Generalized linear mixed models for the genetic evaluation of binary reproductive traits: a simulation study

The objective of this study was to evaluate the use of probit and logit link functions for the genetic evaluation of early pregnancy using simulated data. The following simulation/analysis structures were constructed: logit/logit, logit/probit, probit/logit, and probit/probit. The percentages of precocious females were 5, 10, 15, 20, 25 and 30% and were adjusted based on a change in the mean of the latent variable. The parametric heritability (h²) was 0.40. Simulation and genetic evaluation were implemented in the R software. Heritability estimates (ĥ²) were compared with h² using the mean squared error. Pearson correlations between predicted and true breeding values and the percentage of coincidence between true and predicted ranking, considering the 10% of bulls with the highest breeding values (TOP10) were calculated. The mean ĥ² values were under- and overestimated for all percentages of precocious females when logit/probit and probit/logit models used. In addition, the mean squared errors of these models were high when compared with those obtained with the probit/probit and logit/logit models. Considering ĥ², probit/probit and logit/logit were also superior to logit/probit and probit/logit, providing values close to the parametric heritability. Logit/probit and probit/logit presented low Pearson correlations, whereas the correlations obtained with probit/probit and logit/logit ranged from moderate to high. With respect to the TOP10 bulls, logit/probit and probit/logit presented much lower percentages than probit/probit and logit/logit. The genetic parameter estimates and predictions of breeding values of the animals obtained with the logit/logit and probit/probit models were similar. In contrast, the results obtained with probit/logit and logit/probit were not satisfactory. There is need to compare the estimation and prediction ability of logit and probit link functions.

Comparação de alguns modelos matemáticos para ajuste à curva de lactação média de um rebanho da raça Caracu

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estimação de componentes de co-variância para pesos corporais do nascimento aos 365 dias de idade de bovinos Guzerá empregando-se modelos de regressão aleatória

Um total de 19.770 pesos corporais de bovinos Guzerá, do nascimento aos 365 dias de idade, pertencentes ao banco de dados da Associação Brasileira dos Criadores de Zebu (ABCZ) foi analisado com os objetivos de comparar diferentes estruturas de variâncias residuais, considerando 1, 18, 28 e 53 classes residuais e funções de variância de ordens quadrática a quíntica; e estimar funções de co-variância de diferentes ordens para os efeitos genético aditivo direto, genético materno, de ambiente permanente de animal e de mãe e parâmetros genéticos para os pesos corporais usando modelos de regressão aleatória. Os efeitos aleatórios foram modelados por regressões polinomiais em escala de Legendre com ordens variando de linear a quártica. Os modelos foram comparados pelo teste de razão de verossimilhança e pelos critérios de Informação de Akaike e de Informação Bayesiano de Schwarz. O modelo com 18 classes heterogêneas foi o que melhor se ajustou às variâncias residuais, de acordo com os testes estatísticos, porém, o modelo com função de variância de quinta ordem também mostrou-se apropriado. Os valores de herdabilidade direta estimados foram maiores que os encontrados na literatura, variando de 0,04 a 0,53, mas seguiram a mesma tendência dos estimados pelas análises unicaracterísticas. A seleção para peso em qualquer idade melhoraria o peso em todas as idades no intervalo estudado.

Kondo-attractive-Hubbard model for the ordering of local magnetic moments in superconductors

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estudo da adsorção de hidrogênio e sulfeto na superfície de paládio: aspectos experimentais (eletroquímica) e teóricos (ab initio e Teoria do Funcional da Densidade)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Exigências em treonina para frangos de corte de 22 a 42 dias de idade

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Chicken skeletal muscle-associated macroarray for gene discovery

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Two new bradykinin-related peptides from the venom of the social wasp Protopolybia exigua (Saussure)

Two bradykinin-related peptides (Protopolybiakinin-I and Protopolybiakinin-II) were isolated from the venom of the social wasp Protopolybia exigua by RP-HPLC, and sequenced by Edman degradation method. Peptide sequences of Protopolybiakinin-I and Protopolybiakinin-II were DKNKKPIRVGGRRPPGFTR-OH and DKNKKPIWMAGFPGFTPIR-OH, respectively. Synthetic peptides with identical sequences to the bradykinin-related peptides and their biological functions were characterized. Protopolybiakinin-I caused less potent constriction of the isolated rat ileum muscles than bradykinin (BK). In addition, it caused degranulation of mast cells which was seven times more potent than BK. This peptide causes algesic effects due to the direct activation of B-2-receptors. Protopolybiakinin-II is not an agonist of rat ileum muscle and had no algesic effects. However, Protopolybiakinin-II was found to be 10 times more potent as a mast cell degranulator than BK. The amino acid sequence of Protopolybiakinin-I is the longest among the known wasp kinins. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Chemical communication in isoptera

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Optimisation of a continuous flash fermentation for butanol production using the response surface methodology

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

A systematization for one-loop 4D Feynman integrals

We present a strategy for the systematization of manipulations and calculations involving divergent (or not) Feynman integrals, typical of the one-loop perturbative solutions of QFT, where the use of an explicit regularization is avoided. Two types of systematization are adopted. The divergent parts are put in terms of a small number of standard objects, and a set of structure functions for the finite parts is also defined. Some important properties of the finite structures, specially useful in the verification of relations among Green's functions, are identified. We show that, in fundamental (renormalizable) theories, all the finite parts of two-, three- and four-point functions can be written in terms of only three basic functions while the divergent parts require (only) five objects. The final results obtained within the proposed strategy can be easily converted into those corresponding to any specific regularization technique providing an unified point of view for the treatment of divergent Feynman integrals. Examples of physical amplitudes evaluation and their corresponding symmetry relations verification are presented as well as generalizations of our results for the treatment of Green's functions having an arbitrary number of points are considered.

On the Baker-Akhiezer function in the AKNS scheme

Expressions for the Baker-Akhiezer function and their logarithmic space and time derivatives are derived in terms of the matrix elements of U - V matrices and 'squared basis functions'. These expressions generalize the well known formulas for the KdV equation case and establish links between different forms of the Whitham averaging procedure.

The two-loop massless (lambda/4!)phi(4) model in nontranslational invariant domain

We study the (lambda/4!)phi(4) massless scalar field theory in a four-dimensional Euclidean space, where all but one of the coordinates are unbounded. We are considering Dirichlet boundary conditions in two hyperplanes, breaking the translation invariance of the system. We show how to implement the perturbative renormalization up to two-loop level of the theory. First, analyzing the full two and four-point functions at the one-loop level, we show that the bulk counterterms are sufficient to render the theory finite. Meanwhile, at the two-loop level, we must also introduce surface counterterms in the bare Lagrangian in order to make finite the full two and also four-point Schwinger functions. (c) 2006 American Institute of Physics.

Pressão de preconsolidação como ferramenta de análise da sustentabilidade estrutural de classes de solos com diferentes usos

O principal problema ambiental causado pelo uso do solo em áreas de preservação permanente longitudinais aos rios é a supressão da mata ciliar. O tipo e a intensidade desse uso alteram a estrutura do solo e comprometem as funções físicas dessas áreas, principalmente próximo aos cursos d'água. O objetivo deste trabalho foi avaliar a sustentabilidade estrutural, a partir do ensaio de compressão uniaxial, de três classes de solo (Cambissolo Háplico, Argissolo Amarelo e Gleissolo Háplico) e o impacto de diferentes tipos de usos do solo - não permitido pela legislação ambiental - de áreas de preservação permanente na sub-bacia do rio Ribeira de Iguape, SP. Foram delimitadas na área experimental três classes de solo: Cambissolo, Argissolo e Gleissolo. Numa primeira etapa, compararam-se as três classes de solos sob mata nativa e sob pastagem. Na segunda, avaliou-se a influência de diferentes tipos de uso do solo - cultivo de banana, pastagem degradada, uso silvipastoril e mata nativa - sobre a estrutura de um Cambissolo. A pressão de preconsolidação mostrou-se ferramenta capaz de identificar a degradação nos solos. O uso do solo nas áreas de preservação permanente altera a pressão de preconsolidação do solo, causando sua degradação estrutural, colocando em risco a sustentabilidade das terras, e não deve ser permitido. O Gleissolo mostrou maiores valores de pressão de preconsolidação em função de teores crescentes de água e, portanto, maior capacidade de suporte de carga em relação ao Cambissolo e Argissolo. O cultivo de banana foi o tipo de uso que mais degradou os solos das áreas de preservação permanente.

Luminescence quenching by iron in barium aluminoborate glasses

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)