Diversity and genetic population structure of the Brazilian sharpnose shark Rhizoprionodon lalandii

Similar to many small, range-restricted elasmobranchs, the Brazilian sharpnose shark (Rhizoprionodon lalandii) is listed as 'data deficient' by the International Union for the Conservation of Nature (IUCN). Data on stock assessment and sustainability are scarce, and there is no information on population structure. This constitutes a management problem because this shark comprises approximately 50% of the catch of small coastal sharks in Brazil. In this study, populations of R. lalandii distributed from the Caribbean to southern Brazil were investigated using sequences from the mitochondrial DNA control region. Analysis of molecular variance revealed strong structuring between population samples from the Caribbean and those from the Brazilian coast (F{cyrillic}ST=0.254, P<0.0001). Significant differences in the rates of genetic diversity between these major areas were also detected. The observed levels of population structuring are likely to be driven by female phylopatry. Therefore, the identification of both mating and nursery areas with parallel ban/restriction of fishing in these areas may be critical for the long-term sustainability of these populations. © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.

From widespread to microendemic: Molecular and acoustic analyses show that Ischnocnema guentheri (Amphibia: Brachycephalidae) is endemic to Rio de Janeiro, Brazil

Many species of tropical amphibians are restricted to very small ranges, and this microendemism coupled with ongoing habitat loss and susceptibility to emerging pathogens imperils the long-term persistence of these species. Incomplete taxonomic and distributional knowledge may obscure conservation assessment, particularly in putatively widespread species that are typically considered to be of Least Concern in Red List assessments, but that in fact may constitute complexes of partly microendemic species. Such is the case in the Steindachner's Robber Frog, Ischnocnema guentheri which, together with the recently recognized Ischnocnema henselii, is thought to occupy most of the Brazilian Atlantic Forest. To test whether these taxa may constitute a species complex of range-restricted and thus potentially threatened species, we analyzed 160 samples of I. guentheri and/or I. henselii for two molecular markers, 16S rRNA (16S) and recombination activation gene 1 (RAG1). To verify the monophyly of the complex, closely related species were also included in the 16S analysis. Congruent evidence from the molecular data and from analyses of advertisement calls support the existence of six distinct species within the complex: I. guentheri and I. henselii as well as four candidate new species. The lineages are distributed as a mosaic in the Atlantic Forest and are sympatric at some localities without indication of admixture. Their phylogeographical pattern partially agrees with paleo-models for the Atlantic Forest, but also suggests the existence of micro-refugia in less stable areas. I. guentheri, previously considered to be widespread, was found only in its type locality, a reserve within the urban area of Rio de Janeiro city. Although none of the species studied appears highly threatened with extinction, we recommend their IUCN threat status to be re-evaluated carefully for the next comprehensive update of the Red List of Brazil's amphibians. © 2013 Springer Science+Business Media Dordrecht.

Caracterização da estrutura genética populacional do tubarão-crocodilo (Pseudocarcharias kamoharai) no Atlântico equatorial utilizando marcadores moleculares

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Avaliação da existência de isolamento reprodutivo entre distintos citótipos de veado-mateiro (Mazama americana) por meio de machos híbridos

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise da variabilidade e estruturação genética do tubarão azul, Prionace glauca (Chondrichthyes, Carcharhinidae) no Oceano Atlântico Sul Ocidental utilizando marcador molecular do DNA mitocondrial

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Efeitos da defaunação na comunidades de pequenos mamíferos na Mata Atlântica

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Revisão taxonômica de Sabiaceae Blume para o neotrópico

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Evolução cromossômica na Ordem Xenarthra

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Reprodução em cativeiro de piracanjuba Brycon orbignyanus assistida por marcador molecular como estratégia de conservação

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Zoologia) - IBB

Biogeografia histórica e conservação das serpentes da floresta pluvial atlântica costeira do Brasil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Rarity as an indicator of endangerment in neotropical frogs

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Análises moleculares como ferramentas voltadas ao estudo do boto-cinza (Sotalia guianensis) na região do Lagamar de Cananéia

Dentre os mamíferos marinhos presentes na costa brasileira, Sotalia guianensis (subordem Odontoceti, família Delphinidae) é um dos mais comumente encontrados, possuindo ampla distribuição pela América do Sul e Central. Pelo fato de apresentar hábito costeiro, esta espécie encontra-se diretamente relacionada com impactos de origem antrópica tais como poluição, pesca acidental ou degradação de habitats. Somado a estes fatores, a falta de informações relatada pela IUCN surge como outro ponto de preocupação, visto que não se sabe de fato qual o grau de conservação dessa espécie. Por este motivo o presente estudo pretende avaliar características populacionais existentes nos grupos de S. guianensis na região do Lagamar de Cananéia, litoral sul de São Paulo, utilizando-se de microssatélites. Para tanto, aspectos referentes à diversidade genética, grau de parentesco e fluxo gênico entre áreas estuarinas e de mar aberto foram considerados. A amostragem é composta por 22 tecidos oriundos de indivíduos de mar aberto e 11 estuarinos, coletados entre os anos de 1996 e 2009. O material foi amplificado por PCR utilizando-se de oito locos específicos para a espécie. O presente estudo concluiu que a diversidade genética (número de alelos, riqueza alélica, heterozigosidade esperada e observada) ocorrente no grupo de estudo é considerada como moderada quando comparada a outras populações de S. guianensis estudadas. Após a retirada dos locos com indício da presença de alelos nulos, a população mostrou-se em equilíbrio de Hardy-Weinberg, como revelado também pelo valor de FIS. Corroborando com o nível de diversidade genética encontrado, foram avaliados baixos índices de parentesco, sem diferenças significativas entre os grupos em comparação (estuário e mar aberto), bem como entre os sexos, indicando a ausência de dispersão sexo assimétrica... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Identificação sexual da anta (Tapirus terrestris) por meio de marcadores de DNA

A identificação sexual de indivíduos é extremamente importante para planos de conservação de espécies ameaçadas, pois em muitas espécies, machos e fêmeas apresentam diferenças quanto ao uso de hábitat, estratégias comportamentais e sucesso reprodutivo. A diferença de comportamento entre machos e fêmeas em antas (Tapirus terrestris) ainda é pouco conhecida, mas estudos vem mostrando que esses animais podem apresentar diferentes comportamentos quanto à dispersão, uso de áreas e marcação de territórios por latrina. Antas compreendem animais de um antigo gênero de perissodáctilos, gênero Tapirus. Mesmo sendo a espécie deste gênero que possui a maior distribuição, que se estende por toda a América do sul cis-andina, as populações de T. terrestris vêm sendo reduzidas devido à destruição de seu habitat e à caça ilegal, sendo considerada, atualmente, uma espécie vulnerável segundo a IUCN. As antas desempenham um importante papel como dispersores de sementes, especialmente porque podem dispersar sementes maiores, em grande quantidade e a longas distâncias. Participam desse modo, da estrutura, manutenção e regeneração das florestas, sendo assim, seu declínio pode significar uma grande ameaça às espécies vegetais que produzem grandes frutos. Diante da dificuldade de realização de estudos por meio de técnicas tradicionais, análises genéticas não invasivas por meio de marcadores moleculares têm sido amplamente empregadas, utilizando-se amostras de DNA provenientes de fezes, urina e pêlo como fonte de DNA. A implementação de técnicas de obtenção de DNA a partir de amostras não-invasivas e o desenvolvimento de marcadores de DNA para identificação individual (microssatélites), tem possibilitado a geração de dados para estudos de censo populacional, os quais podem ser utilizados no desenvolvimento de planos de conservação...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Movimentação de indivíduos de uma população de antas (Tapirus terrestris) em uma paisagem fragmentada no cerrado do Mato Grosso do Sul

A anta é um megamamífero vulnerável à extinção (IUCN), apresenta baixa taxa reprodutiva e é uma espécie de elevada importância na manutenção da estrutura das florestas, este estudo pretende avaliar a movimentação de indivíduos de anta em uma paisagem antropizada no cerrado do Mato Grosso do Sul. Dada a dificuldade de estudos com técnicas tradicionais de campo, estão sendo realizadas análises moleculares de amostras não-invasivas (fezes) com marcadores microssatélites, a fim de estimar o número de indivíduos que utilizam essa área, além de gerar informações genéticas que podem ser úteis para auxiliar programas de conservação para esta espécie. Para tal, foram coletadas e georreferenciadas 41 amostras de fezes da área de estudo. Através da distribuição das amostras é possível inferir que as antas utilizam a área de floresta plantada de acordo com a disponibilidade do ambiente. O DNA de todas as amostras foi extraído e os locos microssatélites de interesse foram testados. Dez locos microssatélites foram testados, sendo que deste total cinco se mostraram mais eficientes, ou seja, foi possível realizar sua amplificação na grande maioria das amostras utilizadas e a genotipagem apresentou uma boa qualidade, possibilitando uma identificação confiável dos alelos. As amostras com o genótipo definido para pelo menos três locos foram selecionadas e analisadas no programa GIMLET para identificação individual e estimativa da PID (Probabilidade de Identidade) e nos programas FSTAT e GenAlex para estimativa da diversidade genética. Dentre 23 amostras analisadas, foram identificados 20 indivíduos, sendo 14 machos, 3 fêmeas e 3 de sexo indeterminado. A recaptura de três indivíduos possibilitou a verificação da movimentação destes pela área. O presente estudo mostrou, então, que as antas (Tapirus terrestris) utilizam as florestas plantadas de Eucalyptus... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Levantamento e censo de primatas em fragmentos florestais de mata atlântica na região de Sousas e Joaquim Egídio, Campinas, SP

A Mata Atlântica, um dos biomas mais ameaçados do mundo, possui alta biodiversidade e endemismos, restando apenas 7% de sua área original, e por isso considerada um hotspot. O município de Campinas está incluído no domínio vegetal de Mata Atlântica com transição para Cerrado, onde restam menos de 3% de floresta estacional semidecidual. A fragmentação de áreas naturais, a caça ilegal e a introdução de espécies exóticas são as principais causas de extinção de espécies. Neste estudo buscou-se identificar a riqueza e a densidade populacional de primatas em dez fragmentos de mata na região da Área de Proteção Ambiental de Sousas e Joaquim Egídio, área de ocorrência do sagüi-do-tufo-preto (Callithrix penicilatta), do macaco-prego (Cebus nigritus) e dos ameaçados, segundo a IUCN (2007), sagüi-da-serra-escuro (Callithrix aurita), sauá (Callicebus nigrifrons) e bugio-ruivo (Alouatta guariba clamitans). Os fragmentos variam entre dois e 24ha com formatos variados e de diferentes composições de capoeiras e matas secundárias, numa matriz agrícola, composta de pastagens, silvicultura e culturas perenes e anuais. O levantamento foi feito entre maio de 2007 e outubro de 2008 através de contagens absolutas dos grupos, diferenciados pelo local dos reavistamentos, composição sexual e etária. Cada avistamento foi georreferenciado com um GPS Garmin Camo Etrex®. Por serem territoriais, sauás foram atraídos através do uso de playbacks. A comunidade de primatas da Mata Ribeirão Cachoeira (245ha), maior remanescente local, é composta por cinco espécies. Sagüi-detufo- preto e bugio foram avistados em seis fragmentos e sauás em dois. Em cinco, foram observados grupos de Callithrix jacchus (sagüi-comum), exóticos na região. Em três fragmentos foram encontrados grupos mistos ou híbridos de Callithrix jacchus e C. penicillata. A área total...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)