Scattered organization of the histone multigene family and transposable elements in Synbranchus

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Transmissable Dog Cancer Genome Reveals the Origin and History of an Ancient Cell Lineage

Canine transmissible venereal tumor (CTVT) is the oldest known somatic cell lineage. It is a transmissible cancer that propagates naturally in dogs. We sequenced the genomes of two CTVT tumors and found that CTVT has acquired 1.9 million somatic substitution mutations and bears evidence of exposure to ultraviolet light. CTVT is remarkably stable and lacks subclonal heterogeneity despite thousands of rearrangements, copy-number changes, and retrotransposon insertions. More than 10,000 genes carry nonsynonymous variants, and 646 genes have been lost. CTVT first arose in a dog with low genomic heterozygosity that may have lived about 11,000 years ago. The cancer spawned by this individual dispersed across continents about 500 years ago. Our results provide a genetic identikit of an ancient dog and demonstrate the robustness of mammalian somatic cells to survive for millennia despite a massive mutation burden.

Short interspersed CAN SINE elements as prognostic markers in canine mammary neoplasia

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Estudo da organização e mapeamento cromossômico do elemento transponível Rex1 em espécies do gênero Astyanax Baird & Girard, 1854 (Characiformes: Characidae) provenientes de diferentes bacias hidrográficas

O gênero Astyanax apresenta uma extensa variabilidade em suas fórmulas cariotípicas, as quais acompanham sua diversidade biológica. Estes dados fazem com que a taxonomia do gênero ainda seja confusa, devido à grande plasticidade fenotípica existente entre as populações e a ausência de caracteres morfológicos confiáveis para sua correta identificação. Por outro lado, a análise das sequências e distribuição cromossômica do retrotransposon Rex1 revelou pouca variabilidade. As diferenças encontradas com relação às sequências deste retrotransposon mostram que as variações podem estar associadas à distribuição geográfica das espécies, visto que as espécies mais distantes geograficamente revelaram maiores diferenças em sua composição nucleotídica. A distribuição cromossômica desse elemento mostrou-se conservada entre as espécies do gênero, com marcações dispersas pelos genomas dos mesmos, contribuindo com a ideia de que esses elementos podem se acumular em regiões genômicas específicas dentro de cada grupo de peixes, sendo que esta tendência é maior para peixes do mesmo grupo e menor para grupos diferentes. Deste modo, a ampla distribuição de Rex1 observada nas espécies estudadas sugere que esse elemento pode ter sido incorporado há muito tempo nos genomas desses peixes, e que vem desempenhando um papel importante na evolução do grupo. Ainda assim, devido à grande diversidade encontrada no gênero, mais estudos podem contribuir tanto para o melhor entendimento da taxonomia de Astyanax, como da dinâmica evolutiva dos retrotransposons no gênero e em outros grupos de peixes

Terminal-repeat retrotransposons with GAG domain in plant genomes: a new testimony on the complex world of transposable elements

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)