Genetic evaluation using multi-trait and random regression models in Simmental beef cattle

The Brazilian Association of Simmental and Simbrasil Cattle Farmers provided 29,510 records from 10,659 Simmental beef cattle; these were used to estimate (co)variance components and genetic parameters for weights in the growth trajectory, based on multi-trait (MTM) and random regression models (RRM). The (co)variance components and genetic parameters were estimated by restricted maximum likelihood. In the MTM analysis, the likelihood ratio test was used to determine the significance of random effects included in the model and to define the most appropriate model. All random effects were significant and included in the final model. In the RRM analysis, different adjustments of polynomial orders were compared for 5 different criteria to choose the best fit model. An RRM of third order for the direct additive genetic, direct permanent environmental, maternal additive genetic, and maternal permanent environment effects was sufficient to model variance structures in the growth trajectory of the animals. The (co)variance components were generally similar in MTM and RRM. Direct heritabilities of MTM were slightly lower than RRM and varied from 0.04 to 0.42 and 0.16 to 0.45, respectively. Additive direct correlations were mostly positive and of high magnitude, being highest at closest ages. Considering the results and that pre-adjustment of the weights to standard ages is not required, RRM is recommended for genetic evaluation of Simmental beef cattle in Brazil. ©FUNPEC-RP.

Study of pK Values and Effective Dielectric Constants of Ionizable Residues in Pentapeptides and in Staphylococcal Nuclease (SNase) Using a Mean-Field Approach

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Bright solitons in a quasi-one-dimensional reduced model of a dipolar Bose-Einstein condensate with repulsive short-range interactions

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Random regression models to estimate genetic parameters for milk production of Guzerat cows using orthogonal Legendre polynomials

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Explorando abordagens de aprendizado sequencial para floresta de caminhos ótimos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Persistência na lactação para vacas da raça Holandesa criadas no Estado do Rio Grande do Sul via modelos de regressão aleatória

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Predição de valores genéticos para a produção de leite no dia do controle e para a produção acumulada até 305 dias

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estimação de parâmetros genéticos para peso em diferentes idades para animais da raça Tabapuã

Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento aos 570 dias de idade para 35.308 animais da raça Tabapuã, nascidos entre 1975 e 2000, pertencentes à ABCZ (Associação Brasileira de Criadores de Zebu) sob três modelos distintos. O modelo 1 incluiu o efeito genético aditivo direto como aleatório, além dos efeitos fixos de grupo de contemporâneos, definido pelas variáveis: proprietário, rebanho, criador, rebanho do criador, sexo, condição de criação, ano e mês de nascimento, ano e mês da pesagem, e os efeitos linear e quadrático de idade do bezerro e idade da vaca ao parto como covariáveis. O modelo 2 compreendeu, além dos efeitos supracitados, o efeito de ambiente permanente materno. O modelo 3 constou dos efeitos genético aditivo direto e materno e de ambiente permanente materno (aleatórios) e os mesmos incluídos no modelo 1 (fixos). de acordo com o teste de razão de verossimilhança, o modelo 3 foi o mais adequado para ajustar os efeitos estudados. As estimativas de herdabilidade direta foram baixas a moderadas (0,08 a 0,26), decrescendo do nascimento às idades subseqüentes, com picos aos 90 e aos 180 dias de idade. Aos 345 dias de idade, ocorreu novo aumento nas estimativas, com menor oscilação entre as estimativas subseqüentes até 570 dias de idade. As estimativas de herdabilidade materna foram baixas, sendo maiores no período da desmama.

Dois critérios de seleção na pré-desmama em bovinos da raça Gir. 1. Estimativas de parâmetros genéticos

Dados de 16.592 animais da raça Gir, provenientes do controle de desenvolvimento ponderal da Associação Brasileira dos Criadores de Zebu, nascidos no período de 1978 a 1994, criados em diversas condições de ambiente no Brasil, foram usados para estimar parâmetros genéticos e ambientais das características ganho médio diário do nascimento à desmama (GMD) e dias para atingir 160 kg do nascimento à desmama (D160). As estimativas dos componentes de variância e herdabilidade foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita por modelos animais uni-característica. Foram utilizados dois modelos o modelo 1, com grupo de contemporâneos (GC) como efeito fixo e com efeitos genético aditivo de animal e materno, efeito de ambiente permanente materno e erro como aleatórios; e modelo 2, com os mesmos efeitos do modelo 1, mas com covariância genética entre os efeitos direto e materno igual a zero (sigmaam=0). As estimativas de herdabilidade, utilizando-se o Modelo 1, foram iguais a 0,11; 0,04; 0,11 e 0,07 para GMD (efeito direto), GMD (efeito materno), D160 (efeito direto) e D160 (efeito materno), respectivamente. Para o Modelo 2, as estimativas de herdabilidade foram: 0,12; 0,05; 0,10 e 0,05 para GMD (efeito direto), GMD (efeito materno), D160 (efeito direto) e D160 (efeito materno). A diferença entre os modelos pela não inclusão da estrutura de covariância entre os efeitos direto e materno (sigmaam=0), neste trabalho, não foi significativa. A contribuição da variância residual (como porcentagem da variação fenotípica total) foi de 76% para GMD e de 80% para D160, para os dois modelos, indicando a necessidade da melhoria do ambiente de criação, assim como a padronização e formação de lotes de manejo, o que reflete na possibilidade de melhor definição de grupo de contemporâneos.

Photoinduced orientation in natural rubber

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Infant formula and enamel fluorosis A systematic review

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

The effect of refuge on Dermestes ater (Coleoptera : Dermestidae) predation on Musca domestica (Diptera : Muscidae): Refuge for prey or the predator?

It is believed that habitat heterogeneity can change the extent of predator-prey interactions. Therefore, in this study we examined the effect of habitat heterogeneity (characterized here as an addition of refuge) on D. ater predation on M. domestica. Predation of D. ater on M. domestica larvae was carried out in experimental habitats with and without refuge, and examined at different prey densities. The number of prey eaten by beetles over 24 h of predator-prey interaction was recorded, and we investigated the strength of interaction between prey and predator in both experimental habitats by determining predator functional response. The mean number of prey eaten by beetles in the presence of refuge was significantly higher than in the absence of refuge. Females had greater weight gains than males. Logistic regression analyses revealed the type II functional response for both experimental habitats, even though data did not fit well into the random predator model. Results suggest that the addition of refuge in fact enhanced predation, as prey consumption increased in the presence of refuge. Predators kept in the presence of refuge also consumed more prey at high prey densities. Thus, we concluded that the addition of refuge was an important component mediating D. ater-M. domestica population interactions. Refuge actually acted as a refuge for predators from prey, since prey behaviors detrimental to predators were reduced in this case.

Bright solitons in coupled defocusing NLS equation supported by coupling: Application to Bose-Einstein condensation

We demonstrate the formation of bright solitons in coupled self-defocusing nonlinear Schrodinger (NLS) equation supported by attractive coupling. As an application we use a time-dependent dynamical mean-field model to study the formation of stable bright solitons in two-component repulsive Bose-Einstein condensates (BECs) supported by interspecies attraction in a quasi one-dimensional geometry. When all interactions are repulsive, there cannot be bright solitons. However, bright solitons can be formed in two-component repulsive BECs for a sufficiently attractive interspecies interaction, which induces an attractive effective interaction among bosons of same type. (c) 2005 Elsevier B.V. All rights reserved.

Bose-Einstein condensation thermodynamics of a trapped gas with attractive interaction

We study the Bose-Einstein condensation of an interacting gas with attractive interaction confined in a harmonic trap using a semiclassical two-fluid mean-field model. The condensed state is described by the converged numerical solution of the Gross-Pitaevskii equation. By solving the system of coupled equations of this model iteratively we obtain the converged results for the temperature dependencies of the condensate fraction, chemical potential, and internal energy for the Bose-Einstein condensate of Li-7 atoms. (C) 2000 Elsevier B.V. B.V. All rights reserved.

Josephson oscillation of a superfluid Fermi gas

Using the complete numerical solution of a time-dependent three-dimensional rnean-field model we study the Josephson oscillation of a superfluid Fermi gas (SFG) at zero temperature formed in a combined axially-symmetric harmonic plus one-dimensional periodic optical-lattice (OL) potentials after displacing the harmonic trap along the axial OL axis. We study the dependence of Josephson frequency on the strength of the OL potential. The Josephson frequency decreases with increasing strength as found in the experiment of Cataliotti et al. [Science 293, 843 (2001)] for a Bose-Einstein condensate and of the experiment of Pezze et al. [Phys. Rev. Lett. 93, 120401 (2004)] for an ideal Fermi gas. We demonstrate a breakdown of Josephson oscillation in the SFG for a large displacement of the harmonic trap. These features of Josephson oscillation of a SFG can be tested experimentally.