MICROBIAL COUNTS of DARK RED LATOSOL SAMPLES STORED AT DIFFERENT TEMPERATURES

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Rabies laboratory diagnosis: peculiar features of samples from equine origin

O diagnóstico laboratorial da raiva é realizado através de métodos de pesquisa do corpúsculo de Negri, imunofluorescência direta e inoculação em camundongos. Na maioria dos casos, quando a amostra é bem coletada, bem conservada e o profissional responsável possui experiência, verifica-se concordância entre as técnicas utilizadas. A Seção de Raiva e Encefalomielite do Instituto Biológico ao comparar a sensibilidade das três técnicas diagnósticas, em 3713 amostras (córtex cerebral, cerebelo e hipocampo) recebidas no período de 1980-1994, sendo 3010 da espécie bovina (983 positivas) e 703 da espécie eqüina (111 positivas), observou que, no caso da raiva eqüina, esta concordância não é mantida. Verificou-se, nesta espécie, que somente em algumas oportunidades foi possível identificar, pelo método histopatológico, o corpúsculo de Negri. em relação à prova de imunofluorescência pode-se afirmar que a mesma detectou uma porcentagem menor de amostras positivas, provenientes da espécie equina, em compração com as da espécie bovina, sendo esta diferença estatisticamente significativa. A prova biológica foi a mais sensível, porém houve uma diferença, também significativa, entre o período de incubação em camundongos das amostras de origem bovina e das de origem eqüina. A presença pouco frequente de corpúsculos de Negri e o período de incubação em camundongos mais prolongado, das amostras de origem eqüina, sugerem que devem ser intensificados os estudos da patogenia da raiva nesta espécie.

Size composition, monthly condition factor and morphometrics for fishery-dependent samples of Rioraja agassizi (Chondrichthyes: Rajidae), off Santos, Southeast Brazil

Espécimes de Rioraja agassizi foram mensalmente coletados em águas ao largo de Santos, sudeste do Brasil entre as latitudes 23º37'S e 27º40'S, desde março de 2005 até março de 2006. Um total de 278 machos e 1023 fêmeas foi capturado. A amplitude de profundidade de ocorrência foi 10-120 m, estando a espécie ausente em profundidades >120 m. A razão sexual favoreceu as fêmeas. A amplitude completa de comprimentos de R. agassizi esteve representada e oscilou nas fêmeas entre 16.0-59.4 cm comprimento e nos machos entre 13.0-47.2 cm. O tamanho médio das fêmeas foi significativamente maior do que dos machos. A distribuição de freqüência de comprimentos por amostras agrupadas foi assimétrica em ambos os sexos. As curvas da relação comprimento-largura foram sexualmente dimórficas. As fêmeas foram mais largas que os machos em todas as classes de comprimento maiores do que 25 cm. As curvas comprimento-peso total foram significativamente diferentes das curvas comprimento-peso eviscerado em ambos os sexos. As fêmeas foram mais pesadas do que os machos para uma determinada classe de comprimento. O coeficiente angular b foi <3 nos machos (alometría negativa) e nas fêmeas, mas com exceção da primavera, onde a alometría foi positiva (b>3). O fator de condição variou significativamente ao longo do ano em ambos os sexos.

Detection of Cryptosporidium parvum oocysts in calf fecal samples by direct immunofluorescence assay

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Performance of a reciprocal shaker in mechanical dispersion of soil samples for particle-size analysis

A dispersão da amostra de solo é uma etapa fundamental da análise granulométrica, sendo realizada mediante o uso de dispersantes químicos e agitação mecânica. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência de mesa agitadora reciprocante de baixa rotação na dispersão mecânica de amostras de solos de diferentes classes texturais. Foram realizadas análises granulométricas em 61 amostras com quatro repetições, empregando o método da pipeta para determinação da fração argila e tamisagem para determinação das frações areia grossa, areia fina e areia total, sendo o silte determinado por diferença. Na avaliação de desempenho, os resultados obtidos com uso da mesa agitadora reciprocante (MAR) foram comparados com dados disponíveis para as mesmas amostras oriundos de relatórios do Ensaio de Proficiência IAC para Laboratórios de Análises de Solos - Prolab/IAC. Análises de acurácia foram realizadas com base nos valores dos intervalos de confiança definidos para cada fração granulométrica componente de cada amostra ensaiada. Indicadores gráficos também foram utilizados na comparação de dados, por meio de dispersão e ajuste linear. A estatística descritiva indicou preponderância de baixa variabilidade em mais de 90 % dos resultados obtidos para as amostras de texturas arenosa, média e argilosa e em 68 % dos obtidos para as amostras de textura muito argilosa, indicando boa repetibilidade dos resultados obtidos com a MAR. Média variabilidade foi mais frequentemente associada à fração silte, seguida da fração areia fina. Os resultados das análises de sensibilidade indicam acurácia de 100 % nas três frações granulométricas - areia total, silte e argila - para todas as amostras analisadas pertencentes às classes texturais muito argilosa, argilosa e média. Para as nove amostras de textura arenosa, a acurácia média foi de 85,2 %, e os maiores desvios ocorreram em relação à fração silte. Nas aproximações lineares, coeficientes de correlação igual (silte) ou superiores (areia total e argila) a 0,93, bem como diferenças menores do que 0,16 entre os coeficientes angulares das retas e o valor unitário, indicam alta correlação entre os resultados de referência (Prolab/IAC) e os obtidos nos ensaios com a MAR. Conclui-se pelo desempenho satisfatório da mesa agitadora reciprocante de baixa rotação para dispersão mecânica de amostras de solo de diferentes classes texturais para fins de análise granulométrica, permitindo recomendar o uso alternativo do equipamento quando se emprega agitação lenta. As vantagens do uso do equipamento nacional incluem o baixo custo, a possibilidade de análise simultânea de grande número de amostras e o uso de frascos comuns, de vidro ou de plástico, baratos e de fácil reposição.

Methylation status of CDH1 gene in samples of gastric mucous from brazilian patients with chronic gastritis infected by Helicobacter pylori

CONTEXTO:O câncer gástrico é uma das principais neoplasias que causam o óbito no Brasil e no mundo. Helicobacter pylori é um carcinógeno do tipo I relacionado à gastrite crônica. Diferenças no grau de virulência de suas cepas levam a maior risco de desenvolvimento de doenças gástricas. A metilação de ilhas CpGs está envolvida com o processo de tumorigênese em diferentes tipos de câncer. CDH1 é um gene supressor tumoral que, quando inativado, pode aumentar as chances de metástase. A metilação deste gene em estágios precoces da carcinogênese gástrica ainda não é totalmente compreendida. OBJETIVO: Investigar o padrão de metilação do gene CDH1 em amostras de gastrites crônicas e correlacionar com a presença do H. pylori. MÉTODOS: Foram usadas 60 biopsias de mucosas gástricas. A detecção de H. pylori foi realizada por PCR para o gene da urease C e a genotipagem com PCR para os genes cagA e vacA (região s e m). O padrão de metilação do gene CDH1 foi analisado usando a técnica de PCR e específica para a metilação e sequenciamento direto dos produtos de PCR. RESULTADOS: A bactéria H. pylori foi detectada em 90% das amostras de gastrites crônicas; destas, 33% portavam o gene cagA e 100% vacA s1. O genótipo vacA s2/m1 não foi detectado nas amostras analisadas. Metilação de CDH1 foi detectada em 63,3% das amostras de gastrites e 95% delas eram portadoras de H. pylori. CONCLUSÃO: Os resultados deste estudo sugerem que a metilação em CDH1 e a infecção pelo H. pylori são eventos frequentes em amostras de pacientes brasileiros com gastrite crônica e reforça a correlação entre infecção por H. pylori e inativação do gene CDH1 em estágios precoces da tumorigênese gástrica.

MICROBIAL ACTIVITY of DARK RED LATOSOL SAMPLES STORED AT DIFFERENT TEMPERATURES

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Application of differential scanning calorimetry in hair samples as a possible tool in Forensic Science

A calorimetria Exploratória Diferencial (DSC) foi utilizada para estudar o comportamento térmico de amostras de cabelo e verificar a possibilidade de identificar um indivíduo com base nas curvas DSC de um banco de dados. Amostras de cabelo de estudantes e funcionários do Instituto de Química de Araraquara UNESP, foram obtidas para construir um banco de dados. Procurou-se assim identificar de um indivíduo sob incógnita, utilizando-se a curva DSC deste banco de dados.

Antigenic typing of brazilian rabies virus samples isolated from animals and humans, 1989-2000

Amostras de vírus rábico isoladas de animais e humanos no período de 1989 a 2000 foram tipificadas antigenicamente com a utilização de um painel de anticorpos monoclonais contra a nucleoproteína viral, pré-estabelecido para o estudo da epidemiologia molecular do vírus rábico isolado nas Américas. As amostras testadas foram isoladas no laboratório de diagnóstico do Instituto Pasteur e outros centros de diagnóstico de raiva no Brasil. Além das cepas de vírus rábico fixo CVS-31/96-IP, mantida em cérebro de camundongos e a PV-BHK/97, mantida em cultura de células, cepas de vírus rábico isoladas de cães, gatos, bovinos, eqüinos, morcegos, ovinos, caprino, suínos, raposa, sagüí, coatí, guaxinim e humanos, totalizaram 330 amostras. Seis variantes antigênicas foram definidas, compatíveis com perfís observados no painel de anticorpos monoclonais pré-estabelecido utilizado, as de número 2 (cão), 3 (Desmodus rotundus), 4 (Tadarida brasiliensis), 5 (Vampiro da Venezuela), 6 (Lasiurus cinereus) e Lab (reagente a todos os anticorpos utilizados), além de outros seis perfís desconhecidos, não compatíveis com aqueles observados no painel utilizado. A maior variabilidade foi observada entre as amostras isoladas de morcegos insetívoros e a variante mais comum isolada entre as espécies foi a variante 3 (Desmodus rotundus). Estes fatos podem representar a existência de múltiplos ciclos de transmissão independentes, envolvendo diferentes espécies de morcegos.

Asymmetrical penetration of microwave in a conducting media and determination of microwave conductivity for very thin samples using electron spin resonance

Dyson's theory of conduction electron spin resonance (CESR) has been used in the limit d less than or equal to delta (d being the thickness of the sample and delta the skin depth of the microwave field) to obtain the microwave conductivity from the (A/B) ratio of the CESR absorbed power derivative. In this work we calculate the CESR absorbed power derivative using Kaplan's approach and show that the (A/B) ratio can be enhanced if asymmetrical penetration of microwave is used, which means that the microwave field enters into the sample from one of the faces. Therefore, the determination of the microwave conductivity from the (A/B) ratio of the CESR line can be performed for thinner samples. Experimentally, asymmetrical penetration can be obtained if one of the sample's faces is covered with a thin gold layer. The determination of microwave conductivity in conducting polymers films is among the possible applications of this method. (C) 2001 Elsevier B.V. Ltd. All rights reserved.

Distribution of Cr, Ni, Cu, Cd and Pb in different molecular size of humic fractions extracted from water and sediment samples collected at Anhumas reservoir - Araraquara/SP

In this work was studied the distribution of Cr, Ni, Cu, Cd and Pb in humic fractions with different molecular size. The HS were extracted from waters (AHS), surface sediments (HESS), interface water sediment (HSIS) and bottom sediment (HSBS) collected in the Anhumas surface water collection reservoir, located in the district of Araraquara - São Paulo State Brazil. The humic substances were extracted by procedures recommended by International Humic Substances Society (IHSS). After purification by dialysis, the humic substances were fractionated using a multistage tangential flow ultrafiltration system. The fractionation patterns of HS characterized a mass distribution relatively uniform among the fractions with different molecular sizes, with larger values in the fractions F-2 (20.8%) and F-4 (23.8%), Except for the ions Pb(II) and Cu(II), which presented relatively higher concentrations in the fractions F-2 and F-4, respectively. In general, chromium, nickel, cadmium and lead have similar distributions in the five fractions with larger and medium molecular sizes (F-1 to F-5). With relation to the mass distributions in the different humic substances fractions extracted from sediment samples collected at three depth, they presented 42-48% of HS in the fractions with larger molecular sizes (F-1 and F-2), 29-31% in the middle fractions (F-3 and F-4) and 13-20% in the fractions with smaller molecular sizes (F-5 and F-6). In general, the metallic ions presented distributions similar among the respective fractions F-1 to F-6, Exceptions for Pb(II) and M(II) in surface sediment with concentrations relatively smaller in the fractions F-2 and F-4, respectively,

Screening and confirmation of PAHs in vegetable oil samples by use of supercritical fluid extraction in conjunction with liquid chromatography and fluorimetric detection

A fast, simple, non-destructive method for the direct screening of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) in vegetable oil samples is proposed. The method uses a supercritical fluid extraction (SFE) system coupled on-line with a fluorimetric detector to determine PAHs. This special assembly avoids the main problems encountered in the determination of PAHs in complex matrices such as vegetable oils. PAHs are selectively extracted by using silica gel in the thimble and cleaned up by passage through a C18 column. Interferences are preferentially retained by the silica gel during the SFE process while PAHs are adsorbed in the C18 column and the remainder of the matrix is sent to waste. Finally, the C18 column is purged to remove residual CO2 gas and adsorbed PAHs are recovered by desorption with a solvent. The extracts from positive samples are subsequently analyzed by liquid chromatography (LC) with fluorescence detection. The proposed method allows the confirmation of vegetable oil safety and hence provides a new tool for consumer protection. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

Oxygen stoichiometry effects in spinel-type NiMn2O4-delta samples

We report the effects of oxygen stoichiometry in the structure and magnetic response of spinel-type NiMn2O4-delta polycrystalline samples controlled by heat-treatments in different atmospheric conditions.The post-annealed samples were analyzed by Scanning Electron Microscopy associated to X-ray Energy Dispersion Spectrometry, X-ray Photoelectron Spectroscopy and AC/DC magnetic measurements.Results indicate that the oxygen stoichiometry highly influences the magnetic interactions between the ferromagnetic, and antiferromagnetic sublattices in these compounds due to the presence of manganese in three possible valence states. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Detection of carbamate pesticides in vegetable samples using cholinesterase-based biosensors

Biosensors for determination of carbamates in vegetables based on five different cholinesterases as biorecognition elements and a screen-printed electrode system as an amperometric transducer were developed. Measurements were simply performed by dropping solutions (either sample or substrate) directly on the biosensor. The response of biosensors to selected carbamates (aldicarb, carbaryl, carbofuran, methomyl and propoxur) was characterized. The performance was evaluated on extracts of potatoes and carrots, the results from the AChE biosensor and a standard HPLC procedure were compared. Finally, the biosensor was used for the direct analysis of vegetable juices without any pretreatment steps. In this case, 10 mu g/L levels of added carbofuran and propoxur were reliably identified. The whole procedure takes less than 20 min including 10 min incubation with samples. The concentrations of carbamates determined with biosensor agreed well for carbofuran. Lower response was observed for propoxur.