Groupes diagnostiques utilisés sur SIMULIT 13

La nomenclature des diagnostics est celle de la Classification internationale des maladies (9e révision), utilisée par la Statistique médicale VESKA depuis 1980. Les trois premiers chiffres du code ont été utilisés; seul le premier diagnostic a été retenu.

Multicentre validation study of nucleic acids extraction from FFPE tissues.

In most pathology laboratories worldwide, formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) samples are the only tissue specimens available for routine diagnostics. Although commercial kits for diagnostic molecular pathology testing are becoming available, most of the current diagnostic tests are laboratory-based assays. Thus, there is a need for standardized procedures in molecular pathology, starting from the extraction of nucleic acids. To evaluate the current methods for extracting nucleic acids from FFPE tissues, 13 European laboratories, participating to the European FP6 program IMPACTS (www.impactsnetwork.eu), isolated nucleic acids from four diagnostic FFPE tissues using their routine methods, followed by quality assessment. The DNA-extraction protocols ranged from homemade protocols to commercial kits. Except for one homemade protocol, the majority gave comparable results in terms of the quality of the extracted DNA measured by the ability to amplify differently sized control gene fragments by PCR. For array-applications or tests that require an accurately determined DNA-input, we recommend using silica based adsorption columns for DNA recovery. For RNA extractions, the best results were obtained using chromatography column based commercial kits, which resulted in the highest quantity and best assayable RNA. Quality testing using RT-PCR gave successful amplification of 200 bp-250 bp PCR products from most tested tissues. Modifications of the proteinase-K digestion time led to better results, even when commercial kits were applied. The results of the study emphasize the need for quality control of the nucleic acid extracts with standardised methods to prevent false negative results and to allow data comparison among different diagnostic laboratories.

Empfehlungen zur Diagnostik und Therapie der behavioralen und psychologischen Symptome der Demenz (BPSD) [Recommendations for diagnosis and therapy of behavioral and psychological symptoms in dementia (BPSD)].

In patients with dementia, Behavioral and Psychological Symptoms of Dementia (BPSD) are frequent findings that accompany deficits caused by cognitive impairment and thus complicate diagnostics, therapy and care. BPSD are a burden both for affected individuals as well as care-givers, and represent a significant challenge for therapy of a patient population with high degree of multi-morbidity. The goal of this therapy-guideline issued by swiss professional associations is to present guidance regarding therapy of BPSD as attendant symptoms in dementia, based on evidence as well as clinical experience. Here it appears to be of particular importance to take into account professional experience, as at this point for most therapeutic options no sufficiently controlled clinical trials are available. A critical discussion of pharmaco-therapeutic intervention is necessary, as this patient-population is particularly vulnerable for medication side-effects. Finally, a particular emphasis is placed on incorporating and systematically reporting psycho-social and nursing options therapeutic intervention.

Oesophagite à éosinophiles [Eosinophilic esophagitis].

Eosinophilic esophagitis is a recent diagnosis, of growing interest and prevalence. It has to be considered by every physician when facing any adult or pediatric case of dysphagia, food impaction, and symptoms of GERD (gastroesophageal reflux disease) resistant to proton-pump inhibitor treatment. The diagnosis is made by combining clinical symptoms and endoscopic signs, supported by biopsies of the mucosa, which should show more than 15 eosinophils per high power field. The etiology seems to be of allergic origin, and a full immuno-allergic testing should be made. Recommendations for the treatment are to calm down the inflammatory process by proton-pump inhibitors, and to give topical steroids, keeping the systemic treatment for acute severe cases. In cases of esophageal stenoses, dilations can be undertaken, but with a high risk of recurrence.

Les consultations motivées par une douleur dans la pratique ambulatoire.

Pratique Médicale Ambulatoire (PMA) est une enquête basée sur le modèle américain du National Ambulatory Medical Care Survey qui a été conduite dans les cantons de Vaud et Fribourg en 1987. Elle avait pour but de décrire l'activité des médecins installés et celle des services ambulatoires des hôpitaux. La fiche de relevé de cette enquête comprenait notamment les caractéristiques du patient (âge, sexe), le motif de la consultation et le ou les diagnostics posés par le médecin. Dans le cadre de ce travail, tous les motifs de consultation se rapportant à une douleur ont été sélectionnés et analysés. [Auteur, p. 2]

Cetuximab in combination with chemoradiotherapy prior to surgery in patients with resectable, locally advanced esophageal carcinoma : a prospective, multicenter phase lb-ll trial of the Swiss Group for Clinical Cancer Research (SAKK 75/06) : 4570

Background: Cetuximab significantly enhances efficacy of radiotherapy and chemotherapy in head and neck cancer. We investigated the safety and feasibility of adding cetuximab to neoadjuvant chemoradiation of locally advanced esophageal cancer. Methods: Pts with resectable, locally advanced squamous cell carcinoma (SCC) or adenocarcinoma (AC) of the thoracic esophagus or gastroesophageal junction (staged by EUS, CT and PET scan) were treated with 2 cycles of induction chemotherapy (docetaxel 75mg/m2, cisplatin 75mg/m2 q3w and weekly cetuximab 250mg/m2), followed by concomitant chemo- immuno-radiation therapy (CIRT: docetaxel 20mg/m2, cisplatin 25mg/m2 and cetuximab 250mg/m2 weekly five times concomitant with 45 Gy radiotherapy in 25 fractions); followed by surgery 4-8 weeks later. The phase I part consisted of 2 cohorts of 7 patients each, without and with docetaxel during CIRT, respectively. Interpatient dose-escalation (adding docetaxel during CIRT) was possible if < 2 out of 7 pts of the 1st cohort experienced limiting toxicity. Having finished the phase 1 part, 13 additional patients were treated with docetaxel-containing CIRT in a phase II part. Pathological response was evaluated according to the Mandard classification. Results: 27 pts from 12 institutions were included. As of today, results from 20 pts are available (cohort 1: 7, cohort 2: 7, phase ll : 6). Median age was 64yrs (range 47-71). 11 AC; 9 SCC. 19 pts (95%) completed CIRT (1 pt stopped treatment during induction therapy due to sepsis). 17 pts underwent resection (no surgery: 1pt for PD, 1pt for cardiac reasons). Grade 3 toxicities during CIRT included anorexia 15%, dysphagia/esophagitis 15%, fatigue 10%, nausea 10%, pruritus 5%, dehydration 5%, nail changes 5% and rash 5% .1 pt suffered from pulmonary embolism. 13 pts (65%, intention-to-treat) showed a complete or near complete pathological remission (cohort 1: 5, cohort 2: 4, phase II: 4). Conclusions: Adding cetuximab to preoperative chemoradiation for esophageal cancer is safe and feasible in a community-based multicenter setting. Antineoplastic activity is encouraging with 65% pathological responders.

Santé mentale et asile : quelle réalité locale ?

Problématique : En Suisse, la situation des requérants d'asile est réglementée depuis 1999 par la Loi sur l'Asile (LAsi) qui leur donnait droit jusqu'en 2008 à une aide sociale, que leur demande soit acceptée, refusée ou que les autorités responsables n'entrent pas en matière. Depuis janvier 2008, tout requérant d'asile ne recevant pas de réponse positive perd cette aide sociale au profit d'une aide dite « d'urgence », impliquant un durcissement des conditions de vie. Depuis lors, un Groupe de Travail « Critères de vulnérabilité » (GT-Vulnérabilité) se charge, sur mandat de l'Etablissement Vaudois d'Accueil des Migrants (EVAM), d'évaluer la situation de certaines personnes percevant l'aide d'urgence sur la base de rapports médicaux et psychiatriques. Il détermine premièrement si la personne doit être considérée comme « vulnérable » pour raison de santé et pose ensuite un préavis médical quant à la possibilité d'amélioration des conditions d'hébergement. Les personnes reconnues comme particulièrement vulnérables sont soumises à un régime différent, impliquant des avantages spécifiés dans l'aide d'urgence. Objectifs : Décrire l'état de santé physique mais surtout mental des personnes percevant l'Aide d'urgence, pour lesquelles une demande a été effectuée auprès de ce groupe et identifier des facteurs associés à cet état de santé. Présenter comment le système de soins organise sa prise en charge et explorer les implications sur la pratique médicale. Méthodologie : Revue exhaustive de la littérature afin de mieux comprendre le contexte social, le cadre légal et les questions éthiques qu'ils impliquent. A partir des dossiers traités par le GT- Vulnérabilité, établissement d'une base de données regroupant des informations d'ordre démographique, médical et anamnestique et analyse descriptive univariée. Résultats: De janvier 2008 à avril 2011, le GT-Vulnérabilité a traité 411 demandes. Parmi les personnes concernées, 52% viennent d'Afrique et sont principalement sans famille. Le GT- Vulnérabilité a pu rendre une décision dans 79% des cas, donnant un préavis en faveur du requérant d'asile pour 82% d'entre eux. On retrouve plus fréquemment une réponse positive lorsqu'il s'agit d'une femme, ou d'une personne avec sa famille. L'étude des dossiers contenant un rapport de généraliste, a montré la présence d'au moins deux diagnostics somatiques chez 42% des personnes, concernant notamment les maladies infectieuses et parasitaires et des atteintes du système nerveux. On retrouve au moins un trouble psychiatrique dans 74% des cas. Il s'agit en particulier de troubles de l'humeur unipolaires et de syndromes de stress post-traumatiques. Les rapports psychiatriques ont également permis d'identifier l'existence de traumatismes chez 81% des personnes, associés surtout à la guerre, à des maltraitance et violences, dans le pays d'origine, mais aussi en Suisse. Conclusion : La situation médicale des requérants d'asile soumis au régime de l'aide d'urgence est préoccupante. Elle met le système de santé et ses divers protagonistes face à des questionnements et des enjeux d'ordre éthique et demande une nécessaire réflexion en termes de santé publique et de politique sanitaire.

Marker-independent identification of glioma-initiating cells.

Tumor-initiating cells with stem cell properties are believed to sustain the growth of gliomas, but proposed markers such as CD133 cannot be used to identify these cells with sufficient specificity. We report an alternative isolation method purely based on phenotypic qualities of glioma-initiating cells (GICs), avoiding the use of molecular markers. We exploited intrinsic autofluorescence properties and a distinctive morphology to isolate a subpopulation of cells (FL1(+)) from human glioma or glioma cultures. FL1(+) cells are capable of self-renewal in vitro, tumorigenesis in vivo and preferentially express stem cell genes. The FL1(+) phenotype did not correlate with the expression of proposed GIC markers. Our data propose an alternative approach to investigate tumor-initiating potential in gliomas and to advance the development of new therapies and diagnostics.

Musculoskeletal pain in female asylum seekers and hypovitaminosis D3

Résumé de l'article L'hypovitaminose D3 est bien connue et courante chez la population âgée en Occident. Toutefois, elle est probablement sous-diagnostiquée chez les jeunes femmes immigrantes, bien qu'elle soit bien documentée, principalement en Angleterre dans la population Indo-Pakistanaise. Lorsque ce déficit est diagnostiqué, le traitement substitutif est simple et bon marché. Nous avons suspecté une haute prévalence chez de jeunes femmes requérantes d'asile, surtout chez celles provenant de cultures différant quant à l'exposition solaire et la diète. Nous publions donc une série de 11 cas de patientes avec une hypovitaminose D symptomatique issues de la consultation générale de la Policlinique Médicale Universitaire. Toutes les patientes présentaient une anamnèse d'une faible exposition solaire et de douleurs osseuses diffuses, d'une fatigue, d'une faiblesse musculaire ou des modifications de la marche. Toutefois, les premiers diagnostics évoqués par les médecins étaient une possible somatisation (3 patientes), des douleurs dorso-lombaires chroniques (4 patientes) et des symptômes somatiques multiples et inexpliqués (3 patientes). Le diagnostic a été posé d'emblée chez une patiente seulement. La durée moyenne des plaintes avant la pose du diagnostic était de 38 mois et 5 jours. Avec le traitement de cholecalciférol et de calcium, les symptômes disparaissaient entre 1 et 3 mois, chez une patiente ils ont duré sept mois. Le taux moyen de 250H vitamine D3 était de 10.9 nmol/l (IR 21-131). Le taux moyen de calcium était de 2.19 mmol/l (2.15-2.55) et quatre patientes présentaient une hypocalcémie. Nous pensons donc que les femmes requérantes d'asile sont à risque d'une durée prolongée de symptômes, de part la possible haute prévalence de cette condition et la difficulté chez les médecins à la reconnaître. Le diagnostic d'hypovitaminose devrait être recherché chez les femmes requérantes d'asile souffrant de douleurs musculo-squelettiques de longue durée. Le premier diagnostic souvent évoqué, dans un contexte psychosocial souvent difficile, était de l'ordre d'un trouble somatoforme douloureux ou de somatisations. Toutefois, les douleurs liées à l'hypovitaminose D3 sont relativement bien définies ; elles sont symétriques, osseuses, débutent souvent dans la région lombaire pour ensuite s'étendre au bassin, aux membres inférieures proximalement et à la cage thoracique. Le traitement substitutif est simple, peu onéreux et il serait judicieux d'initier d'autres études pour évaluer le besoin d'une substitution de routine dans la population présentée. Abstract: Deficiency of vitamin D, which can lead to osteomalacia, is common in elderly patients in Western countries. However, it is still widely underdiagnosed in young immigrant women, even though the condition has been extensively reported in the immigrant Indo- Asian population in the United Kingdom since the 1960s. A recent study reports an average 59 months before diagnosis was established, and another study found a prevalence of 78% of hypovitaminosis D3 (compared with 58% in controls) in an Indo-Asian population attending a UK rheumatology clinic. When recognised, hypovitaminosis D3 is easily treatable. A study on osteomalacic myopathy in veiled Arabic women in Denmark found that muscle strength returned to normal (except in maximal voluntary con-traction) after six months' treatment. We expected to see this disease in female asylum seekers, especially in those from societies with different customs regarding exposure to sunlight and diet We report 11 cases of symptomatic hypovitaminosis D3 in female asylum seekers (table 1). We focus on the pathology encountered by the primary care doctors caring for these 11 patients, the length of time between the appearance of symptoms, and the establishment of the diagnosis of hypovitaminosis D3 as well as the women's response to treatment by the improvement of a wide range of clinical symptoms-bone pain, muscular weakness, and fatigue.

Method for retinal gene repair in neonatal mouse.

Gene correction at the site of the mutation in the chromosome is the absolute way to really cure a genetic disease. The oligonucleotide (ODN)-mediated gene repair technology uses an ODN perfectly complementary to the genomic sequence except for a mismatch at the base that is mutated. The endogenous repair machinery of the targeted cell then mediates substitution of the desired base in the gene, resulting in a completely normal sequence. Theoretically, it avoids potential gene silencing or random integration associated with common viral gene augmentation approaches and allows an intact regulation of expression of the therapeutic protein. The eye is a particularly attractive target for gene repair because of its unique features (small organ, easily accessible, low diffusion into systemic circulation). Moreover therapeutic effects on visual impairment could be obtained with modest levels of repair. This chapter describes in details the optimized method to target active ODNs to the nuclei of photoreceptors in neonatal mouse using (1) an electric current application at the eye surface (saline transpalpebral iontophoresis), (2) combined with an intravitreous injection of ODNs, as well as the experimental methods for (3) the dissection of adult neural retinas, (4) their immuno-labelling, and (5) flat-mounting for direct observation of photoreceptor survival, a relevant criteria of treatment outcomes for retinal degeneration.

Molecular genetic approaches to the biology of the moss "Physcomitrella patens"

La mousse haplobiontique Physcomitrella patens est utilisée comme système génétique modèle pour l'étude du développement des plantes. Cependant, l'absence d'un protocole efficace de transformation a constitué jusqu'à présent un gros désavantage méthodologique pour le développement futur de ce système expérimental. Les résultats présentés dans le premier chapitre relatent la mise au point d'un protocole de transformation basé sur la technique de transfert direct de gènes dans des protoplastes par précipitation au PEG. Un essai d'expression transitoire de gènes a été mis au point. Ce protocole a été adapté afin de permettre l'introduction in vivo d'anticorps dans des protoplastes. Le protocole modifié permet d'introduire simultanément du DNA et des IgG dans les cellules, et nous avons démontré que ces anticorps peuvent inactiver spécifiquement le produit d'un gène co-introduit (GUS), ainsi que certaines protéines impliquées dans des processus cellulaires (tubuline). Cet essai, baptisé "essai transitoire d'immuno-inactivation in vivo", devrait être directement applicable à d'autres protoplastes végétaux, et permettre l'élaboration de nouvelles stratégies dans l'étude de processus cellulaires. Le second chapitre est consacré aux expériences de transformation de la mousse avec des gènes conférant une résistance à des antibiotiques. Nos résultats démontrent que l'intégration de gènes de résistance dans le génome de P. patens est possible, mais que cet événement est rare. Il s'agit là néanmoins de la première démonstration d'une transformation génétique réussie de cet organisme. L'introduction de gènes de résistance aux antibiotiques dans les protoplastes de P. patens génère à haute fréquence des clones résistants instables. Deux classes de clones instables ont été identifiés. La caractérisation phénotypique, génétique et moléculaire de ces clones suggère fortement que les séquences transformantes sont concaténées pour former des structures de haut poids moléculaire, et que ces structures sont efficacement répliquées et maintenues dans les cellules résistantes en tant qu'éléments génétiques extrachromosomaux. Ce type de transformation nous permet d'envisager des expériences permettant l'identification des séquences génomiques impliquées dans la replication de l'ADN de mousse. Plusieurs lignées transgéniques ont été retransformées avec des plasmides portant des séquences homologues aux séquences intégrées dans le génome, mais conférant une résistance à un autre antibiotique. Les résultats présentés dans le troisième chapitre montrent que les fréquences de transformation intégrative dans les lignées transgéniques sont 10 fois plus élevées que dans la lignée sauvage, et que cette augmentation est associée à une coségrégation des gènes de résistance dans la plupart des clones testés. Ces résultats génétiques indiquent que l'intégration de séquences d'ADN étranger dans le génome de P. patens a lieu en moyenne 10 fois plus fréquemment par recombinaison homologue que par intégration aléatoire. Ce rapport homologue/aléatoire est 10000 fois supérieur aux rapports obtenus avec d'autres plantes, et fournit l'outil indispensable à la réalisation d'expériences de génétique inverse dans cet organisme à haplophase dominante. THESIS SUMMARY The moss Physcomitrella patens is used as a model genetic system to study plant development, taking advantage of the fact that the haploid gametophyte dominates in its life cycle. But further development of this model system was hampered by the lack of a protocol allowing the genetic transformation of this plant. We have developed a transformation protocol based on PEG-mediated direct gene transfer to protoplasts. Our data demonstrate that this procedure leads to the establishment of an efficient transient gene expression assay. A slightly modified protocol has been developed allowing the in vivo introduction of antibodies in moss protoplasts. Both DNA and IgGs can be loaded simultaneously, and specific antibodies can immunodeplete the product of an expression cassette (GUS) as well as proteins involved in cellular processes (tubulins). This assay, named transient in vivo immunodepletion assay, should be applicable to other plant protoplasts, and offers new approaches to study cellular processes. Transformations have been performed with bacterial plasmids carrying antibiotic resistance expression cassette. Our data demonstrate that integrative transformation occurs, but at low frequencies. This is the first demonstration of a successful genetic transformation of mosses. Resistant unstable colonies are recovered at high frequencies following transformation, and two different classes of unstable clones have been identified. Phenotypical, genetic and molecular characterisation of these clones strongly suggests that bacterial plasmids are concatenated to form high molecular arrays which are efficiently replicated and maintained as extrachromosomal elements in the resistant cells. Replicative transformation in P. patens should allow the design of experiments aimed at the identification of genomic sequences involved in moss DNA replication. Transgenic strains have been retransformed with bacterial plasmids carrying sequences homologous to the integrated transloci, but conferring resistance to another antibiotic. Our results demonstrate an order of magnitude increase of integrative transformation frequencies in transgenic strains as compared to wild-type, associated with cosegregation of the resistance genes in most of these double resistant transgenic strains. These observations provide strong genetic evidence that gene targeting occurs about ten times more often than random integration in the genome of P. patens. Such ratio of targeted to random integration is about 10 000 times higher than previous reports of gene targeting in plants, and provides the essential requirement for the development of efficient reverse genetics in the haplodiplobiontic P. patens.

International consensus guidelines on the management of cytomegalovirus in solid organ transplantation.

Cytomegalovirus (CMV) remains one of the most common infections after solid organ transplantation, resulting in significant morbidity, graft loss, and occasional mortality. Management of CMV varies considerably among transplant centers. A panel of experts on CMV and solid organ transplant was convened by The Infectious Diseases Section of The Transplantation Society to develop evidence and expert opinion-based consensus guidelines on CMV management including diagnostics, immunology, prevention, treatment, drug resistance, and pediatric issues.

Molecular mechanisms of action of herbal antifungal alkaloid berberine, in Candida albicans.

Candida albicans causes superficial to systemic infections in immuno-compromised individuals. The concomitant use of fungistatic drugs and the lack of cidal drugs frequently result in strains that could withstand commonly used antifungals, and display multidrug resistance (MDR). In search of novel fungicidals, in this study, we have explored a plant alkaloid berberine (BER) for its antifungal potential. For this, we screened an in-house transcription factor (TF) mutant library of C. albicans strains towards their susceptibility to BER. Our screen of TF mutant strains identified a heat shock factor (HSF1), which has a central role in thermal adaptation, to be most responsive to BER treatment. Interestingly, HSF1 mutant was not only highly susceptible to BER but also displayed collateral susceptibility towards drugs targeting cell wall (CW) and ergosterol biosynthesis. Notably, BER treatment alone could affect the CW integrity as was evident from the growth retardation of MAP kinase and calcineurin pathway null mutant strains and transmission electron microscopy. However, unlike BER, HSF1 effect on CW appeared to be independent of MAP kinase and Calcineurin pathway genes. Additionally, unlike hsf1 null strain, BER treatment of Candida cells resulted in dysfunctional mitochondria, which was evident from its slow growth in non-fermentative carbon source and poor labeling with mitochondrial membrane potential sensitive probe. This phenotype was reinforced with an enhanced ROS levels coinciding with the up-regulated oxidative stress genes in BER-treated cells. Together, our study not only describes the molecular mechanism of BER fungicidal activity but also unravels a new role of evolutionary conserved HSF1, in MDR of Candida.

Eight years experience from a skeletal dysplasia referral center in a tertiary hospital in Southern India: A model for the diagnosis and treatment of rare diseases in a developing country.

We report on a series of 514 consecutive diagnoses of skeletal dysplasia made over an 8-year period at a tertiary hospital in Kerala, India. The most common diagnostic groups were dysostosis multiplex group (n = 73) followed by FGFR3 (n = 49) and osteogenesis imperfecta and decreased bone density group (n = 41). Molecular confirmation was obtained in 109 cases. Clinical and radiographic evaluation was obtained in close diagnostic collaboration with expert groups abroad through Internet communication for difficult cases. This has allowed for targeted biochemical and molecular studies leading to the correct identification of rare or novel conditions, which has not only helped affected families by allowing for improved genetic counseling and prenatal diagnosis but also resulted in several scientific contributions. We conclude that (1) the spectrum of genetic bone disease in Kerala, India, is similar to that of other parts of the world, but recessive entities may be more frequent because of widespread consanguinity; (2) prenatal detection of skeletal dysplasias remains relatively rare because of limited access to expert prenatal ultrasound facilities; (3) because of the low accessibility to molecular tests, precise clinical-radiographic phenotyping remains the mainstay of diagnosis and counseling and of gatekeeping to efficient laboratory testing; (4) good phenotyping allows, a significant contribution to the recognition and characterization of novel entities. We suggest that the tight collaboration between a local reference center with dedicated personnel and expert diagnostic networks may be a proficient model to bring current diagnostics to developing countries. © 2014 Wiley Periodicals, Inc.