Associação de begomovírus e crinivírus com bemisia tabaci espécie new world 2 e Trialeurodes vaporariorum

Pós-graduação em Agronomia (Proteção de Plantas) - FCA

Produção de vetores recombinantes para análise das propriedades biológicas e cancerígenas da proteína K1 do herpesvírus associado ao sarcoma de Kaposi (KSHV/HHV-8)

Pós-graduação em Patologia - FMB

Estudo comparativo do genoma e do transcriptoma de Phyllosticta citricarpa (fase sexual Guignardia citricarpa) agente da Mancha Preta dos Citros e Phyllosticta capitalensis

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) - IBB

Caracterização de Aeromonas spp isoladas de amostras de ostras e água por método microbiológico e molecular

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Diversidade bacteriana ruminal em bovinos Nelore

Pós-graduação em Zootecnia - FCAV

Hiperacumulação de cádmio em plântulas de Cajanus cajan inoculadas com Pseudomonas

Pós-graduação em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) - FCAV

Prevalência de Clostridios sulfito redutores e Clostridium perfringens na mucosa intestinal de frangos de corte

Pós-graduação em Microbiologia Agropecuária - FCAV

Estrutura e função de peptídeos policatiônicos de Apis mellifera

Os venenos de animais são bastante estudados devido a um interesse industrial e comercial, pois sua composição é rica em moléculas de importância farmacológica. Os peptídeos presentes nesses venenos apresentam características diversas, como antibiose, analgesia, propriedades antiinflamatórias, vasoconstritora, entre outras. Para caracterização dos componentes peptídicos presentes no veneno de Apis mellifera, primeiramente o veneno foi extraído e filtrado para remoção de eventuais impurezas e depois submetido à cromatografia em HPLC com coluna de fase reversa, que gerou um perfil cromatográfico com 29 picos, dos quais os 3 mais abundantes apresentaram características peptídicas, confirmadas por espectrometria de massas e seqüenciamento. Além disso, a cromatografia de íons totais mostrou que esse veneno apresenta 123 compostos peptídicos, alguns com massas relacionadas aos já conhecidos, porém com diversos compostos de massas diferentes dos compostos já descritos na literatura. A partir deste estudo, detectou-se a presença da Melitina como componente peptídico majoritário no veneno de abelha, além da Secapina, que será caracterizada por estudos em andamento

Fungos fitopatógenos associados às formigas cortadeiras (Formicidae: Tribo Attini)

The ants of genus Atta belong to the Attine tribe (order Hymenoptera, family Formicidae, subfamily Myrmicinae) and are commonly known as leaf-cutting ants for having the habit of cutting several vegetable species used as substrate for growing mutualistic fungus (Agaricales: Lepiotaceae). Recent studies showed that, in addition to that, other fungi may occur in the nests in a dorment state or participate in the functioning dynamic of this symbiosis. Researches related to surveys of fungus biodiversity in nests of different Atta species have found important phytopathogenic representatives. In Brazil, studies about integrated management of plagues, developed by Embrapa Meio Ambiente (Embrapa Environment), point out the need of higher investments in projects that involve the phytopathogenic transmission by insects in order to reduce costs to control them or minimize environmental impact. The purpose of this study was to broaden the knowledge about the ecology of these fungi, isolating and identifying species associated with Attine tribe ants, thus understanding the scope of pathogenic and phytopathogenic species spread by these ants. For that reason, gynes were collected from Atta laevigata and Atta capiguara anthills located at Unesp Botucatu (São Paulo, Brazil) campus. In order to isolate the fungus, the mineral oil floating technique was used. The identification of the isolated fungi was done based on microscopic and molecular characteristics using DNA ribosomal sequencing. The most highly abundant genera found so far were: Cladosporium, Exophiala, Penicillium, Acremonium, Phialophora and Teratosphaeria. Representatives of the genera Exophiala, Phialophora and Cladosporium may be human pathogens, whereas Teratosphaeria and Penicillium are related to diseases in Eucalyptus and citric fruits, respectively. The results show that these ants may host important fungal species besides the ones already... (Complete abstract click electronic access below)

Análise da susceptibilidade de leveduras isoladas de insetos sociais aos antifúngicos

A frequência de micoses invasivas causadas por fungos oportunistas, incluindo leveduriformes, vem aumentando significativamente nas últimas décadas e atinge principalmente indivíduos imunocomprometidos. A tribo Attini possui cerca de 230 espécies de formigas e todas possuem o hábito de cultivar e se alimentar de fungos. Algumas espécies cultivam o fungo mutualista em nódulos poligonais sólidos com 0,25 a 0,50mm de diâmetro, aproximadamente. No interior desses nódulos, encontram-se células na forma de leveduras, que quando semeadas em meio de cultura se desenvolvem como fungo filamentoso. Este tipo de fungicultura está restrito a algumas espécies do gênero Cyphomyrmex. Neste trabalho, isolamos 30 leveduras dos nódulos de oito ninhos de Cyphomyrmex transversus da região de Ilhéus (BA), e analisamos a susceptibilidade aos seguintes antifúngicos: Anfotericina B (AMB), Fluconazol (FCZ), Voriconazol (VCZ) e Itraconazol (ITZ). A caracterização das estirpes foi feita através de métodos morfológicos e moleculares, incluindo-se o sequenciamento dos domínios D1/D2 do rDNA. A avaliação da atividade antifúngica foi realizada através do método de microdiluição, de acordo com a norma M27-A2 (CLSI, 2002). Candida parapsilosis ATCC 22019 e Candida krusei ATCC 6258 foram utilizadas como controle. Os resultados foram interpretados segundo os pontos de corte (breakpoints) aplicados ao gênero Candida. As estirpes foram identificadas como Trichosporon asahii (18), T. coremiiforme (4), Candida carpophila (syn. C. guilliermondii) (4), Galactomyces candidum (syn. Geotrichum candidum) (3) e Cryptococcus laurentii (1). Todas as espécies são conhecidas por possuírem representantes que já foram relatados como patógenos oportunistas. Elas foram sensíveis aos azóis FCZ, VCZ e ITZ, com exceção de G. candidus, cujas estirpes apresentaram sensibilidade dose-dependente a FCZ e ITZ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)

Busca de parceiros físicos da proteína CRABP2, utilizando o sistema de duplo-híbrido em Saccharomyces cerevisae

A metilação de ilhas CpG em regiões regulatórias de vários genes tem sido descrita como um processo importante no silenciamento de genes supressores de tumor e diretamente envolvida no processo de carcinogênese de uma série de tumores. O estudo desses genes afetados pela metilação em tumores visa à procura de marcadores moleculares para o diagnóstico, prognóstico e tratamento de tumores, e também a caracterização do seu papel no processo biológico do câncer. O nosso grupo de pesquisa participou de um Projeto Temático que visa a identificação de genes metilados em tumores de cabeça e pescoço (processo 03/09497-3) e foi então proposta a utilização do sistema de duplo-híbrido de levedura como ferramenta no início da análise funcional destes genes. Dessa maneira, utilizando como isca o gene CRABP2 identificado como diferencialmente metilado em câncer de cabeça e pescoço, foi realizado o rastreamento de duplo-híbrido para a identificação de interações físicas proteína-proteína. Foram rastreados aproximadamente 2,1x105 transformantes neste sistema, dos quais 550 foram inicialmente positivos para His+. Desses, 182 transformantes confirmaram a marca His+ e foram testados para -galactosidase. Em seguida, 19 foram selecionados para passar pela etapa do “plasmid linkage”. Após esse teste, 9 clones confirmaram a ligação dos marcadores His+ e β-gal+ com a presença do plasmídeo LEU2 . Assim, após o sequenciamento dos insertos contidos nos clones identificados, ciclina D3 (CCND3), alfa-macroglobulina 2 (A2M) (2 clones), canal aniônico dependente de voltagem 2 (VDAC2), tubulina alfa 1 (TUBA1), tubulina alfa 2 (TUBA2), tubulina beta (TUBB), fator de ligação ao “enhancer” do gene interleucina 2 (ILF2) e desoxi-hipusina sintase (DHPS) emergiram como ligantes de CRABP2

Estudo da organização genômica e localização cromossômica do gene snRNA U1 em peixes do gênero Leporinus

Em eucariotos os íntrons de mRNAs codificantes de proteína são retirados e os éxons são mantidos junto ao transcrito primário pela maquinaria do spliceossomo. Este consiste em um grande complexo RNA-proteína que contém mais de 200 proteínas e cinco tipos de RNAs não codificantes, metabolicamente estáveis, conhecidos como snRNAs U, que incluem U1, U2, U4, U5 e U6. Os genes snRNA U estão presentes em múltiplas cópias dispersas no genoma de diversos eucariotos e parecem apresentar comportamento semelhante aqueles dos elementos móveis exibindo pouca conservação sintênica. No presente trabalho pretendia-se estudar a organização genômica e a localização cromossômica do gene snRNA U1 em espécies de peixes do gênero Leporinus, que é um grupo de peixes que se configura como um modelo interessante para estudo de DNAs repetitivos e evolução genômica em peixes. Porém, após diversas tentativas não foi possível amplificar este gene e então optou-se por estudar o gene snRNA U2. O DNA genômico de diferentes espécies de Leporinus e de Schizodon (grupo próximo evolutivamente) foi amplificado utilizando primers específicos para o gene, por meio da técnica de PCR e os produtos obtidos enviados para o sequenciamento. O tamanho encontrado para essa sequência correspondeu a aproximadamente 200 pb, valor esse já encontrado para outras espécies. As sequências foram analisadas e resultados não concisos das sequencias obtidas não permitiram análises subsequentes. A localização cromossômica do gene foi realizada por meio da técnica de hibridação in situ e as marcações foram evidenciadas em um par cromossômico submetacêntrico de tamanho médio em todas as espécies. A localização destas sequências não mostrou relação com cromossomos sexuais, presentes em algumas das espécies analisadas, mas demonstrou forte evidência de conservação do gene entre as diferentes espécies estudadas

Adesão de Paracoccidioides brasiliensis e outros fungos anemófilos a teias de aranhas: implicações para a identificação de nichos microbianos no ambiente

The dimorphic pathogenic fungus, Paracoccidioides brasiliensis (Pb), is the etiological agent of paracoccidioidomycosis (PCM), the most important systemic mycosis in Latin America. While the yeast phase can be isolated from patients affected by paracoccidioidomycosis, dogs and naturally infected armadillos; several elements related to the ecology of the saprophytic phase of the pathogen, which is responsible for the production of infective propagules, are poorly understood, hampering the adoption of preventive measures. The demonstration of the high incidence of Pb infection in the 9- banded armadillo, Dasypus novemcinctus, has opened new perspectives for the identification of the pathogen’s habitat. At the opening of the armadillos’ burrows, spider webs are commonly found. The objective of this study was to evaluate the presence of Pb in spider webs samples related to the habitat of armadillos. Spider web samples were collected at Lageado Farm, Botucatu/SP and prepared for microscopic, molecular and mycological analyses. Microscopic analysis showed that different fungi were closely attached to spider web samples. Nested-PCR reaction showed positive amplification for Pb in 4 samples, with identity confirmed by amplicon sequencing. Fungal colonies also included members of Aspergillus, Blastobotrys, Penicillium, Candida, and Sporothrix genera, which are related to opportunistic disease and primary infections of great medical importance. In vitro adhesion tests of mycelia and yeast form of Pb to the spider webs were also performed, in order to analyze the possible physical attraction between fungal cells and the spider web protein network. The results showed a clear adherence of fungal particles to spider webs. In the current literature, there are no studies reporting adhesive properties of microorganisms to spider webs... (Complete abstract click electronic access below)

Estudo da produção e caracterização de queratinase produzida por Bacillus sp. LM-21 isolado de águas residuárias de abatedouro de frangos

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Produção de vetores recombinantes para expressão de diferentes formas da proteína K1 do herpesvírus associado ao Sarcoma de Kaposi (KSHV)

Kaposi´s sarcoma associated herpesvirus (KSHV) or human herpesvirus 8 (HHV-8) is a gammaherpesvirus essential for the development of all forms of Kaposi´s sarcoma (KS). The KSHV’s life cycle is basically divided into latent and lytic phases, which have distinct viral gene expression profiles. Some important oncogenic products of KSHV are expressed during the lytic phase, including the viral K1 protein. As an effect of interfer-ence with intracellular signaling, K1 expression increases proliferation and survival of KSHV-infected cells. Due to its high level of genetic variability compared to other re-gions of the viral genome, the K1-encoding ORF (ORF-K1) is commonly evaluated for KSHV genotyping. It remains unclear whether different viral genotypes have particular biological effects that might modify the KSHV oncogenicity. The present study aimed to contribute to the establishment of an experimental in vitro model for evaluation of the K1 protein from common KSHV genotypes. Recombinant expression vectors with the ORF-K1 from KSHV genotypes A, B and C were prepared by genetic cloning. The recombi-nant vectors pKSHVOK1 obtained by cloning were sequenced for structural validation. After that, HEK293 cell line was transfected with the recombinant vectors, and proteins were extracted for expression analysis by Western blot technique, for K1 functional vali-dation. Results showed that ORF-K1 vectors containing KSHV ORF-K1 from the A, B and C genotypes were produced and structurally validated by DNA sequencing. The K1 expression at the protein level was also confirmed by immunoblots using an antibody for FLAG detection, an epitope from the vector that binds to K1. Based on presented re-sults, it´s possible to conclude that the recombinant vectors will be able to be used in future studies of K1 protein biological properties from distinct KSHV genotypes