Allometric analysis of the ontogenetic variation and evolution of the skull in Caiman spix, 1825 (Crocodylia: Alligatoridae)

We studied ontogenetic variation in the shape of the skull among species of Caiman using principal component analysis. Comparison of multivariate allometric coefficients and ontogenetic trends between size and shape reveals that C. sclerops and C. yacare have similar ontogenetic processes, and they are more related to each other than either is to C. latirostris. Allometric relationships of the characters measured are similar in all species studied. The greater differences were in the width measurements, with higher coefficients in shape (second principal component) for C. latirostris, and length measurements with higher coefficients in shape for C. yacare and C. sclerops. The ontogenetic process leading to change in skull shape in the group seems to be plesiomorphic for elongation and derived for broadening. Statistical comparison of the ontogenetic trends with models of allometric heterochrony suggests that C. latirostris has diverged from the other species by a neotenic process, and that C. sclerops is separated from C. yacare by ontogenetic scaling (progenesis).

Comparative studies of the sample decomposition of green and roasted coffee for determination of nutrients and data exploratory analysis

The contents of some nutrients in 35 Brazilian green and roasted coffee samples were determined by flame atomic absorption spectrometry (Ca, Mg, Fe, Cu, Mn, and Zn), flame atomic emission photometry (Na and K) and Kjeldahl (N) after preparing the samples by wet digestion procedures using i) a digester heating block and ii) a conventional microwave oven system with pressure and temperature control. The accuracy of the procedures was checked using three standard reference materials (National Institute of Standards and Technology, SRM 1573a Tomato Leaves, SRM 1547 Peach Leaves, SRM 1570a Trace Elements in Spinach). Analysis of data after application of t-test showed that results obtained by microwave-assisted digestion were more accurate than those obtained by block digester at 95% confidence level. Additionally to better accuracy, other favorable characteristics found were lower analytical blanks, lower reagent consumption, and shorter digestion time. Exploratory analysis of results using Principal Component Analysis (PCA) and Hierarchical Cluster Analysis (HCA) showed that Na, K, Ca, Cu, Mg, and Fe were the principal elements to discriminate between green and roasted coffee samples. ©2007 Sociedade Brasileira de Química.

Chemometric analysis of Hymenoptera toxins and defensins: A model for predicting the biological activity of novel peptides from venoms and hemolymph

When searching for prospective novel peptides, it is difficult to determine the biological activity of a peptide based only on its sequence. The trial and error approach is generally laborious, expensive and time consuming due to the large number of different experimental setups required to cover a reasonable number of biological assays. To simulate a virtual model for Hymenoptera insects, 166 peptides were selected from the venoms and hemolymphs of wasps, bees and ants and applied to a mathematical model of multivariate analysis, with nine different chemometric components: GRAVY, aliphaticity index, number of disulfide bonds, total residues, net charge, pI value, Boman index, percentage of alpha helix, and flexibility prediction. Principal component analysis (PCA) with non-linear iterative projections by alternating least-squares (NIPALS) algorithm was performed, without including any information about the biological activity of the peptides. This analysis permitted the grouping of peptides in a way that strongly correlated to the biological function of the peptides. Six different groupings were observed, which seemed to correspond to the following groups: chemotactic peptides, mastoparans, tachykinins, kinins, antibiotic peptides, and a group of long peptides with one or two disulfide bonds and with biological activities that are not yet clearly defined. The partial overlap between the mastoparans group and the chemotactic peptides, tachykinins, kinins and antibiotic peptides in the PCA score plot may be used to explain the frequent reports in the literature about the multifunctionality of some of these peptides. The mathematical model used in the present investigation can be used to predict the biological activities of novel peptides in this system, and it may also be easily applied to other biological systems. © 2011 Elsevier Inc.

Avaliação dos fatores abióticos e bióticos de uma área petroquímica da região de Paulínia, SP, e fotodocumentação dos fungos transientes isolados

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Microbiologia Aplicada) - IBRC

Multivariate curve resolution analysis applied to time-resolved synchrotron X-ray Absorption Spectroscopy monitoring of the activation of copper alumina catalyst

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Singular Value Decomposition and Ligand Binding Analysis

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Design e semântica: investigação de técnicas estatísticas para auxílio no projeto de produto

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Integrated sediment quality assessment in Paranagua Estuarine System, Southern Brazil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Eutrophization process in a system used for rearing the nile tilapia (Oreochromis niloticus), São Paulo State, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Photosynthesis induction in Eucalyptus urograndis seedlings and cuttings measured by Open Photoacoustics

In this work we study the photosynthetic induction in Eucalyptus urograndis leaves using the Open Photoacoustic Cell Technique. In vivo and in situ measurements were performed in leaves of four months-old E. urograndis seedlings and C041 cuttings previously dark-adapted for at least 10 h. Experimental results for the gas exchange component of the photoacoustic (PA) signal are interpreted considering that a gas uptake component would have a phase angle nearly opposite to that of the oxygen evolution component. Analysis of the photosynthetic induction data shows that seedlings present a net oxygen evolution before cuttings, but cuttings reach a higher steady-state photosynthetic activity.

Germinação de sementes de guandu sob efeito da disponibilidade hídrica e de doses subletais de alumínio

O objetivo deste trabalho foi verificar a germinação de sementes das cultivares de guandu, IAPAR 43-Aratã e IAC Fava Larga, sob efeito da disponibilidade hídrica e de doses subletais de alumínio. Os experimentos foram instalados na Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias-UNESP, em Jaboticabal (SP), no período de março a maio de 2002. As sementes foram colocadas em caixas de germinação, previamente esterilizadas, revestidas com uma folha de papel germitest umedecido com diferentes concentrações de PEG 6000 (0,0; -0,6; -0,9; -1,2 e -1,5 MPa) e de sulfato de alumínio (0,0; 2,5; 5,0; 7,5; e 10,0 mmol.dm-3). O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado em arranjo fatorial 2 x 5 x 5 (cultivares x disponibilidades hídricas x alumínio), com quatro repetições de 50 sementes. Para complementar a análise estatística foram realizadas análises multivariadas de agrupamento e componentes principais. O experimento foi desenvolvido em câmara de germinação, na temperatura de 25 ºC. A porcentagem de germinação foi verificada no 4.º e 10.º dias após a semeadura. No 10.º dia, as plântulas foram separadas em plúmulas e raízes primárias, para determinar a massa seca. A disponibilidade hídrica foi limitante para a germinação e o crescimento inicial. O efeito do alumínio associado ao estresse hídrico foi evidenciado somente até -0,9 MPa. As concentrações menos elevadas de alumínio estimularam o desenvolvimento das plântulas em condições de estresse hídrico até -0,6 MPa. Os efeitos simultâneos da disponibilidade hídrica e do alumínio reduziram a germinação de sementes da cv. IAC Fava Larga e o crescimento das raízes da cv. IAPAR 43-Aratã.

Abordagem multivariada envolvendo características físicas e morfológicas do sêmen bovino, idade dos touros e época de colheita de sêmen

Avaliaram-se as relações entre características físicas e morfológicas do sêmen de bovinos das subespécies Bos taurus taurus e Bos taurus indicus com a idade dos touros e a época de colheita do sêmen. Utilizaram-se observações feitas durante o período de 1993 a 1999, em 42 touros com 12 a 174 meses de idade, divididos em cinco classes: Bos taurus taurus - 12 a 36 meses; 37 a 60 meses; 61 a 84 meses; 85 a 108 meses; e 109 a 138 meses; e Bos taurus indicus - 12 a 42 meses; 43 a 72 meses; 73 a 102 meses; 103 a 132 meses; e 133 a 174 meses. As características analisadas foram: volume, turbilhonamento espermático, concentração espermática, motilidade espermática, vigor espermático, anormalidades espermáticas e integridade do acrossoma. No processamento das análises, utilizaram-se as médias das características em cada classe de idade e o mês de colheita de sêmen durante o período de 1993 a 1999. As técnicas estatísticas multivariadas de componentes principais e de agrupamento hierárquico mostraram resultados que podem contribuir na escolha de sêmen de melhor qualidade. As classes 103 a 132 meses e 133 a 174 meses para a subespécie Bos taurus indicus e a classe de idade 109 a 138 meses para a subespécie Bos taurus taurus foram as mais contrastantes. Para ambas as subespécies, nos meses mais úmidos, o sêmen apresentou menor qualidade, principalmente na subespécie Bos taurus taurus. As características do sêmen mais contrastantes no estudo por classes e no período de coleta de sêmen foram: vigor espermático, motilidade espermática, concentração espermática, integridade do acrossoma e anormalidades terciárias no sêmen.

Fractal dimension and anisotropy of soil CO2 emission in a mechanically harvested sugarcane production area

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Soil CO2 emission and its relation to soil properties in sugarcane areas under Slash-and-burn and Green harvest

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise espacial dos fatores da equação universal de perda de solo em área de nascentes

O objetivo deste trabalho foi avaliar a perda de solo de área de nascentes da Microbacia do Córrego do Tijuco, SP. Foi utilizada a análise espacial dos fatores da equação universal da perda de solo (EUPS), em integração com análise de componentes principais e geoestatística. A perda de solo média, estimada para a área, foi de 118,5 Mg ha‑1 por ano, considerada alta. Próximo à zona urbana, houve alta interação dos fatores erosividade da chuva e práticas conservacionistas, o que evidencia grande perda de solo, em razão da concentração da água proveniente da camada impermeabilizada urbana, com alta velocidade de escoamento. Nos divisores de águas, a atuação da erodibilidade foi proeminente, em contraste com o fator topográfico. Foram observadas áreas com atuação conjunta destes fatores, inclusive em locais de inclinação suave, porém com alto potencial natural de erosão. A interação das análises multivariadas e geoestatística permite a estratificação da área, identifica locais com propriedades específicas quanto à perda de solo, e espacializa os fatores do processo erosivo e suas interações ao longo do relevo.