Phylogenetic relationships within the speciose family Characidae (Teleostei: Ostariophysi: Characiformes) based on multilocus analysis and extensive ingroup sampling

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Molecular phylogeny of Aphyocharacinae (Characiformes, Characidae) with morphological diagnoses for the subfamily and recognized genera

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Phylogeny of leafcutter ants in the genus Atta Fabricius (Formicidae: Attini) based on mitochondrial and nuclear DNA sequences

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

A new species of the Dendropsophus parviceps group from the western Amazon Basin (Amphibia: Anura: Hylidae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Phylogenetic relationships within anuran clade Terrarana, with emphasis on the placement of Brazilian Atlantic rainforest frogs genus Ischnocnema (Anura: Brachycephalidae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Relation of pretreatment sequence diversity in NS5A region of HCV genotype 1 with immune response between pegylated-INF/ribavirin therapy outcomes

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Crystal structure of hemoglobin from the maned wolf (Chrysocyon brachyurus) using synchrotron radiation

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Crystallization, preliminary X-ray diffraction analysis and Patterson search of oxyhaemoglobin I from the wolf (Chrysocyon brachiurus)

Oxyhaemoglobin I isolated from the Brazilian wolf Chrysocyon brachiurus has been crystallized and X-ray diffraction data has been collected to 2.06 A resolution using a synchrotron-radiation source. Crystals were determined to belong to the space group P2(1)2(1)2(1) and preliminary structural analysis revealed the presence of one tetramer in the asymmetric unit. The structure was determined using standard molecular-replacement techniques and is currently being refined using maximum-likelihood protocols. This is the first haemoglobin isolated from a member of the Canidae family to be crystallized and it will provide further insights in the comparative biochemistry of vertebrate haemoglobins.

Measurement of the top-quark mass in t(t)over-bar events with dilepton final states in pp collisions at root s=7 TeV

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise de dados de gastroenterite hemorrágica canina para identificar fatores de risco por regressão logística

No presente estudo, ajustou-se um modelo de regressão logística para prever a probabilidade de óbito de cães acometidos por gastroenterite hemorrágica. O modelo Logístico é recomendado para variáveis-resposta dicotômicas em estudo de Coorte. Registraram-se 176 animais censitariamente atendidos com gastroenterite hemorrágica em quatro clínicas veterinárias da cidade de Lavras, sul de Minas Gerais, entre os anos de 1992 e 1999. Após terem sido selecionadas por meio do teste de Pearson ou teste exato de Fisher, ajustou-se o modelo considerando-se as variáveis sexo, idade, diárias de internação e número de atendimentos. A estimação dos parâmetros foi feita pelo método da máxima verossimilhança. Conclui-se que quando os cães acometidos por gastroenterite hemorrágica são atendidos apenas uma vez, aqueles com idade superior a 6 meses possuem 15,45 vezes mais chances de morrerem (P<0,05) do que aqueles com menos de 6 meses de idade. Quando os animais que apresentam a enfermidade possuem mais de 6 meses de idade, a chance de morrerem, se forem atendidos apenas uma vez, é 20,251 vezes maior (P<0,05) do que se recebessem de 2 a 7 atendimentos.

Genetic trends in the expected progeny difference of the asymptotic weight of Nelore females

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Tendência Genética dos Efeitos Direto e Materno sobre os Pesos à Desmama e Pós-Desmama de Bovinos da Raça Tabapuã no Brasil

Os dados são relativos aos pesos de animais da raça Tabapuã, nascidos no período de 1959 a 1996 em várias regiões brasileiras. As observações foram analisadas com o objetivo de avaliar as mudanças genéticas aditivas diretas e maternas dos pesos padronizados para 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade. As estimativas dos componentes de (co) variância utilizadas no cálculo dos valores genéticos foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas (REML), usando o aplicativo MTDFREML, cujo modelo continha os efeitos aleatórios aditivo direto, materno e de ambiente permanente, além dos efeitos fixos de grupo de contemporâneos (unidade da federação, fazenda, sexo, estação e ano de nascimento do animal) e a covariável idade da vaca ao parto (efeitos linear e quadrático). As tendências genéticas dos efeitos genéticos direto e materno foram estimadas pela regressão, ponderada, das médias anuais dos valores genéticos dos animais. As tendências genéticas dos efeitos direto no período estudado foram 0,134 ; 0,207, e 0,276 kg/ano, para P205, P365 e P550, respectivamente. Ainda para os três pesos, na mesma ordem, as estimativas das tendências genéticas maternas foram 0,019; -0,011; e -0,022 kg/ano. em virtude da variação genética existente, os resultados observados estão bem aquém das mudanças possíveis.

Abordagens freqüentista e bayesiana para avaliação genética de bovinos da raça Canchim para características de crescimento

This study aimed to: a) to compare the covariance components obtained by Restricted Maximum Likelihood (REML) and by bayesian inference (BI): b) to run genetic evaluations for weights of Canchim cattle measured at weaning (W240) and at eighteen months of age (W550), adjusted or not to 240 and 550 days of age, respectively, using the mixed model methodology with covariance components obtained by REML or by BI; and c) to compare selection decisions from genetic evaluations using observed or adjusted weights and by REML or BI. Covariance components, heritabilities and genetic correlation for W240 and W550 were estimated and the predicted breeding values were used to select 10% and 50% of the best bulls and cows, respectively. The covariance components obtained by REML were smaller than the a posteriori means obtained by Bl. Selected animals from both procedures were not the same, probably because the covariance components and genetic parameters were different. The inclusion of age of animal at weighing as a covariate in the statistical model fitted by BI did not change the selected bulls and cows.

Crystallization and X-ray diffraction data analysis of human deoxyhaemoglobin A(0) fully stripped of any anions

In this work, initial crystallographic studies of human haemoglobin (Hb) crystallized in isoionic and oxygen-free PEG solution are presented. Under these conditions, functional measurements of the O-2-linked binding of water molecules and release of protons have evidenced that Hb assumes an unforeseen new allosteric conformation. The determination of the high-resolution structure of the crystal of human deoxy-Hb fully stripped of anions may provide a structural explanation for the role of anions in the allosteric properties of Hb and, particularly, for the influence of chloride on the Bohr effect, the mechanism by which Hb oxygen affinity is regulated by pH. X-ray diffraction data were collected to 1.87 Angstrom resolution using a synchrotron-radiation source. Crystals belong to the space group P2(1)2(1)2 and preliminary analysis revealed the presence of one tetramer in the asymmetric unit. The structure is currently being refined using maximum-likelihood protocols.

Bayesian L-optimal exact design of experiments for biological kinetic models

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)