Genetic Diversity of a Brazilian Strain Collection of Xanthomonas citri subsp citri Based on the Type III Effector Protein Genes

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genetic characterization and nitrogen fixation capacity of Rhizobium strains on common bean

O objetivo deste trabalho foi a caracterização genética de quatro novas estirpes de Rhizobium e a avaliação de sua capacidade de fixação de N2 e nodulação, comparadas a estirpes comerciais e à população nativa de rizóbios de um Latossolo Vermelho. Dois experimentos foram conduzidos em blocos ao acaso, em casa de vegetação. No primeiro experimento, conduzido em tubetes com vermiculita, avaliaram-se a nodulação e a capacidade de fixação das novas estirpes, em comparação com as estirpes comerciais CIAT-899 e PRF-81 e com a população nativa do solo. Das colônias puras isoladas, extraiu-se o DNA genômico e realizou-se o seqüenciamento do espaço intergênico, para a caracterização genética das estirpes e da população nativa de rizóbios. O segundo experimento foi realizado em vasos com solo, para determinação da produtividade e da nodulação do feijoeiro, cultivar Pérola, com o uso das estirpes isoladamente ou em mistura com a PRF-81. A população nativa do solo foi identificada como Rhizobium sp. e se mostrou ineficiente na fixação de nitrogênio. Foram encontradas três espécies de Rhizobium entre as quatro novas estirpes. As estirpes LBMP-4BR e LBMP-12BR estão entre as que têm maior capacidade de nodulação e fixação de N2, e apresentam respostas diferenciadas quando misturadas à PRF-81.

Prevalence of Lettuce mosaic virus - common strain on three lettuce producing areas from São Paulo State

O LMV ocorre em todo o mundo e é considerado um dos patógenos mais importantes para a cultura da alface. de acordo com a habilidade em contornar os genes de resistência mo1¹ e mo1² encontrados em alface, os isolados de LMV podem ser dividos em dois sub-grupos: LMV-Most, capazes de contornar a resistência propiciada por estes genes e de serem transmitidos pela semente nestas cutivares, e LMV-Common, que não são capazes de causar sintomas nestes cultivares, além de serem transmitidos pela semente somente em cultivares suscetíveis. Para avaliar a ocorrência destes dois tipos de isolados de LMV foram coletadas, durante 2002-2005, amostras de alface com sintomas de mosaico em áreas de produção de alface comercial das regiões de Campinas, Mogi das Cruzes e Bauru no estado de São Paulo. O RNA total foi utilizado para detecção por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos universais para LMV que amplificam a porção N-terminal variável da capa protéica, localizada no terminal 3´do genoma. As amostras positivas foram analisadas por um segundo primer que amplifica um fragmento da região central (CI-VPg) do genoma viral. Um total de 1362 amostras foram avaliadas, tendo sido detectado o LMV em 504 amostras (37,29%). O LMV-Common prevaleceu em variedades suscetíveis (77,3%). O LMV-Most foi encontrado frequentemente associado a variedades portadoras do gene de tolerância mo1¹. Apesar da existência dos LMV-Most capazes de contornar a resistência em alface, estes não predominam em nossa condições.

Strain differentiation of Trichophyton rubrum by random amplification of polymorphic DNA (RAPD)

Trichophyton rubrum é um importante agente causal de dermatomicose. Os métodos de tipagem molecular têm sido recentemente desenvolvidos para responder questões sobre epidemiologia e auxiliar no esclarecimento de recidivas, após o tratamento. As seqüências aleatórias 1- (5'-d[GGTGCGGGAA]-3') e 6- (5'-d[CCCGTCAGCA]-3') foram usadas para tipagem molecular deste fungo por RAPD produzindo variabilidade intraespecífica. Cinco padrões foram observados entre os 10 isolados de T. rubrum, com ambas as seqüências. Foi concluído que a análise por RAPD pode ser utilizada para estudos epidemiológicos.

Population dynamics of DENV-1 genotype V in Brazil is characterized by co-circulation and strain/lineage replacement

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

MIGRATION MEASUREMENTS FROM PLASTIC PACKAGING: A SIMULATION STUDY ON INFLUENCE OF INITIAL CONCENTRATION PROFILE

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Strain differentiation of Trichophyton rubrum by randomly amplified polymorphic DNA and analysis of rDNA nontranscribed spacer

Trichophyton rubrum is the most common pathogen causing dermatophytosis. Molecular strain-typing methods have recently been developed to tackle epidemiological questions and the problem of relapse following treatment. A total of 67 strains of T rubrum were screened for genetic variation by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis, with two primers, 5'-d[GGTGCGGGAA]-3' and 5'-d[CCCGTCAGCA]-3', as well as by subrepeat element analysis of the nontranscribed spacer of rDNA, using the repetitive subelements TRS-1 and TRS-2. A total of 12 individual patterns were recognized with the first primer and 11 with the second. Phylogenetic analysis of the RAPID products showed a high degree of similarity (> 90 %) among the epidemiologically related clinical isolates, while the other strains possessed 60% similarity. Specific amplification of TRS-1 produced three strain-characteristic banding patterns (PCR types); simple patterns representing one copy of TRS-1 and two copies of TRS-2 accounted for around 85 % of all isolates. It is concluded that molecular analysis has important implications for epidemiological studies, and RAPID analysis is especially suitable for molecular typing in T. rubrum.

Deformation of Implant Abutments After Framework Connection Using Strain Gauges

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Experimental Investigation into the Characteristics of In-Pipe Leak Noise in Plastic Water Filled Pipes

This paper presents an experimental investigation of the characteristics of leak noise in plastic water-filled pipes. An experimental set-up was designed to identify the physical mechanisms of leak noise generation. Possible mechanisms include cavitation and turbulence. The experiments show that cavitation is not responsible for leak noise generation and clearly indicate that turbulence is the main mechanism, at least in the experiments conducted. An alternative experimental set-up was also designed to identify the characteristics of leak noise spectra and to investigate how the spectra are affected by the leak size and the leak flow velocity. A number of different hole sizes (leaks) starting from 1 mm diameter, increasing progressively every 0.5 mm until a size of 4 mm diameter were tested for different jet velocities and an empirical model that describes this behaviour is proposed.

Microstructural Characterization of Ti-6Al-7Nb Alloy After Severe Plastic Deformation

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Microstructural Evolution of Ti-6Al-7Nb Alloy During High Pressure Torsion

Ti-6Al-7Nb alloys are being evaluated for biomedical applications, in substitution of the more conventional Ti-6Al-7V. Both types of alloys present a microstructure containing the alpha and the beta phases, which result in good compromise for mechanical applications. In the present work Ti-6Al-7Nb alloys were processed by High Pressure Torsion (HPT), varying the number of revolutions and thus the total imposed strain. X-Ray Diffraction (XRD) results revealed the formation of different crystallographic textures in samples subjected to HPT. Microhardness distribution, across the diameters of the disks, is rather homogeneous for all samples, with higher values for those subjected to 03 and 05 turns. Transmission electron microscopy (TEM) micrographs have showed that an ultra-fine grained microstructure was obtained in all the samples.

Strain variability in the DNA immigration control region (ICR) of Xylella fastidiosa

The genome of the bacterium Xylella fastidiosa contains four ORFs (XF2721, XF2725, XF2739 and XF0295) related to the restriction modification type I system, ordinarily named R-M. This system belongs to the DNA immigration control region (ICR). Each CIRF is related to different operon structures, which are homologues among themselves and with subunit Hsd R from the endonuclease coding genes. In addition, these ORFs are highly homologous to genes in Pseudomonas aeruginosa, Methylococcus capsulatus str. Bath, Legionella pneumophila, Helicobacter pylori, Xanthomonas oryzae pv. Oryzae and Silicibacter pomeroyi, as well as to genes from X. fastidiosa strains that infect grapevine, almond and oleander plants. This study was carried out on R-M ORFs from forty-three X. fastidiosa strains isolated from citrus, coffee, grapevine, periwinkle, almond and plum trees, in order to assess the genetic diversity of these loci through PCR-RFLP. PCR-RFLP analysis of the four ORFs related to the R-M system from these strains enabled the detection of haplotypes for these loci. When the haplotypes were defined, wide genetic diversity and a large range of similar strains originating from different hosts were observed. This analysis also provided information indicating differences in population genetic structures, which led to detection of different levels of gene transfer among the groups of strains. (c) 2005 Elsevier SAS. All rights reserved.

Evolution of representation of the hands in plastic arts

A interação entre arte e ciência foi intensa durante o Renascimento, sofrendo declínio nos anos posteriores com retomada significativa no século XX, principalmente com o uso de técnicas de identificação, datação de obras de arte e o desenvolvimento de novos materiais. O relacionamento entre artes plásticas e Cirurgia da Mão mantêm-se intenso , sendo freqüente o uso de reproduções artísticas da mão nas ilustrações de textos científicos. Objetivando compreender o papel da mão nas artes plásticas, reproduções de obras de artes (esculturas e pinturas) representativas de vários estilos ou períodos da história da arte foram analisadas com enfoque no estudo das mãos. Detalhes anatômicos, relacionamento com outras estruturas do corpo humano, papel na composição e aspectos simbólicos das mãos foram estudados no contexto histórico e artístico de obras de arte do período paleolítico (pré-história) até o século XX. A representação da mão nas artes plásticas está diretamente relacionada ao estilo ou período da obra e à capacidade individual de interpretação e execução do artista.

Morphologic changes in the urethral epithelium in an ethanol-drinking rat strain (UChA and UChB)

The extreme use of ethanol causes metabolic and pathologic changes in testes and urogenital system in different animal species. The enzyme alcohol dehydrogenase (ADH) catalyses the conversion of ethanol into carcinogenic metabolite acetaldehyde which is partly excreted into the urine. However, papers relating the chronic ethanol consumption to the urethral morphology are unknown. This work evaluates the toxic effect of the chronic ethanol ingestion on the urethral epithelium of UChA and UChB rats. Conventional techniques of histology, histochemistry, immunohistochemistry and ultrastructural analysis were used. The analysis showed the presence of lipid drops and intercellular spaces in the epithelial cells in the urethra of UChA and UChB rats compared to control rats. Urethral neuroendocrine cell were observed and characterized for presenting vesicles containing electron-dense granules associated with nervous fibers. We conclude that the chronic consumption of ethanol induces the presence lipid drops in the epithelial cells of the urethra of UChA and UChB rats. The NE cells of the urethra of UChA and UChB rats did not show alterations under chronic effect of the ethanol. (C) 2007 Elsevier Ltd. All rights reserved.