Capacitive DNA detection driven by electronic charge fluctuations in a graphene nanopore

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Comprehensive genome methylation and whole genome expression analysis in penile carcinoma: Uncovering new molecular markers

Background: Penile carcinoma (PeCa) is frequently associated with high morbidity rates. Unlikely of the vast majority of tumors, there is no molecular markers described that are able to assist in diagnosis and prognosis or with potential to be therapeutic targets in PeCa. Patients and methods: DNA methylation status (244K Human DNA Methylation Microarray platform, Agilent Technologies) and large-scale expression analysis (4x44K Whole Human Genome Microarray, Agilent Technologies) were performed in 35 and 37 PeCa, respectively. Quantitative bisulfite pyrosequencing (qBP) and RT-qPCR were used to validate the findings in 93 samples. HPV status was assessed using the Linear Array HPV Genotyping kit (Roche Molecular Diagnostics, CA, USA). Results: Methylome analysis revealed 171 hypermethylated and 449 hypomethylated CpGs sites and the transcriptome profiling showed 2986 down- and 2817 over-expressed genes. HPV positivity was found in 32.7% of the cases, mainly the HPV16. The integrative analysis in 32 PeCa revealed a panel of 96 genes with inverse correlation between methylation and gene expression levels. The CpG hypermetlylation and gene downexpression, was confirmed for TWIST1, RSOP2, SOX3, SOX17, CD133, OTX2, HOXA3 and MEIS. In addition, BIRC5, DNMT1 and DNMT3B presented low levels of methylation and overexpression. The comparison of the results with clinical findings revealed that LIN28A, NKX2.2, NKX2.3, LHX5, BDNF, FOXA1 and CDX2 were associated with poor prognosis features. Conclusion: Putative prognostic markers were detected revealing that DNA methylation modulates the expression of several genes in PeCa. These data may prove instrumental for biomarker discovery in clinics and molecular epidemiology of PeCa.

Participação das principais frutas brasileiras no comércio internacional: 1997 a 2008

As tendências do mercado mundial de alimentos apontam para alto crescimento no consumo de produtos naturais, como as frutas e verduras. O mercado mundial de frutas frescas registrou, em 2005, cifra superior a US$ 31,5 bilhões e cresce US$ 1 bilhão ao ano, em média. Tal fato se reproduz no Brasil, onde se observa elevação do consumo de frutas. em termos monetários, o valor bruto da produção de frutas no Brasil atingiu, em 2006, cerca de R$ 16,3 bilhões, 16,5% do valor da produção agrícola brasileira. O presente trabalho buscou analisar características econômicas da participação brasileira no comércio mundial de frutas, entre 1997 e 2008. Ademais, foi analisada a evolução da balança comercial das principais frutas brasileiras, discriminação das exportações em frescas ou processadas, representatividade do comércio externo no valor da produção nacional e participação da exportação de frutas selecionadas na exportação total do agronegócio. Foram utilizados dados da Pesquisa de Orçamento Familiar (POF) do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística; o Sistema de Análise e Levantamento do Comércio Exterior - AliceWeb do Ministério do Desenvolvimento, Indústria e Comércio Exterior e o banco de dados do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Após levantamento das frutas que seriam estudadas, constatou-se que o crescimento das exportações foi maior que o crescimento das importações brasileiras de 1997 a 2008. Isso contribuiu para que o seu saldo comercial aumentasse em 112% no período. As exportações de frutas frescas cresceram relativamente mais que as exportações de frutas processadas. Porém houve queda da participação das exportações de frutas nas exportações do agronegócio brasileiro, de 5,8%, em 1997, para 3,9%, em 2008.

Anapyrexia during hypoxia

Reducing body temperature has been found to improve survival not only due to hypoxia (the main focus of this review) but also to ischemia, shock, and many other types of insults. Under these conditions, there is a reduced oxygen delivery to the brain. To compensate the hypoxia, a regulated hypothermia (anapyrexia-Glossary of terms for Thermal Physiology, Commission for Thermal Physiology, 2001) takes place, which has been reported as a beneficial response since the drop in body temperature causes a reduced oxygen demand. The objective of the present article is to review the current knowledge of the mechanisms of hypoxia-induced anapyrexia, focusing on its neurochemical control mainly at the preoptic region of the anterior hypothalamus. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Repercussões maternas e perinatais da hidroterapia na gravidez

OBJETIVO: estudar os efeitos maternos (composição corporal e capacidade cardiovascular) e perinatais (peso e prematuridade) da prática da hidroterapia na gestação. MÉTODOS: estudo prospectivo, coorte, aleatorizado, com 41 gestantes de baixo risco e gestação única, praticantes (grupo estudo, n=22) e não-praticantes (grupo controle, n=19) de hidroterapia. Avaliações antropométricas definiram-se os índices de peso corporal, massa magra e gordura absoluta e relativa. Por teste ergométrico, definiu-se os índices de consumo máximo de oxigênio(VO2máx), volume sistólico (VS) e débito cardíaco (DC). Como resultado perinatal observaram-se ocorrência de prematuridade e recém-nascidos pequenos para a idade gestacional. Compararam-se os índices iniciais e finais entre e dentro de cada grupo. As variáveis maternas foram avaliadas pelo teste t para amostras dependentes e independentes e empregou-se o chi ² para estudo das proporções. RESULTADOS: a comparação entre os grupos não evidenciou diferença significativa nas variáveis maternas no início e no final da hidroterapia. A comparação dentro de cada grupo confirmou efeito benéfico da hidroterapia: no grupo estudo os índices de gordura relativa foram mantidos (29,0%) e no grupo controle aumentaram de 28,8 para 30,7%; o grupo estudo manteve os índices de VO2máx (35,0%) e aumentou VS (106,6 para 121,5) e DC de (13,5 para 15,1); no grupo controle observaram-se queda nos índices de VO2máx e manutenção de VS e de DC. A hidroterapia não interferiu nos resultados perinatais, relacionados à prematuridade e baixo peso ao nascimento. CONCLUSÕES: a hidroterapia favoreceu adequada adaptação metabólica e cardiovascular materna à gestação e não determinou prematuridade e baixo peso nos recém-nascidos.

Estudo da evolução dos acidentes do trabalho registrados pela Previdência Social no período de 1995 a 1999, em Botucatu, São Paulo

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Influência da ingestão de espirulina sobre o metabolismo de ratos exercitados

No presente estudo foram comparadas as respostas metabólicas agudas ao exercício em ratos alimentados com dieta padrão e à base de espirulina. Ratos Wistar jovens foram divididos em dois grupos de acordo com a dieta: controle (C) (dieta padrão) e espirulina (S) (dieta à base de espirulina). Ao final do período experimental (cinco semanas) os animais foram submetidos a uma sessão aguda de exercício de natação (20 minutos, suportando sobrecarga equivalente a 5% do peso corporal) para avaliação do lactato sanguíneo, glicose, insulina, proteínas, albumina e ácidos graxos livres (AGL) séricos. Amostras do músculo gastrocnêmio e fígado foram utilizadas para determinação dos teores de glicogênio e lipídeos. Ambos os grupos C e S apresentaram aumento da glicemia e dos AGL, queda da insulinemia e redução dos teores de glicogênio muscular e hepático pós-exercício. A lactacidemia durante o exercício foi superior no grupo S em relação ao C. Conclui-se que o padrão de respostas ao exercício agudo dos grupos C e S foi semelhante. Contudo, a proteína da dieta pareceu influenciar aspectos do metabolismo glicídico.

Regulation of breathing and body temperature of a burrowing rodent during hypoxic-hypercapnia

Burrowing mammals usually have low respiratory sensitivity to hypoxia and hypercapnia. However, the interaction between ventilation (V), metabolism and body temperature (Tb) during hypoxic-hypercapnia has never been addressed. We tested the hypothesis that Clyomys bishopi, a burrowing rodent of the Brazilian cerrado, shows a small ventilatory response to hypoxic-hypercapnia, accompanied by a marked drop in Tb and metabolism. V, Tb and O-2 consumption (VO2) of C. bishopi were measured during exposure to air, hypoxia (10% and 7% O-2), hypercapnia (3% and 5% CO2) and hypoxic-hypercapnia (10% O-2 + 3% CO2). Hypoxia of 7% but not 10%, caused a significant increase in V, and a significant drop in Tb. Both hypoxic levels decreased VO2 and 7% O-2 significantly increased V/VO2. Hypercapnia of 5%, but not 3%, elicited a significant increase in V, although no significant change in Tb, VO2 or V/VO2 was detected. A combination of 10% O-2 and 3% CO2 had minor effects on V and Tb, while VO2 decreased and V/VO2 tended to increase. We conclude that C. bishopi has a low sensitivity not only to hypoxia and hypercapnia, but also to hypoxic-hypercapnia, manifested by a biphasic ventilatory response, a drop in metabolism and a tendency to increase V/VO2. The effect of hypoxic-hypercapnia was the summation of the hypoxia and hypercapnia effects, with respiratory responses tending to have hypercapnic patterns while metabolic responses, hypoxic patterns. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

Sazonalidade na produção de raízes e teor de β-ecdisona em acessos de fáfia

As raízes de espécies de Pfaffia são utilizadas há muito na medicina popular no Brasil, especialmente como tônicas, afrodisíacas e antidiabéticas. Nas margens e ilhas do Rio Paraná, vegeta naturalmente a espécie Pfaffia glomerata (Spreng.) Pedersen, que corre risco de extinção pela coleta intensiva de suas raízes. Para preservá-la, é preciso desenvolver sistemas que permitam seu uso sustentável. Nesse contexto, foi avaliada a sazonalidade da produção de biomassa e o teor de β-ecdisona em raízes de diferentes acessos de P. glomerata. A coleta dos acessos foi realizada ao longo dos rios Paraná (A1 e A3), Ivaí (A2) e Paranapanema (A4). Mudas produzidas a partir desses acessos foram plantadas experimentalmente em área de ocorrência natural da espécie. O delineamento utilizado foi blocos casualizados, com parcelas subdivididas (acessos nas parcelas; épocas de colheita nas subparcelas), quatro repetições e subparcelas com seis plantas na área útil. Foram realizadas quatro colheitas: oito, dez, doze e quatorze meses após o plantio. As maiores produtividades em massa seca (MS) de raízes foram alcançadas na terceira colheita, com 38,41 g planta-1. Já o acesso A4 foi significativamente mais produtivo que os demais, tanto para massa fresca (94,67 g planta-1), quanto para MS de raízes (26,39 g planta-1). A relação MF/MS das raízes, com média de 26,9% (3,7:1), foi pouco influenciada pela origem dos acessos, embora tenha se alterado significativamente ao longo das colheitas (de 4,1:1, na primeira colheita, a 3,3:1, na terceira colheita, que correspondeu ao valor máximo). O teor de β-ecdisona foi estatisticamente similar nas três primeiras colheitas, variando de 0,26 a 0,38%, com redução drástica na última colheita (0,16%). Os acessos A2 e A3 foram aqueles com teor de β-ecdisona mais altos, respectivamente 0,36 e 0,30%. Considerando os resultados obtidos, sugere-se que a terceira colheita, que corresponde a doze meses após o transplante, como a mais adequada para colheita das raízes.

Terapêutica com doses profiláticas de sulfato ferroso como medida de intervenção no combate à carência de ferro em crianças atendidas em unidades básicas de saúde

Objetivou-se testar a terapêutica com doses profiláticas de sulfato ferroso no combate à anemia carencial ferropriva, em 620 crianças de 4 a 36 meses de idade, atendidas em duas unidades de saúde do Município de São Paulo, Brasil. As crianças foram submetidas a coleta de sangue para dosagem de hemoglobina. em seguida, foi prescrito dosagem de 12 mg/dia de ferro elementar, por 30 dias. Observou-se que 25% dos menores de 6 meses apresentaram níveis de hemoglobina inferiores a 11,0 g/dl. As maiores ocorrências de anemia foram detectadas entre os 9 e 23 meses de idade (50,0%). Decorrido o prazo, apenas 37,4% das crianças com anemia e 52,4% das não anêmicas retornaram para reavaliação. Das 299 que foram reavaliadas, somente 157 (52,5%) receberam a medicação corretamente. A freqüência de hemoglobinas inferiores a 9,5 g/dl caiu de 17,1% no início, para 8,1% ao final da intervenção. Por outro lado, o percentual de crianças com hemoglobinas superiores a 12,0 g/dl subiu de 13,4%, para 33,4%. As que receberam a suplementação férrica de forma correta registraram queda nos índices de anemia sensivelmente maior que a observada naquelas suplementadas de forma incorreta. Concluiu-se que a terapêutica com doses profiláticas de sulfato ferroso, apesar de se mostrar eficiente na recuperação dos níveis de hemoglobina, apresenta sérios entraves do ponto de vista operacional.

NOVEL EVIDENCE THAT BETA-ADRENOCEPTORS OF THE MEDIAL SEPTAL AREA REGULATE BLOOD-PRESSURE AND ELECTROLYTE BALANCE

We investigated the participation of the beta-adrenoceptors of the septal area (SA) in sodium and potassium excretion and urine flow. The alterations in arterial pressure and some renal functions were also investigated. The injection of 2.10(-9) to 16.10(-9)M of isoproterenol, through a cannula permanently implanted into the SA produced a significant dose-dependent decrease in urinary Na+ and K+ excretion and urinary flow. Pretreatment with 16.10(-9) M butoxamine antagonized the effect of 4.10(-9) M isoproterenol but pretreatment with 16.10(-9) M practolol did not abolish the effect of isoproterenol. The beta 2-agonist terbutaline and salbutamol (4.10(-9) M when injected intraseptally also caused a decrease in urine flow and in renal Na+ and K+ excretion. After injection of isoproterenol or salbutamol (4.10(-9) M) into the SA, the arterial pressure, glomerular, filtration rate (GFR) and filtered Nd were reduced while Na+ fractional reabsorption was increased. The results indicate that the beta 2-adrenoceptors of the SA play a role in the decrease of Na+, K+ and urine flow and this effect may be due to a drop in GFR and filtered Na+ and to the rise in tubular Na+ reabsorption.

Observational study on efficacy of negative expiratory pressure test proposed as screening for obstructive sleep apnea syndrome among commercial interstate bus drivers - protocol study

Background: Obstructive sleep apnea (OSA) is a respiratory disease characterized by the collapse of the extrathoracic airway and has important social implications related to accidents and cardiovascular risk. The main objective of the present study was to investigate whether the drop in expiratory flow and the volume expired in 0.2 s during the application of negative expiratory pressure (NEP) are associated with the presence and severity of OSA in a population of professional interstate bus drivers who travel medium and long distances.Methods/Design: An observational, analytic study will be carried out involving adult male subjects of an interstate bus company. Those who agree to participate will undergo a detailed patient history, physical examination involving determination of blood pressure, anthropometric data, circumference measurements (hips, waist and neck), tonsils and Mallampati index. Moreover, specific questionnaires addressing sleep apnea and excessive daytime sleepiness will be administered. Data acquisition will be completely anonymous. Following the medical examination, the participants will perform a spirometry, NEP test and standard overnight polysomnography. The NEP test is performed through the administration of negative pressure at the mouth during expiration. This is a practical test performed while awake and requires little cooperation from the subject. In the absence of expiratory flow limitation, the increase in the pressure gradient between the alveoli and open upper airway caused by NEP results in an increase in expiratory flow.Discussion: Despite the abundance of scientific evidence, OSA is still underdiagnosed in the general population. In addition, diagnostic procedures are expensive, and predictive criteria are still unsatisfactory. Because increased upper airway collapsibility is one of the main determinants of OSA, the response to the application of NEP could be a predictor of this disorder. With the enrollment of this study protocol, the expectation is to encounter predictive NEP values for different degrees of OSA in order to contribute toward an early diagnosis of this condition and reduce its impact and complications among commercial interstate bus drivers.

The influence of vinegars on exposure of dentinal tubules: a SEM evaluation.

Dentin hypersensitivity is a common painful condition observed in clinics. Dietary habits have been much associated with its development and persistence during and following periodontal treatment. The aim of this in vitro study was to evaluate the influence of vinegars on the removal of smear layer and exposure of dentinal tubules. Extracted human teeth were submitted to manual scaling with Gracey curettes in order to remove the cementum as well as to form a smear layer. Dentin samples with 3 mm(2) were obtained and distributed into six experimental groups: one control and five types of vinegars (alcohol, apple, rice, white wine and balsamic). Each group included two methods of vinegar application: topical and friction. After routine preparation for SEM analysis, photomicrographs were assessed by a calibrated and blind examiner using an appropriate index system. Kruskal-Wallis test indicated a significant influence of vinegars on smear layer removal. There was a statistically significant difference between groups treated with apple, white and rice vinegars and the control group (p < 0.05). Nevertheless, Mann-Whitney test indicated that removal of smear layer did not vary with the method of application (topical versus friction) for any of the tested substances. We can conclude that the contact of vinegar may remove smear layer and expose dentinal tubules, regardless of the type of application. However, balsamic vinegar was associated with less removal of smear layer after both methods of application.

Vascular hyporeactivity to angiotensin II induced by Escherichia coli endotoxin is reversed by Nω-Nitro-L-Arginine, an inhibitor of nitric oxide synthase

Septic shock or sepsis is reported to be one of the major causes of death when followed by systemic infectious trauma in humans and other mammals. Its development leads to a large drop in blood pressure and a reduction in vascular responsiveness to physiological vasoconstrictors which, if not contained, can lead to death. It is proposed that this vascular response is due to the action of bacterial cell wall products released into the bloodstream by the vascular endothelium and is considered a normal response of the body's defenses against infection. A reduction in vascular reactivity to epinephrine and norepinephrine is observed under these conditions. In the present study in rats, the aim was to assess whether those effects of hypotension and hyporeactivity are also related to another endogenous vasoconstrictor, angiotensin II (AII). We evaluated the variation in the power of this vasoconstrictor over the mean arterial pressure in anesthetized rats, before and after the establishment of hypotension by Escherichia coli endotoxin (Etx). Our results show that in this model of septic shock, there is a reduction in vascular reactivity to AII and this reduction can be reversed by the inhibitor of nitric oxide synthase, Nω-Nitro-L- Arginine (NωNLA). Our results also suggest that other endogenous factors (not yet fully known) are involved in the protection of rats against septic shock, in addition to the L-arginine NO pathway.

Foraging behavior and colony cycle of agelaia vicina (Hymenoptera: Vespidae; Epiponini)

The neotropical Agelaia vicina has the largest nest built among social wasps, yet little is known about nest construction, growth and structure. In this work, the development of two nests of A. vicina was followed. Studies were done through analysis of images to estimate the growth of nests. The material collected below the nests was examined to estimate colony productivity. Nests were collected to analyze their architecture and structure. Colony cycle was similar in the two colonies. Colonies increase in size throughout the dry season and into the rainy season, with a sudden drop in production at the end of the rainy season. The colonies doubled in size in about six months.