Factors affecting rhamnolipids production by Pseudomonas aeruginosa LBI

This paper presents the results from study investigating the capacity of Pseudomonas aeruginosa LBI growing on several carbon (Hydrophilic substrate) and nitrogen sources. The carbon source (2016) studied were: glycerol, manitol, fructose, glucose, lactose and the nitrogen sources (2; 3; 4 and 5016) were: NaNO3, NH4NO3, (NH4)(2)SO4 and (NH2)(2)CO. At the 96 h of fermentation, the medium with glycerol as a carbon source reached 7.9 g/L of rhamnolipids and 1. 2 g/L cellular protein. The surface tension reduction was 38.46 % for glycerol as a carbon source. The NaNO3 at 3% was the best concentration for rhamnolipids production (7.35 g/L) and cellular protein (1.12 g/L). The influences of metal ions [FeSO4.7H(2)O (0.001g/L, 0.005 g/L and 0.1 g/L) and MgSO4.7H(2)O (0.001 g/L, 0.005 g/L and 0.1 g/L)] on ramnolipids production were studied. Fe2+ had a negative influence on the studied concentrations while Mg2+ had a positive influence when its concentration was increased.

Structural insights into the catalytic mechanism of sphingomyelinases D and evolutionary relationship to glycerophosphodiester phosphodiesterases

Spider venom sphingomyelinases D catalyze the hydrolysis of sphingomyelin via an Mg2+ ion-dependent acid-base catalytic mechanism which involves two histidines. In the crystal structure of the sulfate free enzyme determined at 1.85 angstrom resolution, the metal ion is tetrahedrally coordinated instead of the trigonal-bipyramidal coordination observed in the sulfate bound form. The observed hyperpolarized state of His47 requires a revision of the previously suggested catalytic mechanism. Molecular modeling indicates that the fundamental structural features important for catalysis are fully conserved in both classes of SMases D and that the Class II SMases D contain an additional intra-chain disulphide bridge (Cys53-Cys201). Structural analysis suggests that the highly homologous enzyme from Loxosceles bonetti is unable to hydrolyze sphingomyelin due to the 95G1y -> Asn and 134Pro -> Glu mutations that modify the local charge and hydrophobicity of the interfacial face. Structural and sequence comparisons confirm the evolutionary relationship between sphingomyelinases D and the glicerophosphodiester phosphoesterases which utilize a similar catalytic mechanism. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

Structural basis for metal ion coordination and the catalytic mechanism of sphingomyelinases D

Sphingomyelinases D (SMases D) from Loxosceles spider venom are the principal toxins responsible for the manifestation of dermonecrosis, intravascular hemolysis, and acute renal failure, which can result in death. These enzymes catalyze the hydrolysis of sphingomyelin, resulting in the formation of ceramide 1-phosphate and choline or the hydrolysis of lysophosphatidyl choline, generating the lipid mediator lysophosphatidic acid. This report represents the first crystal structure of a member of the sphingomyelinase D family from Loxosceles laeta (SMase I), which has been determined at 1.75-angstrom resolution using the quick cryo-soaking technique and phases obtained from a single iodine derivative and data collected from a conventional rotating anode x-ray source. SMase I folds as an (alpha/beta)(8) barrel, the interfacial and catalytic sites encompass hydrophobic loops and a negatively charged surface. Substrate binding and/or the transition state are stabilized by a Mg2+ ion, which is coordinated by Glu(32), Asp(34), Asp(91), and solvent molecules. In the proposed acid base catalytic mechanism, His(12) and His(47) play key roles and are supported by a network of hydrogen bonds between Asp(34), Asp(52), Trp(230), Asp(233), and Asn(252).

Interfacial concentrations of chloride and bromide in zwitterionic micelles with opposite dipoles: Experimental determination by chemical trapping and a theoretical description

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Xylanase production by Aspergillus awamori under solid state fermentation conditions on tomato pomace

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

A comparative study of aquifer systems occurring at the Parana sedimentary basin, Brazil: major hydrochemical trends

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Avaliação da qualidade da água e autodepuração do ribeirão do meio, Leme (SP)

This investigation utilized hydrochemical relations to evaluate possible anthropogenic inputs at Meio Stream, São Paulo State. Realized three sampling of water during the months of February, April and July/2005, in five sampling points analyzing: discharge, temperature, turbidity, pH, electrical conductivity (EC), dissolved oxygen ( DO), TDS (total dissolved solids), TSS (total suspended solids), Ca(2+), Mg(2+), Na(+), K(+), HCO(3)(-), Cl(-), SO(4)(2-), PO(4)(3-) and NO(3)(-). The characteristics of water close to spring until Leme city allow concluding that there is a small interference in its quality, however the absence of treatment of domestic wastewater at Leme city reduced its quality. It was applied the QUAL 2K modeling to evaluate the Meio Stream auto-purification identified the auto-purification zones and indicated the necessity of secondary wastewater treatment, with 76% of efficiency.

Composição química das águas pluviais e deposição atmosférica anual na bacia do Alto Sorocaba (SP)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Photoelectrocatalytic Removal of Bromate Using Ti/TiO2 Coated as a Photocathode

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Relações solo-paisagem em topossequência de origem basáltica

Variações nos atributos do solo dependem da posição do solo na paisagem e processos de drenagem, erosão e deposição. Este estudo objetivou avaliar os atributos físicos e químicos do solo, em uma topossequência de origem basáltica, na região de Batatais (SP). A área possui relevo aplanado e altitude oscilando entre 740 m e 610 m, em região dominada por basaltos. Foi estabelecido caminhamento de 3.000 m, a partir do espigão da vertente, no seu declive mais suave. As superfícies geomórficas foram identificadas e delimitadas conforme critérios topográficos e estratigráficos, com base em intensas investigações detalhadas de campo. Foram coletadas amostras laterais aos perfis modais representativos das diversas superfícies geomórficas (S.G.) da topossequência (S.G. I = topo; S.G. II = meia encosta e sopé de transporte; S.G. III = ombro e sopé de deposição), totalizando 142 amostras. Além disto, foram abertas trincheiras, nos segmentos de vertente inseridos nas superfícies geomórficas mapeadas. As amostras coletadas foram analisadas quanto à densidade do solo, textura, bases trocáveis (Ca2+, K+ e Mg2+), soma de bases, capacidade de troca catiônica, saturação por bases, pH (água e KCl), SiO2, Al2O3, Fe2O3 (ataque por H2SO4), óxidos de Fe livres extraídos com ditionito-citrato-bicarbonato e Fe mal cristalizado extraído com oxalato de amônio. Os resultados revelaram que os solos oriundos de basalto apresentaram atributos físicos e químicos com comportamento dependente das formas do relevo. Com o uso de técnicas estatísticas multivariadas, foi possível distinguir três diferentes ambientes, que equivalem às três superfícies geomórficas.

Modelos de paisagem e susceptibilidade magnética na identificação e caracterização do solo

O conhecimento detalhado do solo e de seus atributos, ao longo da paisagem, é uma demanda permanente dos sistemas urbanos e agroindustriais, para o planejamento sustentável de uso e ocupação. O presente trabalho objetivou estudar o potencial de modelos de paisagem e susceptibilidade magnética na identificação e caracterização de latossolos, em Guariba (SP). Foram coletadas 514 amostras de solo, em 110,0 ha, às profundidades de 0,0-0,20 m e 0,60-0,80 m. Foram identificados diferentes compartimentos de paisagem, com base no modelo de superfície geomórfica e segmento de vertente. em cada compartimento de paisagem, foram abertas trincheiras, para classificação do solo. As amostras foram analisadas quanto à granulometria e atributos químicos, pH (água, CaCl2 e KCl), matéria orgânica, P extraível, K+, Ca2+, Mg2+ e H+ + Al3+. Também foram determinados os teores de SiO2, Al2O3, Fe2O3 e óxidos de Fe livres (Fe d) e pouco cristalizados (Fe o), nas amostras das trincheiras, além da susceptibilidade magnética (SM). Solos taxonomicamente iguais, porém em diferentes compartimentos da paisagem, apresentaram valores distintos, para os atributos estudados, indicando que os modelos de paisagem e a susceptibilidade magnética podem ser viáveis, como técnica de campo, para auxiliar no detalhamento da variação dos atributos do solo. A susceptibilidade magnética demonstrou ter potencial para delimitação das superfícies geomórficas mapeadas no campo, o que indica o seu potencial de uso, na identificação e caracterização de áreas mais homogêneas.

Influence of liming on residual soil respiration and chemical properties in a tropical no-tillage system

Devido às mudanças climáticas do planeta, principalmente ao aquecimento global, as formas de utilização dos solos na agricultura têm atraído grande atenção de pesquisadores. Mudanças de manejo podem influenciar a respiração do solo e, por conseguinte, alterar drasticamente o sequestro de C. Os objetivos deste trabalho foram avaliar, em semeadura direta, a influência da calagem nas emissões de CO2 do solo e correlacioná-las aos atributos químicos deste após dois anos da calagem. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados, com seis repetições. Os tratamentos constituíram de quatro doses de calcário e uma testemunha. Decorridos dois anos da calagem, avaliou-se a emissão residual de CO2 do solo, coletaram-se amostras nas camadas de 0-5, 5-10, 10-20 e 20-30 cm de profundidade e determinaram-se os teores de P, Ca2+ e Mg2+ e valores de pH e de saturação por bases. A emissão residual de CO2 do solo, quando a dose recomendada foi aplicada, foi 24,1 % superior, quando comparada à do solo sem aplicação de calcário, e 47,4 % maior, quando se aplicou o dobro da dose recomendada. A calagem melhorou as condições químicas do solo, e a emissão de CO2 aumentou linearmente com o aumento das doses. A emissão de CO2 do solo apresentou correlações positivas com os teores de P, Ca2+ e Mg2+ e com os valores de pH e de saturação por bases e negativas com os teores de H + Al e Al3+. Maiores coeficientes de correlação entre as taxas de emissão de CO2 do solo e os atributos químicos deste ocorreram na camada de 10-20 cm.

Absorção de magnésio por raízes destacadas de cultivares de tomateiro

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

ALLOSTERIC MODULATION BY ATP, CALCIUM AND MAGNESIUM-IONS OF RAT OSSEOUS PLATE ALKALINE-PHOSPHATASE

Alkaline phosphatase from rat osseous plate is allosterically modulated by ATP, calcium and magnesium at pH 7.5. At pH 9.4, the hydrolysis of ATP and PNPP follows Michaelis-Menten kinetics with K0.5 values of 154 muM and 42 muM, respectively. However, at pH 7.5 both substrates exhibit more complex saturation curves, while only ATP exhibited site-site interactions. Ca2+-ATP and Mg2+-ATP were effective substrates for the enzyme, while the specific activity of the enzyme for the hydrolysis of ATP at pH 7.5 was 800-900 U/mg and was independent of the ion species. ATP, but not PNPP, was hydrolyzed slowly in the absence of metal ions with a specific activity of 140 U/mg. These data demonstrate that in vitro and at pH 7.5 rat osseous plate alkaline phosphatase is an active calcium or magnesium-activated ATPase.

Magnetic oxides of spinel structure: Study of CoxCuyMnzO4 and MgxNiyMnzO4 manganites (x+y+z=3)

Systematic studies in manganites of spinel structure have been undertaken. We report on the magnetic properties of two particular cases, in which one of the transition metals, Mg2+ is non-magnetic (NiMgxMn2-xO4) or presents a stable oxidation state, Cu2+ (CoxCuyMnzO4, x + y + z = 3). The magnetic behaviour is described with respect to varying contents of cobalt, copper or manganese. A ferrimagnetic transition is observed at 110-120 K, which depends on the cobalt content. Presence of copper increases the coercive field by a factor of ten with respect to the parent compound NiMn2O4. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.