Caracterização de um isolado do Sugarcane mosaic virus que quebra a resistência de variedades comerciais de cana-de-açúcar

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

The 20S proteasome alpha(5) subunit of Arabidopsis thaliana carries an RNase activity and interacts in planta with the Lettuce mosaic potyvirus HcPro protein

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Caracterização da região 3'-terminal do genoma de um isolado brasileiro do Southern bean mosaic virus

O presente trabalho caracteriza a região 3'-terminal do genoma de um isolado do Southern bean mosaic virus encontrado no Estado de São Paulo (SBMV-SP). O RNA foi extraído de partículas virais purificadas e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar 972 nt da região 3'-terminal do RNA viral. Foi obtido fragmento de tamanho esperado que inclui o gene da proteína capsidial e a região 3'-terminal não codificadora. O gene da proteína capsidial (ORF4) contém 801 nucleotídeos, incluindo-se o códon de terminação UGA, com seqüência deduzida de 266 aminoácidos e massa molecular estimada de 28.800 Da. Sessenta e um aminoácidos terminais da ORF2 estão sobrepostos na ORF4. O sinal de localização nuclear, encontrado dentro do Domínio R na região 5'-terminal da ORF4 de alguns sobemovírus, não foi identificado no SBMV-SP. Esse dado pode explicar a ausência de partículas virais do SBMV-SP no núcleo celular. A seqüência do SBMV-SP apresentou identidade de nucleotídeos e aminoácidos de, respectivamente, 91% e 93% com o isolado Arkansas (SBMV-ARK) descrito nos EUA. Os resultados obtidos indicam que o SBMV-SP e o SBMV-ARK são isolados muito proximamente relacionados.

Completion of the Nucleotide Sequence of a Brazilian Isolate of Southern bean mosaic virus

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Detecção do Southern bean mosaic virus no Paraná, e separação do Bean rugose mosaic virus em feijoeiro

Em lavouras de feijoeiro (Phaseolus vulgaris) da cultivar Carioca Comum, no município de Londrina, Estado do Paraná, foram encontradas plantas com sintomas de necrose da haste, mosaico clorótico leve e porte reduzido, semelhantes aos sintomas causados por infecção viral. Exames de microscopia eletrônica revelaram a presença de partículas isométricas. em testes de imunodifusão dupla em gel de ágar os extratos foliares de plantas infetadas reagiram positivamente com anti-soro específico para o Southern bean mosaic virus (SBMV). O vírus foi purificado e a massa molecular de sua proteína capsidial foi estimada em 30 kDa, valor esperado para proteínas do capsídeo de vírus do gênero Sobemovirus. A gama de hospedeiras do SBMV isolado no Paraná foi restrita ao feijoeiro e a algumas cultivares de soja (Glycine max). A separação de dois vírus isométricos comuns em infecções mistas no feijoeiro foi possível através da reação de imunidade ao SBMV apresentada por Crotalaria sp, Chenopodium quinoa e Mucuna deeringiana, e da reação de susceptibilidade dessas mesmas hospedeiras ao Bean rugose mosaic virus (BRMV).

Propriedades moleculares de um isolado brasileiro do Southern bean mosaic virus

Um isolado do Southern bean mosaic virus (SBMV), gênero Sobemovirus, encontrado em feijoeiro (Phaseolus vulgaris) no Estado de São Paulo, foi purificado e algumas de suas propriedades moleculares determinadas. As partículas virais apresentam diâmetro de 28-30 nm e proteína capsidial com massa molecular estimada em 30 kDa. Das partículas virais foi extraído RNA de vários tamanhos (4,2 Kb, 3,1 Kb, 2,65 Kb, 2,15 Kb, 1,64 Kb, 1,36 Kb e 1,0 Kb) sendo aquele de 4,2 Kb o RNA genômico e o de 1,0 Kb supostamente um subgenômico que codifica para a proteína capsidial. Ácidos ribonucleicos de mesmo tamanho foram também detectados in vivo, indicando estar associados à replicação viral. Na análise do RNA de fita dupla (dsRNA), somente duas espécies foram detectadas (4,2 Kpb e 1,0 Kpb) correspondendo às formas replicativas do RNA genômico e do subgenômico para proteína capsidial. Os resultados indicam que somente estes dois RNA são replicados por meio de formas replicativas (RFs), enquanto os demais devem ser formados talvez por iniciação interna da fita negativa do RNA genômico. O SBMV-B SP apresentou propriedades moleculares análogas àquelas do SBMV descrito na América do Norte.

Jaguarundi (Puma yagouaroundi) (Geoffroy, 1803) (Carnivora, Felidae) food habits in a mosaic of Atlantic Rainforest and eucalypt plantations of southeastern Brazil

A dieta de uma população de jaguarundi (Puma yagouaroundi) (Geoffroy, 1803) (Carnivora, Felidae) foi estudada entre novembro de 2000 e novembro de 2001, em 24,9 km² de mosaico de Mata Atlântica secundária e reflorestamento de eucalipto na Serra de Paranapiacaba, São Paulo, Brasil. A análise das 26 amostras fecais e regurgitadas, obtidas em 570.1 km de percurso, indicou o consumo de 19 itens alimentares em um total de 74 ocorrências de presas. Pequenos mamíferos foram os itens mais frequentemente encontrados na dieta (42,5%), seguidos por aves (21%), répteis (14%) e mamíferos de tamanho médio (3%). A porcentagem de ocorrência (PO) sugere que a dieta concentra-se, principalmente, em pequenos roedores (30%) e aves (21%). Foi também registrada a predação sobre serpentes da família Viperidae. A amplitude de nicho alimentar padronizada (Bsta = 0,76) mostra uma dieta generalista, entretanto, os dados sugerem que o jaguarundi consome principalmente pequenos vertebrados (mamíferos, aves ou répteis), sobretudo, espécies terrestres.

Efeitos na fotossíntese e área foliar de cultivares de alface inoculadas mecanicamente com patótipos do Lettuce mosaic virus e Lettuce mottle virus

Levantamentos realizados no estado de São Paulo indicaram a ocorrência isolada e em infecções mistas do Lettuce mosaic virus (LMV) e do Lettuce mottle virus (LeMoV) em plantas de alface (Lactuca sativa). O presente trabalho teve como objetivo estudar os efeitos da infecção isolada e mista entre o LMV (patótipos II e IV) e o LeMoV, em cultivares de alface suscetível (White Boston) e tolerante (Elisa - gene mol¹) ao LMV patótipo II. As plantas foram inoculadas via extrato vegetal tamponado com isolados de LMV-II, LMV-IV e LeMoV separadamente e em diferentes combinações, com intervalo de 24 h ou simultaneamente com os dois vírus. As plantas infetadas foram analisadas utilizando-se hospedeiras diferenciais para o LMV e o LeMoV, e no caso do LMV pelo teste sorológico de PTA-ELISA. Nas avaliações de peso fresco e seco, área foliar e teor de clorofila, observou-se que a cultivar White Boston foi a mais afetada por ambos os vírus. As infecções mistas e isoladas na cultivar Elisa causaram efeitos semelhantes, provavelmente devido a presença do gene mo1¹ de tolerância ao LMV-II. O isolado LMV-IV foi considerado o mais agressivo nestas cultivares quando comparado ao LMV-II e o LeMoV.

Breakdown of resistance in sweet pepper against Pepper yellow mosaic virus in Brazil

Plantas de Capsicum annuum cv. Magali R, resistentes ao Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), exibindo sintomas severos de mosaico amarelo, malformação foliar e subdesenvolvimento foram encontradas em plantios na região de Lins, SP, Brasil, em 2003/04. Partículas semelhantes àquelas do gênero Potyvirus foram observadas em extrato foliar de planta infectada examinado em microscópio eletrônico de transmissão. O extrato foliar também reagiu com anti-soro contra o PepYMV em PTA-ELISA. Além de C. annuum cv. Magali R, esse potyvirus também infectou sistemicamente C. annuum cv. Rubia R, que é resistente ao PepYMV. A seqüência de nucleotídeos de parte do gene da proteína capsidial (CP) desse potyvirus apresentou 96-98% de identidade com a de outros isolados do PepYMV. A seqüência parcial de nucleotídeos da região 3' não traduzida (3' NTR) apresentou 94-96% de identidade com a do PepYMV. Esses resultados são indicativos de que o potyvirus que quebrou a resistência em pimentão é um isolado do PepYMV.

PURIFICATION AND PROPERTIES OF SHIKIMATE DEHYDROGENASE FROM CUCUMBER (CUCUMIS-SATIVUS L)

Shikimate dehydrogenase (SDH, EC 1.1.1.25) extracted from cucumber pulp (Cucumis sativus L.) was purified 7-fold by precipitation with ammonium sulfate and elution from columns of Sephadex G-25, DEAE-cellulose, and hydroxyapatite. Two activity bands were detected on polyacrylamide gel electrophoresis at the last purification step. pH optimum was 8.7, and molecular weight of 45 000 was estimated on a Sephadex G-100 column. SDH was inhibited competitively by protocatechuic acid with a K(i) value of 2 x 10-4 M. K(m) values of 6 x 10-5 and 1 x 10-5 M were determined for shikimic acid and NADP+, respectively. The enzyme was completely inhibited by HgCl2 and p-(chloromercuri)benzoate (PCMB). NaCl and KCl showed partial protection against inhibition by PCMB. Heat inactivation between 50 and 55-degrees-C was biphasic, and the enzyme was completely inactivated after 10 min at 60-degrees-C. Incubation of SDH with either NADP+ or shikimic acid protected the enzyme against heat inactivation.

INCREASED CALCIUM AFFINITY OF A FUCOSYLATED CHONDROITIN SULFATE FROM SEA-CUCUMBER

Calcium binding and charge distribution on a fucosylated chondroitin sulfate and a standard chondroitin 6-sulfate have been studied using a metallochromic indicator and conductimetric titrations. The fucosylated chondroitin sulfate has a similar to 5-fold greater affinity for calcium ions than the standard chondroitin 6-sulfate. Possibly, this increased affinity for calcium ions is due to the branches on the fucosylated chondroitin sulfate, since the calcium affinity of an unbranched, sulfated fucan is similar to that of the standard chondroitin 6-sulfate. More charged groups per disaccharide unit (and a shorter distance between these groups) also distinguish the fucosylated chondroitin sulfate from standard chondroitin 6-sulfate. Comparison between native and chemically modified (desulfated or carboxyl-reduced) polysaccharides suggests that the sulfate esters are responsible for the increased charge density of the fucosylated chondroitin sulfate and that the presence of the fucose branches does not alter the length of the repetitive units which compose the central core of chondroitin from sea cucumber. These results are consistent with the chemical studies of these two polysaccharides.

ANT (HYM, FORMICIDAE) MOSAIC STABILITY IN BAHIAN COCOA PLANTATIONS - IMPLICATIONS FOR MANAGEMENT

Mapping and collection of ants in cocoa trees in a 1 ha plot in the south of Bahia, Brazil, revealed three dominant species of the ant mosaic: Wasmannia auropunctata, Ectatomma tuberculatum and Azteca chartifex spiriti. A. chartifex demonstrated a larger influence in the cocoa plantation due to its spatial and temporal (1 y) stability in the same cocoa trees, and its capacity for territorial expansion. The management of A. chartifex for controlling insect pests of cocoa is strongly recommended. Considerations of temporal permanence of mosaic dominant ants should be a necessary criteria for ant management in tropical tree crops.

Assessment of Cerdocyon thous distribution in an agricultural mosaic, southeastern Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Phytotoxicity of organic extracts of Turnera ulmifolia L. and Turnera diffusa Willd. ex Schult. in cucumber seeds

We evaluated the phytotoxic effects that the hexane, ethyl acetate and methanol extracts from leaves and branches of the species Turnera ulmifolia L. and Turnera diffusa Willd. ex Schult. (Turneraceae), at concentrations of 1.25, 2.50, 3.75 and 5.00 mg ml-1, have on seed germination and seedling development in cucumber (Cucumis sativus L.). None of the extracts tested prevented germination, although the ethyl acetate extracts of T. diffusa, at 3.75 and 5.00 mg ml-1, reduced the mean germination speed and time to germination. Hexane extracts of both species reduced the main root length, number of secondary roots and hypocotyl length. In the ethyl acetate and methanol extracts, the number of secondary roots and hypocotyl length varied by species and concentration. Ethyl acetate extracts of T. ulmifolia at ≤ 2.50 mg ml-1stimulated growth of the main root and hypocotyl, as did T. ulmifolia methanol extracts at 1.25 and 3.75 mg ml-1; all other extract/concentration combinations had an inhibitory effect on those parameters. The hexane and ethyl acetate extracts of T. diffusa inhibited the formation of secondary roots and of the main root, although significant inhibition of hypocotyl growth was observed only at ≥ 2.50 mg ml-1. Comparatively, T. diffusa extracts inhibited development to a greater degree, thus presenting greater allelopathic potential, than did T. ulmifolia extracts.

Complementação do seqüenciamento do genoma do Southern bean mosaic virus, isolado São Paulo, expressão da porção C-terminal da polimerase e produção de anti-soro policlonal

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)