Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource

O café é um dos principais produtos agrícolas, sendo considerado o segundo item em importância do comércio internacional de commodities. O gênero Coffea pertence à família Rubiaceae que também inclui outras plantas importantes. Este gênero contém aproximadamente 100 espécies, mas a produção comercial é baseada somente em duas espécies, Coffea arabica e Coffea canephora, que representam aproximadamente 70 % e 30 % do mercado total de café, respectivamente. O Projeto Genoma Café Brasileiro foi desenvolvido com o objetivo de disponibilizar os modernos recursos da genômica à comunidade científica e aos diferentes segmentos da cadeia produtiva do café. Para isso, foram seqüenciados 214.964 clones escolhidos aleatoriamente de 37 bibliotecas de cDNA de C. arabica, C. canephora e C. racemosa representando estádios específicos do desenvolvimento de células e de tecidos do cafeeiro, resultando em 130.792, 12.381 e 10.566 seqüências de cada espécie, respectivamente, após processo de trimagem. Os ESTs foram agrupados em 17.982 contigs e em 32.155 singletons. A comparação destas seqüências pelo programa BLAST revelou que 22 % não tiveram nenhuma similaridade significativa às seqüências no banco de dados do National Center for Biotechnology Information (de função conhecida ou desconhecida). A base de dados de ESTs do cafeeiro resultou na identificação de cerca de 33.000 unigenes diferentes. Os resultados de anotação das seqüências foram armazenados em base de dados online em http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe. Os recursos desenvolvidos por este projeto disponibilizam ferramentas genéticas e genômicas que podem ser decisivas para a sustentabilidade, a competitividade e a futura viabilidade da agroindústria cafeeira nos mercados interno e externo.

Effect of steeping conditions (sulfur dioxide, lactic acid, and temperature) on starch yield, starch quality, and germ quality from the Intermittent Milling and Dynamic Steeping process (IMDS) for a Brazilian corn hybrid

Effect of lactic acid, SO2, temperature, and their interactions were assessed on the dynamic steeping of a Brazilian dent corn (hybrid XL 606) to determine the ideal relationship among these variables to improve the wet-milling process for starch and corn by-products production. A 2x2x3 factorial experimental design was used with SO2 levels of 0.05 and 0.1% (w/v), lactic acid levels of 0 and 0.5% (v/v), and temperatures of 52, 60, and 68degreesC. Starch yield was used as deciding factor to choose the best treatment. Lactic acid added in the steep solution improved the starch yield by an average of 5.6 percentage points. SO2 was more available to break down the structural protein network at 0.1% than at the 0.05% level. Starch-gluten separation was difficult at 68degreesC. The lactic acid and SO2 concentrations and steeping temperatures for better starch recovery were 0.5, 0.1, and 52degreesC, respectively. The Intermittent Milling and Dynamic Steeping (IMDS) process produced, on average, 1.4% more starch than the conventional 36- hr steeping process. Protein in starch, oil content in germ, and germ damage were used as quality factors. Total steep time can be reduced from 36 hr for conventional wet-milling to 8 hr for the IMDS process.

Causes of death of thoroughbred racehorses at Octavio Dupont Veterinary Hospital, Brazilian Jockey Club, Rio de Janeiro

Existem poucas pesquisas que abordam estudos epidemiológicos de mortes em cavalos de corrida de uma forma ampla. A maioria restringe-se a uma afecção ou procedimento específico. O Brasil não possui um programa de monitoramento de mortes instituído. Através de um estudo descritivo em associação a metodologia multivariada de análise, realizou-se um estudo epidemiológico de causa mortis relacionadas com afecções musculosqueléticas (MS), gastrointestinais (GI), sistema respiratório (RES), neurológico (NEU) e mortes súbitas (SD) durante os anos de 2002 a 2008 no Hospital Octavio Dupont, Rio de Janeiro. Os machos representaram o sexo mais afetado e a causa mortis relacionada com a taxa geral de mortalidade por grandes grupos de causas determinadas apresentou a seguinte ordem decrescentemente: MS>GI>SD>NEU>RES. A maioria dos óbitos registrados foi de cavalos na faixa etária de quatro a cinco anos (ID4-ID5). Seguidamente, observaram-se as seguintes relações de correspondência: (Triênio = SM-ID>5-SD; ID>5-GI; ID4-5-MS; SF-ID<4-RES/NEU); (Quatriênio = SM - ID>5 - GI; SF - ID<4 - NEU; ID4-5 - MS; GI - ID>5). O presente estudo aponta a importância e necessidade de estudos epidemiológicos sobre lesões em cavalos atletas, objetivando o diagnostico, reconhecimento de fatores predisponentes e prevenção.

Dunging gutters filled with fresh water in finishing barns had no effect on the prevalence of Salmonella enterica on Brazilian swine farms

Our aim was to assess the importance of dunging gutters filled with water in finishing barns for the prevalence of pigs shedding Salmonella enterica. Some finishing barns in Brazil are provided with a dunging-gutter system which consists of a continuous water flow at the back of solid-floored adjacent pens. Because there is transfer of faecal material between adjacent pens by water in this system and the faecal-oral route of transmission is so important for enteric pathogens, we tested the hypothesis that the presence of this kind of dunging-gutter system in finishing barns affects the prevalence of slaughter-age pigs shedding salmonella organisms in their faeces. The cross-sectional study was conducted on six farms each having barns with and barns without a dunging-gutter system. Breeding, management, nutritional and seasonal factors were similar in both barns on each farm. The two systems did not differ in prevalence of pigs shedding salmonella organisms. Five S. enterica scrotypes were isolated: S. Agona, S. Javiana, S. Rissen, S. Sandiego and S. Senftenberg. (C) 2002 Elsevier B.V. B.V. All rights reserved.

Hemangiosarcoma of the nictitant membrane in a Brazilian Fila dog: case report

Relata-se o caso de um cão, macho, da raça Fila Brasileiro, com nove anos de idade, acometido por neoformação tecidual na membrana nictitante do olho direito, com cerca de quatro meses de evolução. Realizou-se exame oftálmico rotineiro, a partir do qual se notaram hiperemia e edema conjuntivais, secreção ocular serossangüinolenta e neoformação saliente na conjuntiva da membrana nictitante. Realizou-se a exérese cirúrgica da neoformação. À histopatologia, encontraram-se células endoteliais pouco diferenciadas e pleomórficas que originavam intensa neoformação vascular, compatíveis com hemangiossarcoma da membrana nictitante.

Transient bilateral diabetic cataracts in a Brazilian Terrier puppy

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

A revision of the genus Pulaeus Den Heyer, with descriptions of a new genus and four new Brazilian species (Acari: Prostigmata: Cunaxidae)

A new genus, Lupaeus gen. nov., is created to contain part of the described species in the genus Pulaeus Den Heyer. A key to the genera of the tribe Pulaeini, to which these two genera belong, and one auxiliary key to the species of Brazil and South Africa, are provided. Four new species, viz. Pulaeus myrtaceus sp. nov., P. quadrisolenidius sp. nov., Lupaeus lectus sp. nov. and L. lobidorsalis sp. nov. are described and figured. P. martini Den Heyer, 1981 is designated as type species for the new genus. New nomenclatural combinations are reported.

Morphological characterisation of five brazilian species of Fidicinoides (Hemiptera: Cicadidae)

The objective of this study was to describe and illustrate the morphological characteristics of some species of Brazilian Fidicinoides to aid in their identification. Descriptions and illustrations are given of the head, thorax, abdomen, right forewing and the last urostemite of the male of the Fidicinoides besti, Fidicinoides brunnea, Fidicinoides duckensis, Fidicinoides pseudethelae and Fidicinoides sucinalae species. The main diagnostic characteristics of these species are markings on pronotum and/or mesonotum and male stemite VIII characteristics.

Mite diversity on plants of different families found in the Brazilian Atlantic Forest

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Helminthological screening of free-ranging grey brocket deer Mazama gouazoubira Fischer, 1817 (Cervidae: Odocoileini) from Brazilian Pantanal wetlands, with considerations on Pygarginema verrucosa (Molin, 1860) Kadenatzii, 1948 (Spirocercidae: Ascaropsinae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Habitat use, reproductive traits and social interactions in a stream-dweller treefrog endemic to the Brazilian Cerrado

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Cryptic lineages and Pleistocene population expansion in a Brazilian Cerrado frog

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Interaction between breeding habitat and elevation affects prevalence but not infection intensity of Batrachochytrium dendrobatidis in Brazilian anuran assemblages

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Detection of Ehrlichia chaffeensis in Brazilian marsh deer (Blastocerus dichotomus)

Ehrlichia chaffeensis was detected for the first time in blood samples from Brazilian marsh deers (Blastocerus dichotomus) captured in the marshes of Parana River in Southeast Brazil in 1998. Seven EDTA-blood samples from deers were analyzed by PCR and nested PCR for presence of Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia ewingii, Ehrlichia canis, Neoriickettsia risticii, Anaplasma phagocytophilum and Anaplasma marginale. Three samples showed positive reactions for E. chaffeensis and Anaplasma marginale. None contained detectable A. phagocytophilum, E. ewingii, E. canis or Neorickettsia risticii DNA. In Brazil, the wild marsh deer may be a natural reservoir of the agents that cause human monocytotropic ehrlichiosis and ruminant erythrocytic anaplasmosis. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Serosurvey of selected avian pathogens in brazilian commercial Rheas (Rhea americana) and Ostriches (Struthio camelus)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)