7 resultados para Data quality problems

em Université de Montréal, Canada


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Lâéquipe de travail représente, de nos jours, une forme dâorganisation du travail incontournable pour accroître la performance des entreprises. Il est maintenant largement reconnu que la composition dâune équipe de travail est susceptible dâaffecter son efficacité et, plus particulièrement, la qualité des relations interpersonnelles au sein de lâéquipe et la performance de ses membres. Des études se sont donc attardées à isoler certaines caractéristiques individuelles permettant dâinfluencer le contexte des équipes de travail. Ainsi, lâeffet de la composition des équipes a été étudié sous lâangle des traits de personnalité des membres, de leurs attitudes et de leurs valeurs, ou encore en fonction des habiletés cognitives démontrées par chacun des coéquipiers. Malgré quelques invitations répétées à étudier davantage la motivation des équipes de travail et de leurs membres, peu de travaux ont porté sur la composition motivationnelle de ce contexte collectif. Dans la foulée des études portant sur les équipes de travail, on observe une tendance à ne considérer que la performance des équipes et des coéquipiers comme unique critère dâévaluation de leur efficacité. Devant les données alarmantes concernant les problèmes de santé psychologique vécus par les travailleurs, il appert quâil est essentiel de se pencher sur les conditions nécessaires à mettre en place dans ce contexte de travail interpersonnel pour contribuer à la fois au bien-être et à la performance des coéquipiers. Avec lâutilisation du cadre dâanalyse proposé par la théorie de lâautodétermination, la présente thèse vise à répondre à ces enjeux. Le premier article de la thèse propose un modèle théorique qui définit en quoi la composition dâune équipe de travail, en regard des styles de régulations individuelles des membres de lâéquipe, est susceptible dâaffecter les relations interpersonnelles au sein de lâéquipe et dâavoir un impact sur la performance et le bien-être des membres. Sâappuyant sur les mécanismes dâémergence proposés par les théories multiniveaux, ce cadre théorique suggère également que, sous certaines conditions, la composition motivationnelle dâune équipe de travail puisse entraîner la formation dâun phénomène singulier de motivation dâéquipe. Les mécanismes favorisant cette émergence sont présentés dans lâarticle. Le second article de la thèse représente une première vérification empirique de certaines des propositions de lâarticle théorique. à partir dâun échantillon de 138 équipes, regroupant 680 travailleurs, il a été possible de vérifier, à partir dâanalyses multiniveaux, lâimpact de la composition autonome ou contrôlée dâune équipe sur la satisfaction au travail des participants. Les résultats de lâétude montrent quâune forme de composition dâéquipe de nature plus autonome est positivement reliée à la satisfaction des travailleurs. Plus encore, on observe une interaction entre la régulation autonome individuelle et la régulation autonome dâéquipe quant à la satisfaction vécue au travail. Ainsi, la satisfaction au travail est plus élevée pour les participants dont le style de régulation est plus autonome et qui évoluent dans une équipe à composition motivationnelle plus autonome. Parallèlement, les résultats montrent que la composition motivationnelle plus contrôlée est négativement reliée à la satisfaction au travail. De façon générale, la présente thèse souligne la pertinence de considérer le contexte sociomotivationnel émergeant de la composition de lâéquipe en regard des styles de régulations individuelles des membres qui la composent. Cette thèse permet de considérer, avec un regard nouveau, la motivation des équipes de travail et les variables de motivation à évaluer dans la formation des équipes de travail au sein de nos organisations.

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Lâexplosion récente du nombre de centenaires dans les pays à faible mortalité nâest pas étrangère à la multiplication des études portant sur la longévité, et plus spécifiquement sur ses déterminants et ses répercussions. Alors que certains tentent de découvrir les gènes pouvant être responsables de la longévité extrême, dâautres sâinterrogent sur lâimpact social, économique et politique du vieillissement de la population et de lâaugmentation de lâespérance de vie ou encore, sur lâexistence dâune limite biologique à la vie humaine. Dans le cadre de cette thèse, nous analysons la situation démographique des centenaires québécois depuis le début du 20e siècle à partir de données agrégées (données de recensement, statistiques de lâétat civil, estimations de population). Dans un deuxième temps, nous évaluons la qualité des données québécoises aux grands âges à partir dâune liste nominative des décès de centenaires des générations 1870-1894. Nous nous intéressons entre autres aux trajectoires de mortalité au-delà de cent ans. Finalement, nous analysons la survie des frères, sÅurs et parents dâun échantillon de semi-supercentenaires (105 ans et plus) nés entre 1890 et 1900 afin de se prononcer sur la composante familiale de la longévité. Cette thèse se compose de trois articles. Dans le cadre du premier, nous traitons de lâévolution du nombre de centenaires au Québec depuis les années 1920. Sur la base dâindicateurs démographiques tels le ratio de centenaires, les probabilités de survie et lââge maximal moyen au décès, nous mettons en lumière les progrès remarquables qui ont été réalisés en matière de survie aux grands âges. Nous procédons également à la décomposition des facteurs responsables de lâaugmentation du nombre de centenaires au Québec. Ainsi, au sein des facteurs identifiés, lâaugmentation de la probabilité de survie de 80 à 100 ans sâinscrit comme principal déterminant de lâaccroissement du nombre de centenaires québécois. Le deuxième article traite de la validation des âges au décès des centenaires des générations 1870-1894 dâorigine canadienne-française et de confession catholique nés et décédés au Québec. Au terme de ce processus de validation, nous pouvons affirmer que les données québécoises aux grands âges sont dâexcellente qualité. Les trajectoires de mortalité des centenaires basées sur les données brutes sâavèrent donc représentatives de la réalité. Lâévolution des quotients de mortalité à partir de 100 ans témoigne de la décélération de la mortalité. Autant chez les hommes que chez les femmes, les quotients de mortalité plafonnent aux alentours de 45%. Finalement, dans le cadre du troisième article, nous nous intéressons à la composante familiale de la longévité. Nous comparons la survie des frères, sÅurs et parents des semi-supercentenaires décédés entre 1995 et 2004 à celle de leurs cohortes de naissance respectives. Les différences de survie entre les frères, sÅurs et parents des semi-supercentenaires sous observation et leur génération « contrôle » sâavèrent statistiquement significatives à un seuil de 0,01%. De plus, les frères, sÅurs, pères et mères des semi-supercentenaires ont entre 1,7 (sÅurs) et 3 fois (mères) plus de chance dâatteindre 90 ans que les membres de leur cohorte de naissance correspondante. Ainsi, au terme de ces analyses, il ne fait nul doute que la longévité se concentre au sein de certaines familles.

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Le vieillissement de la population canadienne qui est appréhendé dans les années à venir entrainera son lot de défis pour lâadministration des soins et services de longue durée. Par contre, une amélioration de lâétat de santé fonctionnelle de la population pourrait atténuer le rythme de croissance du nombre dâaînés en état dâincapacité. Utilisant les données transversales de lâEnquête nationale sur la santé de la population (ENSP) et de lâEnquête de santé dans les collectivités canadiennes (ESCC), cette recherche analyse les tendances dans les niveaux dâincapacité chez les personnes de 65 ans et plus vivant dans les ménages privés au Canada entre 1994 et 2005, ainsi que les caractéristiques sociodémographiques associées au risque dâêtre en incapacité. Les résultats montrent que la prévalence de lâincapacité est à la baisse durant la période, et que parmi les personnes en incapacité, la proportion présentant une incapacité légère a diminué. Tout étant égal par ailleurs, certaines caractéristiques sociodémographiques augmentent le risque pour une personne âgée dâêtre en incapacité, notamment lââge, être une femme, la faible scolarité, et être veuf, séparé ou divorcé. Cependant, les limites relativement importantes quant à la qualité des données font en sorte que nous devons interpréter ces résultats avec prudence.

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Objectif : Ãtudier le risque dâhémorragies intracrâniennes et dâinfarctus du myocarde chez les patients vivant avec le VIH. Méthode : Jâai réalisé deux études de cohorte au sein de la banque de données de la Régie de lâassurance maladie du Québec. Jâai défini la cohorte des patients VIH-positifs, y ai étudié lâincidence dâhémorragies intracrâniennes et dâinfarctus du myocarde, et lâai comparée à une cohorte VIH-négative de même âge et de même sexe. Jâai étudié lâassociation entre ces évènements et lâexposition aux antirétroviraux au moyen dâétudes cas-témoin nichées dans la cohorte des patients VIH-positifs. Résultats : Le VIH est associé à un risque plus élevé dâhémorragies intracrâniennes, particulièrement au stade SIDA. Les patients VIH-positif sont également plus à risque de subir un infarctus du myocarde, et certains antirétroviraux sont associés à un risque plus grand. Conclusion : Les banques de données médico-administratives représentent un moyen valable dâétudier les comorbidités non-infectieuses chez les patients atteints du VIH.

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La mammite subclinique est un problème de santé fréquent et coûteux. Les infections intra-mammaires (IIM) sont souvent détectées à lâaide de mesures du comptage des cellules somatiques (CCS). La culture bactériologique du lait est cependant requise afin dâidentifier le pathogène en cause. à cause de cette difficulté, pratiquement toutes les recherches sur la mammite subclinique ont été centrées sur la prévalence dâIIM et les facteurs de risque pour lâincidence ou lâélimination des IIM sont peu connus. Lâobjectif principal de cette thèse était dâidentifier les facteurs de risque modifiables associés à lâincidence, lâélimination et la prévalence dâIIM dâimportance dans les troupeaux laitiers Canadiens. En premier lieu, une revue systématique de la littérature sur les associations entre pratiques utilisées à la ferme et CCS a été réalisée. Les pratiques de gestion constamment associées au CCS ont été identifiées et différentiées de celles faisant lâobjet de rapports anecdotiques. Par la suite, un questionnaire bilingue a été développé, validé, et utilisé afin de mesurer les pratiques de gestion dâun échantillon de 90 troupeaux laitiers canadiens. Afin de valider lâoutil, des mesures de répétabilité et de validité des items composant le questionnaire ont été analysées et une évaluation de lâéquivalence des versions anglaise et française a été réalisée. Ces analyses ont permis dâidentifier des items problématiques qui ont du être recatégorisés, lorsque possible, ou exclus des analyses subséquentes pour assurer une certaine qualité des données. La plupart des troupeaux étudiés utilisaient déjà la désinfection post-traite des trayons et le traitement universel des vaches au tarissement, mais beaucoup des pratiques recommandées nâétaient que peu utilisées. Ensuite, les facteurs de risque modifiables associés à lâincidence, à lâélimination et à la prévalence dâIIM à Staphylococcus aureus ont été investigués de manière longitudinale sur les 90 troupeaux sélectionnés. Lâincidence dâIIM semblait être un déterminant plus important de la prévalence dâIIM du troupeau comparativement à lâélimination des IIM. Le port de gants durant la traite, la désinfection pré-traite des trayons, de même quâune condition adéquate des bouts de trayons démontraient des associations désirables avec les différentes mesures dâIIM. Ces résultats viennent souligner lâimportance des procédures de traite pour lâobtention dâune réduction à long-terme de la prévalence dâIIM. Finalement, les facteurs de risque modifiables associés à lâincidence, à lâélimination et à la prévalence dâIIM à staphylocoques coagulase-négatif (SCN) ont été étudiés de manière similaire. Cependant, afin de prendre en considération les limitations de la culture bactériologique du lait pour lâidentification des IIM causées par ce groupe de pathogènes, une approche semi-Bayesienne à lâaide de modèles de variable à classe latente a été utilisée. Les estimés non-ajusté de lâincidence, de lâélimination, de la prévalence et des associations avec les expositions apparaissaient tous considérablement biaisés par les imperfections de la procédure diagnostique. Ce biais était en général vers la valeur nulle. Encore une fois, lâincidence dâIIM était le principal déterminant de la prévalence dâIIM des troupeaux. Les litières de sable et de produits du bois, de même que lâaccès au pâturage étaient associés à une incidence et une prévalence plus basse de SCN.

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La phosphorylation est une modification post-traductionnelle omniprésente des protéines Cette modification est ajoutée et enlevée par lâactivité enzymatique respective des protéines kinases et phosphatases. Les kinases Erk1/2 sont au cÅur dâune voie de signalisation importante qui régule lâactivité de protéines impliquées dans la traduction, le cycle cellulaire, le réarrangement du cytosquelette et la transcription. Ces kinases sont aussi impliquées dans le développement de lâorganisme, le métabolisme du glucose, la réponse immunitaire et la mémoire. Différentes pathologies humaines comme le diabète, les maladies cardiovasculaires et principalement le cancer, sont associées à une perturbation de la phosphorylation sur les différents acteurs de cette voie. Considérant lâimportance biologique et clinique de ces deux kinases, connaître lâétendue de leur activité enzymatique pourrait mener au développement de nouvelles thérapies pharmacologiques. Dans ce contexte, lâobjectif principal de cette thèse était de mesurer lâinfluence de cette voie sur le phosphoprotéome et de découvrir de nouveaux substrats des kinases Erk1/2. Une étude phosphoprotéomique de cinétique dâinhibition pharmacologique de la voie de signalisation Erk1/2 a alors été entreprise. Le succès de cette étude était basé sur trois technologies clés, soit lâenrichissement des phosphopeptides avec le dioxyde de titane, la spectrométrie de masse haut débit et haute résolution, et le développement dâune plateforme bio-informatique nommée ProteoConnections. Cette plateforme permet dâorganiser les données de protéomique, évaluer leur qualité, indiquer les changements dâabondance et accélérer lâinterprétation des données. Une fonctionnalité distinctive de ProteoConnections est lâannotation des sites phosphorylés identifiés (kinases, domaines, structures, conservation, interactions protéiques phospho-dépendantes). Ces informations ont été essentielles à lâanalyse des 9615 sites phosphorylés sur les 2108 protéines identifiées dans cette étude, soit le plus large ensemble rapporté chez le rat jusquâà ce jour. Lâanalyse des domaines protéiques a révélé que les domaines impliqués dans les interactions avec les protéines, les acides nucléiques et les autres molécules sont les plus fréquemment phosphorylés et que les sites sont stratégiquement localisés pour affecter les interactions. Un algorithme a été implémenté pour trouver les substrats potentiels des kinases Erk1/2 à partir des sites identifiés selon leur motif de phosphorylation, leur cinétique de stimulation au sérum et lâinhibition pharmacologique de Mek1/2. Une liste de 157 substrats potentiels des kinases Erk1/2 a ainsi été obtenue. Parmi les substrats identifiés, douze ont déjà été rapportés et plusieurs autres ont des fonctions associées aux substrats déjà connus. Six substrats (Ddx47, Hmg20a, Junb, Map2k2, Numa1, Rras2) ont été confirmés par un essai kinase in vitro avec Erk1. Nos expériences dâimmunofluorescence ont démontré que la phosphorylation de Hmg20a sur la sérine 105 par Erk1/2 affecte la localisation nucléocytoplasmique de cette protéine. Finalement, les phosphopeptides isomériques positionnels, soit des peptides avec la même séquence dâacides aminés mais phosphorylés à différentes positions, ont été étudiés avec deux nouveaux algorithmes. Cette étude a permis de déterminer leur fréquence dans un extrait enrichi en phosphopeptides et dâévaluer leur séparation par chromatographie liquide en phase inverse. Une stratégie analytique employant un des algorithmes a été développée pour réaliser une analyse de spectrométrie de masse ciblée afin de découvrir les isomères ayant été manqués par la méthode dâanalyse conventionnelle.

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Les études génétiques, telles que les études de liaison ou dâassociation, ont permis dâacquérir une plus grande connaissance sur lâétiologie de plusieurs maladies affectant les populations humaines. Même si une dizaine de milliers dâétudes génétiques ont été réalisées sur des centaines de maladies ou autres traits, une grande partie de leur héritabilité reste inexpliquée. Depuis une dizaine dâannées, plusieurs percées dans le domaine de la génomique ont été réalisées. Par exemple, lâutilisation des micropuces dâhybridation génomique comparative à haute densité a permis de démontrer lâexistence à grande échelle des variations et des polymorphismes en nombre de copies. Ces derniers sont maintenant détectables à lâaide de micropuce dâADN ou du séquençage à haut débit. De plus, des études récentes utilisant le séquençage à haut débit ont permis de démontrer que la majorité des variations présentes dans lâexome dâun individu étaient rares ou même propres à cet individu. Ceci a permis la conception dâune nouvelle micropuce dâADN permettant de déterminer rapidement et à faible coût le génotype de plusieurs milliers de variations rares pour un grand ensemble dâindividus à la fois. Dans ce contexte, lâobjectif général de cette thèse vise le développement de nouvelles méthodologies et de nouveaux outils bio-informatiques de haute performance permettant la détection, à de hauts critères de qualité, des variations en nombre de copies et des variations nucléotidiques rares dans le cadre dâétudes génétiques. Ces avancées permettront, à long terme, dâexpliquer une plus grande partie de lâhéritabilité manquante des traits complexes, poussant ainsi lâavancement des connaissances sur lâétiologie de ces derniers. Un algorithme permettant le partitionnement des polymorphismes en nombre de copies a donc été conçu, rendant possible lâutilisation de ces variations structurales dans le cadre dâétude de liaison génétique sur données familiales. Ensuite, une étude exploratoire a permis de caractériser les différents problèmes associés aux études génétiques utilisant des variations en nombre de copies rares sur des individus non reliés. Cette étude a été réalisée avec la collaboration du Wellcome Trust Centre for Human Genetics de lâUniversity of Oxford. Par la suite, une comparaison de la performance des algorithmes de génotypage lors de leur utilisation avec une nouvelle micropuce dâADN contenant une majorité de marqueurs rares a été réalisée. Finalement, un outil bio-informatique permettant de filtrer de façon efficace et rapide des données génétiques a été implémenté. Cet outil permet de générer des données de meilleure qualité, avec une meilleure reproductibilité des résultats, tout en diminuant les chances dâobtenir une fausse association.