Exome sequencing extends the phenotypic spectrum for ABHD12 mutations: from syndromic to nonsyndromic retinal degeneration.

OBJECTIVE: To identify the genetic causes underlying autosomal recessive retinitis pigmentosa (arRP) and to describe the associated phenotype. DESIGN: Case series. PARTICIPANTS: Three hundred forty-seven unrelated families affected by arRP and 33 unrelated families affected by retinitis pigmentosa (RP) plus noncongenital and progressive hearing loss, ataxia, or both, respectively. METHODS: A whole exome sequencing (WES) analysis was performed in 2 families segregating arRP. A mutational screening was performed in 378 additional unrelated families for the exon-intron boundaries of the ABHD12 gene. To establish a genotype-phenotype correlation, individuals who were homozygous or compound heterozygotes of mutations in ABHD12 underwent exhaustive clinical examinations by ophthalmologists, neurologists, and otologists. MAIN OUTCOME MEASURES: DNA sequence variants, best-corrected visual acuity, visual field assessments, electroretinogram responses, magnetic resonance imaging, and audiography. RESULTS: After a WES analysis, we identified 4 new mutations (p.Arg107Glufs*8, p.Trp159*, p.Arg186Pro, and p.Thr202Ile) in ABHD12 in 2 families (RP-1292 and W08-1833) previously diagnosed with nonsyndromic arRP, which cosegregated with the disease among the family members. Another homozygous mutation (p.His372Gln) was detected in 1 affected individual (RP-1487) from a cohort of 378 unrelated arRP and syndromic RP patients. After exhaustive clinical examinations by neurologists and otologists, the 4 affected members of the RP-1292 had no polyneuropathy or ataxia, and the sensorineural hearing loss and cataract were attributed to age or the normal course of the RP, whereas the affected members of the families W08-1833 and RP-1487 showed clearly symptoms associated with polyneuropathy, hearing loss, cerebellar ataxia, RP, and early-onset cataract (PHARC) syndrome. CONCLUSIONS: Null mutations in the ABHD12 gene lead to PHARC syndrome, a neurodegenerative disease including polyneuropathy, hearing loss, cerebellar ataxia, RP, and early-onset cataract. Our study allowed us to report 5 new mutations in ABHD12. This is the first time missense mutations have been described for this gene. Furthermore, these findings are expanding the spectrum of phenotypes associated with ABHD12 mutations ranging from PHARC syndrome to a nonsyndromic form of retinal degeneration.

Comparable Survival Between HIV+ and HIV- non-Hodgkin and Hodgkin Lymphoma Patients Undergoing Autologous Peripheral Blood Stem Cell Transplantation.

Autologous stem cell transplantation (ASCT) has been successfully used in HIV-related lymphoma (HIV-Ly) patients on highly active antiretroviral therapy. We report the first comparative analysis between HIV-Ly and a matched cohort of HIV(-) lymphoma patients. This retrospective European Group for Blood and Marrow Transplantation study included 53 patients (66% non-Hodgkin and 34% Hodgkin lymphoma) within each cohort. Both groups were comparable except for the higher proportion of males, mixed-cellularity Hodgkin lymphoma and patients receiving granulocyte colony-stimulating factor before engraftment and a smaller proportion receiving total body irradiation-based conditioning within the HIV-Ly cohort. Incidence of relapse, overall survival, and progression-free survival were similar in both cohorts. A higher nonrelapse mortality within the first year after ASCT was observed in the HIV-Ly group (8% vs 2%), predominantly because of early bacterial infections, although this was not statistically significant and did not influence survival. Thus, within the highly active antiretroviral therapy era, HIV patients should be considered for ASCT according to the same criteria adopted for HIV(-) lymphoma patients.

Eosinophilic esophagitis: Updated consensus recommendations for children and adults.

Eosinophilic esophagitis (EoE) is a clinicopathologic condition of increasing recognition and prevalence. In 2007, a consensus recommendation provided clinical and histopathologic guidance for the diagnosis and treatment of EoE; however, only a minority of physicians use the 2007 guidelines, which require fulfillment of both histologic and clinical features. Since 2007, the number of EoE publications has doubled, providing new disease insight. Accordingly, a panel of 33 physicians with expertise in pediatric and adult allergy/immunology, gastroenterology, and pathology conducted a systematic review of the EoE literature (since September 2006) using electronic databases. Based on the literature review and expertise of the panel, information and recommendations were provided in each of the following areas of EoE: diagnostics, genetics, allergy testing, therapeutics, and disease complications. Because accumulating animal and human data have provided evidence that EoE appears to be an antigen-driven immunologic process that involves multiple pathogenic pathways, a new conceptual definition is proposed highlighting that EoE represents a chronic, immune/antigen-mediated disease characterized clinically by symptoms related to esophageal dysfunction and histologically by eosinophil-predominant inflammation. The diagnostic guidelines continue to define EoE as an isolated chronic disorder of the esophagus diagnosed by the need of both clinical and pathologic features. Patients commonly have high rates of concurrent allergic diatheses, especially food sensitization, compared with the general population. Proved therapeutic options include chronic dietary elimination, topical corticosteroids, and esophageal dilation. Important additions since 2007 include genetic underpinnings that implicate EoE susceptibility caused by polymorphisms in the thymic stromal lymphopoietin protein gene and the description of a new potential disease phenotype, proton pump inhibitor-responsive esophageal eosinophila. Further advances and controversies regarding diagnostic methods, surrogate disease markers, allergy testing, and treatment approaches are discussed.

Neurotensin is a regulator of insulin secretion in pancreatic beta-cells.

Neurotensin (NT) is secreted from neurons and gastrointestinal endocrine cells. We previously reported that the three NT receptors (NTSRs) are expressed in pancreatic islets and beta cell lines on which we observed a protective effect of NT against cytotoxic agents. In this study, we explored the role of NT on insulin secretion in the endocrine pancreatic beta cells. We observed that NT stimulates insulin secretion at low glucose level and has a small inhibiting effect on stimulated insulin secretion from isolated islets or INS-1E cells. We studied the mechanisms by which NT elicited calcium concentration changes using fura-2 loaded islets or INS-1E cells. NT increases calcium influx through the opening of cationic channels. Similar calcium influxes were observed after treatment with NTSR selective ligands. NT-evoked calcium regulation involves PKC and the translocation of PKCalpha and PKCepsilon to the plasma membrane. Part of NT effects appears to be also mediated by PKA but not via the Erk pathway. Taken together, these data provide evidence for an important endocrine role of NT in the regulation of the secretory function of beta cells.

La question nationale en Europe du Sud-Est : genèse, émergence et développement de l'identité nationale albanaise au Kosovo et en Macédoine

NOTE METHODOLOGIQUE Avant d'entamer notre travail d'analyse, nous tenons à souligner d'emblée un certain nombre de remarques sur les obstacles affrontés et aux difficultés que nous avons rencontrées durant cette recherche. Plusieurs observations s'imposent quant aux concepts utilités, aux sources et travaux consultés et à la manière d'aborder la thématique nationale et nationaliste albanaise. Sachant que notre objectif a été de rompre avec le discours dominant sur le thème de l'identité nationale albanaise et de celui des travaux qui sont l'oeuvre, dans la plupart des cas, d'observateurs et d'acteurs à la fois, il fallait utiliser avec beaucoup de précaution les termes désignant aujourd'hui des groupes ethniques ou alors des entités territoriales contemporaines telles que le Kosovo ou la Macédoine. Pour la clarté de l'analyse, il était nécessaire d'utiliser certains concepts tels que l'ethnie, populations albanophones, albanaises ou proto-albanaises, toutefois, nous n'avons pas retenu le même sens que celui des acteurs. Lorsqu'on évoque ces populations, ce n'est pas le sens ethnique contemporain que nous retenons, mais celui qui pouvait prévaloir dans les contextes historiques auxquels nous nous sommes référés. Quant aux lieux et entités politiques d'aujourd'hui, nous avons choisi de recourir aux concepts tels qu'espace ou aire culturelle albanophone pour éviter de projeter dans le passé des catégories contemporaines comme le fait volontiers l'iconographie nationaliste. Enfin, par un souci d'impartialité, nous avons utilisé l'appellation des villes et des noms des figures historiques selon les contextes historiques abordés et avons précisé, entre parenthèses, l'appellation dans d'autres langues aussi. Concernant les sources et les travaux utilisés, comme nous venons de l'évoquer, la plupart d'eux sont émaillés par des considérations d'ordre idéologique et prennent clairement position soit en faveur de la position albanaise, soit de celle serbe, macédonienne ou autre. En fait, dans l'entreprise nationaliste, la définition d'un problème est un enjeu de luttes dans le temps et dans l'espace. Afin d'éviter de s'enliser dans le piège d'une lecture unilatérale des événements historiques, nous avons systématiquement utilisé des sources directes, croisé les sources d'information, sélectionné les publications utilisées selon leur rigueur scientifique et les références utilisées dans l'élaboration de leur argumentation. L'établissement d'une chronologie fiable a été une tâche difficile. En fait, comme nous l'avons rappelé dans notre introduction, peu d'ouvrages traitent de la question identitaire albanaise. En ce qui concerne la littérature albanaise, celle-ci est abondante, cependant, nous avons exclusivement utilisé des travaux universitaires qui ont le souci de la clarté et de l'objectivité et qui abordent la question albanaise sur la base des sources variées consultées (basées sur les archives officielles albanaise, serbe et internationale). Toutefois, nous avons d'une part relevé que certains travaux historiques utilisés ont été produits en Albanie durant la période du régime totalitaire d'Enver Hoxha. L'influence de ce régime dans la lecture de l'histoire ressort implicitement dans le choix des thèmes et des faits socio-historiques relatés par les auteurs. D'autre part, la littérature albanaise du Kosovo et de Macédoine et l'approche qu'elle effectue de la question nationale albanaise varie selon les contextes politiques. Ainsi, par exemple, les publications des années 1980 sur la Ligue de Prizren sont riches et fiables et poursuivent des objectifs autres que ceux visant à légitimer les revendications politiques albanaises. Quant aux travaux des auteurs serbes et macédoniens sur la question nationale albanaise, force est de constater qu'ils sont sous une forte influence nationaliste sur cette question. En fait, les travaux de Dimitrije Tucović, d'Aleksandar Matkovski et la publication dirigée par Nebojša Popov font exception à toute une production qui ne prend pas uniquement partie dans son jugement, mais qui a une attitude pour le moins problématique à l'égard des Albanais du Kosovo et de Macédoine. Compte tenu de ces constatations et de ces difficultés et afin de nous protéger des éventuelles approximations, nous avons systématiquement vérifié les faits socio-historiques relatés par la littérature historique occidentale qui portait sur Byzance, sur l'Empire ottoman ou alors sur la période plus contemporaine. Tout au long de notre recherche, nous avons privilégié certaines références des chercheurs (triés sur la base de leur connaissance de la question et des sources consultées) sur la région des Balkans pour l'établissement de notre chronologie (notamment ceux de Tahir Abdyli, de Skender Anamali, d'Ivo Banac, de Sadulla Brestovci, de Georges Castellan, d'Alain Ducellier, d'Ali Hadri, de Branko Horvat, de Kristo Frashëri, de Hivzi Islami, de Kristaq Prifti, de Noel Malcolm, d'Aleksandar Matkovski, de Pajazit Nushi, de Stefanaq Pollo, de Selami Pulaha, de Halim Purellku, de Skënder Rizaj, de Limon Rushiti, de Michel Roux, de Zija Shkodra, de Stavro Skendi de Dimitrije Tucović et de Miranda Vickers). Ces travaux nous ont été d'une grande utilité, même si les thématiques abordées étaient parfois complémentaires à notre objectif de recherche.

Impact of genomic methylation on radiation sensitivity of colorectal carcinoma.

PURPOSE: To investigate the influence of demethylation with 5-aza-cytidine (AZA) on radiation sensitivity and to define the intrinsic radiation sensitivity of methylation deficient colorectal carcinoma cells. METHODS AND MATERIALS: Radiation sensitizing effects of AZA were investigated in four colorectal carcinoma cell lines (HCT116, SW480, L174 T, Co115), defining influence of AZA on proliferation, clonogenic survival, and cell cycling with or without ionizing radiation. The methylation status for cancer or DNA damage response-related genes silenced by promoter methylation was determined. The effect of deletion of the potential target genes (DNMT1, DNMT3b, and double mutants) on radiation sensitivity was analyzed. RESULTS: AZA showed radiation sensitizing properties at >or=1 micromol/l, a concentration that does not interfere with the cell cycle by itself, in all four tested cell lines with a sensitivity-enhancing ratio (SER) of 1.6 to 2.1 (confidence interval [CI] 0.9-3.3). AZA successfully demethylated promoters of p16 and hMLH1, genes associated with ionizing radiation response. Prolonged exposure to low-dose AZA resulted in sustained radiosensitivity if associated with persistent genomic hypomethylation after recovery from AZA. Compared with maternal HCT116 cells, DNMT3b-defcient deficient cells were more sensitive to radiation with a SER of 2.0 (CI 0.9-2.1; p = 0.03), and DNMT3b/DNMT1-/- double-deficient cells showed a SER of 1.6 (CI 0.5-2.7; p = 0.09). CONCLUSIONS: AZA-induced genomic hypomethylation results in enhanced radiation sensitivity in colorectal carcinoma. The mediators leading to sensitization remain unknown. Defining the specific factors associated with radiation sensitization after genomic demethylation may open the way to better targeting for the purpose of radiation sensitization.