Estimating genomic instability mediated by Alu retroelements in breast cancer

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Utilização experimental de hidroxiapatita sintética em alvéolos dentários de gatos domésticos (Felis catus): estudo clínico, radiográfico e histomorfométrico

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Distribuição temporal e espacial de anuros em área de Pampa, Santa Maria, RS

Este estudo teve como objetivo determinar a riqueza, a constância de ocorrência, os modos reprodutivos, o padrão de distribuição da abundância, a temporada de vocalização e testar a correlação das variáveis climáticas sobre a atividade de vocalização dos anuros em uma região do Bioma Pampa, Santa Maria, Rio Grande do Sul. Durante o período de novembro de 2001 a outubro de 2002 foram realizadas coletas mensais empregando o método de busca em sítio de reprodução e exame de exemplares depositados na Coleção Herpetológica do Setor de Zoologia da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM) (ZUFSM). Foi registrada a ocorrência de 25 espécies de anuros. A anurofauna registrada corresponde a 30% das espécies encontradas no Rio Grande do Sul e normalmente está associada a áreas abertas encontradas no estado e em países vizinhos. Foram registrados quatro modos reprodutivos: modo 1 (14 espécies; 58,3%); modos 11 e 30 (nove espécies; 37,5%) e modo 24 (uma espécie; 4,2%). A baixa diversificação de modos reprodutivos provavelmente está relacionada à homogeneidade do hábitat primariamente campestre. A maior parte das espécies mostrou-se constante ou acessória na área estudada e o padrão de distribuição da abundância das espécies apresentou ajuste aos modelos Broken Stick e Log-normal, caracterizados pela homogeneidade na distribuição da abundância das espécies. A maioria das espécies apresentou grande plasticidade na ocupação de hábitats, mas poucas foram plásticas no uso dos sítios de vocalização. Houve correlação positiva, ainda que fraca, da riqueza de espécies com a precipitação mensal acumulada e da abundância com a temperatura média máxima. As correlações obtidas indicaram que na área estudada a temperatura parece atuar mais sobre a abundância de machos em atividade de vocalização e a precipitação sobre a riqueza, apesar da riqueza de espécies ser significativamente maior durante o período mais quente do ano. Estes resultados revelaram que as variáveis climatológicas testadas explicaram muito pouco da ocorrência sazonal das espécies, assim a influência de outras variáveis ambientais merece ser testada em estudos futuros.

Quantificação da função esfincteriana pela medida da capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária do canal anal

RACIONAL: Tem sido demonstrado que a pressão máxima de contração voluntária e a pressão média de repouso não refletem a real situação clínica do paciente portador de incontinência fecal, não traduzem a realidade funcional do canal anal, além de poder estar comprometendo a conduta a ser tomada devido ao não-encaminhamento à terapêutica específica. OBJETIVO: Com a hipótese de que contrair e manter a contração é mais importante que simplesmente contrair, mesmo com pico momentaneamente elevado de pressão, analisou-se a capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária do canal anal com o intuito de quantificar a função esfincteriana relativa à continência fecal. MATERIAL E MÉTODOS: Submeteram-se a exame manométrico anorretal 72 pacientes (56 mulheres) portadores de incontinência fecal de vários graus e 15 (9 mulheres) indivíduos continentes (normais), avaliando-se a pressão média de repouso, a pressão máxima de contração voluntária e a capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária. RESULTADOS: Os indivíduos continentes apresentaram valores normais de pressão média de repouso e de pressão máxima de contração voluntária, além de adequada capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária. Os pacientes incontinentes apresentaram pressão média de repouso e pressão máxima de contração voluntária com valores pressóricos normais ou abaixo do normal e perfil semelhante de capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária, ou seja, moderada na fase inicial e ruim nas fases intermediária e final, com queda da mesma superior a 35% em 78% dos pacientes. A pressão máxima de contração voluntária apresenta excelente especificidade (100%) porém, sensibilidade baixa (46%) para incontinência fecal. Comparativamente, a capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária apresenta elevadas especificidade (93%) e sensibilidade (78%) para incontinência fecal. Embora a pressão máxima de contração voluntária não indique falso-positivos, apresenta 72% de falso-negativos. A probabilidade deste fato acontecer com a medida de capacidade de sustentação da pressão de contração voluntária é, praticamente, 20% menor, valor estatisticamente significativo. CONCLUSÃO: O indicativo de função esfincteriana é melhor analisado pela capacidade de sustentação. A capacidade de sustentação traduz com mais exatidão, a capacidade funcional do canal anal em relação à continência voluntária, sendo isoladamente, melhor que a pressão máxima de contração voluntária.

Potential of non-pathogenic Fusarium oxysporum isolates for control of Fusarium wilt of tomato

O trabalho avaliou a eficiência dos isolados (141/3, 233, 233/1, 245, 245/1, 251, 251/2, 251/5 e 257) de Fusarium oxysporum não patogênico ao tomateiro (Lycopersicon esculentum), no controle da murcha vascular causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici, raça 2 em plântulas de tomateiro cv. Viradoro. Para verificar o efeito dos isolados de F. oxysporum não patogênicos, o sistema radicular de plântulas de tomateiro, com 30 dias de idade, foi imerso na suspensão de conídios (10(6) ml-1) e as mudas transplantadas para substrato de cultivo. Após 35 dias do transplante foi verificado que esses isolados não foram patogênicos às plantas de tomateiro, nem afetaram o desenvolvimento das mudas. A eficiência dos isolados de Fusarium oxysporum não patogênicos no controle da murcha foi determinada imergindo-se as raízes de mudas de tomateiro em suspensão de conídios (10(6) conídios ml-1) e transplantando-as em substratos previamente infestados com os isolados de F. oxysporum f.sp. lycopersici, raça 2 (10(5) conídios ml-1 de substrato). Transcorridos 35 dias do transplante, foram realizadas as avaliações da severidade na escala de 1=planta sadia a 6=planta morta ou com vasos coloridos e folhas murchas até o ponteiro e altura das mudas. Os isolados de F. oxysporum não patogênicos foram eficientes em reduzir a severidade da doença e em manter normal o seu desenvolvimento. Esses resultados evidenciam a atividade antagônica dos isolados de F. oxysporum não patogênico no controle da murcha vascular do tomateiro, causada por Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici raça 2.

Alterações do fluxo sanguíneo em artéria umbilical na síndrome hipertensiva gestacional e suas implicações nos resultados neonatais

OBJETIVO: Avaliar as características antropométricas, a morbidade e mortalidade de recém-nascidos (RN) prematuros nascidos vivos de mães hipertensas em função da presença ou não de diástole zero (DZ) ou reversa (DR) na doplervelocimetria arterial umbilical. MÉTODOS: Estudo prospectivo, envolvendo RN prematuros nascidos vivos de gestantes hipertensas, com idade gestacional entre 25 e 33 semanas, submetidas à doplervelocimetria da artéria umbilical nos 5 dias que antecederam o parto, realizado no Hospital do Distrito Federal, entre 1º de novembro de 2009 e 31 de outubro de 2010. Os RN foram estratificados em dois grupos, conforme o resultado da doplervelocimetria da artéria umbilical: Gdz/dr=presença de diástole zero (DZ) ou diástole reversa (DR) e Gn=doplervelocimetria normal. Medidas antropométricas ao nascimento, morbidades e mortalidade neonatal foram comparadas entre os dois grupos. RESULTADOS: Foram incluídos 92 RN, assim distribuídos: Gdz/dr=52 RN e Gn=40 RN. No Gdz/dr a incidência de RN pequenos para idade gestacional foi significativamente maior, com risco relativo de 2,5 (IC95% 1,7‒3,7). No grupo Gdz/dr os RN permaneceram mais tempo em ventilação mecânica mediana 2 (0‒28) e no Gn mediana 0,5 (0‒25), p=0,03. A necessidade de oxigênio aos 28 dias de vida foi maior no Gdz/dr do que no Gn (33 versus10%; p=0,01). A mortalidade neonatal foi maior em Gdz/dr do que em Gn (36 versus 10%; p=0,03; com risco relativo de 1,6; IC95% 1,2 - 2,2). Nessa amostra a regressão logística mostrou que a cada 100 gramas a menos de peso ao nascer no Gdz/dr a chance de óbito aumentou 6,7 vezes (IC95% 2,0 - 11,3; p<0,01). CONCLUSÃO: em RN prematuros de mães hipertensas com alteração na doplervelocimetria da artéria umbilical a restrição do crescimento intrauterino é frequente e o prognóstico neonatal pior, sendo elevado o risco de óbito relacionado ao peso ao nascimento.

Molecular systematics of Thorea (Rhodophyta, Thoreales) species in Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Influência do substrato e do tipo de fertilizante na aclimatação de mudas de bananeira 'Prata-Anã'

Objetivando-se avaliar a influência do substrato e tipo de fertilizante na aclimatação de mudas de bananeira 'Prata-Anã', provenientes de micropropagação, foi instalado um experimento em blocos casualizados, no esquema fatorial 5 x 3, com quatro repetições. Os substratos utilizados foram: S1 - Terra de subsolo + casca de arroz carbonizada + substrato comercial Rendimax Floreira®; S2 - Terra de subsolo + casca de arroz carbonizada + composto orgânico Organifol®; S3 - Terra de subsolo + casca de arroz carbonizada + composto orgânico Organifol® 9% SiO; S4 - substrato comercial Technes Vivatto®; S5 - Areia grossa + casca de arroz carbonizada + Rendimax Floreira®, todos na proporção 1:1:1 (v/v/v). Os fertilizantes utilizados foram: SF - sem fertilizante; FLL - fertilizante de liberação lenta, 14-14-14 (5,0 kg m-3) misturado ao substrato; e FLN - fertilizante de liberação normal, 14-14-14 (5,0 kg m-3) aplicado em cobertura, 30 dias após o plantio. As mudas foram plantadas em sacos de polietileno quando apresentavam quatro a cinco folhas, sendo mantidas em viveiro com 50% de sombreamento. Foram feitas medidas de altura, diâmetro do colo e número de folhas, e determinada a massa seca das mudas. As diferenças químicas das misturas utilizadas como substrato, juntamente com o tipo de fertilizante utilizado, proporcionaram crescimento diferenciado das mudas. O substrato S4 pode ser utilizado sem fertilização. Os substratos S2 e S3 devem ser utilizados com fertilizante de liberação normal ou lenta de nutrientes, e S1 e S5, sendo pobres em nutrientes, com fertilizante de liberação lenta.

Allelic imbalance studies of chromosome 9 suggest major differences in chromosomal instability among nonmelanoma skin carcinomas

CONTEXTO: Vários estudos de perda de heterozigozidade na região 9p21-p22, que abriga os genes supressores tumorais CDKN2a/p16INK4a, p19ARF e p15INK4b, têm sido realizados em uma ampla série de tumores humanos, incluindo os melanomas familiares. Perdas e ganhos em outras regiões do cromossomo 9 também têm sido observados com freqüência e podem indicar mecanismos adicionais no processo de tumorigênese dos carcinomas basocelulares da pele. OBJETIVO: Investigar o equilíbrio alélico existente na região 9p21-p22 em carcinomas basocelulares. TIPO DE ESTUDO: Análise molecular de marcadores de microssatélites em tumores e controles. LOCAL: Dois serviços de dermatologia de atendimento terciário em universidades públicas de São Paulo e o Laboratório de Genética Molecular do Câncer da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), Brasil. PARTICIPANTES: Examinamos 13 casos benignos, incluindo 4 queratoses solares, 3 queratoacantomas, 3 nevos melanocíticos, 2 doenças de Bowen e 1 neurofibroma cutâneo, além de 58 tumores malignos da pele: 14 de células escamosas, 40 carcinomas basocelulares e 4 melanomas; em pacientes consecutivamente encaminhados à clínica de Dermatologia da Unicamp e que concordaram em participar do estudo. VARIÁVEIS ESTUDADAS: O tumor principal e uma porção normal de pele não-adjacente foram removidos cirurgicamente de pacientes que consecutivamente procuraram os ambulatórios de dermatologia da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) e da Universidade Estadual de São Paulo (Unesp), São Paulo, por causa de lesões cutâneas. Extraímos DNA tanto de tecido tumoral como do correspondente tecido normal de cada paciente. Para amplificar regiões de repetição polimórfica de microssatélites do cromossomo 9, foram utilizados quatro pares de primers, sendo dois deles destinados à região 9p21-p22. RESULTADOS: Identificamos oito casos (20%) de desequilíbrio alélico entre os carcinomas basocelulares, sendo dois casos de perda de heterozigozidade e seis casos de instabilidade de microssatélite na região 9p21-p22. Outros marcadores também mostravam anormalidades em três destes tumores, enquanto nenhuma alteração foi detectada entre os casos benignos e nos outros tumores malignos. CONCLUSÃO: Esta dependência fenotípica sugere que existem diferenças importantes no comportamento das formas mais comuns de tumores cutâneos não-melanocíticos em relação à sua tendência para instabilidade de microssatélite no cromossomo 9. Considerando-se que os genes CDKN2a/p16INK4a, p19ARF e p15INK4b não parecem responsáveis pelas anormalidades observadas, outros genes em 9p21-p22 podem estar envolvidos na etiopatogenia e na progressão dos carcinomas basocelulares.

Quantitative real-time PCR identifies a critical region of deletion on 22q13 related to prognosis in oral cancer

Quantitative real time PCR was performed on genomic DNA from 40 primary oral carcinomas and the normal adjacent tissues. The target genes ECGFB, DIA1, BIK, and PDGFB and the microsatellite markers D22S274 and D22S277, mapped on 22q13, were selected according to our previous loss of heterozygosity findings in head and neck tumors. Quantitative PCR relies on the comparison of the amount of product generated from a target gene and that generated from a disomic reference gene (GAPDH-housekeeping gene). Reactions have been performed with normal control in triplicates, using the 7700 Sequence Detection System (PE Applied Biosystems). Losses in the sequences D22S274 (22q13.31) and in the DIA1 (22q13.2-13.31) gene were detected in 10 out of 40 cases (25%) each. Statistically significant correlations were observed for patients with relative copy number loss of the marker D22S274 and stages T3-T4 of disease (P=0.025), family history of cancer (P = 0.001), and death (P = 0.021). Relative copy number loss involving the DIA1 gene was correlated to family history of cancer (P<0.001), death (P=0.002), and consumption of alcohol (P=0.026). Log-rank test revealed a significant decrease in survival (P=0.0018) for patients with DIA1 gene loss. Relative copy number losses detected in these sequences may be related to disease progression and a worse prognosis in patients with oral cancer.

ULTRASTRUCTURE OF THE GERMINATIVE EPITHELIUM IN A GOAT WITH A 5/15-ROBERTSONIAN TRANSLOCATION

The spermatogenesis of two goats bearing a 5/15 Robertsonian translocation was investigated by electron microscopy. There was no dramatic change in the morphology of the cells of the spermatic line. All cells of the seminiferous epithelium seemed quite normal at the ultrastructural level. However a certain disturbance in the cell localization and some morphological abnormalities involving nuclear structure were seen. Spermatocytes and spermatids normal in appearance were observed, but a great number of cells presented two or more nuclei. These cells were frequently seen to become degenerated during spermatogenesis. We believe that unbalanced spermatocytes degenerate during the process and only some spermatocytes succeed in fertilizing gametes.

SURFACE EFFECTS IN THE HYDROGEN EVOLUTION REACTION ON NI-ZN ALLOY ELECTRODES IN ALKALINE-SOLUTIONS

Hydrogen evolution reaction was studied on Ni-Zn (25% of Ni before leaching) in 1 M NaOH at 25 degrees C. These electrodes were characterized by very low Tafel slopes of 67 mV dec(-1). Other techniques used included potential and current pulse, potential relaxation in an open circuit, and ac impedance spectroscopy. Analysis of the experimental results led to the conclusion that hydrogen adsorption in the surface layers was responsible for the observed behavior. Influence of the oxidation of the electrode surface and the addition of poisons, thiourea and cyanides, were also studied. These processes inhibit the hydrogen absorption and restore ''normal'' Tafel slopes. Kinetic parameters of the hydrogen evolution reaction were determined.

Diamondiferous deposits in the Jequitai area (Minas Gerais, Brazil): a consequence of neotectonic processes

Diamonds obtained from small scale mining near Jequitai and surrounding villages are extracted from Tertiary conglomerates and Quaternary gravels of the Rio Jequitai. Eocretaceous conglomerates, which are locally poorly diamondiferous, cover parts of the Serra da Agua Fria and Serra do Cabral. They are of no economic importance. Analyses of neotectonic, post-Miocene features support a transpressive regime that gave rise to N-S to N25&DEG; E transcurrent faults, and WNW normal faults. The main evidence for neotectonic processes are inclined Tertiary sediments, drainage captures, striated laterites of Miocene age, and tilting of blocks that form the Rio Jequitai graben. Diamonds in the Tertiary terraces derived from the Eocretaceous conglomerates, which were affected by neotectonic processes, followed by erosion and concentration during redeposition of sediments.

Crescimento de mudas micropropagadas da bananeira cv. Nanicão, em diferentes substratos e fontes de fertilizante

With the objective of evaluating the effect of different substrates combined with fertilizers in the growth of micropropagated seedlings of Cavendish banana (Musa spp. AAA), ail experiment was conducted in a randomized block design, in a 5 x 3 factorial scheme, with four repetitions. The substrates used were: S1 - subsoil land + carbonized rice hull + Rendmax Floreira (R); S2 - subsoil land + carbonized rice hull + Organifol (R); S3 - subsoil land + carbonized rice hull + Organifol (R) 9% SiO; S4 - Technes Vivatto (R); S5 - thick sand + carbonized rice hull + Rendmax Floreira (R). The fertilizer sources were: SA - without fertilizer; LL - slow-release fertilizer - Osmocote (R) 3M 14-14-14 (5.0 kg m(-3)) inixed in the substrate; and LN - normal-release fertilizer, 14-14-14 (7.5 g seedling(-1)) applied in covering. The height, collar diameter, leaf number, leaf area and dry matter were determined. Based on the differences of growth, substrates S 1, S2, S3 and S4 can be used with fertilizer 14-14-14, with slow (5.0 kg m(-3)) or normal (7.5 g seedling(-1)) release of nutrients.

Chromosomal imbalances are uncommon in chagasic megaesophagus

Background: Chagas' disease is a human tropical parasitic illness and a subset of the chronic patients develop megaesophagus or megacolon. The esophagus dilation is known as chagasic megaesophagus (CM) and one of the severe late consequences of CM is the increased risk for esophageal carcinoma (ESCC). Based on the association between CM and ESCC, we investigated whether genes frequently showing unbalanced copy numbers in ESCC were altered in CM by fluorescence in situ (FISH) technology.Methods: A total of 50 formalin-fixed, paraffin-embedded esophageal mucosa specimens (40 from Chagas megaesophagus-CM, and 10 normal esophageal mucosa-NM) were analyzed. DNA FISH probes were tested for FHIT, TP63, PIK3CA, EGFR, FGFR1, MYC, CDKN2A, YES1 and NCOA3 genes, and centromeric sequences from chromosomes 3, 7 and 9.Results: No differences between superficial and basal layers of the epithelial mucosa were found, except for loss of copy number of EGFR in the esophageal basal layer of CM group. Mean copy number of CDKN2A and CEP9 and frequency of nuclei with loss of PIK3CA were significantly different in the CM group compared with normal mucosa and marginal levels of deletions in TP63, FHIT, PIK3CA, EGFR, CDKN2A, YES and gains at PIK3CA, TP63, FGFR1, MYC, CDNK2A and NCOA3 were detected in few CM cases, mainly with dilation grades III and IV. All changes occurred at very low levels.Conclusions: Genomic imbalances common in esophageal carcinomas are not present in chagasic megaesophagus suggesting that these features will not be effective markers for risk assessment of ESCC in patients with chagasic megaesophagus.