Interação genótipo vs formas de inoculação com Azospirillum brasilense em milho

Pós-graduação em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) - FCAV

Eficácia de duas formulações de vacinas autógenas para o controle da lactococose em surubins híbridos Pseudoplatystoma corruscans x Pseudoplatystoma reticulatum

Pós-graduação em Aquicultura - FCAV

Análise de propriedades topológicas das redes biológicas integradas da Escherichia coli e da Saccharomyces cerevisiae

Biological processes are complex and possess emergent properties that can not be explained or predict by reductionism methods. To overcome the limitations of reductionism, researchers have been used a group of methods known as systems biology, a new interdisciplinary eld of study aiming to understand the non-linear interactions among components embedded in biological processes. These interactions can be represented by a mathematical object called graph or network, where the elements are represented by nodes and the interactions by edges that link pair of nodes. The networks can be classi- ed according to their topologies: if node degrees follow a Poisson distribution in a given network, i.e. most nodes have approximately the same number of links, this is a random network; if node degrees follow a power-law distribution in a given network, i.e. small number of high-degree nodes and high number of low-degree nodes, this is a scale-free network. Moreover, networks can be classi ed as hierarchical or non-hierarchical. In this study, we analised Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae integrated molecular networks, which have protein-protein interaction, metabolic and transcriptional regulation interactions. By using computational methods, such as MathematicaR , and data collected from public databases, we calculated four topological parameters: the degree distribution P(k), the clustering coe cient C(k), the closeness centrality CC(k) and the betweenness centrality CB(k). P(k) is a function that calculates the total number of nodes with k degree connection and is used to classify the network as random or scale-free. C(k) shows if a network is hierarchical, i.e. if the clusterization coe cient depends on node degree. CC(k) is an indicator of how much a node it is in the lesse way among others some nodes of the network and the CB(k) is a pointer of how a particular node is among several ...(Complete abstract click electronic access below)

Descrição morfo-histológica dos testículos de Amblyomma cajennense em jejum e alimentados

Os carrapatos são ectoparasitas hematófagos de grande importância epidemiológica, pois são vetores de muitos patógenos. Esses animais pertencem ao Filo Arthropoda, Classe Arachnida, Subclasse Acari, são classificados em três famílias: Ixodidae, Argasidae e Nutalliellidae, apresentam ampla distribuição geográfica e podem parasitar grande variedade de vertebrados, inclusive o homem. O carrapato da espécie Amblyomma cajennense, popularmente conhecido como carrapato-estrela, carrapato do cavalo ou rodoleiro, tem grande importância médica por ser vetor da bactéria Rickettsia rickettsii, causadora da febre maculosa brasileira (FMB), que pode levar o hospedeiro a óbito. Apesar das crescentes pesquisas com esses animais, ainda existem lacunas na literatura acerca de alguns de seus processos reprodutivos. Dessa forma, esse trabalho teve por objetivo estudar o desenvolvimento dos testículos dessa espécie por meio da descrição da morfologia e histologia dos testículos de indivíduos em jejum e alimentados, identificando a dinâmica do processo de espermatogênese e se a alimentação influencia nesse processo. Os resultados obtidos mostraram que os testículos são estruturas pares e tubulares arranjadas dorsolateralmente no opistossoma, sendo que a região proximal está conectada às vesículas seminais pelos ductos deferentes, semelhante ao observado em outras espécies de ixodídeos. Associado ao aparelho genital masculino encontra-se um complexo de glândulas acessórias multilobuladas. Foi constatado que a alimentação tem papel fundamental no desenvolvimento do sistema reprodutor, visto que nos indivíduos em jejum as vesículas seminais e o complexo de glândulas acessórias foram menores e menos desenvolvidos do que nos animais alimentados. Além disso, as espermátides alongadas, precursoras dos espermatozoides no trato reprodutor... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Atividade antimicrobiana da violaceína em linhagens isoladas de mastite bovina

Violacein is a deeply violet pigment produced by Chromobacterium violaceum, an ubique tropical and subtropical bacterium. This molecule presents many biological activities including antimicrobial, antimycotic, antiviral, antiprotozoal and antitumoral. Important reports pointed to a considerable bactericide activity, which brings an extremely necessary quest. This work evaluated the resistance of some bacterias of interest veterinary. It was obtained significant inhibition activity against Staphylococcus aureus came from bovine mastitis. It was also obtained important synergic relations when violacein and penicillin or cloranphenicol are combined

Avaliação do efeito do tratamento com surfactante químico e Pseudomonas aeruginosa LBI na toxicidade de solo contaminado com óleo lubrificante usado

Petroleum and its subproducts are considered a treat for the environmental quality because of the many environmental accidents that may occur during exploitation, transport and storage. A common remediation technique used in the contaminated areas is based on the use of surfactants, mainly the chemical ones, because they have low production costs. In the other hand, some microorganisms have indicate capacities of producing surfactants that emulsify substances and as result, offer a bigger contact surface for the microbiota degradation. This biossurfactants stand out in comparison with the chemical surfactants because they present lower micelar concentration values, are more tolerant for temperature and pH variation, because they are biodegradable, have low toxicity, higher emulsification and hydrocarbon solubilization index. In this way, after the surfactant application, a toxicity evaluation have to be made to identify the treatment effects. In soil, the activity of some microbial enzymes can show the environmental behavior of the contaminant under different treatment conditions. Dehydrogenase is one example of those enzymes that can demonstrate indirectly the effect of the pollutant on the soil microorganisms. The aim of this paper was to evaluate the toxicity after the addition of a surfactant and/or Pseudomonas aeruginosa LBI in soil contaminated by a mineral automotive lubricant. The previous mentioned bacteria are a potential biossurfactant (rhamnolipid) producer. In order to evaluate the toxicity, the dehydrogenase test was run. In this test, trifeniltetrazolium compound (TTC) after utilized as an electron acceptor, turns into trifenil formazan (TPF), that can be indirectly quantified using the absorbance measured by the spectrophotometer UV-visible. In this way, it was possible to quantify the dehydrogenase activity from the contaminated soil samples... (Complete abstract click electronic access below)

Avaliação da estabilidade da capacidade de produção de cefamicina C por Streptomyces clavuligerus

Streptomyces clavuligerus é uma importante espécie industrial que produz múltiplos compostos de interesse clínico, destacando-se o antibiótico cefamicina C (CefC) e o ácido clavulânico (AC), um potente inibidor de b-lactamases produzidas por bactérias resistentes a penicilinas e cefalosporinas. Sabe-se que situações limite como subculturas sucessivas, forma inadequada de armazenamento das células, variações bruscas de condições de cultura, podem causar deleções de mais de 25% dos genes de Streptomyces sp que, embora muitas vezes não comprometam a sobrevivência do micro-organismo, acarretam perdas na capacidade produtiva. Neste trabalho, investigou-se a estabilidade da linhagem selvagem S. clavuligerus ATCC 27064 quanto à produção de CefC variando-se condições do inóculo utilizado nos cultivos submersos de obtenção do antibiótico. As fermentações foram realizadas em frascos agitados (28ºC, 260 rpm) e as amostras coletadas em 48 e 72 horas do caldo fermentativo foram analisadas quanto ao pH, biomassa (massa seca a 105ºC por 24 h) e CefC foi determinada por bioensaio de difusão em ágar (bactéria-teste Escherichia coli ESS 2235). Foi selecionado o micro-organismo melhor produtor por meio de screening, e o que apresentou a melhor produção de CefC e os menores desvios com relação à média foi utilizado para preparar novos lotes de células: ampolas de micélios liofilizados e criotubos contendo 108 esporos.mL-1 . Observou-se que a capacidade produtiva foi afetada quando foram utilizadas subculturas do micro-organismo original. A realização do screening mostrou-se eficiente na seleção de colônias superiores em termos de produção volumétrica, sendo recomendada a realização de tal procedimento periodicamente para manutenção de uma linhagem com maior potencial produtivo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Desenvolvimento e caracterização de sistemas líquido-cristalinos acrescidos de geoprópolis (Melipona scutellaris): avaliação da bioadesividade

A alta incidência da cárie no Brasil vem despertando muito interesse para estudos que visem combatê-la. Tem-se observado a procura pela utilização de produtos naturais (plantas medicinais e resinas) que buscam atividade contra a principal bactéria causadora da cárie, que é o Streptococcus mutans, entre estas a geoprópolis (Melipona scutellaris). Todavia, apesar de os estudos mostrarem ação destes produtos de origem animal contra este micro-organismo, muitas vezes a baixa substantividade (bioadesão) deste material ao substrato determina uma baixa efetividade. Este estudo promoveu o desenvolvimento de um sistema líquido cristalino objetivando aumento da substantividade da própolis. Foram desenvolvidos sistemas constituídos por dispersão de quitosana, ácido oleico e álcool cetílico propoxilado e etoxilado (Procetyl® AWS), de acordo com o diagrama de fases ternário. Foram selecionadas 3 formulações, as quais foram submetidas a ensaios de microscopia de luz polarizada, análise de textura, bioadesão e reologia. Os resultados mostraram que os sistemas são viáveis para incorporação do extrato de própolis, aumentando sua bioadesão em ensaios in vitro

Avaliação do potencial de sistemas nanoestruturados mucoadesivos para administração bucal do peptídeo p1025

A cárie dental é uma das doenças crônico-infecciosas mais comuns no mundo e é potencializada por fatores que favorecem a colonização da bactéria Streptococcus mutans na cavidade oral. O presente trabalho visa avaliar o potencial de sistemas nanoestruturados mucoadesivos para administração bucal do peptídeo sintético p1025, potencialmente ativo contra cárie dental. Este peptídeo, análogo aos fragmentos 1025-1044 da adesina celular de S. mutans mostrou-se, em estudos recentes, eficaz contra a adesão do patógeno na superfície do biofilme bacteriano. Acredita-se que, se incorporado em sistemas nanoestruturados mucoadesivos, sobretudo os sistemas líquido-cristalinos, sua ação possa ser modulada, pelo fato de que estes sistemas podem se aderir na mucosa bucal, de modo a proteger o peptídeo da degradação enzimática, além de prolongar o tempo de contato com a mucosa, diminuindo assim a frequência de administração. Os sistemas nanoestruturados de liberação controlada foram analisados estruturalmente através de microscopia de luz polarizada, determinação do comportamento reológico, TPA e bioadesão. Os resultados evidenciaram, através das análises de microscopia de luz polarizada, a presença de sistemas líquido-cristalinos de fase hexagonal e lamelar, além de domínios de microemulsões. As análises reológicas mostraram que ao adicionar dispersões poliméricas na fase aquosa do sistema, características como pseudoplasticidade e tixotropia são favorecidas, o que pode facilitar a aplicação do produto na mucosa bucal. O teste de biodesão mostrou que o emprego de dispersões poliméricas contribuiu para a adesão na mucosa bucal, sendo os melhores resultados obtidos com dispersão de Policarbofil® a 0,5 %.O teste microbiológico demonstrou a potencialização do efeito inibidor/redutor da carga microbiana com a utilização de óleo de melaleuca na fase oleosa do sistema. Os resultados obtidos sugerem que o ...

Tuberculose e sua importância para a pecuária brasileira

Tuberculosis due the large number of victims that come attacking in recent years has become a major concern in the World Health Organization. It is caused by a bacterium that is becoming increasingly resistant to drugs, because it requires long periods in treatment that are not always followed correctly. AIDS has contributed much in recent years with increased morbidity and mortality of Mycobacterium. The Ministry of Agriculture, Livestock and Supply (MAPA) of Brazil in 2001 created the National Program of Control and Eradication of Animal Brucellosis and Tuberculosis (PNCEBT) establishing guidelines such as: sets the method to diagnose, control and certify herds free of disease. Joining the program is voluntary

Caracterização topológica dos motivos das redes biológicas integradas da Escherichia coli e da Saccharomyces cerevisiae

The reducionism method has helped in the clari cation of functioning of many biological process. However, such process are extremely complex and have emergent properties that can not be explained or even predicted by reducionism methods. To overcome these limits, researchers have been used a set of methods known as systems biology, a new area of biology aiming to understand the interactions between the multiple components of biological processes. These interactions can be represented by a mathematical object called graph or network, where the interacting elements are represented by a vertex and the interactions by edges that connect a pair of vertexes. Into graphs it is possible to nd subgraphs, occurring in complex networks at numbers that are signi cantly higher than those in randomized networks, they are de ned as motifs. As motifs in biological networks may represent the structural units of biological processess, their detection is important. Therefore, the aim of this present work was detect, count and classify motifs present in biological integrated networks of bacteria Escherichia coli and yeast Saccharomyces cere- visiae. For this purpose, we implemented codes in MathematicaR and Python environments for detecting, counting and classifying motifs in these networks. The composition and types of motifs detected in these integrated networks indicate that such networks are organized in three main bridged modules composed by motifs in which edges are all the same type. The connecting bridges are composed by motifs in which the types of edges are diferent

Etiologia e perfil de sensibilidade aos antimicrobianos de pacientes ambulatoriais de Botucatu e região

As infecções do trato urinário (ITU) são definidas como a invasão e posterior multiplicação de microorganismos nos tecidos das vias urinárias, sendo a bactéria gram-negativa E.coli o principal uropatógeno envolvido nessa infecção. A avaliação para a presença de ITU é feita através do quadro clínico característico desse tipo de paciente e o exame de cultura de urina. As amostras positivas para as culturas são avaliadas quanto ao perfil de sensibilidade aos antimicrobianos dos agentes etiológicos encontrados. Descrever a porcentagem de ocorrência dos agentes etiológicos e o perfil de sensibilidade aos antimicrobianos das Infecções do Trato Urinário em pacientes ambulatoriais de Botucatu e região. Foram incluídas neste estudo culturas de urinas de pacientes atendidos em UBS de Botucatu e região Pólo Cuesta, no período de Janeiro de 2008 a Maio de 2010. As culturas positivas foram avaliadas quanto a porcentagem de ocorrência dos uropatógenos segundo sexo, faixa etária e origem. Foi utilizado o teste do qui-quadrado para verificar associação entre cada antimicrobiano e as porcentagens de sensibilidade e resistência encontradas. Foram avaliadas 11.768 culturas de urina provenientes de 11 municípios da região, sendo consideradas as culturas positivas (28%). Quanto à ocorrência dos agentes etiológicos verificou-se que a E.coli é responsável 58,76% dos casos. A distribuição dos uropatógenos segundo sexo revelou maior ocorrência de E.coli nos dois sexos. O segundo agente etiológico de maior ocorrência foi, nos homens o Proteus mirabilis e nas mulheres, o S. saprophyticus. Dentre as faixas etárias, a E.coli foi o patógeno de maior ocorrência. O perfil de sensibilidade aos antimicrobianos revelou que a E.coli é mais sensível a Ertapenem, Imipenem, Meropenem, Fosfomicina, Amicacina, Ceftriaxona, Nitrofurantoína e Norfloxacina; e mais resistente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Determinação de comunidades em redes biológicas integradas

To understand how biological phenomena emerge, the nonlinear interactions among the components envolved in these and the correspondent connected elements, like genes, proteins, etc., can be represented by a mathematical object called graph or network, where interacting elements are represented by edges connecting pairs of nodes. The analysis of various graph-related properties of biological networks has revealed many clues about biological processes. Among these properties, the community structure, i.e. groups of nodes densely connected among themselves, but sparsely connected to other groups, are important for identifying separable functional modules within biological systems for the comprehension of the high-level organization of the cell. Communities' detection can be performed by many algorithms, but most of them are based on the density of interactions among nodes of the same community. So far, the detection and analysis of network communities in biological networks have only been pursued for networks composed by one type of interaction (e.g. protein-protein interactions or metabolic interactions). Since a real biological network is simultaneously composed by protein-protein, metabolic and transcriptional regulatory interactions, it would be interesting to investigate how communities are organized in this type of network. For this purpose, we detected the communities in an integrated biological network of the Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae by using the Clique Percolation Method and we veri ed, by calculating the frequency of each type of interaction and its related entropy, if components of communities... (Complete abstract click electronic access below)

Busca de fitofármacos com potencial atividade contra Mycobacterium tuberculosis a partir de óleos essenciais

A Tuberculose é um problema grave de Saúde Pública em todo o mundo, causada pelo Mycobacterium tuberculosis e considerada a principal causa de morte entre as doenças infecto-contagiosas. Cerca de 80% da população infectada habitam países subdesenvolvidos, onde o Brasil ocupa a 19ª posição entre os países mais afetados. Embora existam agentes anti-tuberculosos, que são razoavelmente eficazes no tratamento da tuberculose, há uma crescente prevalência de cepas resistentes à multiplos fármacos devido principalmente ao abandono do tratamento.Outros fatores como a co-infecção HIV/TB e a infecção com bactéria em estado de latência denotam a necessidade em se buscar novos fármacos contra TB. Este trabalho teve como objetivo verificar a atividade antimicrobiana do óleo extraído da planta Hedychium coronarium e seus marcadores fitoquímicos frente ao M. tuberculosis utilizando a técnica de Rezasurin Microtiter Assay (REMA), que utiliza como revelador a resazurina. Com a técnica de REMA pudemos verificar a atividade dos óleos essenciais de H. coronarium e seus marcadores fitoquímicos frente ao M. tuberculosis. Futuros estudos buscando o isolamento de compostos a partir desses óleos e testá-los para a verificação de suas atividades anti-tuberculose, é válido e deve ser encorajado, pois existem características antimicrobianas promissoras e é interessante que se realize estudos de sinergismo com outros compostos naturais, podendo assim dar continuidade na busca de novos fitofármacos na luta contra a tuberculose

Susceptibilidade do Staphylococcus aureus à terapia fotodinâmica (PDT)

A terapia fotodinâmica (PDT), de maneira simplificada pode ser aplicada utilizando um fotossensibilizador (FS) e uma fonte de luz com comprimento de onda específico, que combinados na presença do oxigênio produzem espécies citotóxicas que causam o dano celular. O objetivo deste estudo piloto foi verificar a susceptibilidade de Staphylococcus aureus (ATCC 25923) à PDT, empregando diferentes concentrações de azul de metileno. As amostras desta bactéria foram sensibilizadas com azul de metileno nas concentrações de 6,25 μg/mL; 12,5 μg/mL; 25,0 μg/mL; 50,0 μg/mL; 100,0 μg/mL e 200,0 μg/mL e expostas à luz LED vermelha (660nm) por 20 minutos. Após o tratamento de todos os grupos estudados a fração de sobrevivência foi calculada pela contagem das unidades formadoras de colônia (UFC). O resultado deste estudo mostrou que o fotossensibilizador no escuro foi tóxico (dark toxicity) nas concentrações de 100 e 200 μg/mL. Já no grupo onde utilizamos apenas a luz, não houve redução bacteriana significativa. Entretanto, o uso combinado do AM e da luz LED (Grupo PDT) mostrou que todas as concentrações testadas causaram uma redução significativa de S aureus. Desta forma concluímos que a terapia fotodinâmica antimicrobiana pode ser um tratamento alternativo para redução de Staphylococcus aureus.