cigarrinhas no pomar foi feito através de amostragens mensais, utilizando-se armadilhas adesivas amarelas de 3 x 5, distribuídas uniformemente em 50 pontos na área, dispostas em laranjeiras à altura de 1,5 m do solo e substituídas mensalmente. Acrogonia sp. foi a espécie prevalente nas amostragens. Os resultados possibilitaram ajustar modelos aos semivariogramas da distribuição espacial das três espécies no pomar estudado. Durante os três anos consecutivos de amostragem, as populações de Acrogonia sp., D. costalimai e O. facialis apresentaram modelos de distribuição agregada somente nos meses de verão, inverno e primavera, respectivamente, mostrando a necessidade de monitoramento constante desses vetores para reduzir a sua população em épocas favoráveis ao seu desenvolvimento. Através de parâmetros geoestatísticos foi possível calcular a área de agregação das cigarrinhas no pomar. A espécie Acrogonia sp. apresentou área média de agregação de 15.760 m², enquanto para O. facialis e D. costalimai foi possível constatar áreas médias de agregação de 11.555 m² e 10.980 m², respectivamente. Esses resultados indicaram que para um levantamento seguro de cigarrinhas é necessário pelo menos dispor de uma armadilha por hectare.

Eficiência de nematoides entomopatogênicos e inseticidas químicos contra Sphenophorus levis e Leucothyreus sp. em cana-de-açúcar

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Enterotoxigenicidade de cepas de Aeromonas sp. isoladas em diferentes pontos do fluxograma de abate bovino

Com o objetivo de verificar a capacidade enterotoxigênica de cepas de Aeromonas sp. isoladas em diferentes produtos e locais no fluxograma de abate bovino, foram testadas 102 cepas (18 da espécie A. hydrophila, 65 da espécie A. caviae e 19 atípicas) ante os testes de inoculação intragástrica em camundongo lactente e em alça intestinal ligada de coelho. Revelaram-se como produtoras de enterotoxinas três (16,7%) cepas da espécie A. hydrophila, originárias das mãos do manipulador antes que ele iniciasse seus trabalhos e da carne desossada pronta para o consumo, e uma (1,5%) da espécie A. caviae, também isolada das mãos. Os resultados são preocupantes pela presença de cepas enterotoxigênicas de bactérias do gênero Aeromonas em indústria de alto nível higiênico-sanitário.

Ocorrência de Staphylococcus sp. em água utilizada em propriedades leiteiras do Estado de São Paulo

Com o objetivo de verificar o papel da água utilizada durante a produção do leite como via de transmissão de Staphylococcus sp., fez-se a contagem de Staphylococcus coagulase negativa e Staphylococcus aureus nas amostras de água das fontes, dos reservatórios e dos estábulos de 30 propriedades leiteiras situadas na região Nordeste do Estado de São Paulo. As maiores ocorrências de isolamentos (10,0 e 16,6%) e os maiores valores médios (4,3×10(4) e 2,5×10(4)) de contagens desses microrganismos foram encontrados nas amostras de água dos estábulos utilizada na obtenção de leite. Estes resultados são importantes pois evidenciam a possibilidade de contaminação do leite ou dos animais por cepas patogênicas.

Molecular and serological detection of Ehrlichia spp. in cats on São Luís Island, Maranhão, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

MOLECULAR and SEROLOGICAL DETECTION of BABESIA SPP. IN NEOTROPICAL and EXOTIC CARNIVORES IN BRAZILIAN ZOOS

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Efeito do ethephon na qualidade da uva 'Niagara Rosada' (Vitis labrusca L.), produzida na entressafra, na região de Jales-SP

Na região de Jales (SP), a produção de uva 'Niagara Rosada' obtida de videiras podadas em períodos de ocorrência de baixas temperaturas é, em geral, insatisfatória, apresentando pequena produtividade e cachos com qualidade inadequada à comercialização. Essa qualidade da produção está intimamente relacionada à efetiva brotação. Assim, este trabalho teve o objetivo de avaliar a aplicação do ethephon em diferentes doses antes da poda, visando a melhorar a brotação e a qualidade dos cachos, em seis experimentos, durante os anos de 2001 e 2002. Foram testadas as doses de 0; 3; 6 e 9 L.ha-1 de ethephon aplicado via foliar. Concluiu-se que o uso de ethephon, na dose de 9 L.ha-1, proporcionou cachos e bagas maiores e com maiores pesos, comprimento e largura, melhorando o aspecto dos mesmos. A aplicação de ethephon não afetou os teores de sólidos solúveis totais e a acidez total titulável, não alterando o sabor da uva 'Niagara Rosada'.

Propagação de Dovyalis sp. pelo processo de mergulhia aérea

Com objetivo de avaliar a capacidade de propagação vegetativa de Dovyalis sp. pelo método da alporquia, realizou-se o presente trabalho. Foram utilizados ramos com cerca de 50 centímetros, os quais receberam os tratamentos: 0; 1.000; 3.000; 5.000 e 7.000 mg/kg de ácido indolbutírico (AIB) diluídos em lanolina, em duas épocas do ano: outono e primavera. No outono, considerou-se como subparcelas as localizações dos alporques por toda a planta, analisando-as como alporques da parte superior e inferior da copa e das faces norte e sul da planta. Na primavera, por insuficiência de ramos, apenas foram consideradas as doses com AIB. Nas épocas estudadas, o outono foi a que demonstrou maior percentagem de enraizamento e número de raízes (93,93 e 10,26 %, respectivamente). Obteve-se que o enraizamento independe da posição do ramo na planta, para esta época. O maior comprimento de raízes foi obtido na primavera.

Determination of crude protein, crude fiber and crude fat in twenty-five genotypes of kale (B-oleracea var. acephala)

The aim of the study was to determine the percentage of crude protein, crude fiber and crude fat (ether extract) of 25 genotypes of kale from the Germplasm Bank of Instituto Agronomico de Campinas and of one genotype grown in the region of Jaboticabal-SP. The plants were cultivated in the field, and the leaves after collection were pre-dried in a convection oven at 65 degrees C for 72 h. Afterward, the leaves were analyzed for crude protein, crude fiber and crude fat (ether-soluble materials). Significant differences were detected among the different genotypes for all the characteristics examined. of the genotypes studied, six showed more than 30% crude protein: HS-20 (32.56%), Comum (31.70%), Couve de Arthur Nogueira 2 (31.16%), Pires 2 de Campinas (30.63%), Manteiga 1-916 (30.36%), and Manteiga de Ribeirao Pires I-2446 (30.03%). In relation to crude fiber, the highest percentage was seen in the genotype Manteiga de Mococa (10.92%), differing significantly from the other genotypes studied. With regard to crude fat, the highest percentage was found in the genotype HS-20 (3.72%), and Pires 1 de Campinas (3.34%). of the genotypes tested, HS-20 stood out among the others, showing both the highest percentage of protein and fat.

Liming and quality of guava fruit cultivated in Brazil

An experiment was conducted on guava trees Psidium guajava L. (cv. Paluma) grown in the Experimental Citrus Culture Station of Bebedouro, SP, on dystrophic, acid Typical Hapludox in order to assess the effects of application of increasing lime doses to the soil on the quality of guava fruits on the basis of the physicochemical changes observed in the fruits after harvesting. The treatments consisted of increasing lime doses applied before planting, considering 0, 1.85, 3.79, 5.56 and 7.41 t ha(-1), applied in August 1999. Leaf calcium content was assessed at flowering time. After fruit harvesting, calcium content in the pulp, total weight, transverse diameter, length, pulp weight, % pulp, Brix degrees (degrees Brix), titratable acidity, and fruit ratio were determined. Loss of fruit fresh mass, firmness and color were determined daily during a period of 8 days of storage. Lime application to an acid Red Latosol before guava tree planting did not affect the physical characteristics of the fruits but provided a lower loss of fresh matter and greater fruit firmness when the fruits presented Ca levels close to 0.99 g kg(-1). It is important to conduct new studies of the effects of liming on guava fruit quality under different edaphic-climatic conditions and on different guava tree genotypes. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.