Determination of disease biomarkers in Eucalyptus by comprehensive two-dimensional gas chromatography and multivariate data analysis

In this paper is reported the use of the chromatographic profiles of volatiles to determine disease markers in plants - in this case, leaves of Eucalyptus globulus contaminated by the necrotroph fungus Teratosphaeria nubilosa. The volatile fraction was isolated by headspace solid phase microextraction (HS-SPME) and analyzed by comprehensive two-dimensional gas chromatography-fast quadrupole mass spectrometry (GC. ×. GC-qMS). For the correlation between the metabolic profile described by the chromatograms and the presence of the infection, unfolded-partial least squares discriminant analysis (U-PLS-DA) with orthogonal signal correction (OSC) were employed. The proposed method was checked to be independent of factors such as the age of the harvested plants. The manipulation of the mathematical model obtained also resulted in graphic representations similar to real chromatograms, which allowed the tentative identification of more than 40 compounds potentially useful as disease biomarkers for this plant/pathogen pair. The proposed methodology can be considered as highly reliable, since the diagnosis is based on the whole chromatographic profile rather than in the detection of a single analyte. © 2013 Elsevier B.V..

Development and validation of an environmentally friendly attenuated total reflectance in the mid-infrared region method for the determination of ethanol content in used engine lubrication oil

Lubricating oils are crucial in the operation of automotive engines because they both reduce friction between moving parts and protect against corrosion. However, the performance of lubricant oil may be affected by contaminants, such as gasoline, diesel, ethanol, water and ethylene glycol. Although there are many standard methods and studies related to the quantification of contaminants in lubricant oil, such as gasoline and diesel oil, to the best of our knowledge, no methods have been reported for the quantification of ethanol in used Otto cycle engine lubrication oils. Therefore, this work aimed at the development and validation of a routine method based on partial least-squares multivariate analysis combined with attenuated total reflectance in the mid-infrared region to quantify ethanol content in used lubrication oil. The method was validated based on its figures of merit (using the net analyte signal) as follows: limit of detection (0.049%), limit of quantification (0.16%), accuracy (root mean square error of prediction=0.089% w/w), repeatability (0.05% w/w), fit (R 2 =0.9997), mean selectivity (0.047), sensitivity (0.011), inverse analytical sensitivity (0.016% w/w-1) and signal-to-noise ratio (max: 812.4 and min: 200.9). The results show that the proposed method can be routinely implemented for the quality control of lubricant oils. © 2013 Elsevier B.V. All rights reserved.

Análise de séries temporais de coordenadas estimadas com GPS: uma proposta metodológica para eliminação de efeitos sazonais

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Modelo de avaliação de maturidade em gerenciamento de projetos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Fast determination of beef quality parameters with time-domain nuclear magnetic resonance spectroscopy and chemometrics

The noteworthy of this study is to predict seven quality parameters for beef samples using time-domain nuclear magnetic resonance (TD-NMR) relaxometry data and multivariate models. Samples from 61 Bonsmara heifers were separated into five groups based on genetic (breeding composition) and feed system (grain and grass feed). Seven sample parameters were analyzed by reference methods; among them, three sensorial parameters, flavor, juiciness and tenderness and four physicochemical parameters, cooking loss, fat and moisture content and instrumental tenderness using Warner Bratzler shear force (WBSF). The raw beef samples of the same animals were analyzed by TD-NMR relaxometry using Carr-Purcell-Meiboom-Gill (CPMG) and Continuous Wave-Free Precession (CWFP) sequences. Regression models computed by partial least squares (PLS) chemometric technique using CPMG and CWFP data and the results of the classical analysis were constructed. The results allowed for the prediction of aforementioned seven properties. The predictive ability of the method was evaluated using the root mean square error (RMSE) for the calibration (RMSEC) and validation (RMSEP) data sets. The reference and predicted values showed no significant differences at a 95% confidence level.

Classification of intact açai (Euterpe oleracea Mart.) and jucara (Euterpe edulis Mart) fruits based on dry matter content by means of near infrared spectroscopy

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Efeitos ambientais e genéticos sobre escores visuais e ganho de peso à desmama de animais formadores da raça Brangus

Estudaram-se os efeitos da idade da vaca ao parto e da idade do animal à desmama, bem como os efeitos genéticos aditivo direto e materno e da heterozigose individual, sobre os escores visuais de conformação, precocidade e musculatura e ganho de peso do nascimento à desmama, de animais formadores da raça Brangus. Foram analisados 53.683, 45.136, 52.937 e 56.471 dados de conformação, precocidade e musculatura à desmama e ganho de peso do nascimento à desmama, respectivamente, de animais nascidos entre 1986 e 2002, provenientes do arquivo zootécnico da empresa Gensys Consultores Associados S/C Ltda. Os efeitos de ambiente e genéticos sobre as características em estudo foram analisados pelo método de quadrados mínimos usando modelos matemáticos que incluíram grupo de contemporâneos como variável classificatória e a idade da vaca ao parto, a idade do animal à desmama e os efeitos aditivo direto e materno e da heterozigose individual como co-variáveis. Todos os efeitos incluídos nos modelos afetaram significativamente as características avaliadas, com exceção do efeito da idade da vaca ao parto sobre o ganho de peso do nascimento à desmama e do efeito aditivo materno sobre todas as características estudadas. Os efeitos ambientais e genéticos revelaram-se importantes fontes de variação para as características estudadas e devem, pois, ser considerados na distinção e comparação dos animais para seleção.

Endogamia em um rebanho da raça Guzerá

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Effect of crude protein levels and organic selenium supplementation in the diets fed during the breeding season on reproductive parameters of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens)

There is little information on the nutrition of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens) reared in captivity, and their nutritional requirements still need to be determined. This study aimed at determining dietary crude protein requirements and testing four organic selenium supplementation levels in the diet of red-winged tinamous during the breeding season. Birds were housed in a conventional broiler house divided in 16 boxes with one male and three females each. Iso-energy (2800kcal ME/kg) pelleted feeds, based on corn and soybean meal, were supplied in tube feeders. In the first experiment, treatments consisted of four different diets containing different crude protein (CP) contents (15, 18, 21, or 24%) and in the second experiment, the four diets contained equal protein level (22.5%) and four different organic selenium levels (0, 0.2, 0.4, or 0.8ppm). Data were analyzed by the least square method. The best egg weight and eggshell thickness were obtained with 22.5% dietary CP. Organic selenium did not influence the studied reproductive traits of red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens) males or females.

Models for the analysis of growth curves for rearing tinamous (Rhynchotus rufescens) in captivity

Growth curves models provide a visual assessment of growth as a function of time, and prediction body weight at a specific age. This study aimed at estimating tinamous growth curve using different models, and at verifying their goodness of fit. A total number 11,639 weight records from 411 birds, being 6,671 from females and 3,095 from males, was analyzed. The highest estimates of a parameter were obtained using Brody (BD), von Bertalanffy (VB), Gompertz (GP,) and Logistic function (LG). Adult females were 5.7% heavier than males. The highest estimates of b parameter were obtained in the LG, GP, BID, and VB models. The estimated k parameter values in decreasing order were obtained in LG, GP, VB, and BID models. The correlation between the parameters a and k showed heavier birds are less precocious than the lighter. The estimates of intercept, linear regression coefficient, quadratic regression coefficient, and differences between quadratic coefficient of functions and estimated ties of quadratic-quadratic-quadratic segmented polynomials (QQQSP) were: 31.1732 +/- 2.41339; 3.07898 +/- 0.13287; 0.02689 +/- 0.00152; -0.05566 +/- 0.00193; 0.02349 +/- 0.00107, and 57 and 145 days, respectively. The estimated predicted mean error values (PME) of VB, GP, BID, LG, and QQQSP models were, respectively, 0.8353; 0.01715; -0.6939; -2.2453; and -0.7544%. The coefficient of determination (RI) and least square error values (MS) showed similar results. In conclusion, the VB and the QQQSP models adequately described tinamous growth. The best model to describe tinamous growth was the Gompertz model, because it presented the highest R-2 values, easiness of convergence, lower PME, and the easiness of parameter biological interpretation.

Seleção para peso pós-desmama em um rebanho Gir. 1. Resposta direta e correlacionada em 21 anos de seleção

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estudo preliminar da influência do perímetro escrotal sobre a libido em touros jovens da raça Nelore

O perímetro escrotal (PE) de 202 touros jovens da raça Nelore, sem experiência sexual prévia, classificados pela Associação Brasileira de Criadores de Zebu como superiores ou elite, foi medido aos 7, 12, 18 e 28 meses de idade, aproximadamente. Após a última medição, eles foram submetidos ao teste de libido e procedeu-se à colheita de sêmen por eletroejaculação, seguida de avaliação andrológica. As medidas do PE aos 7, 12, 18 e 28 meses foram de 18,30; 22,29; 27,54 e 33,26cm, respectivamente. Os coeficientes de correlação simples entre estas medidas variaram de 0,35 a 0,53. O coeficiente de correlação entre PE aos 28 meses e peso corporal na mesma idade foi de 0,43. A correlação entre a nota da libido e o perímetro escrotal medido aos l8 meses foi de 0,15 e entre aquela e o perímetro escrotal aos 28 meses foi de 0,13. Observou-se elevado crescimento do perímetro escrotal entre o 7º e 18º meses de idade. Utilizou-se o método de quadrados mínimos para analisar a libido, incluindo ano de nascimento como efeito fixo e como covariáveis os efeitos lineares da idade e peso no momento da avaliação e medidas de perímetro escrotal aos 7, l2, l8 e 28 meses. Cada covariável foi retida de forma seqüencial obtendo-se vários modelos de análises e as somas de quadrados foram decompostas de forma seqüencial e parcial. O ano de nascimento, a idade e o perímetro escrotal aos 18 meses de idade afetaram significativamente a libido. Os coeficientes de correlação entre a libido e concentração espermática, motilidade, peso e idade do animal no momento da avaliação foram de 0,34, 0,l6, 0,38 e 0,35, respectivamente.

Efeito da endogamia sobre características de crescimento de bovinos da raça Gir no Brasil

Esta pesquisa foi conduzida com o objetivo de avaliar o efeito da endogamia e suas possíveis influências sobre o crescimento de bovinos de corte. Foram utilizadas 27.406 observações de peso à desmama, padronizado aos 205 dias (PD), e 14.317 informações de peso ao ano, padronizado aos 365 dias (PA), de animais da raça Gir, no período de 1970 a 1995. As análises foram feitas pelo método dos quadrados mínimos, incluindo-se o efeito aleatório de grupo contemporâneo e os efeitos fixos de geração (discreto), idade da vaca ao parto e taxa de endogamia do bezerro e da vaca como variáveis contínuas, considerando-se os efeitos linear e quadrático. Apenas 11,65% das vacas, 19,84% dos touros e 9,23% dos bezerros da raça Gir estudados apresentaram algum grau de endogamia e as estimativas das médias de endogamia foram de pequena magnitude, constatando-se valores de 1,04; 0,96; e 1,66% para vacas, touros e bezerros, respectivamente. O efeito da endogamia do animal foi significativo e quadrático para as duas características estudadas. Os resultados mostraram depressão endogâmica para ambas as características (PD e PA). Recomenda-se evitar os acasalamentos, intencionalmente, endogâmicos e monitorar os acasalamentos com base no parentesco entre os indivíduos, visando manter baixas as taxas de endogamia.

Estimação de fatores de correção do perímetro escrotal para idade e peso corporal em touros jovens da raça Nelore

Neste trabalho foram estudados os efeitos de idade e peso sobre o perímetro escrotal (PE) de touros jovens da raça Nelore e estimados os fatores de correção (FC) do PE para esses efeitos. As informações utilizadas pertencem aos Registros de Produção da Associação Paraguaia dos Criadores de Nelore, obtidos entre 1986 e 1997, de 110 criatórios, totalizando 7458 observações. Os coeficientes de regressão que permitiram o cálculo dos FCs para o PE foram estimados pelo método dos quadrados mínimos, empregando-se um modelo que considerou o grupo contemporâneo (animais nascidos no mesmo ano, estação, rebanho, avaliados na mesma data e do mesmo grupo de manejo alimentar na desmama e no sobreano), o efeito linear da idade em dias e os efeitos linear e quadrático do peso aos 570 dias de idade (P570). O efeito da idade sobre o PE foi igual a 0,0383(±0,0024) cm/dia e do P570 sobre o PE corrigido para essa idade, 0,0708(±0,0049) cm/kg, efeito linear, e -0,0000413(±0,0000074) cm/kg², efeito quadrático. A idade e o peso do animal foram importantes fontes de variação a serem removidas do PE, como indicativo da precocidade sexual de touros de sobreano.

Adaptive filter feature identification for structural health monitoring in an aeronautical panel

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)