In situ evaluation of single-cell lysis by cytosol extraction observation through fluorescence decay and dielectrophoretic trapping time

We present a new method for lysis of single cells in continuous flow, where cells are sequentially trapped, lysed and released in an automatic process. Using optimized frequencies, dielectrophoretic trapping allows exposing cells in a reproducible way to high electrical fields for long durations, thereby giving good control on the lysis parameters. In situ evaluation of cytosol extraction on single cells has been studied for Chinese hamster ovary (CHO) cells through out-diffusion of fluorescent molecules for different voltage amplitudes. A diffusion model is proposed to correlate this out-diffusion to the total area of the created pores, which is dependent on the potential drop across the cell membrane and enables evaluation of the total pore area in the membrane. The dielectrophoretic trapping is no longer effective after lysis because of the reduced conductivity inside the cells, leading to cell release. The trapping time is linked to the time required for cytosol extraction and can thus provide additional validation of the effective cytosol extraction for non-fluorescent cells. Furthermore, the application of one single voltage for both trapping and lysis provides a fully automatic process including cell trapping, lysis, and release, allowing operating the device in continuous flow without human intervention.

Mean platelet volume in the early phase of acute ischemic stroke is not associated with severity or functional outcome.

Background: Previous studies reported an increase of mean platelet volume (MPV) in patients with acute ischemic stroke. However, its correlation with stroke severity has not been investigated. Moreover, studies on the association of MPV with functional outcome yielded inconsistent results. Methods: We included all consecutive ischemic stroke patients admitted to CHUV (Centre Hospitalier Universitaire Vaudois) Neurology Service within 24 h after stroke onset who had MPV measured on admission. The association of MPV with stroke severity (NIHSS score at admission and at 24 h) and outcome (Rankin Scale score at 3 and 12 months) was analyzed in univariate analysis. The chi(2) test was performed to compare the frequency of minor strokes (NIHSS score </=4) and good functional outcome (Rankin Scale score </=2) across MPV quartiles. The ANOVA test was used to compare MPV between stroke subtypes according to the TOAST classification. Student's two-tailed unpaired t test was performed to compare MPV between lacunar and nonlacunar strokes. MPV was generated at admission by the Sysmex XE-2100 automated cell counter (Sysmex Corporation, Kobe, Japan) from EDTA blood samples. Results: There was no significant difference in the frequency of minor strokes (p = 0.46) and good functional outcome (p = 0.06) across MPV quartiles. MPV was not associated with stroke severity or outcome in univariate analysis. There was no significant difference in MPV between stroke subtypes according to the TOAST classification (p = 0.173) or between lacunar and nonlacunar strokes (10.50 +/- 0.91 vs. 10.40 +/- 0.81 fl, p = 0.322). Conclusions: MPV, assessed within 24 h after ischemic stroke onset, is not associated with stroke severity or functional outcome.

On the use of reporter bacteria for measuring availability of organic contaminants

Natural environments are constantly challenged by the release of hydrophobic organic contaminants, which represent a threat for both the ecosystem and human health. Despite a substantial degradation by naturally occurring micro-organisms, a non negligible fraction of these pollutants tend to persist in soil and sediments due to their reduced accessibility to microbial degraders. This lack of 'bioavailability' is acknowledged as a key parameter for the natural and stimulated clean-up (bioremediation) of contaminated sites. We developed a bacterial bioreporter that responds to the presence of polyaromatic hydrocarbons (PAHs) by the production of the green fluorescent protein (GFP), based on the PAH-degrading bacterium Burkholderia sartisoli. We showed in this study that the bacterial biosensor B. sartisoli strain RP037 was faithfully reporting the degradation of naphthalene and phenanthrene (two PAHs of low molecular weight) via the production of GFP. What is more, the magnitude of GFP induction was influenced by change in the PAH flux triggered by a variety of physico-chemical parameters, such as the contact surface between the pollutant and the aqueous suspension. Further experiments permitted to test the influence of dissolved organic matter, which is an important component of natural habitats and can interact with organic pollutants. In addition, we tested the influence of two types of biosurfactants (tensio-active agents produced by living organisms) on phenanthrene's degradation by RP037. Interestingly, the surfactant's effects on the biodegradation rate appeared to depend on the type of biosurfactant and probably on the type of bacterial strain. Finally, we tagged B. sartisoli strain RP037 with a constitutively expressed mCherry fluorescent protein. The presence of mCherry allowed us to visualize the bacteria in complex samples even when GFP production was not induced. The new strain RP037-mChe embedded in a gel patch was used to detect PAH fluxes from a point source, such as a non-aqueous liquid or particles of contaminated soil. In parallel, we also developed and tested a so-called multiwell bacterial biosensor platform, which permitted the simultaneous use of four different reporter strains for the detection of major crude oil components (e.g., saturated hydrocarbons, mono- and polyaromatics) in aqueous samples. We specifically constructed the strain B. sartisoli RP007 (pPROBE-phn-luxAB) for the detection of naphthalene and phenanthrene. It was equipped with a reporter plasmid similar to the one in strain RP037, except that the gfp gene was replaced by the genes luxAB, which encoded the bacterial luciferase. The strain was implemented in the biosensor platform and detected an equivalent naphthalene concentration in oil spilled-sea water. We also cloned the gene for the transcriptional activator AlkS and the operator/promoter region of the operon alkSB1GHJ from the alkane-degrader bacterium Alcanivorax borkumensis strain SK2 in order to construct a new bacterial biosensor with higher sensitivity towards long-chain alkanes. However, the resulting strain showed no increased light emission in presence of tetradecane (C14), while it still efficiently reported low concentrations of octane (C8). RÉSUMÉ : Les écosystèmes naturels sont constamment exposés à nombre de contaminants organiques hydrophobes (COHs) d'origine industrielle, agricole ou même naturelle. Les COHs menacent à la fois l'environnement, le bien-être des espèces animales et végétales et la santé humaine, mais ils peuvent être dégradés par des micro-organismes tels que les bactéries et les champignons, qui peuvent être capables des les transformer en produits inoffensifs comme le gaz carbonique et l'eau. La biodégradation des COHs est cependant fréquemment limitée par leur pauvre disponibilité envers les organismes qui les dégradent. Ainsi, bien que la biodégradation opère partiellement, les COHs persistent dans l'environnement à de faibles concentrations qui potentiellement peuvent encore causer des effets toxiques chroniques. Puisque la plupart des COHs peuvent être métabolisés par l'activité microbienne, leur persistance a généralement pour origine des contraintes physico-chimiques plutôt que biologiques. Par exemple, leur solubilité dans l'eau très limitée réduit leur prise par des consommateurs potentiels. De plus, l'adsorption à la matière organique et la séquestration dans les micropores du sol participent à réduire leur disponibilité envers les microbes. Les processus de biodisponibilité, c'est-à-dire les processus qui gouvernent la dissolution et la prise de polluants par les organismes vivants, sont généralement perçus comme des paramètres clés pour la dépollution (bioremédiation) naturelle et stimulée des sites contaminés. Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAPs) sont un modèle de COH produits par les activités aussi bien humaines que naturelles, et listés comme des contaminants chroniques de l'air, des sols et des sédiments. Ils peuvent être dégradés par un vaste nombre d'espèces bactériennes mais leur taux de biodégradation est souvent limité par les contraintes mentionnées ci-dessus. Afin de comprendre les processus de biodisponibilité pour les cellules bactériennes, nous avons décidé d'utiliser les bactéries elles-mêmes pour détecter et rapporter les flux de COH. Ceci a été réalisé par l'application d'une stratégie de conception visant à produire des bactéries `biocapteurs-rapporteurs', qui littéralement s'allument lorsqu'elles détectent un composé cible pour lequel elles ont été conçues. En premier lieu, nous nous sommes concentrés sur Burkholderia sartisoli (souche RP007), une bactérie isolée du sol et consommatrice de HAP .Cette souche a servi de base à la construction d'un circuit génétique permettant la formation de la protéine autofluorescente GFP dès que les cellules détectent le naphtalène ou le phénanthrène, deux HAP de faible masse moléculaire. En effet, nous avons pu montrer que la bactérie obtenue, la souche RP037 de B. sartisoli, produit une fluorescence GFP grandissante lors d'une exposition en culture liquide à du phénanthrène sous forme cristalline (0.5 mg par ml de milieu de culture). Nous avons découvert que pour une induction optimale il était nécessaire de fournir aux cellules une source additionnelle de carbone sous la forme d'acétate, ou sinon seul un nombre limité de cellules deviennent induites. Malgré cela, le phénanthrène a induit une réponse très hétérogène au sein de la population de cellules, avec quelques cellules pauvrement induites tandis que d'autres l'étaient très fortement. La raison de cette hétérogénéité extrême, même dans des cultures liquides mélangées, reste pour le moment incertaine. Plus important, nous avons pu montrer que l'amplitude de l'induction de GFP dépendait de paramètres physiques affectant le flux de phénanthrène aux cellules, tels que : la surface de contact entre le phénanthrène solide et la phase aqueuse ; l'ajout de surfactant ; le scellement de phénanthrène à l'intérieur de billes de polymères (Model Polymer Release System) ; la dissolution du phénanthrène dans un fluide gras immiscible à l'eau. Nous en avons conclu que la souche RP037 détecte convenablement des flux de phénantrène et nous avons proposé une relation entre le transfert de masse de phénanthrène et la production de GFP. Nous avons par la suite utilisé la souche afin d'examiner l'effet de plusieurs paramètres chimiques connus dans la littérature pour influencer la biodisponibilité des HAP. Premièrement, les acides humiques. Quelques rapports font état que la disponibilité des HAP pourrait être augmentée par la présence de matière organique dissoute. Nous avons mesuré l'induction de GFP comme fonction de l'exposition des cellules RP037 au phénanthrène ou au naphtalène en présence ou absence d'acides humiques dans la culture. Nous avons testé des concentrations d'acides humiques de 0.1 et 10 mg/L, tandis que le phénanthrène était ajouté via l'heptamethylnonane (HMN), un liquide non aqueux, ce qui au préalable avait produit le plus haut flux constant de phénanthrène aux cellules. De plus, nous avons utilisé des tests en phase gazeuse avec des concentrations d'acides humiques de 0.1, 10 et 1000 mg/L mais avec du naphtalène. Contrairement à ce que décrit la littérature, nos résultats ont indiqué que dans ces conditions l'expression de GFP en fonction de l'exposition au phénanthrène dans des cultures en croissance de la souche RP037 n'était pas modifiée par la présence d'acides humiques. D'un autre côté, le test en phase gazeuse avec du naphtalène a montré que 1000 mg/L d'acides humiques abaissent légèrement mais significativement la production de GFP dans les cellules de RP037. Nous avons conclu qu'il n'y a pas d'effet général des acides humiques sur la disponibilité des HAP pour les bactéries. Par la suite, nous nous sommes demandé si des biosurfactants modifieraient la disponibilité du phénanthrène pour les bactéries. Les surfactants sont souvent décrits dans la littérature comme des moyens d'accroître la biodisponibilité des COHs. Les surfactants sont des agents tensio-actifs qui augmentent la solubilité apparente de COH en les dissolvant à l'intérieur de micelles. Nous avons ainsi testé si des biosurfactants (des surfactants produits par des organismes vivants) peuvent être utilisé pour augmenter la biodisponibilité du phénanthrène pour la souche B. sartisoli RP037. Premièrement, nous avons tenté d'obtenir des biosurfactants produits par une autre bactérie vivant en co-culture avec les biocapteurs bactériens. Deuxièmement, nous avons utilisé des biosurfactants purifiés. La co-cultivation en présence de la bactérie productrice de lipopeptide Pseudomonas putida souche PCL1445 a augmenté l'expression de GFP induite par le phénanthrène chez B. sartisoli en comparaison des cultures simples, mais cet effet n'était pas significativement différent lorsque la souche RP037 était co-cultivée avec un mutant de P. putida ne produisant pas de lipopeptides. L'ajout de lipopeptides partiellement purifiés dans la culture de RP037 a résulté en une réduction de la tension de surface, mais n'a pas provoqué de changement dans l'expression de GFP. D'un autre côté, l'ajout d'une solution commerciale de rhamnolipides (un autre type de biosurfactants produits par Pseudomonas spp.) a facilité la dégradation du phénanthrène par la souche RP037 et induit une expression de GFP élevée dans une plus grande proportion de cellules. Nous avons ainsi conclu que les effets des biosurfactants sont mesurables à l'aide de la souche biocapteur, mais que ceux-ci sont dépendants du type de surfactant utilisé conjointement avec le phénanthrène. La question suivante que nous avons abordée était si les tests utilisant des biocapteurs peuvent être améliorés de manière à ce que les flux de HAP provenant de matériel contaminé soient détectés. Les tests en milieu liquide avec des échantillons de sol ne fournissant pas de mesures, et sachant que les concentrations de HAP dans l'eau sont en général extrêmement basses, nous avons conçu des tests de diffusion dans lesquels nous pouvons étudier l'induction par les HAPs en fonction de la distance aux cellules. Le biocapteur bactérien B. sartisoli souche RP037 a été marqué avec une seconde protéine fluorescente (mCherry), qui est constitutivement exprimée dans les cellules et leur confère une fluorescence rouge/rose. La souche résultante RP037-mChe témoigne d'une fluorescence rouge constitutive mais n'induit la fluorescence verte qu'en présence de naphtalène ou de phénanthrène. La présence d'un marqueur fluorescent constitutif nous permet de visualiser les biocapteurs bactériens plus facilement parmi des particules de sol. Un test de diffusion a été conçu en préparant un gel fait d'une suspension de cellules mélangées à 0.5 % d'agarose. Des bandes de gel de dimensions 0.5 x 2 cm x 1 mm ont été montées dans des chambres d'incubation et exposées à des sources de HAP (soit dissouts dans du HMN ou en tant que matériel solide, puis appliqués à une extrémité de la bande). En utilisant ce montage expérimental, le naphtalène ou le phénanthrène (dissouts dans du HMN à une concentration de 2.5 µg/µl) ont induit un gradient d'intensité de fluorescence GFP après 24 heures d'incubation, tandis que la fluorescence mCherry demeurait comparable. Un sol contaminé par des HAPs (provenant d'un ancien site de production de gaz) a induit la production de GFP à un niveau comparable à celui du naphtalène. Des biocapteurs bactériens individuels ont également détecté un flux de phénanthrène dans un gel contenant des particules de sol amendées avec 1 et 10 mg/g de phénanthrène. Ceci a montré que le test de diffusion peut être utilisé pour mesurer des flux de HAP provenant de matériel contaminé. D'un autre côté, la sensibilité est encore très basse pour plusieurs sols contaminés, et l'autofluorescence de certains échantillons rend difficile l'identification de la réponse de la GFP chez les cellules. Pour terminer, un des points majeurs de ce travail a été la production et la validation d'une plateforme multi-puits de biocapteurs bactériens, qui a permis l'emploi simultané de plusieurs souches différentes de biocapteurs pour la détection des constituants principaux du pétrole. Pour cela nous avons choisi les alcanes linéaires, les composés mono-aromatiques, les biphényls et les composés poly-aromatiques. De plus, nous avons utilisé un capteur pour la génotoxicité afin de détecter la `toxicité globale' dans des échantillons aqueux. Plusieurs efforts d'ingénierie ont été investis de manière à compléter ce set. En premier lieu, chaque souche a été équipée avec soit gfp, soit luxAB en tant que signal rapporteur. Deuxièmement, puisqu'aucune souche de biocapteur n'était disponible pour les HAP ou pour les alcanes à longues chaînes, nous avons spécifiquement construit deux nouveaux biocapteurs. L'un d'eux est également basé sur B. sartisoli RP007, que nous avons équipé avec le plasmide pPROBE-phn-luxAB pour la détection du naphtalène et du phénanthrène mais avec production de luciférase bactérienne. Un autre est un nouveau biocapteur bactérien pour les alcanes. Bien que nous possédions une souche Escherichia coli DHS α (pGEc74, pJAMA7) détectant les alcanes courts de manière satisfaisante, la présence des alcanes à longues chaînes n'était pas rapportée efficacement. Nous avons cloné le gène de l'activateur transcriptionnel A1kS ainsi que la région opérateur/promoteur de l'opéron alkSB1GHJ chez la bactérie dégradant les alcanes Alcanivorax borkumensis souche SK2, afin de construire un nouveau biocapteur bactérien bénéficiant d'une sensibilité accrue envers les alcanes à longues chaînes. Cependant, la souche résultante E. coli DHSα (pAlk3} n'a pas montré d'émission de lumière augmentée en présence de tétradécane (C14), tandis qu'elle rapportait toujours efficacement de basses concentrations d'octane (C8). De manière surprenante, l'utilisation de A. borkumensis en tant que souche hôte pour le nouveau plasmide rapporteur basé sur la GFP a totalement supprimé la sensibilité pour l'octane, tandis que la détection de tétradécane n'était pas accrue. Cet aspect devra être résolu dans de futurs travaux. Pour calibrer la plateforme de biocapteurs, nous avons simulé une fuite de pétrole en mer dans une bouteille en verre ouverte de 5L contenant 2L d'eau de mer contaminée avec 20 ml (1%) de pétrole brut. La phase aqueuse a été échantillonée à intervalles réguliers après la fuite durant une période allant jusqu'à une semaine tandis que les principaux contaminants pétroliers étaient mesurés via les biocapteurs. L'émission de bioluminescence a été mesurée de manière à déterminer la réponse des biocapteurs et une calibration intégrée faite avec des inducteurs types a servi à calculer des concentrations d'équivalents inducteurs dans l'échantillon. E. coli a été utilisée en tant que souche hôte pour la plupart des spécificités des biocapteurs, à l'exception de la détection du naphtalène et du phénanthrène pour lesquels nous avons utilisé B. sartisoli. Cette souche, cependant, peut être employée plus ou moins selon la même procédure. Il est intéressant de noter que le pétrole répandu a produit une apparition séquentielle de composés dissouts dans la phase aqueuse, ceux-ci .étant détectables par les biocapteurs. Ce profil contenait d'abord les alcanes à courtes chaînes et les BTEX (c'est-à dire benzène, toluène, éthylbenzène et xylènes), apparaissant entre des minutes et des heures après que le pétrole a été versé. Leurs concentrations aqueuses ont par la suite fortement décru dans l'eau échantillonnée après 24 heures, à cause de la volatilisation ou de la biodégradation. Après quelques jours d'incubation, ces composés sont devenus indétectables. Les HAPs, en revanche, sont apparus plus tard que les alcanes et les BTEX, et leur concentration a augmenté de pair avec un temps d'incubation prolongé. Aucun signal significatif n'a été mis en évidence avec le biocapteur pour le biphényl ou pour la génotoxicité. Ceci démontre l'utilité de ces biocapteurs, spécifiquement pour la détection des composés pétroliers, comprenant les alcanes à courtes chaînes, les BTEX et les HAPs légers.

High constant incidence rates of second primary cancers of the head and neck: a pooled analysis of 13 cancer registries.

Scanty data are available on the incidence (i.e., the absolute risk) of second cancers of the head and neck (HN) and its pattern with age. We investigated this issue using data from a multicentric study of 13 population-based cancer registries from Europe, Canada, Australia and Singapore for the years 1943-2000. A total of 99,257 patients had a first primary HN cancer (15,985 tongue, 22,378 mouth, 20,758 pharyngeal, and 40,190 laryngeal cancer), contributing to 489,855 person-years of follow-up. A total of 1,294 of the patients (1.3%) were diagnosed with second HN cancers (342 tongue, 345 mouth, 418 pharynx and 189 larynx). Male incidence rates of first HN cancer steeply increased from 0.68/100,000 at age 30-34 to 46.2/100,000 at age 70-74, and leveled off at older age; female incidence increased from 0.50/100,000 at age 30-34 to 16.5/100,000 at age 80-84. However, age-specific incidence of second HN cancers after a first HN cancer in men was around 200-300/100,000 between age 40-44 and age 70-74 and tended to decline at subsequent ages (150/100,000 at age 80-84); in women, incidence of second HN cancers was around 200-300/100,000 between age 45-49 and 80-84. The patterns of age-specific incidence were consistent for different subsites of second HN cancer and sexes; moreover, they were similar for age-specific incidence of first primary HN cancer in patients who subsequently developed a second HN cancer. The incidence of second HN cancers does not increase with age, but remains constant, or if anything, decreases with advancing age.

Antiretroviral treatment during pregnancy.

OBJECTIVE: Virologic failure of HIV-positive patients is of special concern during pregnancy. We compared virologic failure and the frequency of treatment changes in pregnant and non-pregnant women of the Swiss HIV Cohort Study. METHODS: Using data on 372 pregnancies in 324 women we describe antiretroviral therapy during pregnancy. Pregnant women on HAART at conception (n = 131) were matched to 228 non-pregnant women (interindividual comparison) and to a time period of equal length before and after pregnancy (intraindividual comparison). Women starting HAART during pregnancy (n = 145) were compared with 578 non-pregnant women starting HAART. FINDINGS: The median age at conception was 31 years, 16% (n = 50) were infected through injecting drug use and the median CD4 cell count was 489 cells/microl. In the majority of pregnancies (n = 220, 59%), women had started ART before conception. When ART was started during pregnancy (n = 145, 39%), it was mainly during the second trimester (n = 100, 69%). Two thirds (n = 26) of 35 women starting in the third trimester were diagnosed with HIV during pregnancy. The risk of virologic failure tended to be lower in pregnant than in non-pregnant women [adjusted odds ratio 0.52 (95% confidence interval 0.25-1.09, P = 0.08)], but was similar in the intraindividual comparison (adjusted odds ratio 1.04, 95% confidence interval 0.48-2.28). Women starting HAART during pregnancy changed the treatment less often than non-pregnant women. CONCLUSION: Despite the physiological changes occurring during pregnancy, HIV infected pregnant women are not at higher risk of virologic failure.

Independent relations of left ventricular structure with the 24-hour urinary excretion of sodium and aldosterone.

Previous studies reported on the association of left ventricular mass index (LVMI) with urinary sodium or with circulating or urinary aldosterone. We investigated the independent associations of LVMI with the urinary excretion of both sodium and aldosterone. We randomly recruited 317 untreated subjects from a white population (45.1% women; mean age 48.2 years). Measurements included echocardiographic left ventricular (LV) properties, the 24-hour urinary excretion of sodium and aldosterone, plasma renin activity (PRA), and proximal (RNa(prox)) and distal (RNa(dist)) renal sodium reabsorption, assessed from the endogenous lithium clearance. In multivariable-adjusted models, we expressed changes in LVMI per 1-SD increase in the explanatory variables, while accounting for sex, age, systolic blood pressure, and the waist-to-hip ratio. LVMI increased independently with the urinary excretion of both sodium (+2.48 g/m(2); P=0.005) and aldosterone (+2.63 g/m(2); P=0.004). Higher sodium excretion was associated with increased mean wall thickness (MWT: +0.126 mm, P=0.054), but with no change in LV end-diastolic diameter (LVID: +0.12 mm, P=0.64). In contrast, higher aldosterone excretion was associated with higher LVID (+0.54 mm; P=0.017), but with no change in MWT (+0.070 mm; P=0.28). Higher RNa(dist) was associated with lower relative wall thickness (-0.81x10(-2), P=0.017), because of opposite trends in LVID (+0.33 mm; P=0.13) and MWT (-0.130 mm; P=0.040). LVMI was not associated with PRA or RNa(prox.) In conclusion, LVMI independently increased with both urinary sodium and aldosterone excretion. Increased MWT explained the association of LVMI with urinary sodium and increased LVID the association of LVMI with urinary aldosterone.

First explicit criteria to decide on the appropriateness of therapy of ulcerative colitis: the European EPATUC panel

Background: Ulcerative colitis (UC) is a chronic disease with a wide variety of treatment options many of which are not evidence based. Supplementing available guidelines, which are often broadly defined, consensus-based and generally not tailored to specifically reflect the individual patient situation, we developed explicit appropriateness criteria to assist, and improve treatment decisions. Methods: We used the RAND appropriateness method which does not force consensus. An extensive literature review was compiled based on and supplementing, where necessary, the ECCO UC 2011 guidelines. EPATUC (endorsed by ECCO) was formed by 8 gastroenterologists, 2 surgeons and 2 general practitioners from throughout Europe. Clinical scenarios reflecting practice were rated on a 9-point scale from 1 (extremely inappropriate) to 9 (extremely appropriate), based on the expert's experience and the available literature. After extensive discussion, all scenarios were re-rated at a two-day panel meeting. Median and disagreement were used to categorize ratings into 3 categories: appropriate, uncertain and inappropriate. Results: 718 clinical scenarios were rated, structured in 13 main clinical presentations: not refractory (n=64) or refractory (n=33) proctitis, mild to moderate left-sided (n=72) or extensive (n=48) colitis, severe colitis (n=36), steroid-dependant colitis (n=36), steroid-refractory colitis (n=55), acute pouchitis (n=96), maintenance of remission (n=248), colorectal cancer prevention (n=9) and fulminant colitis (n=9). Overall, 100 indications were judged appropriate (14%), 129 uncertain (18%) and 489 inappropriate (68%). Disagreement between experts was very low (6%). Conclusion: For the very first time, explicit appropriateness criteria for therapy of UC were developed that allow both specific and rapid therapeutic decision making and prospective assessment of treatment appropriateness. Comparison of these detailed scenarios with patient profiles encountered in the Swiss IBD cohort study indicates good concordance. EPATUC criteria will be freely accessible on the internet (epatuc.ch).

International exercise on 124Sb activity measurements.

An international exercise, registered as EUROMET project no. 907, was launched to measure both the activity of a solution of (124)Sb and the photon emission intensities of its decay. The same solution was sent by LNE-LNHB to eight participating laboratories. In order to identify possible biases, the participants were asked to use all possible activity measurement methods available in their laboratory and then to determine their reference value for comparison. Thus, measurement results from 4pibeta-gamma coincidence/anti-coincidence counting, CIEMAT/NIST liquid-scintillation counting, 4pigamma counting with well-type ionization chambers and well-type crystal detectors were given. The results are compared and show a maximum discrepancy of about 1.6%: possible explanations are proposed.

European cancer mortality predictions for the year 2013.

Background Estimated cancer mortality statistics were published for the years 2011 and 2012 for the European Union (EU) and its six more populous countries. Patients and methods Using logarithmic Poisson count data joinpoint models and the World Health Organization mortality and population database, we estimated numbers of deaths and age-standardized (world) mortality rates (ASRs) in 2013 from all cancers and selected cancers. Results The 2013 predicted number of cancer deaths in the EU is 1 314 296 (737 747 men and 576 489 women). Between 2009 and 2013, all cancer ASRs are predicted to fall by 6% to 140.1/100 000 in men, and by 4% to 85.3/100 000 in women. The ASRs per 100 000 are 6.6 men and 2.9 women for stomach, 16.7 men and 9.5 women for intestines, 8.0 men and 5.5 women for pancreas, 37.1 men and 13.9 women for lung, 10.5 men for prostate, 14.6 women for breast, and 4.7 for uterine cancer, and 4.2 and 2.6 for leukaemia. Recent trends are favourable except for pancreatic cancer and lung cancer in women. Conclusions Favourable trends will continue in 2013. Pancreatic cancer has become the fourth cause of cancer death in both sexes, while in a few years lung cancer will likely become the first cause of cancer mortality in women as well, overtaking breast cancer.

Admissions of patients with alcohol intoxication in the Emergency Department: a growing phenomenon.

QUESTION UNDER STUDY: To investigate the change over time in the number of ED admissions with positive blood alcohol concentration (BAC) and to evaluate predictors of BAC level. METHODS: We conducted a single site retrospective study at the ED of a tertiary referral hospital (western part of Switzerland) and obtained all the BAC performed from 2002 to 2011. We determined the proportion of ED admissions with positive BAC (number of positive BAC/number of admissions). Regression models assessed trends in the proportion of admissions with positive BAC and the predictors of BAC level among patients with positive BAC. RESULTS: A total of 319,489 admissions were recorded and 20,021 BAC tests were performed, of which 14,359 were positive, divided 34.5% female and 65.5% male. The mean (SD) age was 41.7(16.8), and the mean BAC was 2.12(1.04) permille (g of ethanol/liter of blood). An increase in the number of positive BAC was observed, from 756 in 2002 to 1,819 in 2011. The total number of admissions also increased but less: 1.2 versus 2.4 times more admissions with positive BAC. Being male was independently associated with a higher (+0.19 permille) BAC, as was each passing year (+0.03). A significant quadratic association with age indicated a maximum BAC at age 53. CONCLUSION: We observed an increase in the percentage of admissions with positive BAC that was not limited to younger individuals. Given the potential consequences of alcohol intoxication, and the large burden imposed on ED teams, communities should be encouraged to take measures aimed at reducing alcohol intoxication.

The effects of CYP2D6 and CYP3A activities on the pharmacokinetics of immediate release oxycodone.

BACKGROUND AND PURPOSE: There is high interindividual variability in the activity of drug-metabolizing enzymes catalysing the oxidation of oxycodone [cytochrome P450 (CYP) 2D6 and 3A], due to genetic polymorphisms and/or drug-drug interactions. The effects of CYP2D6 and/or CYP3A activity modulation on the pharmacokinetics of oxycodone remains poorly explored. EXPERIMENTAL APPROACH: A randomized crossover double-blind placebo-controlled study was performed with 10 healthy volunteers genotyped for CYP2D6 [six extensive (EM), two deficient (PM/IM) and two ultrarapid metabolizers (UM)]. The volunteers randomly received on five different occasions: oxycodone 0.2 mg x kg(-1) and placebo; oxycodone and quinidine (CYP2D6 inhibitor); oxycodone and ketoconazole (CYP3A inhibitor); oxycodone and quinidine+ketoconazole; placebo. Blood samples for plasma concentrations of oxycodone and metabolites (oxymorphone, noroxycodone and noroxymorphone) were collected for 24 h after dosing. Phenotyping for CYP2D6 (with dextromethorphan) and CYP3A (with midazolam) were assessed at each session. KEY RESULTS: CYP2D6 activity was correlated with oxymorphone and noroxymorphone AUCs and C(max) (-0.71 < Spearman correlation coefficient rhos < -0.92). Oxymorphone C(max) was 62% and 75% lower in PM than EM and UM. Noroxymorphone C(max) reduction was even more pronounced (90%). In UM, oxymorphone and noroxymorphone concentrations increased whereas noroxycodone exposure was halved. Blocking CYP2D6 (with quinidine) reduced oxymorphone and noroxymorphone C(max) by 40% and 80%, and increased noroxycodone AUC(infinity) by 70%. Blocking CYP3A4 (with ketoconazole) tripled oxymorphone AUC(infinity) and reduced noroxycodone and noroxymorphone AUCs by 80%. Shunting to CYP2D6 pathway was observed after CYP3A4 inhibition. CONCLUSIONS AND IMPLICATIONS: Drug-drug interactions via CYP2D6 and CYP3A affected oxycodone pharmacokinetics and its magnitude depended on CYP2D6 genotype.