Measurement Errors Should Always Be Incorporated in Phylogenetic Comparative Analysis

The evolution of continuous traits is the central component of comparative analyses in phylogenetics, and the comparison of alternative models of trait evolution has greatly improved our understanding of the mechanisms driving phenotypic differentiation. Several factors influence the comparison of models, and we explore the effects of random errors in trait measurement on the accuracy of model selection. We simulate trait data under a Brownian motion model (BM) and introduce different magnitudes of random measurement error. We then evaluate the resulting statistical support for this model against two alternative models: Ornstein-Uhlenbeck (OU) and accelerating/decelerating rates (ACDC). Our analyses show that even small measurement errors (10%) consistently bias model selection towards erroneous rejection of BM in favour of more parameter-rich models (most frequently the OU model). Fortunately, methods that explicitly incorporate measurement errors in phylogenetic analyses considerably improve the accuracy of model selection. Our results call for caution in interpreting the results of model selection in comparative analyses, especially when complex models garner only modest additional support. Importantly, as measurement errors occur in most trait data sets, we suggest that estimation of measurement errors should always be performed during comparative analysis to reduce chances of misidentification of evolutionary processes.

Tumor cell budding and laminin-5 expression in colorectal carcinoma can be modulated by the tissue micro-environment.

Expression of laminin-5 alpha3, beta3 and gamma2 protein subunits was investigated in colorectal adenocarcinomas using immunostaining and confocal microscopy. The laminin-5 heterotrimer was found in basement membranes and as extracellular deposits in tumor stroma. In contrast to the alpha3 subunit, which was under-expressed, the gamma2 and beta3 subunits were detected in the cytoplasm of carcinoma cells dissociating (budding) from neoplastic tubules, suggestive of focal alterations in laminin-5 assembly and secretion. Laminin-5 gamma2 or beta3 subunit-reactive budding carcinoma cells expressed cytokeratins but not vimentin; they did not proliferate and were not apoptotic. Furthermore, expression of laminin-5 gamma2 and beta3 subunits in budding cells was associated with focal under-expression of the E-cadherin-beta-catenin complex. Results from xenograft experiments showed that budding activity in colorectal adenocarcinomas could be suppressed when these tumors grew at ectopic s.c. sites in nude mice. In vitro, cultured colon carcinoma cells, but not adenoma-derived tumor cells, shared the laminin-5 phenotype expressed by carcinoma cells in vivo. Using colon carcinoma cell lines implanted orthotopically and invading the cecum of nude mice, the laminin-5-associated budding was restored, indicating that this phenotype is not only determined by tumor cell properties but also dependent on the tissue micro-environment. Our results indicate that both laminin-5 alpha3 subunit expression and cell-cell cohesiveness are altered in budding carcinoma cells, which we consider to be actively invading. We propose that the local tissue micro-environment contributes to these events.

Pulse wave analysis aortic pressure . distole should also be considered

La rigidité anormalement haute des artères à grande conductance est un marqueur de l'augmentation du risque cardiovasculaire et est typiquement retrouvée chez les patients diabétiques ou hypertendus. Ces vaisseaux deviennent plus rigides avec l'âge, expliquant la haute prévalence d'hypertension systolique chez les personnes âgées. Cette rigidification agit sur la pression sanguine de plusieurs façons. Notamment la fonction windkessel est gênée, menant à l'augmentation de la pression systolique et de la pression puisée, la diminution de la pression diastolique, et ainsi à l'augmentation de la postcharge ventriculaire gauche associée à une probable diminution de la perfusion coronarienne. De plus, la propagation des ondes de pression le long de l'arbre vasculaire est accélérée, de sorte que les ondes réfléchies générées au site de décalage d'impédance atteignent l'aorte ascendante plus tôt par rapport au début de l'éjection ventriculaire, aboutissant à une augmentation de la pression systolique centrale, ce qui n'arriverait pas en présence de vaisseaux moins rigides. Dans ce cas, au contraire, les ondes de pression antérogrades et réfléchies voyages plus lentement, de sorte que les ondes de réflexion tendent à atteindre l'aorte centrale une fois l'éjection terminée, augmentant la pression diastolique et contribuant à la perfusion coronarienne. La tonométrie d'applanation est une méthode non invasive permettant l'évaluation de la forme de l'onde de pression au niveau l'aorte ascendante, basée sur l'enregistrement du pouls périphérique, au niveau radial dans notre étude. Nous pouvons dériver à partir de cette méthode un index d'augmentation systolique (sAIX) qui révèle quel pourcentage de la pression centrale est du aux ondes réfléchies. Plusieurs études ont montré que cet index est corrélé à d'autres mesures de la rigidité artérielle comme la vitesse de l'onde de pouls, qu'il augmente avec l'âge et avec les facteurs de risques cardiovasculaires, et qu'il est capable de préciser le pronostic cardiovasculaire. En revanche, peu d'attention a été portée à l'augmentation de la pression centrale diastolique due aux ondes réfléchies (dAIX). Nous proposons donc de mesurer cet index par un procédé d'analyse développé dans notre laboratoire, et ce dans la même unité que l'index systolique. Etant donné que les modifications de la paroi artérielle modulent d'une part la vitesse de l'onde de pouls (PWV) et d'autre part le temps de voyage aller-retour des ondes de pression réfléchies aux sites de réflexion, toute augmentation de la quantité d'énergie réfléchie atteignant l'aorte pendant la systole devrait être associée à une diminution de l'énergie arrivant au même point pendant la diastole. Notre étude propose de mesurer ces deux index, ainsi que d'étudier la relation de l'index d'augmentation diastolique (dAIX) avec la vitesse de propagation de l'onde de pouls (PWV) et avec le rythme cardiaque (HR), ce dernier étant connu pour influencer l'index d'augmentation systolique (sAIX) . L'influence de la position couchée et assise est aussi étudiée. Les mesures de la PWV et des sAIX et dAIX est réalisée chez 48 hommes et 45 femmes âgées de 18 à 70 ans, classés en 3 groupes d'âges. Les résultats montrent qu'en fonction de l'âge, le genre et la position du corps, il y a une relation inverse entre sAIX et dAIX. Lorsque PWV et HR sont ajoutés comme covariables à un modèle de prédiction comprenant l'âge, le genre et la position du corps comme facteurs principaux, sAIX est directement lié à PWV (p<0.0001) et inversement lié à HR (p<0.0001). Avec la même analyse, dAIX est inversement lié à PWV (p<0.0001) et indépendant du rythme cardiaque (p=0.52). En conclusion, l'index d'augmentation diastolique est lié à la rigidité vasculaire au même degré que l'index d'augmentation systolique, alors qu'il est affranchi de l'effet confondant du rythme cardiaque. La quantification de l'augmentation de la pression aortique diastolique due aux ondes réfléchies pourrait être une partie utile de l'analyse de l'onde de pouls.

Hirsutisme: que faire [Hirsutism, what can be done?]

Hirsutism is a relatively frequent condition in an ambulatory setting affecting about 4% of women. A rational clinical and biochemical diagnostic approach assures an optimal treatment directed at etiologic and pathogenetic factors. The diagnosis of hyperandrogenism is evaluated considering the pathophysiologic mechanisms responsible for excessive growth of hair. Ovarian and adrenal tumors are the most serious diseases that have to be excluded by clinical and biochemical tests. The other causes for hirsutism are treatable by a great variety of modalities, available drugs can inhibit pituitary gonadotropins, the hypothalamo-pituitary axis and the conversion of testosterone into biologically active substrate. Finally the binding of androgens to its receptor can be blocked. These possibilities for treatment and their indications for the different etiologies of hirsutism are discussed.

Prescription de statines en prévention primaire: quel score de risque cardiovasculaire faut-il utiliser en Suisse? [Statin prescription in primary prevention: which cardiovascular risk score should be used in Switzerland?]

La prévention primaire des maladies cardiovasculaires par les médecins s'effectue par une prise en charge individualisée des facteurs de risque. L'indication à un traitement par statines se base sur une estimation du risque de survenue d'une maladie cardiovasculaire et sur le taux de LDL-cholestérol. Trois scores de risque sont couramment utilisés: le score PROCAM, le score Framingham, et le SCORE européen. En Suisse, le Groupe Suisse Lipides et Athérosclérose (GSLA) recommande en première instance l'utilisation du score PROCAM avec une adaptation du niveau de risque pour la Suisse. Une enquête a aussi montré que c'est le score le plus utilisé en Suisse. Dans cet article, les particularités de ces scores et leurs applications pratiques en ce qui concerne la prescription de statines en prévention primaire sont discutées. Les conséquences et les bénéfices potentiels de l'application de ces scores en Suisse sont également abordés. [Abstract] Primary prevention of cardiovascular disease by physicians is achieved by management of individual risk factors. The eligibility for treatment with statins is based on both an estimate of the risk of developing cardiovascular disease and the LDL-cholesterol. Three risk scores are commonly used : the PROCAM score, the Framingham score, and the European score. In Switzerland, the Swiss Group Lipids and Atherosclerosis (GSLA) recommends to use the PROCAM score with an adjustment of the level of risk for Switzerland. A survey also showed that PROCAM is the most used in Switzerland. In this article, the differences of these scores and their practical applications regarding the prescription of statins in primary prevention are discussed. The consequences and potential benefits of applying these scores in Switzerland are also discussed.

Fruits et légumes: peuvent-ils être dangereux? [Fruits and vegetables: can they be dangerous?].

Fruits, vegetables and spices are found in our everyday food consumption. However, some contain potentially toxic substances, particularly when consumed in large amounts. These risks may be greater for certain susceptible individuals and may depend on how the ingredients are prepared. Food poisoning is generally speaking self-limiting, but may be life threatening. This article discusses the possible toxic effects of certain common foodstuffs, as described in the current medical literature.

Can Valproic Acid be an Inducer of Clozapine Metabolism?

Introduction: Prior clozapine studies indicated no effects, mild inhibition or induction of valproic acid (VPA) on clozapine metabolism. The hypotheses that (i) VPA is a net inducer of clozapine metabolism, and (ii) smoking modifies this inductive effect were tested in a therapeutic drug monitoring study. Methods: After excluding strong inhibitors and inducers, 353 steady-state total clozapine (clozapine plus norclozapine) concentrations provided by 151 patients were analyzed using a random intercept linear model. Results: VPA appeared to be an inducer of clozapine metabolism since total plasma clozapine concentrations in subjects taking VPA were significantly lower (27% lower; 95% confidence interval, 14-39%) after controlling for confounding variables including smoking (35% lower, 28-56%). Discussion: Prospective studies are needed to definitively establish that VPA may (i) be an inducer of clozapine metabolism when induction prevails over competitive inhibition, and (ii) be an inducer even in smokers who are under the influence of smoking inductive effects on clozapine metabolism.

Ulnar nerve transposition at the elbow : local anesthesia should be preferred to general anesthesia

Après la compression du nerf médian au niveau du tunnel carpien, la compression du nerf ulnaire au niveau du coude est le deuxième syndrome compressif le plus fréquent des nerfs périphériques. La chirurgie des nerfs périphériques consiste dans une décompression nerveuse et est caractérisée par un suivi post¬opératoire parfois très douloureux avec des douleurs qui peuvent chroniciser si insuffisamment traitées. Le traitement chirurgical de décompression nerveuse se fait traditionnellement sous anesthésie générale ou régionale. Une analgésie post-opératoire plus efficace et durable avec moindre risque de chronicisation avait justifié ce choix jusqu'à ce jour. Grâce au développement de la chirurgie ambulatoire ces dernières années, un grand nombre d'interventions chirurgicales au niveau de la main sont effectués sous anesthésie locale. Au vu d'une meilleure connaissance de cette technique d'anesthésie, son rôle dans la chirurgie des nerfs périphériques a été remis en question. Alors que plusieurs études ont démontré que l'anesthésie locale est aussi efficace que l'anesthésie générale et régionale au sujet de la chirurgie du tunnel carpien, son utilisation pour la chirurgie du nerf ulnaire reste peu connue. La raison de l'hésitation à l'utilisation de l'anesthésie locale pour le traitement du tunnel ulnaire est due au fait que dans plus de la moitié des cas, une simple décompression n'est pas suffisante et qu'il est souvent nécessaire de transposer le nerf ulnaire devant l'épicondyle ulnaire. La seule publication disponible au sujet de l'utilisation de l'anesthésie locale dans le traitement du tunnel ulnaire considère comme irréalisable d'utiliser cette méthode dans le cas d'une transposition. Malgré cette mise en garde, nous avons, depuis plusieurs années, des excellents résultats avec la transposition du nerf ulnaire sous anesthésie locale. Avec le but d'objectiver notre expérience dans ce domaine nous avons souhaité analyser nos résultats de façon rétrospective avec particulière attention aux douleurs post-opératoires et à la satisfaction des patients. Les dossiers de cinquante patients Consécutifs (26F, 24M) opérés par le même chirurgien dans notre service de 2002 à 2012 ont été analysés rétrospectivement. Les critères suivants ont été récoltés: l'âge du patient, la profession, la main dominante, les détails des techniques opératoires utilisées, le type d'anesthésie, l'intensité du suivi ainsi que les complications, le niveau de douleur dans l'immédiat post-opératorie ainsi que à une année de l'intervention. Les patients ont été divisés en 4 groupes: les opérés sous anesthésie générale avec transposition du nerf (n=17) ou sans transposition (n=10) et les opérés sous anesthésie locale avec transposition (n=12) ou sans transposition (n=11). Au premier jour la douleur était comparable dans tous les groupes. A une semaine, elle était deux fois plus importante lorsque la transposition avait été réalisée sous anesthésie générale par rapport à si une anesthésie locale avait été effectuée (p=0.03). La satisfaction s'est révélée plus élevée mais non significative chez les patients opérés sous anesthésie locale. Ces derniers étaient significativement plus enclins à répéter la chirurgie comparé a ceux opérés sous anesthésie générale (p=0.04). En conclusion, les résultats de cette étude suggèrent que l'anesthésie locale est au moins autant efficace que l'anesthésie générale en termes de complications et de douleurs post-opératoires indépendamment du fait qu'une transposition nerveuse soit effectuée ou pas. Un meilleur contrôle des douleurs à une semaine post-opératoire a contribué à une haute satisfaction des patients de notre étude.

Jaundice-Should "yellow" be a red code?

Objective: Jaundice is the clinical manifestation, of hyperbilirubinemia. It is considered as a sign of either a liver disease or, less often, of a hemolytic disorder. It can be divided into obstructive and non obstructive type, involving increase of indirect (non-conjugated) bilirubin or increase of direct (conjugated) bilirubin, respectively, but it can be also manifested as mixed type. Methods: This article updates the current knoweledge concerning the jaundice's etiology, pathophysiological mechanisms, and complications ant treatment by reviewing of the latest medical literature. It also presents an approach of jaundice's treatment and pathogenesis, in special populations as in neonates and pregnant women. Results: The treatment is consistent in the management of the subjective diseases responsible for the jaundice and its complications.The clinical prognosis of the jaundice depends on the etiology. Surgical treatment of jaundiced patients is associated with high mortality and morbidity rates. Studies have shown that the severity of jaundice and the presence of malignant disease are importan risk factors for post-operative mortality. Conclusions: Early detection of jaundice is of vital importance because of its involvement in malignancy or in other benign conditions requiring immediate treatment in order to avoid further complications.