Frequencies of virulence genes and pulse field gel electrophoresis fingerprints in Escherichia coli isolates from canine pyometra

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Reaction and colonization of common bean genotypes by Curtobacterium flaccumfaciens pv. Flaccumfaciens

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Genetic characterization and nitrogen fixation capacity of Rhizobium strains on common bean

O objetivo deste trabalho foi a caracterização genética de quatro novas estirpes de Rhizobium e a avaliação de sua capacidade de fixação de N2 e nodulação, comparadas a estirpes comerciais e à população nativa de rizóbios de um Latossolo Vermelho. Dois experimentos foram conduzidos em blocos ao acaso, em casa de vegetação. No primeiro experimento, conduzido em tubetes com vermiculita, avaliaram-se a nodulação e a capacidade de fixação das novas estirpes, em comparação com as estirpes comerciais CIAT-899 e PRF-81 e com a população nativa do solo. Das colônias puras isoladas, extraiu-se o DNA genômico e realizou-se o seqüenciamento do espaço intergênico, para a caracterização genética das estirpes e da população nativa de rizóbios. O segundo experimento foi realizado em vasos com solo, para determinação da produtividade e da nodulação do feijoeiro, cultivar Pérola, com o uso das estirpes isoladamente ou em mistura com a PRF-81. A população nativa do solo foi identificada como Rhizobium sp. e se mostrou ineficiente na fixação de nitrogênio. Foram encontradas três espécies de Rhizobium entre as quatro novas estirpes. As estirpes LBMP-4BR e LBMP-12BR estão entre as que têm maior capacidade de nodulação e fixação de N2, e apresentam respostas diferenciadas quando misturadas à PRF-81.

Spray deposition on weeds of common bean crops

A.C.P. Rodrigues-Costa, D. Martins, N.V. Costa, and M.R.R. Pereira. 2011. Spray deposition on weeds of common bean crops. Cien. Inv. Agr. 38(3): 357-365. Weed control failure in common bean (Phaseolus vulgaris L.) production may be related to inappropriate herbicide application techniques. The purpose of this study, therefore, was to evaluate the amount of spray solution deposition that occurred on the weeds, Bidens pilosa L. and Brachiaria plantaginea (Link) Hitch., both within and between rows of common beans. The research was arranged in a randomized block design with four replications. The following 6 spray nozzles were used: flat fan nozzles XR 110015 VS (150 L ha(-1)) and XR 11002 VS (200 L ha(-1)); cone nozzles TX VK 6 (150 L ha(-1)) and TX VK 8 (200 L ha(-1)); and twin flat fan nozzles TJ60 11002 VS (150 L ha(-1)) and TJ60 11002 VS (200 L ha-1). The results showed that the loss of the spray solution on the soil occurred mainly within the bean rows and with a high intensity when using a nozzle spraying 200 L ha(-1). At 30 days after sowing, the TX (150 L ha(-1)) nozzle was the only nozzle that promoted deposits of less than 210.0 mu L g(-1) of dry mass. The spray nozzles showed a good performance in the deposition of the spray solution on the weeds that occurred both within and between the rows. However, for both species there was great variation in individual deposits depending on their location in relationship to the plants.

The nitrogen sufficiency index underlying estimates of nitrogen fertilization requirements of common bean

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Nitrogen fertilization and soil management of winter common bean crop

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

ISOENZYMATIC POLYMORPHISM and ACTIVITY of PEROXIDASES of COMMON BEAN(Phaseolus vulgaris L.) UNDER SALINE STRESS

Uma das utilizações da técnica de cultura de tecidos para o melhoramento vegetal é a identificação de linhas de células que apresentem tolerância ao estresse salino. Para se estudar os mecanismos bioquímicos envolvidos na expressão genética da tolerância a salinidade, calos oriundos de eixos embrionários de quatro cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris L.; cultivares IAC - carioca, IAPAR 14, JALO-EEP 558, BAT - 93), foram cultivados em meio sólido Murashige & Skoog (1962), suplementado com NaCl nas concentrações de 0, 20, 40, 60 e 80 mM. Após 14 dias de incubação, os calos foram coletados e analisados quanto aos padrões isoenzimáticos e de atividade das peroxidases. Os cultivares BAT e IAPAR apresentaram duas zonas de atividade em comum na região anódica e apenas uma zona enzimática específica a cada um deles (migração mais rápida).Possivelmente as duas zonas anódicas intermediárias sejam produtos do mesmo loco enzimático, porém com alelos diferentes, consequentemente diferentes mobilidades eletroforéticas. O cv. JALO apresentou duas zonas anódicas de atividade em comum com os cultivares IAC e IAPAR com uma zona anódica exclusiva de migração mais lenta, a qual apresentou atividade mais intensa de todos os cultivares analisados. Este cultivar revelou ainda uma zona catódica provavelmente dimérica e heterozigota nos indivíduos de todos os tratamentos aplicados. Provavelmente, esta é a mesma zona que ocorre em homozigose com fixação do alelo lento para os indivíduos de todos os tratamentos efetuados nos cultivares BAT e IAPAR. O cv. IAC apresentou duas bandas anódicas em comum com os cv. IAPAR e JALO. Apresentou também a banda anódica mais rápida em comum com o cv. IAPAR e uma banda anódica exclusiva de migração mais lenta. Curiosamente, os indivíduos deste cv. mantidos em meio suplementado com 20 mM de NaCl não apresentaram atividade nas três zonas anódicas mais lentas. Ocorreu no cv. IAC uma única zona de atividade catódica, dimérica e heterozigota para os indivíduos provenientes de todos os tratamentos, composta provavelmente de dois alelos diferentes da zona correspondente ao cv. JALO. Amostras provenientes dos tratamentos 40 e 60 mM de NaCl, desta zona catódica, apresentaram maior atividade enzimática. A análise da atividade da peroxidase no extrato bruto, revelou que os cultivares responderam diferentemente ao aumento da concentração salina no meio de cultura, com aumento pronunciado dessa atividade nos cultivares IAC e JALO.

Magnesium levels in nutrient solution and common bean (Phaseolus vulgaris L cv Carioca) development. Evaluation of the growth relations and assimilate partitioning

The effect of magnesium levels in nutrient solution upon relation between shoot and root, leaf weight ratio and assimilate partitioning of common bean (Phaseolus vulgaris L. cv Carioca) was studied. Bean plants (3 per pot) were grown in 6 l pots containing Hoagland & Arnon n. 2 solution modified to obtain 2.4, 24.3, 48.6, 72.9 and 97.2 ppm of magnesium. The experimental design was a completely randomized factorial replicated 3 times with 5 levels of magnesium and 5 samplings wich were done forthnightly. Therefore, it may be suggested that the 48.6 ppm of magnesium level proposed by Hoagland & Amen (1950) is the best choice for the common bean, according to the conditions of this experiment. Magnesium concentrations over 48.6 ppm didn't show significant alterations of the evaluated parameters. Nutrient solution with 2.4 ppm of magnesium content provides higher efficiency to the common bean plants during almost all its cycle, except the final of the reproductive phase. These results suggest that magnesium concentration increased to 48.6 ppm, in the cycle final perhaps could increase the productivity.

PrimerSNP: a web tool for whole-genome selection of allele-specific and common primers of phylogenetically-related bacterial genomic sequences

Background: The increasing number of genomic sequences of bacteria makes it possible to select unique SNPs of a particular strain/species at the whole genome level and thus design specific primers based on the SNPs. The high similarity of genomic sequences among phylogenetically-related bacteria requires the identification of the few loci in the genome that can serve as unique markers for strain differentiation. PrimerSNP attempts to identify reliable strain-specific markers, on which specific primers are designed for pathogen detection purpose.Results: PrimerSNP is an online tool to design primers based on strain specific SNPs for multiple strains/species of microorganisms at the whole genome level. The allele-specific primers could distinguish query sequences of one strain from other homologous sequences by standard PCR reaction. Additionally, PrimerSNP provides a feature for designing common primers that can amplify all the homologous sequences of multiple strains/species of microorganisms. PrimerSNP is freely available at http://cropdisease.ars.usda.gov/similar to primer.Conclusion: PrimerSNP is a high-throughput specific primer generation tool for the differentiation of phylogenetically-related strains/species. Experimental validation showed that this software had a successful prediction rate of 80.4 - 100% for strain specific primer design.

Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli em feijoeiro: sobrevivência em restos de cultura e ocorrência em sementes produzidas no estado do Paraná

Pós-graduação em Agronomia (Proteção de Plantas) - FCA

Age of No-Till System and Nitrogen Management on Common Bean Nutrition and Yield

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Outbreaks of Chrysodeixis includens (Walker) (Lepidoptera: Noctuidae) in common bean and castor bean in São Paulo State, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Antixenosis and tolerance to Diabrotica speciosa (Coleoptera: Chrysomelidae) in common bean cultivars

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Early growth of common bean cropped over ruzigrass residues

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)