Is The amphibian tree of life really fatally flawed?

Wiens (2007, Q. Rev. Biol. 82, 55-56) recently published a severe critique of Frost et al.'s (2006, Bull. Am. Mus. Nat. Hist. 297, 1-370) monographic study of amphibian systematics, concluding that it is a disaster and recommending that readers simply ignore this study. Beyond the hyperbole, Wiens raised four general objections that he regarded as fatal flaws: (1) the sampling design was insufficient for the generic changes made and taxonomic changes were made without including all type species; (2) the nuclear gene most commonly used in amphibian phylogenetics, RAG-1, was not included, nor were the morphological characters that had justified the older taxonomy; (3) the analytical method employed is questionable because equally weighted parsimony assumes that all characters are evolving at equal rates; and (4) the results were at times clearly erroneous, as evidenced by the inferred non-monophyly of marsupial frogs. In this paper we respond to these criticisms. In brief: (1) the study of Frost et al. did not exist in a vacuum and we discussed our evidence and evidence previously obtained by others that documented the non-monophyletic taxa that we corrected. Beyond that, we agree that all type species should ideally be included, but inclusion of all potentially relevant type species is not feasible in a study of the magnitude of Frost et al. and we contend that this should not prevent progress in the formulation of phylogenetic hypotheses or their application outside of systematics. (2) Rhodopsin, a gene included by Frost et al. is the nuclear gene that is most commonly used in amphibian systematics, not RAG-1. Regardless, ignoring a study because of the absence of a single locus strikes us as unsound practice. With respect to previously hypothesized morphological synapomorphies, Frost et al. provided a lengthy review of the published evidence for all groups, and this was used to inform taxonomic decisions. We noted that confirming and reconciling all morphological transformation series published among previous studies needed to be done, and we included evidence from the only published data set at that time to explicitly code morphological characters (including a number of traditionally applied synapomorphies from adult morphology) across the bulk of the diversity of amphibians (Haas, 2003, Cladistics 19, 23-90). Moreover, the phylogenetic results of the Frost et al. study were largely consistent with previous morphological and molecular studies and where they differed, this was discussed with reference to the weight of evidence. (3) The claim that equally weighted parsimony assumes that all characters are evolving at equal rates has been shown to be false in both analytical and simulation studies. (4) The claimed strong support for marsupial frog monophyly is questionable. Several studies have also found marsupial frogs to be non-monophyletic. Wiens et al. (2005, Syst. Biol. 54, 719-748) recovered marsupial frogs as monophyletic, but that result was strongly supported only by Bayesian clade confidence values (which are known to overestimate support) and bootstrap support in his parsimony analysis was < 50%. Further, in a more recent parsimony analysis of an expanded data set that included RAG-1 and the three traditional morphological synapomorphies of marsupial frogs, Wiens et al. (2006, Am. Nat. 168, 579-596) also found them to be non-monophyletic.Although we attempted to apply the rule of monophyly to the naming of taxonomic groups, our phylogenetic results are largely consistent with conventional views even if not wth the taxonomy current at the time of our writing. Most of our taxonomic changes addressed examples of non-monophyly that had previously been known or suspected (e.g., the non-monophyly of traditional Hyperoliidae, Microhylidae, Hemiphractinae, Leptodactylidae, Phrynobatrachus, Ranidae, Rana, Bufo; and the placement of Brachycephalus within Eleutherodactylus, and Lineatriton within Pseudoeurycea), and it is troubling that Wiens and others, as evidenced by recent publications, continue to perpetuate recognition of non-monophyletic taxonomic groups that so profoundly misrepresent what is known about amphibian phylogeny. (C) The Willi Hennig Society 2007.

Envenomation by scorpion in dog: case report

A case admitted at the Small Animals Clinics Service, Veterinary Hospital, FMVZ - UNESP, in May, 1999 is described. A Brazilian Terrier dog, 3 years and 3 months old, weighing 1.7 kg was brought after 2 hours and a half from contact with a scorpion (Tityus bahiensis). The dog showed vocalization inserted with drowsiness. Physical examination showed slightly hyperemic mucous, pain, agressiveness, tachypnea, tachycardia, and discrete erythema on the right forelimb palmar face. An anesthetic block was performed around the stung area using 2% lidocaine hydrochloride without vasoconstrictor (10mL). The animal was asymptomatic, after 24 h treatment.

Myxomycetes sobre inflorescências e folhas vivas de lírio-do-brejo (Hedychium coronarium Koenig, Zingiberaceae): registro de um novo substrato

A ocorrência de Myxomycetes sobre plantas vivas de Hedychium coronarium Koenig foi registrada nos Municípios de Botucatu (22o52 S e 48o26 W) e Itatinga (23o08 S e 48o38 W), São Paulo, região Sudeste do Brasil. Foram encontrados esporóforos sobre brácteas florais, restos de flores e sobre folhas adjacentes às inflorescências em plantas vivas, evidenciando ser este um ambiente favorável ao desenvolvimento de Myxomycetes. Cinco espécies foram encontradas: Didymium bahiense Gottsb., D. nigripes (Link) Fr. (Didymiaceae), Physarum compressum Alb. & Schwein., P. pusillum (Berk. & M. A. Curtis) G. Lister (Physaraceae) e Arcyria cinerea (Bull.) Pers. (Arcyriaceae). Todas podem ser consideradas espécies florícolas, embora haja registros mais freqüentes de sua ocorrência sobre componentes da serapilheira. Este é o primeiro relato da ocorrência de Myxomycetes neste tipo de microhabitat para o Brasil.

CARACTERÍSTICAS DE QUALIDADE do CONTRAFILÉ (m. L. dorsi) DE TOUROS JOVENS da RAÇA NELORE

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Efeito do alecrim na defumação da carne de rã (Rana catesbeiana): características sensoriais, composição e rendimento

Este trabalho avaliou o efeito do alecrim na qualidade da carne de rã (Rana catesbeiana) defumada, por meio da análise das características sensoriais, da composição centesimal e do rendimento. Após o abate e a evisceração, as carcaças foram imersas em solução de salmoura (20%) numa proporção de 2:1 (volume da salmoura/peso). Posteriormente, elas foram banhadas em azeite e defumadas a uma temperatura de 50 a 90 °C. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, com 2 tratamentos (T1 = Carcaça de rã defumada com alecrim; T2 = Carcaça de rã defumada sem alecrim) com 16 repetições. Na análise estatística, foi utilizado o programa SAEG 2004, com 5% de significância. As carcaças defumadas apresentaram valores médios de proteína bruta (28,39%), lipídios totais (5,13%) e cinzas (2,79%) superiores comparados aos das carcaças in natura (23,41; 2,29 e 0,85%). Não houve efeito significativo do alecrim na composição centesimal. A carcaça de rã defumada com alecrim apresentou melhor aceitação quanto ao aroma. Nas demais características sensoriais, a presença do alecrim não interferiu nos resultados. A carne de rã pode ser defumada com e sem alecrim, sem interferir na aceitabilidade do produto.

Efeito da utilização de diferentes diluidores para a produção in vitro de embriões bovinos

Objetivou-se avaliar as características morfológica e funcional do sêmen bovino congelado comparando-se a eficácia de dois diferentes diluidores. O ejaculado de quatro touros foi dividido em duas partes iguais, uma submetida ao diluidor Tris e gema de ovo (A) e outra ao diluidor à base de lecitina de soja (Andromed®) (B). No experimento I, cinco palhetas dos diluidores A e B de cada touro foram descongeladas e avaliadas quanto à motilidade, vigor, concentração, morfologia espermática e teste de termor-resistência lento. Foram feitas, ainda, avaliação da integridade de membranas, por meio da associação das sondas iodeto de propídio, isotiocionato de fluoresceína - Pisum sativum e carbocianina catiônica lipofílica, e avaliação funcional da membrana plasmática com teste hiposmótico. A avaliação da integridade da cromatina foi realizada pelo método de coloração com laranja de acridina. No experimento II, o sêmen com os diferentes diluidores foi utilizado na fecundação in vitro, sendo observadas taxas de clivagem e desenvolvimento embrionário in vitro. em relação aos resultados obtidos, apenas a porcentagem de espermatozoides no sêmen congelado foi discretamente maior com o diluidor A, concluindo-se que o diluidor composto por lecitina de soja pode substituir o composto por Tris e gema de ovo, respeitando-se as variações individuais de cada touro utilizado no presente experimento.

Miocardite chagásica em caninos no Estado do Rio Grande do Sul

Neste trabalho, são relatados dois casos de morte súbita por doença de Chagas aguda em caninos da zona rural de Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brasil. Os cães, um macho Pit Bull com nove meses (canino 1) e uma fêmea Labrador Retriever com dois anos (canino 2), morreram em janeiro de 2005 e maio de 2008, respectivamente. As necropsias revelaram aumento cardíaco em ambos os casos. O coração do canino 2 apresentou formato globoso com múltiplas áreas pálidas na musculatura cardíaca, mais evidentes no ventrículo direito e câmaras cardíacas dilatadas, principalmente as da direita. Ao exame histológico, ambos os casos apresentaram alterações semelhantes caracterizadas por infiltrado inflamatório difuso não-purulento acentuado, predominantemente linfocitário intersticial. Nas fibras miocárdicas, havia grande número de pseudocistos, repletos de formas amastigotas do Trypanosoma cruzi. Ao teste sorológico TESA-blot, amostra do canino 2 foi positiva para anticorpos IgM e IgG anti-T.cruzi, achado característico da fase aguda da miocardite chagásica. Os resultados indicam que a doença de Chagas deve ser investigada em casos de morte súbita em cães na região Sul do Brasil e que a espécie pode servir como reservatório e sentinela da doença em humanos.

Afecções ortopédicas dos membros pélvicos em cães: estudo retrospectivo

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Perfil em SDS-PAGE das proteínas do plasma seminal e sua relação com a congelabilidade do sêmen de touros doadores da raça gir

Foram utilizados dez animais doadores de sêmen em nível de Central de Inseminação Artificial, da raça Gir, divididos em dois grupos, de acordo com o grau de congelabilidade do sêmen de cada animal. Os animais com sêmen de alta congelabilidade foram aqueles cuja porcentagem de ejaculados viáveis pós-descongelação foi superior a 80%. O grupo de baixa congelabilidade tinha animais com porcentagem menor que 50% de ejaculados viáveis pós-descongelação. Os critérios de avaliação da viabilidade do sêmen e seleção dos animais foram definidos pelo controle de qualidade do Departamento de Produção da Central de Inseminação Artificial. Foram feitas quatro coletas semanais consecutivas, sendo que obtiveram-se as amostras de plasma seminal por centrifugação a 1.500 g por 15 a 20 minutos a 4°C, momentos após a coleta do sêmen em vagina artificial. O plasma seminal foi dialisado em membrana de celulose, em tampão Tris-Glicina pH-7,4 por 24 horas a 4°C, em agitação lenta e constante. As amostras foram padronizadas em 1,0 mg/ml de proteína total, por diluição em tampão Tris-HCl 62mM pH-6,2 mais 20% de glicerol e 4% de SDS. Através de eletroforese do tipo SDS-PAGE, foram feitas as corridas em gel a 13%. A corrida foi feita com a constante de 25 mA, por um período de 5 horas. A coloração do gel foi feita por Coomassie Brilliant Blue. Pelos resultados obtidos, verificou-se que existe uma banda no grupo de alta congelabilidade, cujo fragmento polipeptídico desta proteína tem Mr (mobilidade relativa) 20,3 e PM (peso molecular) aproximado de 61.800 Da. Esta banda não foi detectada nas amostras do grupo de baixa congelabilidade, o que sugere ser um possível marcador bioquímico quanto ao potencial de criopreservação do sêmen de bovinos.

Testosterone concentration in a bovine Bos indicus with bilateral varicocele: case report

Um reprodutor bovino, Bos indicus, com varicocele bilateral detectado por palpação e ultra-sonografia foi acompanhado por um período de 24 meses quanto à biometria testicular, valores espermáticos e concentração de testosterona comparados entre as estações do ano e outros animais da mesma espécie. As alterações morfológicas dos defeitos maiores e menores não variaram entre o touro com a patologia e os demais touros, no entanto, durante o verão o touro com varicocele apresentou maior percentual de defeitos totais se comparado aos demais touros da mesma espécie (49,86%±6,9 e 27,91%±2,9). O animal apresentou maior percentual de defeitos maiores no verão se comparado às outras estações do ano. Os achados de necrópsia confirmaram o diagnóstico clínico. Pode-se concluir que esta patologia, caracterizada por trombose nos vasos do cordão espermático, comprometeu a termoregulação determinando degeneração testicular severa. O aumento das concentrações de testosterona sérica sugerem a diminuição da retenção de esteroides nos testículos pelo plexo pampiniforme, a produção espermática estava anormal.

Evaluation of nine microsatellite loci and misidentification paternity frequency in a population of Gyr breed bovines

Erros de identificação de paternidade são prejudiciais por reduzir o ganho genético anual e comprometer um programa eficiente de melhoramento genético. O objetivo principal deste trabalho foi avaliar o potencial de uso de nove microssatélites em testes de paternidade e investigar a freqüência de erro de identificação de famílias de um rebanho de animais da raça Gir. No experimento foram utilizadas amostras de sangue de quarenta famílias (touro/ vaca/ bezerro) de animais da raça Gir, Puros de Origem e registrados na Associação Brasileira dos Criadores de Zebu (ABCZ). A maior parte dos microssatélites avaliados neste trabalho são recomendados, para Testes de Paternidade em bovinos, pela Sociedade Internacional de Genética Animal (ISAG). As regiões microssatélites TGLA122, TGLA126, BM1824, BMS2533, SPS115, ETH3, ETH10, ETH225 e POTCHA foram amplificadas por meio da técnica de PCR. Os produtos da amplificação foram separados por eletroforese em gel de poliacrilamida desnaturante. A partir dos dados obtidos foram calculadas as freqüências alélicas, diversidade gênica, conteúdo de polimorfismo informativo e probabilidade de exclusão para cada microssatélite. Também foram calculadas as freqüências genotípicas, heterozigosidade, probabilidade de exclusão combinada e probabilidade de Paternidade nas famílias consideradas. A probabilidade de exclusão combinada para todos os microssatélites estudados foi de 0,9789. Os resultados dos testes de paternidade acusaram erro de identificação em onze das 40 famílias estudadas, ou seja, 27,5% da amostra. A probabilidade de paternidade variou entre 0,8691 e 0,9999, com valor médio de 0,9512.

Avaliação do comportamento sexual em touros Nelore: comparação entre os testes da libido em curral e do comportamento sexual a campo

Objetivou-se determinar a eficiência do teste da libido realizado em curral em comparação ao teste realizado a campo e relacioná-los à taxa de gestação em estação de monta de 120 dias. Treze touros aptos à reprodução foram submetidos ao teste da libido em curral por 3 horas. Desses touros, nove foram submetidos à avaliação a campo na proporção touro:vaca de 1:33. A cada 21 dias, foi diagnosticada a gestação por meio de avaliações ultra-sonográficas. No teste em curral, observou-se que, quanto maior o tempo, maiores foram os escores de classificação e que nenhum touro efetuou serviço completo nos 10 minutos iniciais do teste. Com um touro classificado como muito bom obteve-se 84,80% de prenhez, porém touros questionáveis proporcionaram taxas de prenhez de 86,67 e 96,55% ao final da estação. As correlações entre características físicas e morfológicas do sêmen mantiveram-se próximas de zero ou foram nulas. Os principais sinais fisiológicos do comportamento sexual foram o ato de cheirar ou lamber o corpo da fêmea, cheirar ou lamber a vulva, seguidos ou não por reflexo de Flehmen. em animais da raça Nelore, o tempo de 30 minutos de observação mostrou-se mais eficiente para a realização do teste da libido em curral. O teste da libido realizado a campo no período diurno não foi eficaz em predizer a libido de todos os animais estudados, em decorrência, provavelmente, do comportamento sexual noturno de alguns reprodutores.

Relação da taxa de gestação com sêmen bovino congelado e testes de avaliação espermática in vitro

Avaliou-se a relação entre os testes complementares (teste hiposmótico, teste de termorresistência lento e teste de reação acrossômica) e os testes de avaliações convencionais (aspectos físicos e morfológicos) de sêmen bovino congelado/descongelado e os índices de prenhez. Os valores médios da motilidade espermática progressiva retilínea avaliados pelo teste de termorresistência foram de 53,48 (pós-descongelamento), 43,69 (60 minutos), 35,88 (120 minutos) e 33,04% (180 minutos) e a porcentagem de células reativas ao teste hiposmótico foi de 37,89%. Correlação positiva e de média intensidade foi encontrada para a motilidade espermática progressiva retilínea pós-descongelamento e o teste hiposmótico (0,21). Entretanto, a correlação da motilidade aos 180 minutos com o teste hiposmótico foi alta (0,64). A porcentagem de células que tiveram acrossoma reagido pós-descongelamento foi de 9,85%, apresentando correlações negativas de média e alta intensidade (-0,25 e -0,46, respectivamente) com a motilidade espermática progressiva retilínea pós-descongelamento e após 3 horas de incubação. Não houve correlação dos testes complementares e da motilidade pós-descongelamento com a taxa de gestação. Nenhum parâmetro considerado isoladamente serviu para avaliar a capacidade fertilizante do sêmen congelado/descongelado.

Genetic evaluation of the probability of pregnancy at 14 months for Nellore heifers

To estimate the heritability for the probability that yearling heifers would become pregnant, we analyzed the records of 11,487 Nellore animals that participated in breeding seasons at three farms in the Brazilian states of São Paulo and Mato Grosso do Sul. All heifers were exposed to a bull at the age of about 14 mo. The probability of pregnancy was analyzed as a categorical trait, with a value of 1 (success) assigned to heifers that were diagnosed pregnant by rectal palpation about 60 d after the end of the breeding season of 90 d and a value of 0 (failure) assigned to those that were not pregnant at that time. The estimate of heritability, obtained by Method 9, was 0.57 with standard error of 0.01. The EPD was predicted using a maximum a posteriori threshold method and was expressed as deviations from 50% probability. The range in EPD was -24.50 to 24.55%, with a mean of 0.78% and a SD of 7.46%. We conclude that EPD for probability of pregnancy can be used to select heifers with a higher probability of being fertile. However, it is mainly recommended for the selection of bulls for the production of precocious daughters because the accuracy of prediction is higher for bulls, depending on their number of daughters.

GENETIC-RELATIONSHIP, INBREEDING AND GENERATION INTERVAL IN REGISTERED GIR CATTLE IN BRAZIL

Two-hundred random pedigrees of cows and fifty of sires born in 1987 from the Gir herdbook of the Brazilian Association of Zebu Breeders were analized. The bull Chave de Ouro DGR no. 2851 was the most influential animal with a 7 % direct relationship to the breed. Total average inbreeding was 3.62 and 3.25 for the female and male sample, respectively. The subdivision of total inbreeding into current and non-current components resulted in values of 1.62, 1.25, 2.00 and 2.00 for the female and male sample, respectively. Long-term inbreeding was the principal component of non-current inbreeding, with values of 1.52 % and 1.26 %, respectively. Inbreeding due to strain formation strain due formation was less important (0.48 % and 0.74 %, respectively). The average generation interval was 8.02 years. The breed appears not yet to be subdivided into strains but this process may be starting. The average generation interval for the pedigree population was very high. Culling of old bulls could decrease this interval.