Mykobakteerien lajinmääritykseen käytettävän kitin validointi

Tämä opinnäytetyö tehtiin Elintarviketurvallisuusvirasto Eviran Helsingin yksikön eläintautibakteriologian ryhmälle. Työn tarkoituksena oli löytää ja ottaa käyttöön tämänhetkisen AccuProbe-menetelmän lisäksi monipuolisempi menetelmä mykobakteerien lajinmääritykseen. AccuProbe-testillä pystytään tunnistamaan suurin osa Eviraan tulleista näytteistä eristetyistä mykobakteereista, mutta muun muassa kalanäytteistä eristettyjen mykobakteerien tunnistamiseen ei ole ollut menetelmää. Työhön valittiin GenoType® Mycobacterium CM -kitti. Mykobakteerien lajinmääritykseen kehitetyn GenoType® Mycobacterium CM -kitin käyttöä opeteltiin aluksi Mycobacterium avium ATCC 25291 -kannalla. Tämän jälkeen kittiä kokeiltiin eläimistä eristetyillä sekä M. intracellulare ATCC 13950- ja M. tuberculosis ATCC 25177 -kannoilla. Kyseessä on hybridisaatioon perustuva DNA-liuska-menetelmä, joka sisältää kolme päävaihetta: DNA:n eristäminen, monistaminen PCR:llä ja hybridisaatio. Työn aikana optimoitiin substraatin vaikutusaikoja, seurattiin hybrisaatiovaiheen lämpötiloja ja kehitettiin kitin valmistajan suosittelemaa ravistelevaa lämpöhaudetta / inkubaattoria vastaavia laitteita. Työn tuloksena kitti on käyttövalmis, mutta menetelmän soveltuvuutta eläinkannoille täytyy testata lisää. Osassa tulosliuskoissa oli vääriä vaaleita viivoja ja osa oikeista vaaleista viivoista puuttui. Saadut tulokset antavat kuitenkin hyvän pohjan jatkaa kitin validointia.

A linkage map of spring turnip rape based on RFLP and RAPD markers

Selostus: RAPD- ja RFLP-markkereista koostuva rypsin kytkentäkartta

Generating a raster map presentation of a forest resource by solving a transportation problem

Abstract

Asia... lijknat widh een flygande Häst, hwilken Poëterne kalla Pegasum - [Kartta - kartan - the map]

Stockholm 1595, Andreas Gutterwitz

Matkapuhelinverkon MAP-protokollatoteutus älyverkkopalveluiden ohjauspisteeseen

Työssä esitellään yleiseurooppalaisen GSM-matkapuhelinjärjestelmän verkkoelementtejä ja perehdytään niiden väliseen standardoituun merkinantoprotokollaan. Lisäksi tarkastellaan protokollan lyhytsanomien välitykseen liittyviä operaatioita ja niissä tapahtunutta kehitystä standardoinnin eri vaiheissa. Tavoitteena oli toteuttaa GSM-matkapuhelinverkon merkinantoprotokollaan perustuva ohjelma, jonka tehtävänä on välittää lyhytsanomia matkapuhelin- ja lyhytsanomakeskuksen välillä. Matkapuhelimeen päättyvän lyhytsanoman välitykseen liittyy lisäksi reititystiedon hakeminen vastaanottajan kotirekisteristä. Toteutuksessa on ohjelmointirajapinta, joka helpottaa matkapuhelinverkon uusien palvelusovellusten kehittämistä. Toteutus testattiin standardoituja testitapauksia soveltaen. Yhdenmukaisuustestauksessa käytettiin apuna merkinantoanalysaattoria. Testauksessa tarkastettiin, että protokolla toimii loogisesti oikein. Suorituskykyä ei ole voitu testata todellisessa testiympäristössä, mutta ohjelmallisesti toteutettujen simulaattoreiden avulla on saatu hyviä tuloksia.

Knowledge Map of Research on Biofuels

This work highlights and analyzes the citations and co-citations by different authors, countries and institutions in series of researches on biofuel. These relations represent a knowledge map which shows the areas of research by different countries and authors. The contributions of different institutions were also shown. With this knowledge map developed, areas of research that still need more attention as well as the most important studies were highlighted. The software used for this analysis is Citespace which is developed by Chaomei Chen. Sources of information are articles retrieved from ISI Web of Science. Biofuel as a renewable form of energy is discussed. Its sources, types, methods of production, effects, market, and producers were discussed. Also plans and strategies that aim at boosting world biofuel market were listed as well as recent researches on it. Knowledge mapping, its types and methods as well as the method and software used for the analysis were also discussed.

Building the map of innovation for membrane materials (Ceramic membranes)

This work proposes a method of visualizing the trend of research in the field of ceramic membranes from 1999 to 2006. The presented approach involves identifying problems encountered during research in the field of ceramic membranes. Patents from US patent database and articles from Science Direct(& by ELSEVIER was analyzed for this work. The identification of problems was achieved with software Knowledgist which focuses on the semantic nature of a sentence to generate series of subject action object structures. The identified problems are classified into major research issues. This classification was used for the visualization of the intensity of research. The image produced gives the relation between the number of patents, with time and the major research issues. The identification of the most cited papers which strongly influence the research of the previously identified major issues in the given field was also carried out. The relations between these papers are presented using the metaphor of social network. The final result of this work are two figures, a diagram showing the change in the studied problems a specified period of time and a figure showing the relations between the major papers and groups of the problems